Genomic surveillance of HIV infection in the Russian Federation ; Геномный эпидемиологический надзор за ВИЧ-инфекцией в Российской Федерации

Authors: D. E. Kireev, A. A. Kirichenko, V. G. Akimkin, Д. Е. Киреев, А. А. Кириченко, В. Г. Акимкин

Contributors: Работа выполнена в рамках выполнения государственного задания НИОКТР № ААААА21–121011990056–9 «Разработка новых методик и подходов для совершенствования лабораторной диагностики и эпидемиологического надзора за ВИЧ-инфекцией».

Source: HIV Infection and Immunosuppressive Disorders; Том 16, № 4 (2024); 17-27 ; ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии; Том 16, № 4 (2024); 17-27 ; 2077-9828 ; 10.22328/2077-9828-2024-16-4

Subject Terms: лекарственная устойчивость, surveillance, genomic surveillance, sequencing, nucleotide sequence, genome, molecular cluster, drug resistance, эпидемиологический надзор, геномный эпидемиологический надзор, секвенирование, нуклеотидная последовательность, геном, молекулярный кластер

File Description: application/pdf

Relation: https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/960/611; World Health Organization. HIV statistics, globally and by WHO region, 2023. Epidemiological fact sheet. https://cdn.who.int/media/docs/default-source/hq-hiv-hepatitis-and-stis-library/j0294-who-hiv-epi-factsheet-v7.pdf.; Соколова Е.В., Ладная Н.Н., Покровский В.В. и др. Влияние антиретровирусной терапии на развитие эпидемии ВИЧ-инфекции в Российской Федерации // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2023. Т. 13, № 3. С. 20–26. doi:10.18565/epidem.2023.13.3.20-6.; Покровский В.В., Ладная Н.Н., Соколова Е.В. ВИЧ-инфекция. Информационный бюллетень № 47. М.: Специализированный научно-исследовательский отдел по профилактике и борьбе со СПИДом ФБУН ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, 2023.; Kirichenko A., Kireev D., Lapovok I. et al. Prevalence of Pretreatment HIV-1 Drug Resistance in Armenia in 2017–2018 and 2020–2021 following a WHO Survey // Viruses. 2022. Vol. 14, No. 11. Р. 2320. doi:10.3390/v14112320.; World Health Organization. Global genomic surveillance strategy for pathogens with pandemic and epidemic potential, 2022–2032. Geneva, 2022. https://www.who.int/publications/i/item/9789240046979.; Акимкин В.Г., Семененко Т.А., Хафизов К.Ф. и др. Стратегия геномного эпидемиологического надзора. Проблемы и перспективы // Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2024. Т. 101, № 2. С. 163–172. doi:10.36233/0372-9311-507.; Poon A.F., Gustafson R., Daly P. et al. Near real-time monitoring of HIV transmission hotspots from routine HIV genotyping: an implementation case study // Lancet HIV. 2016. Vol. 3, No. 5. Р. e231–e238. doi:10.1016/S2352–3018(16)00046-1.; Howison M., Gillani F.S., Novitsky V. et al. An Automated Bioinformatics Pipeline Informing Near-Real-Time Public Health Responses to New HIV Diagnoses in a Statewide HIV Epidemic // Viruses. 2023. Vol. 15, No. 3. Р. 737. doi:10.3390/v15030737.; Hanke K., Rykalina V., Koppe U. et al. Developing a next level integrated genomic surveillance: Advances in the molecular epidemiology of HIV in Germany // International journal of medical microbiology, 2024. Vol. 314, No. 151606. doi:10.1016/j.ijmm.2024.151606.; Методические указания МУ 3.1.3342-16 «Эпидемиологический надзор за ВИЧ-инфекцией». М., 2016.; Larder B.A., Darby G., Richman D.D. HIV with reduced sensitivity to zidovudine (AZT) isolated during prolonged therapy // Science. 1989. Vol. 243, No. 4899. Р. 1731–1734. doi:10.1126/science.2467383.; World Health Organization. HIV drug resistance: brief report 2024. Geneva, 2024. https://www.who.int/publications/i/item/9789240086319.; Lazzari S., de Felici A., Sobel H., Bertagnolio S. HIV drug resistance surveillance: summary of an April 2003 WHO consultation // AIDS. 2004. Vol. 18. Р. S49–S53. doi:10.1097/00002030-200406003-00010.; World Health Organization. HIV drug resistance strategy, 2021 update. Geneva, 2021.; Методические рекомендации МР 3.1.5.0075/1-13. 3.1.5. «Эпидемиология. Профилактика инфекционных болезней. ВИЧ-инфекции. Надзор за распространением штаммов ВИЧ, резистентных к антиретровирусным препаратам». М., 2013.; Wertheim J.O., Kosakovsky Pond S.L., Forgione L.A. et al. Social and Genetic Networks of HIV-1 Transmission in New York City // PLoS pathogens. 2017. Vol. 13, No. 1. Р. e1006000. doi:10.1371/journal.ppat.1006000.; Balfe P., Simmonds P., Ludlam C.A. et al. Concurrent evolution of human immunodeficiency virus type 1 in patients infected from the same source: rate of sequence change and low frequency of inactivating mutations // Journal of virology. 1990. Vol. 64, No. 12. Р. 6221–6233. doi:10.1128/JVI.64.12.6221-6233.1990.; Ou C.Y., Ciesielski C.A., Myers G. et al. Molecular epidemiology of HIV transmission in a dental practice // Science. 1992. Vol. 256, No. 5060. Р. 1165–1171. doi:10.1126/science.256.5060.1165.; Bernard E.J., Azad Y., Vandamme A.M. et al. HIV forensics: pitfalls and acceptable standards in the use of phylogenetic analysis as evidence in criminal investigations of HIV transmission // HIV medicine. 2007. Vol. 8, No. 6. Р. 382–387. doi:10.1111/j.1468-1293.2007.00486.x.; Сандырева Т.П., Герасимова Н.А., Лопатухин А.