Uniform dynamics of cohesin-mediated loop extrusion in living human cells

Συγγραφείς: Sabaté, Thomas, Lelandais, Benoît, Robert, Marie-Cécile, Szalay, Michael, Tinevez, Jean-Yves, Bertrand, Edouard, Zimmer, Christophe

Συνεισφορές: Walker, Mathilde

Πηγή: Nat Genet

Θεματικοί όροι: CCCTC-Binding Factor, Binding Sites, [PHYS.PHYS.PHYS-BIO-PH] Physics [physics]/Physics [physics]/Biological Physics [physics.bio-ph], Chromosomal Proteins, Non-Histone, Genome, Human, Journal Article, Humans, Cell Cycle Proteins, [SDV.GEN] Life Sciences [q-bio]/Genetics, Cohesins, Article, Chromatin

Περιγραφή αρχείου: application/pdf

Σύνδεσμος πρόσβασης: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41238959
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41238959/
https://doi.org/10.1038/s41588-025-02406-9
https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12695666/
https://dspace.library.uu.nl/handle/1874/468485
https://hal.science/hal-05527371v1/document
https://doi.org/10.1038/s41588-025-02406-9
https://hal.science/hal-05527371v1

Co-translational determination of quaternary structures in chaperone factories

Συγγραφείς: Philippe, Manon, Salloum, Soha, Slimani, Floric, Normanno, Davide, Barbosa, Isabelle, Chassé, Héloïse, Robert, Marie-Cécile, Urbach, Serge, Imbert, Jacques, Séveno, Martial, George, Simon, Le Hir, Hervé, Boulon, Séverine, Verheggen, Céline, Bertrand, Edouard

Συνεισφορές: Guerineau, Nathalie C.

Πηγή: Nat Commun

Θεματικοί όροι: [SDV.BC] Life Sciences [q-bio]/Cellular Biology, Article

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Σύνδεσμος πρόσβασης: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41577667
https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC12932852/
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/41577667/
https://doi.org/10.1038/s41467-026-68687-8
https://hal.science/hal-05482009v2/document
https://hal.science/hal-05482009v2
https://doi.org/10.1038/s41467-026-68687-8

G-quadruplexes are promoter elements controlling nucleosome exclusion and RNA polymerase II pausing

Συγγραφείς: Esnault, Cyril^{Aff1, IDs41588025022636_cor1}, Zine El Aabidine, Amal^Aff1, Robert, Marie-Cécile^{Aff1, Aff2, Aff3}, Cucchiarini, Anne^Aff4, Magat, Talha^Aff1, Pigeot, Alexia^Aff1, Bouchouika, Soumya^Aff1, Garcia-Oliver, Encar^Aff1, Gawron, Kevin^Aff1, Basyuk, Eugénia^{Aff1, Aff5}, Karpinska, Magdalena A.^{Aff1, Aff2, Aff3}, Kozulic-Pirher, Alja^{Aff1, Aff2}, Luo, Yu^{Aff4, Aff6}, Verga, Daniela^Aff6, Mourad, Raphael^Aff7, Radulescu, Ovidiu^Aff8, Mergny, Jean-Louis^Aff4, Bertrand, Edouard^{Aff1, Aff2, Aff3}, Andrau, Jean-Christophe^{Aff1, Aff9, IDs41588025022636_cor2}

Πηγή: Nature Genetics. 57(8):1981-1993

The HSP90/R2TP Quaternary Chaperone Scaffolds Assembly of the TSC Complex

Συγγραφείς: Abéza, Claire ^{1, 2, 3}, Busse, Philipp ^{4, 5}, Paiva, Ana C.F. ^{4, 5}, Chagot, Marie-Eve ⁶, Schneider, Justine ⁷, Robert, Marie-Cécile ^{1, 2, 3}, Vandermoere, Franck ⁸, Schaeffer, Christine ⁷, Charpentier, Bruno ⁶, Sousa, Pedro M.F. ⁴, Bandeiras, Tiago M. ⁴, Manival, Xavier ⁶, Cianferani, Sarah ⁷, Bertrand, Edouard ^{1, 2, 3, ⁎}, Verheggen, Céline ^{1, 2, 3, ⁎}

Πηγή: In Journal of Molecular Biology 1 December 2024 436(23)

NOPCHAP1 is a PAQosome cofactor that helps loading NOP58 on RUVBL1/2 during box C/D snoRNP biogenesis

