Bibliographic Details
| Title: |
Метагеномы крови и псориатической кожи. Проект исследования |
| Publisher Information: |
Zenodo, 2019. |
| Publication Year: |
2019 |
| Subject Terms: |
бактериальная DNA, нехозяйская DNA, секвенирование, бактериальные продукты, вирус папилломы человека, псорагенные бактерии, псориаз, кишечная проницаемость, нейтрофилы, кератиноциты, системный псориатический процесс, нетоз, мурамилдипептид, фагоциты, микробиом, пептидогликан, T-лимфоциты, метагеном, врожденный и приобретенный ответ, модель патогенеза, дендритные клетки, липополисахарид, хемокины, PAMP-немия, kPAMP-носительство, биоинформатика, моноциты, псориатическая болезнь |
| Description: |
Выполнено обоснование и подробное описание первого этапа проекта, посвященного изучению, диагностике и лечению псориаза. Целью первого этапа является проверка базовых гипотез новой системной YN-модели патогенеза псориаза. Проверка представляет собой комплексное изучение метагенома цельной крови и метагенома (фагоцитов) псориатической кожи. Метагеном это вся нехозяйская DNA (здесь – не принадлежащая человеку), содержащаяся в биоматериале. Предложены и обоснованы алгоритмы, необходимые для комплексного изучения метагеномов. Проведена обзорно-аналитическая оценка результатов основных работ по изучению метагеномов крови и кожи. Выполнен аналитический обзор всех (опубликованных до начала 2019 года) работ по определению концентрации бактериальной DNA в цельной крови здоровых людей. Выполнено детальное сравнение характеристик 16S-теста и WMS-теста. Сформулированы цели и задачи (включая порядок их решения) первого этапа. Поставлены основные вопросы, на которые по итогам первого этапа должны быть получены ответы. Предложен порядок подготовки и выполнения WMS-теста цельной крови. Проведено детальное сравнение YN-модели патогенеза с ранее опубликованной Y‑моделью. Выполнен аналитический обзор работ, посвященных изучению привлечения нейтрофилов крови в псориатическую кожу и последующего их возможного нетоза. Нетоз в псориатической коже нейтрофилов, являющихся носителями эндоцитированного в крови Y‑антигена, назван необходимым звеном порочного цикла псориатического воспаления в рамках YN-модели. Предложена классификация псориатической болезни как нетопатии. Дано определение псорагенных бактерий, основанное на наличии генов, ответственных за формирование межпептидных мостиков. Определены наименьшие пептиды (фрагменты пептидогликана) – потенциальные Y-антигены. A) Иллюстрации выполнены в виде презентации и находятся в отдельном файле: http://doi.org/10.5281/zenodo.2677818 B) Дополнения S1-S8 находятся в отдельном файле: http://doi.org/10.5281/zenodo.2677822 C) Расчетные данные находятся в отдельном файле: http://doi.org/10.5281/zenodo.2571445 Авторизованный перевод на английский язык данной книги (а также Дополнений A и B): https://doi.org/10.5281/zenodo.2667680 |
| Document Type: |
Book |
| Language: |
Russian |
| DOI: |
10.5281/zenodo.1415418 |
| Rights: |
CC BY NC ND |
| Accession Number: |
edsair.doi...........094ad1d0e70b9dc3ba231e7ca0f4684b |
| Database: |
OpenAIRE |