Э. и др. Филогенетический анализ в эпидемиологических расследованиях случаев ВИЧ-инфекции // Эпидемиология и инфекционные болезни, 2014. Т. 19, № 1. С. 17–21.; Санитарно-эпидемиологические правила СП 3.1.5.2826–10 «Профилактика ВИЧ-инфекции». М., 2011.; Abecasis A.B., Pingarilho M., Vandamme A.M. Phylogenetic analysis as a forensic tool in HIV transmission investigations // AIDS. 2018. Vol. 32, No. 5. Р. 543–554. doi:10.1097/QAD.0000000000001728.; Wymant C., Hall M., Ratmann O. et al. STOP-HCV Consortium, The Maela Pneumococcal Collaboration, The BEEHIVE Collaboration. PHY-LOSCANNER: Inferring Transmission from Within- and Between-Host Pathogen Genetic Diversity // Molecular biology and evolution. 2018. Vol. 35, No. 3. Р. 719–733. doi:10.1093/molbev/msx304.; Shimotohno K., Golde D.W., Miwa M. et al. Nucleotide sequence analysis of the long terminal repeat of human T-cell leukemia virus type II // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 1984. Vol. 81, No. 4. Р. 1079–1083. doi:10.1073/pnas.81.4.1079.; Ratner L., Haseltine W., Patarca R. et al. Complete nucleotide sequence of the AIDS virus, HTLV-III // Nature. 1985. Vol. 313, No. 6000. Р. 277–284. doi:10.1038/313277a0.; Abecasis A., Vandamme A.M. Origin and Distribution of HIV-1 Subtypes // Encyclopedia of AIDS. N.Y.: Springer, 2015. doi:10.1007/978-14614-9610-6_130-2.; Лаповок И.А., Лопатухин А.Э., Киреев Д.Е. и др. Молекулярно-эпидемиологический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в России в 1987–2015 гг. // Терапевтический архив. 2017. Т. 89, № 11. С. 44–49. doi:10.17116/terarkh2017891144-49.; Baryshev P.B., Bogachev V.V., Gashnikova N.M. HIV-1 genetic diversity in Russia: CRF63_02A1, a new HIV type 1 genetic variant spreading in Siberia // AIDS research and human retroviruses. 2014. Vol. 30, No. 6. Р. 592–597. doi:10.1089/aid.2013.0196.; Сивай М.В., Екушов В.Е., Зырянова Д.П. и др. Реконструкция эпидемии, вызванной CRF63_02A ВИЧ-1 // Молекулярная диагностика и биобезопасность-2022: сборник материалов конгресса с международным участием, Москва, 27–28 апреля 2022 года. Москва: ФБУН ЦНИИ эпидемиологии Роспотребнадзора, 2022. С. 107.; Murzakova A., Kireev D., Baryshev P. et al. Molecular Epidemiology of HIV-1 Subtype G in the Russian Federation // Viruses. 2019. Vol. 11, No. 4. Р. 348. doi:10.3390/v11040348.; Акимкин В.Г., Хафизов К.Ф., Дубоделов Д.В. и др. Молекулярно-генетический мониторинг и технологии цифровой трансформации в современной эпидемиологии // Вестник Российской академии медицинских наук. 2023. Т. 78, № 4. С. 363–369. doi:10.15690/vramn13672.; Kuleshov K.V., Vodop’ianov S.O., Dedkov V.G. et al. Travel-Associated Vibrio cholerae O1 El Tor, Russia // Emerging infectious diseases. 2016. Vol. 22, No. 11. Р. 2006–2008. doi:10.3201/eid2211.151727.; Кулешов К.В., Павлова А.С., Егорова А.E. и др. Филогеномный анализ изолятов Salmonella enterica subsp. enterica серовар Enteritidis, ассоциированных со спорадической и групповой заболеваемостью в России // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы. 2023. Т. 13, № 2. С. 76–82.doi:10.18565/epidem.2023.13.2.76-82.; Киреев Д.Е., Кириченко А.А., Осадчая О.А. и др. Связанность эпидемий ВИЧ-инфекции в республике Армения и Российской Федерации // Эпидемиология и инфекционные болезни. Актуальные вопросы, 2023. Т. 13, № 2. С. 27–34. doi:10.18565/epidem.2023.13.3.27-34.; Worobey M., Watts T.D., McKay R.A. et al. 1970s and ‚Patient 0’ HIV-1 genomes illuminate early HIV/AIDS history in North America // Nature. 2016. Vol. 539, No. 7627. Р. 98–101. doi:10.1038/nature19827.; Díez-Fuertes F., Cabello M., Thomson M.M. Bayesian phylogeographic analyses clarify the origin of the HIV-1 subtype A variant circulating in former Soviet Union’s countries. Infection, genetics and evolution // Infect. Genet Evol. 2015. Vol. 33, Р. 197–205. doi:10.1016/j.meegid.2015.05.003; Paraskevis D., Pybus O., Magiorkinis G. et al. SPREAD Programme. Tracing the HIV-1 subtype B mobility in Europe: a phylogeographic approach // Retrovirology. 2009. Vol. 6, No. 49. doi:10.1186/1742-4690-6-49.; Du L., Wu J., Qian P. et al. Phylogeographical Analysis Reveals Distinct Sources of HIV-1 and HCV Transmitted to Former Blood Donors in China // AIDS research and human retroviruses. 2017. Vol. 33, No. 3. Р. 284–289. doi:10.1089/AID.2016.0147.; Lai A., Bozzi G., Franzetti M. et al. HIV-1 A1 Subtype Epidemic in Italy Originated from Africa and Eastern Europe and Shows a High Frequency of Transmission Chains Involving Intravenous Drug Users // PloS One. 2016. Vol. 11, No. 1. Р. e0146097. doi:10.1371/journal.pone.0146097.; Phillips A.N., Sabin C., Pillay D., Lundgren J.D. HIV in the UK 1980–2006: reconstruction using a model of HIV infection and the effect of anti-retroviral therapy // HIV medicine. 2007. Vol. 8, No. 8. Р. 536–546. doi:10.1111/j.1468–1293.2007.00507.x.; Volz E.M., Kosakovsky Pond S.L., Ward M.J. et al. Phylodynamics of infectious disease epidemics // Genetics. 2009. Vol. 183, No. 4. Р. 1421– 1430. doi:10.1534/genetics.109.106021.; Dennis A. M., Hué S., Billock R. et al. Human Immunodeficiency Virus Type 1 Phylodynamics to Detect and Characterize Active Transmission Clusters in North Carolina // The Journal of infectious diseases. 