Συγγραφείς: Abel, Yoann, C.F. Paiva, Ana, Bizarro, Jonathan, Chagot, Marie-Eve, Santo, Paulo E., Robert, Marie-Cécile, Quinternet, Marc, Vandermoere, Franck, M.F. Sousa, Pedro, Fort, Philippe, Charpentier, Bruno, Manival, Xavier, Bandeiras, Tiago M., Bertrand, Edouard, Verheggen, Céline

Συνεισφορές: Verheggen, Céline

Πηγή: Nucleic Acids Res

Θεματικοί όροι: Proteomics, 0301 basic medicine, Saccharomyces cerevisiae Proteins, Recombinant Fusion Proteins, Chaperone, Gene Knockout Techniques, 03 medical and health sciences, Adenosine Triphosphate, Protein Domains, Genes, Reporter, Ribonucleoproteins, Small Nucleolar, Protein Interaction Mapping, RNA and RNA-protein complexes, Humans, RNP biogenesis, HSP90 Heat-Shock Proteins, Eye Proteins, Multi-subunit complex assembly, PAQosome, DNA Helicases, Nuclear Proteins, Box C/D snoRNP, 3. Good health, [SDV] Life Sciences [q-bio], Multiprotein Complexes, ATPases Associated with Diverse Cellular Activities, Carrier Proteins, HeLa Cells, Molecular Chaperones

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Σύνδεσμος πρόσβασης: https://academic.oup.com/nar/article-pdf/49/2/1094/36084904/gkaa1226.pdf
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33367824

A Dual Protein-mRNA Localization Screen Reveals Compartmentalized Translation and Widespread Co-translational RNA Targeting

Συγγραφείς: Chouaib, Racha ^{1, 2, 3, 11, 12}, Safieddine, Adham ^{1, 2, 3, 11, 12}, Pichon, Xavier ^{1, 2, 12}, Imbert, Arthur ^{4, 5, 6, 12}, Kwon, Oh Sung ⁷, Samacoits, Aubin ^{8, 9}, Traboulsi, Abdel-Meneem ^{1, 2}, Robert, Marie-Cécile ^{1, 2}, Tsanov, Nikolay ^{1, 2}, Coleno, Emeline ^{1, 2}, Poser, Ina ¹⁰, Zimmer, Christophe ^{8, 9}, Hyman, Anthony ¹⁰, Le Hir, Hervé ⁷, Zibara, Kazem ^{3, 11}, Peter, Marion ^{1, 2}, Mueller, Florian ^{8, 9, ∗}, Walter, Thomas ^{4, 5, 6, ∗∗}, Bertrand, Edouard ^{1, 2, 13, ∗∗∗}

Πηγή: In Developmental Cell 28 September 2020 54(6):773-791

Universal dynamics of cohesin-mediated loop extrusion

Συγγραφείς: Sabaté, Thomas, Lelandais, Benoît, Robert, Marie-Cécile, Szalay, Michael, Tinevez, Jean-Yves, Bertrand, Edouard, Zimmer, Christophe

Συνεισφορές: Imagerie et Modélisation - Imaging and Modeling, Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Institut de génétique humaine (IGH), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Collège Doctoral, Sorbonne Université (SU), Hub d'analyse d'images - Image Analysis Hub (Platform) (IAH), Institut Pasteur Paris (IP)-Université Paris Cité (UPCité), Julius-Maximilians-Universität Würzburg = University of Würzburg Würsburg, Germany (JMU), We acknowledge and thank members of the MRI imaging facility, part of the nationalinfrastructure France-BioImaging supported by the French Nation Research Agency(ANR-10-INBS-04, Investments for the future)., T.S. was supported by aContrat Doctoral Spécifique aux Normaliens and Fondation ARC pour la recherchesur le cancer (ARCDOC 42021120004333). We also acknowledge Investissement d’Avenir grant ANR-16-CONV-0005 for funding computing resources used in thiswork., We acknowledge the help of the HPC Core Facility of the Institut Pasteur for the use of computing resources. We thank Xavier Pichon for the initial cloning of the splitGFP array., ANR-10-INBS-0004,France-BioImaging,Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée(2010), ANR-16-CONV-0005,INCEPTION,Institut Convergences pour l'étude de l'Emergence des Pathologies au Travers des Individus et des populatiONs(2016)

Πηγή: https://hal.science/hal-04780400 ; 2024.

