Ανάλυση αλληλουχιών πρωτεϊνών με μεθόδους δυναμικού προγραμματισμού

Η αντιστοίχιση αλληλουχιών είναι χρήσιμη για την εύρεση λειτουργικών, δομικών, και εξελικτικών πληροφοριών σε βιολογικές ακολουθίες. Είναι σημαντικό να βρίσκουμε την καλύτερη δυνατή ή αλλιώς «βέλτιστη» αντιστοίχιση για να εξάγουμε αυτές τις πληροφορίες. Αλληλουχίες...

Full description

Saved in:
Bibliographic Details
Main Author: Γεωργίου, Θεοδώρα - Ιωάννης
Other Authors: Γιαννακόπουλος, Αθανάσιος
Language:Greek
Published: 2015
Subjects:
Online Access:https://vsmart.lib.aegean.gr/webopac/FullBB.csp?WebAction=ShowFullBB&EncodedRequest=*A5u*10*9E*9B*19*15*2E*7C*EERq*99*E6*A3*B9&Profile=Default&OpacLanguage=gre&NumberToRetrieve=50&StartValue=2&WebPageNr=1&SearchTerm1=2005%20.1.29204&SearchT1=&Index1=Keywordsbib&SearchMethod=Find_1&ItemNr=2
http://hdl.handle.net/11610/15588
Tags: Add Tag
No Tags, Be the first to tag this record!
_version_ 1828461120485064704
author Γεωργίου, Θεοδώρα - Ιωάννης
author2 Γιαννακόπουλος, Αθανάσιος
author_facet Γιαννακόπουλος, Αθανάσιος
Γεωργίου, Θεοδώρα - Ιωάννης
author_sort Γεωργίου, Θεοδώρα - Ιωάννης
collection DSpace
description Η αντιστοίχιση αλληλουχιών είναι χρήσιμη για την εύρεση λειτουργικών, δομικών, και εξελικτικών πληροφοριών σε βιολογικές ακολουθίες. Είναι σημαντικό να βρίσκουμε την καλύτερη δυνατή ή αλλιώς «βέλτιστη» αντιστοίχιση για να εξάγουμε αυτές τις πληροφορίες. Αλληλουχίες οι οποίες είναι παρόμοιες, πιθανότατα έχουν την ίδια λειτουργία, είτε είναι ένας ρυθμιστικός ρόλος στην περίπτωση παρόμοιων μορίων DNA, είτε είναι μια παρόμοια βιοχημική λειτουργία και τρισδιάστατη δομή στην περίπτωση πρωτεϊνών. Σκοπός της παρούσας μελέτης είναι να ανακτήσει αλληλουχίες πρωτεϊνών τις ίδιας κλάσης από βάσεις δεδομένων, να τις αντιστοιχίσει χρησιμοποιώντας διαφορετικούς αλγόριθμους δυναμικού προγραμματισμού, και κατόπιν να συγκρίνει και να αξιολογήσει τα αποτελέσματα που παράγονται από τους διαφορετικούς αλγόριθμους.
id oai:hellanicus.lib.aegean.gr:11610-15588
institution Hellanicus
language Greek
publishDate 2015
record_format dspace
spelling oai:hellanicus.lib.aegean.gr:11610-155882022-02-04T11:52:21Z Ανάλυση αλληλουχιών πρωτεϊνών με μεθόδους δυναμικού προγραμματισμού Γεωργίου, Θεοδώρα - Ιωάννης Γιαννακόπουλος, Αθανάσιος Πρωτεΐνη Αντιστοίχιση αλληλουχιών Δυναμικός προγραμματισμός Protein Sequence alignment Dynamic programming Proteins--Analysis Dynamic programming Η αντιστοίχιση αλληλουχιών είναι χρήσιμη για την εύρεση λειτουργικών, δομικών, και εξελικτικών πληροφοριών σε βιολογικές ακολουθίες. Είναι σημαντικό να βρίσκουμε την καλύτερη δυνατή ή αλλιώς «βέλτιστη» αντιστοίχιση για να εξάγουμε αυτές τις πληροφορίες. Αλληλουχίες οι οποίες είναι παρόμοιες, πιθανότατα έχουν την ίδια λειτουργία, είτε είναι ένας ρυθμιστικός ρόλος στην περίπτωση παρόμοιων