2020. Vol. 221, No. 8, Р. 1321–1330. doi:10.1093/infdis/jiz176.; Jovanović L., Šiljić, M., Ćirković V. et al. Exploring Evolutionary and Transmission Dynamics of HIV Epidemic in Serbia: Bridging Socio-Demographic With Phylogenetic Approach // Frontiers in microbiology. 2019. Vol. 10, No. 287. doi:10.3389/fmicb.2019.00287.; Volz E.M., Ionides E., Romero-Severson E.O. et al. HIV-1 transmission during early infection in men who have sex with men: a phylodynamic analysis // PLoS medicine. 2013. Vol. 10, No. 12. Р. e1001568. doi:10.1371/journal.pmed.1001568.; Novitsky V., Kühnert D., Moyo S. et al. Phylodynamic analysis of HIV sub-epidemics in Mochudi, Botswana // Epidemics. 2015. Vol. 13. Р. 44–55. doi:10.1016/j.epidem.2015.07.002.; Stadler T., Kouyos R., von Wyl V. et al. Swiss HIV Cohort Study. Estimating the basic reproductive number from viral sequence data // Molecular biology and evolution. 2012. Vol. 29, No. 1. Р. 347–357. doi:10.1093/molbev/msr217.; Gray R.R., Tatem A.J., Lamers S. et al. Spatial phylodynamics of HIV-1 epidemic emergence in east Africa // AIDS. 2009. Vol. 23, No. 14. Р. F9– F17. doi:10.1097/QAD.0b013e32832faf61.; Skar H., Axelsson M., Berggren I. et al. Dynamics of two separate but linked HIV-1 CRF01_AE outbreaks among injection drug users in Stockholm, Sweden, and Helsinki, Finland // Journal of virology, 2011. Vol. 85, No. 1. Р. 510–518. doi:10.1128/JVI.01413–10.; Peters P.J., Pontones P., Hoover K.W. et al. Indiana HIV Outbreak Investigation Team. HIV Infection Linked to Injection Use of Oxymorphone in Indiana, 2014–2015 // The New England journal of medicine. 2016. Vol. 375, No. 3. Р. 229–239. doi:10.1056/NEJMoa1515195.; Golden M.R., Lechtenberg R., Glick S.N. et al. Outbreak of Human Immunodeficiency Virus Infection Among Heterosexual Persons Who Are Living Homeless and Inject Drugs — Seattle, Washington, 2018 // MMWR. Morbidity and mortality weekly report. 2019. Vol. 68, No. 15. Р. 344–349. doi:10.15585/mmwr.mm6815a2.; Alpren C., Dawson E. L., John B. et al. Opioid Use Fueling HIV Transmission in an Urban Setting: An Outbreak of HIV Infection Among People Who Inject Drugs-Massachusetts, 2015–2018 // American journal of public health. 2020. Vol. 110, No. 1. Р. 37–44. doi:10.2105/AJPH.2019.305366.; Tookes H., Bartholomew T.S., Geary S. et al. Rapid Identification and Investigation of an HIV Risk Network Among People Who Inject Drugs-Miami, FL, 2018 // AIDS and behavior, 2020. Vol. 24, No. 1. Р. 246–256. doi:10.1007/s10461-019-02680-9.; Metcalfe R., Ragonnet-Cronin M., Bradley-Stewart A. et al. From hospital to the community: redesigning the human immunodeficiency virus (HIV) clinical service model to respond to an outbreak of HIV among people who inject drugs // The Journal of infectious diseases. 2020. Vol. 222. Р. S410–S419. doi:10.1093/infdis/jiaa336.; Bavinton B.R., Jin F., Prestage G. et al.; Opposites Attract Study Group. The Opposites Attract Study of viral load, HIV treatment and HIV transmission in serodiscordant homosexual male couples: design and methods // BMC public health. 2014. Vol. 14, No. 917. doi:10.1186/1471-2458-14-917.; Cohen M. S., Chen Y. Q., McCauley M. et al.; HPTN 052 Study Team. Antiretroviral Therapy for the Prevention of HIV-1 Transmission // The New England journal of medicine. 2016. Vol. 375, No. 9. Р. 830–839. doi:10.1056/NEJMoa1600693.; Rodger A.J., Cambiano V., Bruun T. et al.; PARTNER Study Group. Risk of HIV transmission through condomless sex in serodifferent gay couples with the HIV-positive partner taking suppressive antiretroviral therapy (PARTNER): final results of a multicentre, prospective, observational study // Lancet. 2019. Vol. 393, No. 10189. Р. 2428–2438. doi:10.1016/S0140-6736(19)30418-0.; EACS Guidelines version 12.0, October 2023; CDC. Detecting and responding to HIV transmission clusters. A guide for health departments. Draft version 2.0. June 2018.; Lou J., Wu J., Chen L., Ruan Y., Shao Y. A sex-role-preference model for HIV transmission among men who have sex with men in China // BMC public health. 2009. Vol. 9, No. 1. Р. S10. doi:10.1186/1471-2458-9-S1-S10.; Kwon Y. M., Yeun E. J., Kim H. Y., Youn M. S., Cho J. Y., Lee H. J. Application of the transtheoretical model to identify aspects influencing condom use among Korean college students // Western journal of nursing research. 2008. Vol. 30, No. 8. Р. 991–1004. doi:10.1177/0193945908319988.; Wang Z., Zhang Z., Zhang C., Jin X., Wu J., Su B., Shen Y., Ruan Y., Xing H., Lou J. Trace the History of HIV and Predict Its Future through Genetic Sequences // Tropical medicine and infectious disease. 2022. Vol. 7, No. 8, Р. 190. doi:10.3390/tropicalmed7080190.; Novitsky V., Moyo S., Le, Q., DeGruttola V., Essex M. Impact of sampling density on the extent of HIV clustering // AIDS research and human retroviruses. 2014. Vol. 30, No. 12. Р. 1226–1235. doi:10.1089/aid.2014.0173.; Mazrouee S., Hallmark C. J., Mora R., Del Vecchio N., Carrasco Hernandez R., Carr M., McNeese M., Fujimoto K., Wertheim J. O. Impact of molecular sequence data completeness on HIV cluster detection and a network science approach to enhance detection // Scientific reports. 2022. Vol. 12, No. 1. Р. 19230. doi:10.1038/s41598-022-21924-8.

