Dissertation/ Thesis

Models and methods for molecular phylogenetics

Bibliographic Details
Title: Models and methods for molecular phylogenetics
Authors: Catanzaro, Daniele
Contributors: Labbé, Martine, Mardulyn, Patrick, Latouche, Guy, Fortz, Bernard, Pesenti, Raffaele, Gendreau, Michel, Barthelemy, Jean-Pierre
Publisher Information: Universite Libre de Bruxelles
Université libre de Bruxelles, Faculté des Sciences – Informatique, Bruxelles
Publication Year: 2008
Collection: DI-fusion : dépôt institutionnel de l'Université libre de Bruxelles (ULB)
Subject Terms: Sciences exactes et naturelles, Informatique générale, Combinatorial optimization, Phylogeny -- Molecular aspects -- Data processing, Molecular evolution -- Data processing, Genetic algorithms, Optimisation combinatoire, Phylogenèse -- Aspect moléculaire -- Informatique, Evolution moléculaire -- Informatique, Algorithmes génétiques, models of molecular evolution, phylogenetic inference, Network design
Description: Un des buts principaux de la biologie évolutive et de la médecine moléculaire consiste à reconstruire les relations phylogénétiques entre organismes à partir de leurs séquences moléculaires. En littérature, cette question est connue sous le nom d’inférence phylogénétique et a d'importantes applications dans la recherche médicale et pharmaceutique, ainsi que dans l’immunologie, l’épidémiologie, et la dynamique des populations. L’accumulation récente de données de séquences d’ADN dans les bases de données publiques, ainsi que la facilité relative avec laquelle des données nouvelles peuvent être obtenues, rend l’inférence phylogénétique particulièrement difficile (l'inférence phylogénétique est un problème NP-Hard sous tous les critères d’optimalité connus), de telle manière que des nouveaux critères et des algorithmes efficaces doivent être développés. Cette thèse a pour but: (i) d’analyser les limites mathématiques et biologiques des critères utilisés en inférence phylogénétique, (ii) de développer de nouveaux algorithmes efficaces permettant d’analyser de plus grands jeux de données. ; Doctorat en Sciences ; info:eu-repo/semantics/nonPublished
Document Type: doctoral or postdoctoral thesis
File Description: 1 v.; 2 full-text file(s): application/pdf | application/pdf
Language: French
Relation: local/ulbcat.ulb.ac.be:831188
Availability: https://hdl.handle.net/2013/ULB-DIPOT:oai:dipot.ulb.ac.be:2013/210453
https://dipot.ulb.ac.be/dspace/bitstream/2013/210453/4/28d11b46-1fa0-402b-b2d7-c9f48b8f946b.txt
https://dipot.ulb.ac.be/dspace/bitstream/2013/210453/1/adcfe415-619b-4991-854f-9c3cd49354dd.txt
Accession Number: edsbas.8768FA2
Database: BASE
Description
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