Academic Journal
Распределение частот VNTR аллелей локуса 5-HTTLPR гена транспортера серотонина в населении Евразии и Африки
| Title: | Распределение частот VNTR аллелей локуса 5-HTTLPR гена транспортера серотонина в населении Евразии и Африки |
|---|---|
| Source: | Ecological genetics. |
| Publisher Information: | Общество с ограниченной ответственностью «Эко-Вектор», 2014. |
| Publication Year: | 2014 |
| Subject Terms: | ГЕН ТРАНСПОРТЕРА СЕРОТОНИНА SLC6A4,ГЕОГРАФИЧЕСКОЕ РАСПРЕДЕЛЕНИЕ ЧАСТОТ АЛЛЕЛЕЙ 5-HTTLPR,МИГРАЦИИ,SEROTONIN TRANSPORTER SLC6A4 GENE,5-HTTLPR ALLELE FREQUENCY MAP,MIGRATION |
| Description: | Background. VNTR-polymorphism at 5 HTTLPR regulatory region of human serotonin transporter gene SLC6A4, which is associated with some psychiatric diseases and personality traits, is presented by two alleles, S and L, affecting the gene transcription level. A correlation between the S allele frequency in populations of European and Asian origin and a Hofstede's individualism-collectivism index was revealed and a hypothesis of culture-gene coevolution was suggested (Chiao, Blizinsky, 2010). Methods. As another reason for the correlation we examined underlying population genetic substructure, which may affect genetic association level. Results. We have experimentally established the 5 HTTLPR genotypes for 2144 individuals to calculate S and L allele frequencies in 21 populations of Eurasia and Africa. In contrast to Eurasia populations, we have found low S allele frequencies in all four African populations studied, although the collectivism index in the populations was high. The total set of Eurasian and African populations analysis does not confirm the correlation (R= 0.263, p=0.146). We have applied principal component (PC) analysis to check a correlation between S allele frequency distribution and a frequency distribution for alleles which are supposed to be neutral. PC analysis for 68 alleles of five CODIS STR loci revealed correlation between PC2 and S allele frequency (R= 0.820, p Для 21 популяции Евразии и Африки определены частоты аллеля S локуса 5-HTTLPR гена транспортера серотонина ассоциированного с рядом психологических особенностей человека. В тех же популяциях рассчитаны главные компоненты генетической изменчивости (PC1 и РС2) на основе опубликованных частот 68 предположительно нейтральных аллелей 5 STR-локусов системы CODIS. Частота аллеля S значимо коррелирует c PC2 (R = 0,820, p < 0,0001), то есть соответствует структуре общей генетической изменчивости этих популяций. Для 4 из 68 исследованных аллелей уровень корреляции частоты STR аллеля с индексом индивидуализма-коллективизма по Хофстеду даже выше, чем для аллеля S. Наши данные не подтверждают гипотезу (Chiao, Blizinsky, 2010) о ген-культурной коэволюции частоты аллеля S и уровня коллективизма. |
| Document Type: | Article |
| File Description: | text/html |
| Language: | Russian |
| ISSN: | 2411-9202 1811-0932 |
| Access URL: | http://cyberleninka.ru/article_covers/16419574.png http://cyberleninka.ru/article/n/raspredelenie-chastot-vntr-alleley-lokusa-5-httlpr-gena-transportera-serotonina-v-naselenii-evrazii-i-afriki |
| Accession Number: | edsair.od......2806..b6989b82fc4dbc1505bf3e038c062cfc |
| Database: | OpenAIRE |
| ISSN: | 24119202 18110932 |
|---|