Availability: https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/960
https://doi.org/10.22328/2077-9828-2024-16-4-17-27

Analysis of Peculiarities of Epidemiological Situation on Cholera in the World and in the Russian Federation in 2024 and Forecast of its Development in 2025 ; Анализ особенностей эпидемиологической ситуации по холере в 2024 г. в мире, в Российской Федерации и прогноз ее развития на 2025 г.

Authors: V. D. Kruglikov, N. E. Gaevskaya, E. V. Monakhova, E. A. Moskvitina, V. V. Agafonova, I. V. Savina, O. A. Podoynitsyna, N. A. Selyanskaya, A. S. Vodop’yanov, O. V. Duvanova, E. A. Men’shikova, M. I. Ezhova, E. S. Shipko, A. V. Evteev, V. S. Kaz’mina, P. V. Bodraya, E. N. Sokirkina, В. Д. Кругликов, Н. Е. Гаевская, Е. В. Монахова, Э. А. Москвитина, В. В. Агафонова, И. В. Савина, О. А. Подойницына, Н. А. Селянская, А. С. Водопьянов, О. В. Дуванова, Е. А. Меньшикова, М. И. Ежова, Е. С. Шипко, А. В. Евтеев, В. С. Казьмина, П. В. Бодрая, Е. Н. Сокиркина

Source: Problems of Particularly Dangerous Infections; № 1 (2025); 35-47 ; Проблемы особо опасных инфекций; № 1 (2025); 35-47 ; 2658-719X ; 0370-1069

Subject Terms: прогноз, proactive epidemiological surveillance, epidemiological situation, toxigenic and non-toxigenic strains, Vibrio cholerae O1/O139 and nonO1/nonO139, acute intestinal infections, extra-intestinal infections, bioinformatics analysis, prognosis, проактивный эпидемиологический надзор, эпидемиологическая ситуация, токсигенные и нетоксигенные штаммы, Vibrio cholerae О1/O139 и nonO1/nonO139, ОКИ, внекишечные инфекции, биоинформационный анализ