Θεματικοί όροι: [SDV]Life Sciences [q-bio]

Relation: BIORXIV: 2024.08.09.605990

Διαθεσιμότητα: https://hal.science/hal-04780400
https://hal.science/hal-04780400v1/document
https://hal.science/hal-04780400v1/file/2024.08.09.605990v1.full.pdf
https://doi.org/10.1101/2024.08.09.605990

A single-molecule view of transcription reveals convoys of RNA polymerases and multi-scale bursting

Συγγραφείς: Tantale, Katjana, Mueller, Florian, Kozulic-Pirher, Alja, Lesne, Annick, Victor, Jean-Marc, Robert, Marie-Cécile, Capozi, Serena, Chouaib, Racha, Bäcker, Volker, Mateos-Langerak, Julio, Darzacq, Xavier, Zimmer, Christophe, Basyuk, Eugenia, Bertrand, Edouard

Πηγή: Nature Communications. 7(1)

Θεματικοί όροι: 31 Biological Sciences (for-2020), 3102 Bioinformatics and Computational Biology (for-2020), Biotechnology (rcdc), Infectious Diseases (rcdc), Genetics (rcdc), Sexually Transmitted Infections (rcdc), HIV/AIDS (rcdc), 1.1 Normal biological development and functioning (hrcs-rac), Generic health relevance (hrcs-hc), Base Sequence (mesh), Cell Survival (mesh), DNA-Directed RNA Polymerases (mesh), Gene Products, tat (mesh), HIV-1 (mesh), HeLa Cells (mesh), Humans (mesh), Kinetics (mesh), Models, Biological (mesh), Promoter Regions, Genetic (mesh), RNA (mesh), Single Molecule Imaging (mesh), TATA Box (mesh), TATA-Box Binding Protein (mesh), Transcription, Genetic (mesh), Hela Cells (mesh), Humans (mesh), HIV-1 (mesh), DNA-Directed RNA Polymerases (mesh), TATA-Box Binding Protein (mesh), Gene Products, tat (mesh), RNA (mesh), Cell Survival (mesh), Transcription, Genetic (mesh), Base Sequence (mesh), TATA Box (mesh), Kinetics (mesh), Models, Biological (mesh), Promoter Regions, Genetic (mesh), Single Molecule Imaging (mesh), Base Sequence (mesh), Cell Survival (mesh), DNA-Directed RNA Polymerases (mesh), Gene Products, tat (mesh), HIV-1 (mesh), HeLa Cells (mesh), Humans (mesh), Kinetics (mesh), Models, Biological (mesh), Promoter Regions, Genetic (mesh), RNA (mesh), Single Molecule Imaging (mesh), TATA Box (mesh), TATA-Box Binding Protein (mesh), Transcription, Genetic (mesh)

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Σύνδεσμος πρόσβασης: https://escholarship.org/uc/item/68w460sk
https://escholarship.org/content/qt68w460sk/qt68w460sk.pdf

The interaction between RPAP3 and TRBP reveals a possible involvement of the HSP90/R2TP chaperone complex in the regulation of miRNA activity

Συγγραφείς: Abel, Yoann, Charron, Christophe, Virciglio, Camille, Bourguignon-Igel, Valérie, Quinternet, Marc, Chagot, Marie-Eve, Robert, Marie-Cécile, Verheggen, Céline, Branlant, Christiane, Bertrand, Edouard, Manival, Xavier, Charpentier, Bruno, Rederstorff, Mathieu

Συνεισφορές: Ingénierie Moléculaire et Physiopathologie Articulaire (IMoPA), Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Ingénierie, Biologie et Santé en Lorraine (IBSLor), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Lorraine (UL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de génétique humaine (IGH), ANR-16-CE11-0032,snoRNPASSEMBLY,Comprendre l'assemblage des complexes macro-moléculaires en utilisant les snoRNP C/D comme modèle(2016)

Πηγή: ISSN: 0305-1048.

