Academic Journal
Вплив окиснення залишків цистеїну на конформаційну рухливість субфрагменту S1 міозину ІІ
| Title: | Вплив окиснення залишків цистеїну на конформаційну рухливість субфрагменту S1 міозину ІІ |
|---|---|
| Source: | Физика живого. |
| Publisher Information: | Киевский национальный университет им. Тараса Шевченко, 2010. |
| Publication Year: | 2010 |
| Subject Terms: | МІОЗИН II, СКЕЛЕТНІ М'ЯЗИ, МОДЕЛЮВАННЯ ЗА ГОМОЛОГІЄЮ, МОДЕЛЮВАННЯ МОЛЕКУЛЯРНОЇ ДИНАМІКИ, ОКИСНЕННЯ, ТІОЛЬНІ ГРУПИ, МИОЗИН ІІ, СКЕЛЕТНЫЕ МЫШЦЫ, МОДЕЛИРОВАНИЕ ПО ГОМОЛОГИИ, МОДЕЛИРОВАНИЕ МОЛЕКУЛЯРНОЙ ДИНАМИКИ, ОКИСЛЕНИЕ, ТИОЛЬНЫЕ ГРУППЫ |
| Description: | Побудована тривимірна модель субфрагменту S1 міозину ІІ скелетних м’язів кроля у пост-рігорній конформації. В якості шаблону застосовували файл з Протеїн дата банку 2mys, що є кристалографічною структурою голівки міозину ІІ скелетних м’язів курчати. В каталітичний центр моделі розміщено MgАТФ. За допомогою пакету програм Gromacs 4.0.7 у часовому інтервалі 7 нс здійснено моделювання молекулярної динаміки субфрагменту S1 міозину ІІ з нативними залишками цистеїну та з залишками цистеїну окисненими до цистеїнової кислоти. Встановлено, що окиснений міозин має більшу конформаційну рухливість, ніж нативний. Проаналізовано вплив окиснення окремих залишків цистеїну на конформаційну рухливість субфрагменту S1 міозину.Построена трехмерная модель субфрагмента S1 миозина II скелетных мышц кроля в пост-ригорной конформации. В качестве шаблона использовали файл Протеин дата банка 2mys, который представляет собой кристаллографическую структуру головки миозина II скелетных мышц цыпленка. В каталитический центр модели размещено MgАТФ. С помощью пакета программ Gromacs 4.0.7 во временном интервале 7 нс проведено моделирование молекулярной динамики субфрагмента S1 миозина II с нативными остатками цистеина и с остатками цистеина, окисленными до цистеиновой кислоты. Установлено, что окисленный миозин проявляет большую конформационную подвижность, чем нативный. Проанализировано влияние окисления отдельных остатков цистеина на конформационную подвижность субфрагмента S1 миозина. |
| Document Type: | Article |
| File Description: | text/html |
| Language: | Russian |
| ISSN: | 1023-2427 |
| Access URL: | http://cyberleninka.ru/article_covers/15556031.png http://cyberleninka.ru/article/n/vpliv-okisnennya-zalishkiv-tsisteyinu-na-konformatsiynu-ruhlivist-subfragmentu-s1-miozinu-ii |
| Accession Number: | edsair.od......2806..37e5692d13f3315156598b23ea78cbec |
| Database: | OpenAIRE |
| ISSN: | 10232427 |
|---|