File Description: application/pdf

Relation: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/2114/1542; Попова А.Ю., Носков А.К., Ежлова Е.Б., Кругликов В.Д., Монахова Е.В., Чемисова О.С., Лопатин А.А., Иванова С.М., Подойницына О.А., Водопьянов А.С., Левченко Д.А., Савина И.В. Эпидемиологическая ситуация по холере в Российской Федерации в 2023 г. и прогноз на 2024 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2024; (1):76–88. DOI:10.21055/0370-1069-2024-1-76-88.; Ali M., Nelson A.R., Lopez A.L., Sack D.A. Updated global burden of cholera in endemic countries. PLoS Negl. Trop. Dis. 2015; 9(6):e0003832. DOI:10.1371/journal.pntd.0003832.; Cholera, 2015. Wkly Epidem. Rec. WHO. 2016; 91(38):433–40. [Электронный ресурс]. URL: https://iris.who.int/bitstream/handle/10665/250142/WER9138.pdf?sequence=1.; Cholera, 2016. Wkly Epidem. Rec. WHO. 2017; 92(36):521– 36. [Электронный ресурс]. URL: https://iris.who.int/bitstream/handle/10665/258910/WER9236.pdf?sequence=1.; Cholera, 2017. Wkly Epidem. Rec. WHO. 2018; 93(38):489– 97. [Электронный ресурс]. URL: https://iris.who.int/bitstream/handle/10665/274654/WER9338.pdf?ua=1.; Cholera, 2018. Wkly Epidem. Rec. WHO. 2019; 94(48):561– 80. [Электронный ресурс]. URL: https://iris.who.int/bitstream/handle/10665/274654/WER9448.pdf?ua=1.; Cholera, 2019. Wkly Epidem. Rec. WHO. 2020; 95(37):441–8. [Электронный ресурс]. URL: https://iris.who.int/bitstream/handle/10665/334241/WER9537-eng-fre.pdf?ua=1.; Cholera, 2020. Wkly Epidem. Rec. WHO. 2021; 96(37):445–60. [Электронный ресурс]. URL: https://iris.who.int/bitstream/handle/10665/345267/WER9637-eng-fre.pdf.; Cholera, 2021. Wkly Epidem. Rec. WHO. 2022; 97(37):453– 64. [Электронный ресурс]. URL: http://iris.who.int/bitstream/handle/10665/362852/WER9737-eng-fre.pdf.; Cholera, 2022. Wkly Epidem. Rec. WHO. 2023; 98(38):431–52. [Электронный ресурс]. URL: http://iris.who.int/bitstream/handle/10665/372986/WER9838-eng-fre.pdf.; Cholera, 2023. Wkly Epidem. Rec. WHO. 2024; 98(36):481–94. [Электронный ресурс]. URL: http://iris.who.int/bitstream/handle/10665/378714/WER9936-eng-fre.pdf (дата обращения 20.09.2024).; Data show marked increase in annual cholera deaths. WHO [EN/FR/ZH]. [Электронный ресурс]. URL: https://www.who.int/news/item/04-09-2024-data-show-marked-increase-in-annual-cholera-deaths (дата обращения 06.09.2024).; Communicable disease threats report, 17–23 December 2023, week 51. [Электронный ресурс]. URL: https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/communicable-disease-threats-report17-23-december-2023-week-51.; PRO/EDR> Cholera, diarrhea & dysentery update (19): Africa (West Africa). WAHOO. ArchiveNumber: 20240512.8716469. [Электронный ресурс]. URL: https://promedmail.org/promedpost/?id=8716469 (дата обращения 13.05.2024).; Global Cholera and Acute Watery Diarrhoea (AWD) Dashboard. [Электронный ресурс]. URL: https://who-globalcholera-and-awd-dashboard-1-who.hub.arcgis.com/ (дата обращения 23.12.2024).; Ng Q.X., De Deyn M.L.Z.Q., Loke W., Yeo W.S. Yemen’s cholera epidemic is a one health issue. J. Prev. Med. Public Health. 2020; 53(4):289–92. DOI:10.3961/jpmph.20.154.; Yemen reports the highest burden of cholera globally [EN/ AR]. [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/report/yemen/yemen-reports-highest-burden-cholera-globally-enar (дата обращения 24.12.2024).; UNICEF Afghanistan Humanitarian Situation Report. No. 10, 1–31 October 2024. [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/report/afghanistan/unicef-afghanistan-humanitariansituation-report-no-10-1-31-october-2024 (дата обращения 21.11.2024).; Africa CDC Weekly Event Based Surveillance Report, December 2024. [Электронный ресурс]. URL: https://africacdc.org/download/africa-cdc-weekly-event-based-surveillance-reportdecember-2024/ (дата обращения 18.12.2024).; Décès communautaires de cas suspects de choléra (ACT_ DES_15092024). [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/report/haiti/deces-communautaires-de-cas-suspects-de-choleraactdes15092024 (дата обращения 10.12.2024).; Haiti_Factsheet: MSNA Haïti 2024: Artibonite – juillet 2024. [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/report/haiti/factsheet-msna-haiti-2024-artibonite-juillet-2024 (дата обращения 16.12.2024).; PAHO urges protection of medical facilities and services in Haiti to ensure continued access amid escalating conflict. [Электронный ресурс]. URL: https://reliefweb.int/report/haiti/paho-urges-protection-medical-facilities-and-services-haiti-ensurecontinued-access-amid-escalating-conflict (дата обращения 24.12.2024).; Communicable disease threats report. Week 11, 10–16 March 2024. [Электронный ресурс]. URL: https://www.ecdc.europa.eu/en/publications-data/communicable-disease-threatsreport-10-16-march-2024-week-11 (дата обращения 18.03.2024).; Martins-Filho P.R., Alves Dos Santos C. Potential re-emergence of cholera in Brazil. Lancet Reg. Health. Am. 2024; 34:100767. DOI:10.1016/j.lana.2024.100767.; PRO/PORT> Colera – Brasil (BA), caso confirmado, autóctone, fonte de infecção desconhecida. Archive Number: 20240421.8716081. [Электронный ресурс]. URL: https://promedmail.org/promed-post/?id=8716081 (дата обращения 22.04.2024).; Янович Е.Г., Москвитина Э.А. Эпидемиологические риски: значение при районировании административных территорий и в активизации эпидемического процесса при инфекционных болезнях. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2019; 18(6):81–9. DOI:10.31631/2073-3046-2019-18-6-81-89.; PRO/EDR> Cholera, diarrhea & dysentery update (18): France (MT) fatal. Archive Number: 20240512.8716458. [Электронный ресурс]. URL: https://promedmail.org/promedpost/?id=8716458 (дата обращения 13.05.2024).; Газета.ru: Обнаружен штамм холеры, устойчивый к 10 антибиотикам. [Электронный ресурс]. URL: https://www.gazeta.ru/science/news/2024/12/17/24644546.shtml (дата обращения 17.12.2024).; Rouard C., Collet L., Njamkepo E., Jenkin C., Sacheli R., Benoit-Cattin T., Figoni J., Weill F.-X. Long-distance spread of a highly drug-resistant epidemic cholera. N. Engl. J. Med. 2024; 391(23):2271–3. DOI:10.1056/NEJMc2408761.; Lassalle F., Al-Shalali S., Al-Hakimi M., Njamkepo E., Bashir I.M., Dorman M.J., Rauzier J., Blackwell G.A., Taylor-Brown A., Beale M.A., Cazares A., Al-Somainy A.A., Al-Mahbashi A., Almoayed K., Aldawla M., Al-Harazi A., Quilici M.L., Weill F.X., Dhabaan G., Thomson N.R. Genomic epidemiology reveals multidrug resistant plasmid spread between Vibrio cholerae lineages in Yemen. Nat. Microbiol. 2023; 8(10):1787–98. DOI:10.1038/s41564-023-01472-1.; Ranjbar R., Sadeghy J., Shokri Moghadam M., Bakhshi B. Multi-locus variable number tandem repeat analysis of Vibrio cholerae isolates from 2012 to 2013 cholera outbreaks in Iran. Microb. Pathog. 