Θεματικοί όροι: [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology

Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/35150569; PUBMED: 35150569; PUBMEDCENTRAL: PMC8887487

Διαθεσιμότητα: https://hal.univ-lorraine.fr/hal-03583324
https://hal.univ-lorraine.fr/hal-03583324v1/document
https://hal.univ-lorraine.fr/hal-03583324v1/file/gkac086%2811%29.pdf
https://doi.org/10.1093/nar/gkac086

G-quadruplexes are promoter elements controlling nucleosome exclusion and RNA polymerase II pausing

Συγγραφείς: Esnault, Cyril, Garcia-Oliver, Encar, El Aabidine, Amal, Zine, Robert, Marie-Cécile, Magat, Talha, Gawron, Kevin, Basyuk, Eugénia, Karpinska, Magda, Pigeot, Alexia, Cucchiarini, Anne, Luo, Yu, Verga, Daniele, Mourad, Raphael, Radulescu, Ovidiu, Mergny, Jean-Louis, Bertrand, Edouard, Andrau, Jean-Christophe

Συνεισφορές: Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Institut de génétique humaine (IGH), Laboratoire d'Optique et Biosciences (LOB), École polytechnique (X), Institut Polytechnique de Paris (IP Paris)-Institut Polytechnique de Paris (IP Paris)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Chimie et modélisation pour la biologie du cancer (CMBC), Institut Curie Paris -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratory of Pathogen Host Interactions Montpellier (LPHI), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), ANR-18-CE12-0019,Epromoters,Contrôle de la réponse au stress par une nouvelle classe de promoteurs à activité enhancer(2018)

Πηγή: https://hal.science/hal-04286714 ; 2023.

Θεματικοί όροι: [SDV]Life Sciences [q-bio]

Relation: BIORXIV: 2023.02.24.529838

Διαθεσιμότητα: https://hal.science/hal-04286714
https://hal.science/hal-04286714v1/document
https://hal.science/hal-04286714v1/file/15_Esnault_et_al_BioRxiv_2023.pdf
https://doi.org/10.1101/2023.02.24.529838

Stochastic pausing at latent HIV-1 promoters generates transcriptional bursting

Συγγραφείς: Tantale, Katjana^{Aff1, Aff2}, Garcia-Oliver, Encar^Aff1, Robert, Marie-Cécile^{Aff1, Aff2, Aff3}, L’Hostis, Adèle^Aff4, Yang, Yueyuxiao^Aff4, Tsanov, Nikolay^{Aff1, Aff2}, Topno, Rachel^{Aff2, Aff3, Aff4}, Gostan, Thierry^Aff1, Kozulic-Pirher, Alja^{Aff1, Aff2}, Basu-Shrivastava, Meenakshi^{Aff1, Aff2}, Mukherjee, Kamalika^{Aff1, Aff2}, Slaninova, Vera^{Aff2, Aff3}, Andrau, Jean-Christophe^Aff1, Mueller, Florian^Aff5, Basyuk, Eugenia^{Aff1, Aff2, Aff6, IDs41467021244625_cor15}, Radulescu, Ovidiu^{Aff4, IDs41467021244625_cor16}, Bertrand, Edouard^{Aff1, Aff2, Aff3, IDs41467021244625_cor17}

Πηγή: Nature Communications. 12(1)

A choreography of centrosomal mRNAs reveals a conserved localization mechanism involving active polysome transport

Συγγραφείς: Safieddine, Adham^{Aff1, Aff2, Aff3, IDs41467021215857_cor1}, Coleno, Emeline^{Aff1, Aff2}, Salloum, Soha^{Aff1, Aff2, Aff3}, Imbert, Arthur^{Aff4, Aff5, Aff6}, Traboulsi, Abdel-Meneem^{Aff1, Aff2}, Kwon, Oh Sung^Aff7, Lionneton, Frederic^Aff8, Georget, Virginie^Aff8, Robert, Marie-Cécile^{Aff1, Aff2}, Gostan, Thierry^Aff1, Lecellier, Charles-Henri^{Aff1, Aff2}, Chouaib, Racha^{Aff1, Aff2, Aff3}, Pichon, Xavier^{Aff1, Aff2}, Le Hir, Hervé^Aff7, Zibara, Kazem^Aff3, Mueller, Florian^Aff9, Walter, Thomas^{Aff4, Aff5, Aff6}, Peter, Marion^{Aff1, Aff2}, Bertrand, Edouard^{Aff1, Aff2, Aff10, IDs41467021215857_cor19}

Πηγή: Nature Communications. 12(1)

New Generations of MS2 Variants and MCP Fusions to Detect Single mRNAs in Living Eukaryotic Cells

Συγγραφείς: Pichon, Xavier, Robert, Marie-Cécile, Bertrand, Edouard, Singer, Robert, Tutucci, Evelina

