Report
A localization screen reveals translation factories and widespread co-translational RNA targeting
| Τίτλος: | A localization screen reveals translation factories and widespread co-translational RNA targeting |
|---|---|
| Συγγραφείς: | Chouaib, Racha, Safieddine, Adham, Pichon, Xavier, Imbert, Arthur, Sung Kwon, Oh, Samacoits, Aubin, Traboulsi, Abdel-Meneem, Robert, Marie-Cécile, Tsanov, Nikolay, Coleno, Emeline, Poser, Ina, Zimmer, Christophe, Hyman, Anthony, A., Le Hir, Hervé, Zibara, Kazem, Peter, Marion, Mueller, Florian, ‘floyd’, Walter, Thomas, Bertrand, Edouard |
| Συνεισφορές: | Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Equipe labelisée Ligue Contre le Cancer, Laboratory of Stem Cells Lebanese, Beirut (ER045-PRASE), الجامعة اللبنانية بيروت = Lebanese University Beirut = Université libanaise Beyrouth (LU / ULB), Faculty of Sciences Lebanese University, Equipe labellisée Ligue contre le Cancer, Centre de Bioinformatique (CBIO), Mines Paris - PSL (École nationale supérieure des mines de Paris), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL), Cancer et génome: Bioinformatique, biostatistiques et épidémiologie d'un système complexe, Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut Curie Paris -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS), Département de Biologie - ENS-PSL (IBENS), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Imagerie et Modélisation - Imaging and Modeling, Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Bioinformatique, Biostatistique et Biologie Intégrative (C3BI), Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics (MPI-CBG), Max-Planck-Gesellschaft, Université Paris Sciences et Lettres (PSL), This project was supported by France BioImaging (ANR-10-INBS-04), the Agence Nationale de la Recherche (ANR-11-BSV8-018-02 and ANR-14-CE10-0018-01), the Institut Pasteur, the Ligue Nationale Contre le Cancer and the Fondation pour la Recherche Médicale (FRM grant to EB). This work was supported by the Labex EpiGenMed, from the framework "Investissements d’avenir"., ANR-10-INBS-0004,France-BioImaging,Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée(2010), ANR-14-CE10-0018,HI-FISH,Etude systématique de l'expression des gènes à l'échelle des molécules uniques d'ARN(2014) |
| Πηγή: | https://pasteur.hal.science/pasteur-02873144 ; 2020. |
| Στοιχεία εκδότη: | CCSD |
| Έτος έκδοσης: | 2020 |
| Συλλογή: | Université de Montpellier: HAL |
| Θεματικοί όροι: | local translation, RNA transport, co-translational targeting +Equal contributions, smFISH, RNA localization, translation factories, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie |
| Περιγραφή: | Publié sur BioRxiv le 21 mai 2020 : https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.20.106989v1 ; Local translation allows a spatial control of gene expression. Here, we performed a dual protein/mRNA localization screen, using smFISH on 523 human cell lines expressing GFP-tagged genes. A total of 32 mRNAs displayed specific cytoplasmic localizations, and we observed local translation at unexpected locations, including cytoplasmic protrusions, cell edges, endosomes, Golgi, the nuclear envelope and centrosomes, the latter being cell cycle dependent. Quantitation of mRNA distribution and automatic pattern classification revealed a high degree of localization heterogeneity between cells. Surprisingly, mRNA localization frequently required ongoing translation, indicating widespread co-translational RNA targeting. Interestingly, while P-body accumulation was frequent (15 mRNAs), four mRNAs accumulated in foci that were distinct structures. These foci lacked the mature protein, but nascent polypeptide imaging showed that they were specialized translation factories. For β-catenin, foci formation was regulated by Wnt, relied on APC-dependent polysome aggregation, and led to nascent protein degradation. Thus, translation factories uniquely regulate nascent protein metabolism and create a fine granular compartmentalization of translation. |
| Τύπος εγγράφου: | report |
| Γλώσσα: | English |
| DOI: | 10.1101/2020.05.20.106989 |
| Διαθεσιμότητα: | https://pasteur.hal.science/pasteur-02873144 https://pasteur.hal.science/pasteur-02873144v1/document https://pasteur.hal.science/pasteur-02873144v1/file/2020.05.20.106989v1.full%20%281%29.pdf https://doi.org/10.1101/2020.05.20.106989 |
| Rights: | http://hal.archives-ouvertes.fr/licences/copyright/ ; info:eu-repo/semantics/OpenAccess |
| Αριθμός Καταχώρησης: | edsbas.7B19B1A0 |
| Βάση Δεδομένων: | BASE |
καταχωρήστε σχόλιο πρώτοι!