2016; (97):84–8. DOI:10.1016/j.micpath.2016.05.023.; Bhattacharya D., Dey S., Roy S., Parande M.V., Telsang M., Seem M.H., Parande A.V., Mantur B.G. Multidrug-resistant Vibrio cholerae O1 was responsible for a cholera outbreak in 2013 in Bagalkot, North Karnataka. Jpn. J. Infect. Dis. 2015; 68(4):347–50. DOI:10.7883/yoken.JJID.2014.257.; Wang R., Yu D., Yue J., Kan B. Variations in SXT elements in epidemic Vibrio cholerae O1 El Tor strains in China. Sci. Rep. 2016; 6:22733. DOI:10.1038/srep22733.; Eibach D., Herrera-León S., Gil H., Hogan B., Ehlkes L., Adjabeng M., Kreuels B., Nagel M., Opare D., Fobil J.N., May J. Molecular epidemiology and antibiotic susceptibility of Vibrio cholerae associated with a large cholera outbreak in Ghana in 2014. PLoS Negl. Trop. Dis. 2016; 10(5):e0004751. DOI:10.1371/journal. pntd.0004751.; Irenge L.M., Ambroise J., Mitangala P.N., Bearzatto B., Kabangwa R.K.S., Duran J.F., Gala J.L. Genomic analysis of pathogenic isolates of Vibrio cholerae from eastern Democratic Republic of the Congo (2014–2017). PLoS Negl. Trop. Dis. 2020; 14(4):e0007642. DOI:10.1371/journal.pntd.0007642.; Mashe T., Domman D., Tarupiwa A., Manangazira P., Phiri I., Masunda K., Chonzi P., Njamkepo E., Ramudzulu M., MtapuriZinyowera S., Smith A.M., Weill F.X. Highly resistant cholera outbreak strain in Zimbabwe. N. Engl. J. Med. 2020; 383(7):687–9. DOI:10.1056/NEJMc2004773.; PRO/RUS> Холера (завозной случай) – Республика Казахстан (Алматы). Archive Number: 20240405.8715805. [Электронный ресурс]. URL: https://promedmail.org/promedpost/?id=8715805 (дата обращения 09.04.2024).; PRO/EDR> Cholera, diarrhea & dysentery update (34): Estonia ex Azerbaijan, RFI. Archive Number: 20240724.8717738. Published Date: 2024-07-25. [Электронный ресурс]. URL: https://promedmail.org/promed-post/?id=8717738 (дата обращения 25.07.2024).; PRO/EDR> Cholera, diarrhea & dysentery update (50): Bulgaria ex India. Archive Number: 20240915.8718795. [Электронный ресурс]. URL: https://www.stiripesurse.ro/alertain-bulgaria-a-fost-inregistrat-primul-caz-de-holera-dupa-103-ani_3433335.html#google_vignette (дата обращения 16.09.2024).; Фазылов В.Х., Баширова Д.К., Малышева Л.М., Зиатдинов В.Б., Нестерова Д.Ф., Малова А.А., Таирова Г.А. Клинико-эпидемиологическая характеристика вспышки холеры в Казани. Казанский медицинский журнал. 2003; 84(2):150–1.; Мишанькин Б.Н., Водопьянов А.С., Ломов Ю.М., Водопьянов С.О., Романова Л.В., Черепахина И.Я., Сучков И.Ю., Дуванова О.В., Шишияну М.В. Мультилокусное VNTR-типирование культур холерных вибрионов, выделенных в г. Казань во время вспышки холеры летом 2001 г. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2003; (6):11–5.; Крицкий А.А., Смирнова Н.И., Каляева Т.Б., Оброткина Н.Ф., Грачева И.В., Катышев А.Д., Кутырев В.В. Сравнительный анализ молекулярно-генетических свойств нетоксигенных штаммов Vibrio cholerae O1 биовара Эль Тор, изолированных в России и на эндемичных по холере территориях. Проблемы особо опасных инфекций. 2021; (3):72–82. DOI:10.21055/0370-1069-2021-3-72-82.; Миронова Л.В., Бочалгин Н.О., Гладких А.С., Феранчук С.И., Пономарева А.С., Балахонов С.В. Филогенетическое положение и особенности структуры геномов ctxAB–tcpA+ Vibrio cholerae из поверхностных водоемов на неэндемичной по холере территории. Проблемы особо опасных инфекций. 2020; (1):115–23. DOI:10.21055/0370-1069-2020-1-115-123.; Esteves K., Mosser T., Aujoulat F., Hervio-Heath D., Monfort P., Jumas-Bilak E. Highly diverse recombining populations of Vibrio cholerae and Vibrio parahaemolyticus in French Mediterranean coastal lagoons. Front. Microbiol. 2015; 6:708. DOI:10.3389/fmicb.2015.00708.; Kirchberger P.C., Orata F.D., Barlow E.J., Kauffman K.M., Case R.J., Polz M.F., Boucher Y. A small number of phylogenetically distinct clonal complexes dominate a coastal Vibrio cholerae population. Appl. Environ. Microbiol. 2016; 82(18):5576–86. DOI:10.1128/AEM.01177-16.; Chowdhury F., Mather A.E., Begum Y.A., Asaduzzaman M., Baby N., Sharmin S., Biswas R., Uddin M.I., LaRocque R.C., Harris J.B., Calderwood S.B., Ryan E.T.,. Clemens J.D., Thomson N.R., Qadri F. Vibrio cholerae serogroup O139: isolation from cholera patients and asymptomatic household family members in Bangladesh between 2013 and 2014. PLoS Negl. Trop. Dis. 2015; 9(11):e0004183. DOI:10.1371/journal.pntd.0004183.; Dorman M.J., Domman D., Uddin M.I., Sharmin S., Afrad M.H., Begum Y.A., Qadri F., Thomson N.R. High quality reference genomes for toxigenic and non-toxigenic Vibrio cholerae serogroup O139. Sci. Rep. 2019; 9(1):5865. DOI:10.1038/s41598-019-41883-x.; Schirmeister F., Dieckmann R., Bechlars S., Bier N., Faruque S.M., Strauch E. Genetic and phenotypic analysis of Vibrio cholerae non-O1, non-O139 isolated from German and Austrian patients. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2014; 33(5):767–78. DOI:10.1007s10096-013-2011-9.; Kechker P., Senderovich Y., Ken-Dror S., Laviad-Shitrit S., Arakawa E., Halpern M. Otitis media caused by V. cholerae O100: a case report and review of the literature. Front. Microbiol. 2017; 8:1619. DOI:10.3389/fmicb.2017.01619.; Van Bonn S.M., Schraven S.P., Schuldt T., Heimesaat M.M., Mlynski R., Warnke P.C. Chronic otitis media following infection by non-O1/non-O139 Vibrio cholerae: a case report and review of the literature. Eur. J. Microbiol. Immunol. (Bp). 2020; 10(3):186–91. DOI:10.1556/1886.2020.0001310.1556/1886.2020.00013.; Chowdhury G., Joshi S., Bhattacharya S., Sekar U., Birajdar B., Bhattacharyya A., Shinoda S., Ramamurthy T. Extraintestinal infections caused by non-toxigenic Vibrio cholerae non-O1/non-O139. Front. Microbiol. 2016; 7:144. DOI:10.3389/fmicb.2016.00144.; Li M., Kotetishvili M., Chen Y., Sozhamannan S. Comparative genomic analyses of the vibrio pathogenicity island and cholera toxin prophage regions in nonepidemic serogroup strains of Vibrio cholerae. Appl. Environ. Microbiol. 2003; 69(3):1728–38. DOI:10.1128/AEM.69.3.1728-1738.2003.; Olsvik O., Wahlberg J., Petterson B., Uhlén M., Popovic T., Wachsmuth I.K., Fields P.I. Use of automated sequencing of polymerase chain reaction-generated amplicons to identify three types of cholera toxin subunit B in Vibrio cholerae O1 strains. J. Clin. Microbiol. 1993; 31(1):22–5. DOI:10.1128/jcm.31.1.22-25.1993.; Raychoudhuri A., Mukherjee P., Ramamurthy T., Nandy R.K., Takeda Y., Nair G.B., Mukhopadhyay A.K. Genetic analysis of CTX prophages with special reference to ctxB and rstR alleles of Vibrio cholerae O139 strains isolated from Kolkata over a decade. FEMS Microbiol. Lett. 2010; 303(2):107–15. DOI:10.1111/j.15746968.2009.01856.x.; Ерошенко Г.А., Краснов Я.М., Фадеева А.В., Одиноков Г.Н., Кутырев В.В. Генетическая характеристика токсигенных штаммов Vibrio cholerae не О1/не О139 из Средней Азии. Генетика. 2013; 49(10):1165–74. DOI:10.7868/S0016675813100032.; Carpenter M.R., Kalburge S.S., Borowski J.D., Peters M.C., Colwell R.R., Boyd E.F. CRISPR-Cas and contact-dependent secretion systems present on excisable pathogenicity islands with conserved recombination modules. J. Bacteriol. 2017; 199:e00842-16. DOI:10.1128/JB.00842-16.; Монахова Е.В., Архангельская И.В., Титова С.В., Писанов Р.В. MSHA-подобные пили нетоксигенных штаммов холерных вибрионов. Проблемы особо опасных инфекций. 2019; (3):75–80. (Англ. яз.). DOI:10.21055/0370-1069-2019-3-75-80.; Murase K., Arakawa E., Izumiya H., Iguchi A., Takemura T., Kikuchi T., Nakagawa I., Thomson N.R., Ohnishi M., Morita M.Genomic dissection of the Vibrio cholerae O-serogroup global reference strains: reassessing our view of diversity and plasticity between two chromosomes. Microb. Genom. 2022; 8(8):mgen000860. DOI:10.1099/mgen.0.000860.; Onifade T.J.M., Hutchinson R., Van Zile K., Bodager D., Baker R., Blackmore C. Toxin producing Vibrio cholerae O75 outbreak, United States, March to April 2011. Euro Surveill. 2011; 16(20):19870.; Takahashi E., Ochi S., Mizuno T., Morita D., Morita M., Ohnishi M., Koley H., Dutta M., Chowdhury G., Mukhopadhyay A.K., Dutta S., Miyoshi S.I., Okamoto K. Virulence of cholera toxin gene-positive Vibrio cholerae non-O1/non-O139 strains isolated from environmental water in Kolkata, India. Front. Microbiol. 2021;12:726273. DOI:10.3389/fmicb.2021.726273.; https://journal.microbe.ru/jour/article/view/2114