Συνεισφορές: Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Montpellier (UM), ANR-10-LABX-0012,EpiGenMed,From Genome and Epigenome to Molecular Medicine: turning new paradigms in biology into the therapeutic strategies of tomorrow(2010)

Πηγή: Methods in Molecular Biology ; https://hal.science/hal-03044742 ; Methods in Molecular Biology, pp.121-144, 2020, ⟨10.1007/978-1-0716-0712-1_7⟩

Θεματικοί όροι: [SDV]Life Sciences [q-bio]

Διαθεσιμότητα: https://hal.science/hal-03044742
https://hal.science/hal-03044742v1/document
https://hal.science/hal-03044742v1/file/Pichon_tutucci_New%20generations%20of%20MS2-MCP%20variants.pdf
https://doi.org/10.1007/978-1-0716-0712-1_7

The kinesin KIF1C transports APC-dependent mRNAs to cell protrusions

Συγγραφείς: Pichon, Xavier, Moissoglu, Konstadinos, Coleno, Emeline, Wang, Tianhong, Imbert, Arthur, Robert, Marie-Cecile, Peter, Marion, Chouaib, Racha, Walter, Thomas, Mueller, Florian, Zibara, Kazem, Bertrand, Edouard, Mili, Stavroula

Συνεισφορές: Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Equipe labellisée Ligue contre le Cancer, National Cancer Institute Bethesda (NCI-NIH), National Institutes of Health Bethesda, MD, USA (NIH), Institut de génétique humaine (IGH), Cancer et génome: Bioinformatique, biostatistiques et épidémiologie d'un système complexe, Mines Paris - PSL (École nationale supérieure des mines de Paris), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut Curie Paris -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), الجامعة اللبنانية بيروت = Lebanese University Beirut = Université libanaise Beyrouth (LU / ULB), Imagerie et Modélisation - Imaging and Modeling, Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité), Centre de Bioinformatique, Biostatistique et Biologie Intégrative (C3BI), Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), This project was supported by France BioImaging (ANR-10-INBS-04), the Agence Nationale de la Recherche (ANR-11-BSV8-018-02, ANR-14-CE10-0018-01 and ANR-19-CE12-0007-03), and the Ligue Nationale Contre le Cancer and the Fondation pour la Recherche Médicale. This work was supported by the Labex EpiGenMed, from the framework "Investissements d’avenir". This work was supported in part by the Intramural Research Program of the National Cancer Institute, NIH., ANR-10-INBS-0004,France-BioImaging,Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée(2010), ANR-11-BSV8-0018,EJCbirth,Impacts de la transcription par l'ARN polymérase II sur l'assemblage de l'EJC(2011), ANR-14-CE10-0018,HI-FISH,Etude systématique de l'expression des gènes à l'échelle des molécules uniques d'ARN(2014), ANR-19-CE12-0007,TRANSFACT,Caracterisation des foyers de traduction: de nouvelles structures qui organisement finement le cytoplasme(2019), ANR-10-LABX-0012,EpiGenMed,From Genome and Epigenome to Molecular Medicine: turning new paradigms in biology into the therapeutic strategies of tomorrow(2010)

Πηγή: ISSN: 1355-8382.

Θεματικοί όροι: RNA transport, cytoplasmic protrusions, local translation, RNA localization, [SDV]Life Sciences [q-bio]

Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/34493599; PUBMED: 34493599

Διαθεσιμότητα: https://hal.science/hal-03371977
https://hal.science/hal-03371977v1/document
https://hal.science/hal-03371977v1/file/2021-Pichon_RNA.pdf
https://doi.org/10.1261/rna.078576.120

Uniform dynamics of cohesin-mediated loop extrusion

Συγγραφείς: Sabaté, Thomas, Lelandais, Benoît, Robert, Marie-Cécile, Szalay, Michael, Tinevez, Jean-Yves, Bertrand, Edouard, Zimmer, Christophe

Relation: https://zenodo.org/records/16949930; oai:zenodo.org:16949930; https://doi.org/10.5281/zenodo.16949930

Διαθεσιμότητα: https://doi.org/10.5281/zenodo.16949930
https://zenodo.org/records/16949930

Single-Molecule DNA Footprinting and Transcription Imaging Reveal the Molecular Mechanisms of Promoter Dynamics