μορίων DNA, είτε είναι μια παρόμοια βιοχημική λειτουργία και τρισδιάστατη δομή στην περίπτωση πρωτεϊνών. Σκοπός της παρούσας μελέτης είναι να ανακτήσει αλληλουχίες πρωτεϊνών τις ίδιας κλάσης από βάσεις δεδομένων, να τις αντιστοιχίσει χρησιμοποιώντας διαφορετικούς αλγόριθμους δυναμικού προγραμματισμού, και κατόπιν να συγκρίνει και να αξιολογήσει τα αποτελέσματα που παράγονται από τους διαφορετικούς αλγόριθμους. Sequence alignment is very useful in finding functional, structural, and evolutional information in biological sequences. It is very important to find the best possible alignment in order to extract this information. Sequences that are similar, possibly do the same function, whether it is a prescriptive part in the case of similar DNA molecules, or a biochemical function and 3-dimensional structure in the case of proteins. The aim of this study is to retrieve protein sequences of the same class from protein databases, to align them using different algorithms of dynamic programming, and finally to compare and evaluate the results generated from the different algorithms. 2015-11-22T15:59:23Z 2015-11-22T15:59:23Z 2005 https://vsmart.lib.aegean.gr/webopac/FullBB.csp?WebAction=ShowFullBB&EncodedRequest=*A5u*10*9E*9B*19*15*2E*7C*EERq*99*E6*A3*B9&Profile=Default&OpacLanguage=gre&NumberToRetrieve=50&StartValue=2&WebPageNr=1&SearchTerm1=2005%20.1.29204&SearchT1=&Index1=Keywordsbib&SearchMethod=Find_1&ItemNr=2 http://hdl.handle.net/11610/15588 el Σάμος
spellingShingle Πρωτεΐνη
Αντιστοίχιση αλληλουχιών
Δυναμικός προγραμματισμός
Protein
Sequence alignment
Dynamic programming
Proteins--Analysis
Dynamic programming
Γεωργίου, Θεοδώρα - Ιωάννης
Ανάλυση αλληλουχιών πρωτεϊνών με μεθόδους δυναμικού προγραμματισμού
title Ανάλυση αλληλουχιών πρωτεϊνών με μεθόδους δυναμικού προγραμματισμού
title_full Ανάλυση αλληλουχιών πρωτεϊνών με μεθόδους δυναμικού προγραμματισμού
title_fullStr Ανάλυση αλληλουχιών πρωτεϊνών με μεθόδους δυναμικού προγραμματισμού
title_full_unstemmed Ανάλυση αλληλουχιών πρωτεϊνών με μεθόδους δυναμικού προγραμματισμού
title_short Ανάλυση αλληλουχιών πρωτεϊνών με μεθόδους δυναμικού προγραμματισμού
title_sort ανάλυση αλληλουχιών πρωτεϊνών με μεθόδους δυναμικού προγραμματισμού
topic Πρωτεΐνη
Αντιστοίχιση αλληλουχιών
Δυναμικός προγραμματισμός
Protein
Sequence alignment
Dynamic programming
Proteins--Analysis
Dynamic programming
url https://vsmart.lib.aegean.gr/webopac/FullBB.csp?WebAction=ShowFullBB&EncodedRequest=*A5u*10*9E*9B*19*15*2E*7C*EERq*99*E6*A3*B9&Profile=Default&OpacLanguage=gre&NumberToRetrieve=50&StartValue=2&WebPageNr=1&SearchTerm1=2005%20.1.29204&SearchT1=&Index1=Keywordsbib&SearchMethod=Find_1&ItemNr=2
http://hdl.handle.net/11610/15588
work_keys_str_mv AT geōrgioutheodōraiōannēs analysēallēlouchiōnprōteïnōnmemethodousdynamikouprogrammatismou