Availability: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/2114
https://doi.org/10.21055/0370-1069-2025-1-35-47

The Epidemiological Situation on Plague in the World and the Forecast of its Development in the Russian Federation for 2025 ; Эпидемиологическая обстановка по чуме в мире и прогноз ее развития на 2025 г. в Российской Федерации

Authors: N. V. Popov, I. G. Karnaukhov, A. A. Kuznetsov, A. N. Matrosov, A. V. Ivanova, K. S. Martsokha, Sh. V. Magerramov, M. V. Pospelov, V. M. Korzun, D. B. Verzhutsky, E. V. Chipanin, A. V. Kholin, A. A. Lopatin, V. M. Dubyansky, U. M. Ashibokov, A. Yu. Gazieva, I. V. Kutyrev, T. Z. Ayazbaev, D. M. Bammatov, S. V. Balakhonov, A. N. Kulichenko, V. V. Kutyrev, Н. В. Попов, И. Г. Карнаухов, А. А. Кузнецов, А. Н. Матросов, А. В. Иванова, К. С. Марцоха, Ш. В. Магеррамов, М. В. Поспелов, В. М. Корзун, Д. Б. Вержуцкий, Е. В. Чипанин, А. В. Холин, А. А. Лопатин, В. М. Дубянский, У. М. Ашибоков, А. Ю. Газиева, И. В. Кутырев, Т. З. Аязбаев, Д. М. Бамматов, С. В. Балахонов, А. Н. Куличенко, В. В. Кутырев

Source: Problems of Particularly Dangerous Infections; № 1 (2025); 74-83 ; Проблемы особо опасных инфекций; № 1 (2025); 74-83 ; 2658-719X ; 0370-1069

Subject Terms: ГИС-портал, epizootic activity, epidemiological surveillance, preventive measures, Loginom analytical platform, GIS portal, эпизоотическая активность, эпидемиологический надзор, профилактические мероприятия, аналитическая платформа Loginom