Συγγραφείς: Slaninova, Vera, Mazzarda, Flavia, Dalakishvili, Lasha, Depierre, David, Moene, Christina, Topno, Rachel, Escudier, Jean-Marc, Robert, Marie-Cécile, Cuvier, Olivier, Krebs, Arnaud, Molina, Nacho, Radulescu, Ovidiu, Bertrand, Edouard

Συνεισφορές: Synthèse et Physico-Chimie de Molécules d'Intérêt Biologique (SPCMIB), Institut de Chimie de Toulouse (ICT), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP), Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Biologie Intégrative (CBI), Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Unité de biologie Moléculaire, Cellulaire et du Développement (MCD), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre de Biologie Intégrative (CBI), Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Communauté d'universités et établissements de Toulouse (Comue de Toulouse)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de Génétique et de Biologie Moléculaire et Cellulaire (IGBMC), Université de Strasbourg (UNISTRA)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Strasbourg (UNISTRA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratory of Pathogen and Host Immunity Montpellier (LPHI), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Dynamique des interactions membranaires normales et pathologiques (DIMNP), Université Montpellier 1 (UM1)-Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratory of Pathogen Host Interactions Montpellier (LPHI), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Πηγή: https://hal.science/hal-05388172 ; 2025.

Θεματικοί όροι: [SDV]Life Sciences [q-bio]

Relation: BIORXIV: 2025.11.26.690466

Διαθεσιμότητα: https://hal.science/hal-05388172
https://doi.org/10.1101/2025.11.26.690466

A localization screen reveals translation factories and widespread co-translational RNA targeting

Συγγραφείς: Chouaib, Racha, Safieddine, Adham, Pichon, Xavier, Imbert, Arthur, Sung Kwon, Oh, Samacoits, Aubin, Traboulsi, Abdel-Meneem, Robert, Marie-Cécile, Tsanov, Nikolay, Coleno, Emeline, Poser, Ina, Zimmer, Christophe, Hyman, Anthony, A., Le Hir, Hervé, Zibara, Kazem, Peter, Marion, Mueller, Florian, ‘floyd’, Walter, Thomas, Bertrand, Edouard

Συνεισφορές: Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Equipe labelisée Ligue Contre le Cancer, Laboratory of Stem Cells Lebanese, Beirut (ER045-PRASE), الجامعة اللبنانية بيروت = Lebanese University Beirut = Université libanaise Beyrouth (LU / ULB), Faculty of Sciences Lebanese University, Equipe labellisée Ligue contre le Cancer, Centre de Bioinformatique (CBIO), Mines Paris - PSL (École nationale supérieure des mines de Paris), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL), Cancer et génome: Bioinformatique, biostatistiques et épidémiologie d'un système complexe, Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut Curie Paris -Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM), Institut de biologie de l'ENS Paris (IBENS), Département de Biologie - ENS-PSL (IBENS), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Imagerie et Modélisation - Imaging and Modeling, Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Centre de Bioinformatique, Biostatistique et Biologie Intégrative (C3BI), Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics (MPI-CBG), Max-Planck-Gesellschaft, Université Paris Sciences et Lettres (PSL), This project was supported by France BioImaging (ANR-10-INBS-04), the Agence Nationale de la Recherche (ANR-11-BSV8-018-02 and ANR-14-CE10-0018-01), the Institut Pasteur, the Ligue Nationale Contre le Cancer and the Fondation pour la Recherche Médicale (FRM grant to EB). This work was supported by the Labex EpiGenMed, from the framework "Investissements d’avenir"., ANR-10-INBS-0004,France-BioImaging,Développment d'une infrastructure française distribuée coordonnée(2010), ANR-14-CE10-0018,HI-FISH,Etude systématique de l'expression des gènes à l'échelle des molécules uniques d'ARN(2014)

Πηγή: https://pasteur.hal.science/pasteur-02873144 ; 2020.

Θεματικοί όροι: local translation, RNA transport, co-translational targeting +Equal contributions, smFISH, RNA localization, translation factories, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie

Διαθεσιμότητα: https://pasteur.hal.science/pasteur-02873144
https://pasteur.hal.science/pasteur-02873144v1/document
https://pasteur.hal.science/pasteur-02873144v1/file/2020.05.20.106989v1.full%20%281%29.pdf
https://doi.org/10.1101/2020.05.20.106989

Stochastic pausing at latent HIV-1 promoters generates transcriptional bursting

Συγγραφείς: Tantale, Katiana, Garcia-Oliver, Encarnation, L'Hostis, Adèle, Yang, Yueyuxio, Robert, Marie- Cécile, Gostan, Thierry, Basu, Meenakshi, Kozulic-Pirher, Alja, Andrau, Jean-Christophe, Müller, Florian, Basyuk, Eugenia, Radulescu, Ovidiu, Bertrand, Edouard

Συνεισφορές: Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Πηγή: https://hal.science/hal-03019157 ; 2020.

Θεματικοί όροι: transcriptional noise, polymerase pausing, HIV-1 latency, bursting, single molecule imaging, [SDV]Life Sciences [q-bio]

Διαθεσιμότητα: https://hal.science/hal-03019157
https://hal.science/hal-03019157v1/document
https://hal.science/hal-03019157v1/file/2020.08.25.265413v1.full.pdf
https://doi.org/10.1101/2020.08.25.265413

A conserved choreography of mRNAs at centrosomes reveals a localization mechanism involving active polysome transport

Συγγραφείς: Safieddine, Adham, Coleno, Emeline, Traboulsi, Abdel-Meneem, Kwon, Oh Sung, Lionneton, Frederic, Georget, Virginie, Robert, Marie-Cécile, Gostan, Thierry, Lecellier, Charles, Salloum, Soha, Chouaib, Racha, Pichon, Xavier, Le Hir, Hervé, Zibara, Kazem, Peter, Marion, Bertrand, Edouard

Συνεισφορές: Institut de Génétique Moléculaire de Montpellier (IGMM), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM), Institut de biologie de l'ENS Paris (UMR 8197/1024) (IBENS), Département de Biologie - ENS Paris, École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), BioCampus Montpellier (BCM), Université Montpellier 1 (UM1)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Lebanese University Beirut (LU)

Πηγή: https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03014936 ; 2020.

Θεματικοί όροι: high-throughput screening, ASPM, smFISH, cotranslational targeting, conserved polysome choreography at centrosomes mRNA localization, local translation, centrosomes, polysome imaging, NUMA1, [SDV]Life Sciences [q-bio]

Relation: hal-03014936; https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03014936; https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03014936/document; https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03014936/file/2020.09.04.282038v1.full.pdf; BIORXIV: 2020.09.04.282038

Διαθεσιμότητα: https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03014936
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03014936/document
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03014936/file/2020.09.04.282038v1.full.pdf
https://doi.org/10.1101/2020.09.04.282038

CBC–ARS2 stimulates 3′-end maturation of multiple RNA families and favors cap-proximal processing

Συγγραφείς: Hallais, Marie, Pontvianne, Frédéric, Refsing Andersen, Peter, Clerici, Marcello, Lener, Daniela, Benbahouche, Nour El Houda, Gostan, Thierry, Vandermoere, Franck, Robert, Marie-Cécile, Cusack, Stephen, Verheggen, Céline, Jensen, Torben Heick, Bertrand, Edouard

Συνεισφορές: Böttger, Sonja

Πηγή: Hallais, M, Pontvianne, F, Andersen, P R, Clerici, M, Lener, D, Benbahouche, N E H, Gostan, T, Vandermoere, F, Robert, M-C, Cusack, S, Verheggen, C, Jensen, T H & Bertrand, E 2013, 'CBC-ARS2 stimulates 3'-end maturation of multiple RNA families and favors cap-proximal processing', Nature Structural and Molecular Biology, vol. 20, no. 12, pp. 1358-1366. https://doi.org/10.1038/nsmb.2720

Θεματικοί όροι: 0301 basic medicine, Nucleocytoplasmic Transport Proteins, 0303 health sciences, 03 medical and health sciences, Models, Genetic, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Humans, Nuclear Proteins, RNA 3' End Processing, Phosphoproteins, Poly A, Nuclear Cap-Binding Protein Complex, HeLa Cells

Περιγραφή αρχείου: application/pdf

Σύνδεσμος πρόσβασης: https://pure.au.dk/ws/files/81415309/Hallais_et_al._2013.pdf
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24270878
https://hal.science/hal-02191615v1
https://doi.org/10.1038/nsmb.2720
https://hal.science/hal-02191615v1/document
https://pure.au.dk/ws/files/81415309/Hallais_et_al._2013.pdf
https://doi.org/10.1038/nsmb.2720
https://pure.au.dk/portal/en/publications/6fed95f9-30c1-46f6-bbe5-5097eb64d861