File Description: application/pdf

Relation: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/2118/1546; Bezerra M.F., Fernandes D.L.R.S., Rocha I.V., Pitta J.L.L.P., Freitas N.D.A., Oliveira A.L.S., Guimarães R.J.P.S., Gomes E.C.S., de Andreazzi C.S., Sobreira M., Rezende A.M., Cordeiro-Estrela P., Almeida A.M.P. Ecologic, geoclimatic, and genomic factors modulating plague epidemics in primary natural focus, Brazil. Emerg. Infect. Dis. 2024; 30(9):1850–64. DOI: org/10.3201/eid3009.240468.; Попов Н.В., Ерошенко Г.А., Карнаухов И.Г., Кузнецов А.А., Матросов А.Н., Иванова А.В., Поршаков А.М., Ляпин М.Н., Корзун В.М., Вержуцкий Д.Б., Аязбаев Т.З., Лопатин А.А., Ашибоков У.М., Балахонов С.В., Куличенко А.Н., Кутырев В.В. Эпидемиологическая и эпизоотическая обстановка по чуме в Российской Федерации и прогноз ее развития на 2020–2025 гг. Проблемы особо опасных инфекций. 2020; (1):43–50. DOI:10.21055/0370-1069-2020-1-43-50.; Xu L., Wang Q., Yang R., Ganbold D., Tsogbadrakh N., Dong K., Liu M., Altantogtokh D., Liu Q., Undrakhbold S., Boldgiv B., Liang W., Stenseth N.C. Climate-driven marmot-plague dynamics in Mongolia and China. Sci. Rep. 2023; 13(1):11906. DOI:10.1038/s41598-023-38966-1. Erratum in: Sci. Rep. 2023; 13(1):14663. DOI:10.1038/s41598-023-41800-3.; Wimsatt J., Eads D.A., Matchett M.R., Biggins D.E. Alternative lifestyles: A plague persistence hypothesis. Ecosphere. 2023; 14(11):e4673. DOI:10.1002/ecs2.4673.; Rajamannar V., Govindarajan R., Kumar A., Samuel P.P. A review of public health important fleas (Insecta, Siphonaptera) and flea-borne diseases in India. J. Vector Borne Dis. 2022; 59(1):12–21. DOI:10.4103/0972-9062.328977.; Yang R., Atkinson S., Chen Z., Cui Y., Du Z., Han Y., Sebbane F., Slavin P., Song Y., Yan Y., Wu Y., Xu L., Zhang C., Zhang Y., Hinnebusch B.J., Stenseth N.C., Motin V.L. Yersinia pestis and plague: some knowns and unknowns. Zoonoses (Burlingt). 2023; 3(1):5. DOI:10.15212/zoonoses-2022-0040.; Carlson C.J., Bevins S.N., Schmid B.V. Plague risk in the western United States over seven decades of environmental change. Glob. Chang. Biol. 2022; 28(3):753–69. DOI:10.1111/gcb.15966.; Abdel Z., Abdeliyev B., Yessimseit D., Begimbayeva E., Mussagalieva R. Natural foci of plague in Kazakhstan in the spacetime continuum. Comp. Immunol. Microbiol. Infect. Dis. 2023; 100:102025. DOI:10.1016/j.cimid.2023.102025.; Pitta J.L.L.P., Bezerra M.F., Fernandes D.L.R.D.S., Block T., Novaes A.S., Almeida A.M.P., Rezende A.M. Genomic analysis of Yersinia pestis strains from Brazil: Search for virulence factors and association with epidemiological data. Pathogens. 2023; 12(8):991. DOI:10.3390/pathogens12080991.; Cao B., Bai C., Wu K., La T., Su Y., Che L., Zhang M., Lu Y., Gao P., Yang J., Xue Y., Li G. Tracing the future of epidemics: Coincident niche distribution of host animals and disease incidence revealed climate-correlated risk shifts of main zoonotic diseases in China. Glob. Chang. Biol. 2023; 29(13):3723–46. DOI:10.1111/gcb.16708.; Eads D.A., Biggins D.E., Wimsatt J., Eisen R.J., Hinnebusch B.J., Matchett M.R., Goldberg A.R., Livieri T.M., Hacker G.M., Novak M.G., Buttke D.E., Grassel S.M., Hughes J.P., Atiku L.A. Exploring and mitigating plague for one health purposes. Curr. Trop. Med. Rep. 2022; 9(4):169–84. DOI:10.1007/s40475-022-00265-6.; Alderson J., Quastel M., Wilson E., Bellamy D. Factors influencing the re-emergence of plague in Madagascar. Emerg. Top. Life Sci. 2020; 4(4):411–21. DOI:10.1042/ETLS20200334.; Eisen R.J., Atiku L.A., Enscore R.E., Mpanga J.T., Acayo S., Mead P.S., Apangu T., Yockey B.M., Borchert J.N., Beard C.B., Gage K.L. Epidemiology, ecology and prevention of Plague in the West Nile Region of Uganda: The value of long-term field studies. Am. J. Trop. Med. Hyg. 2021; 105(1):18–23. DOI:10.4269/ajtmh.20-1381.; Qazi S., Ullah I., Jabbar A., Junaid Tahir M. Plague outbreaks in Africa – A gesture of new pandemic. Disaster Med. Public Health Prep. 2022; 16(6):2228–9. DOI:10.1017/dmp.2022.67.; Попов Н.В., Кутырев И.В., Иванова А.В., Никифоров К.А., Зубова А.А., Нейштадт Я.А., Бойко А.В., Куклев Е.В., Топорков В.П. О существовании Восточно-Африканского природного мегаочага Yersinia pestis основного подвида античного биовара филогенетической линии 1.ANT: эпидемическая активность, пространственная и биоценотическая структура. Проблемы особо опасных инфекций. 2024; (4):35–41. DOI:10.21055/0370-1069-2024-4-35-41.; Ерошенко Г.А., Кубанычбекова Г.К., Коврижников А.В., Джапарова А.К., Муканметэсен уулу Ж., Абдыгазиева А.К., Сидорин А.С., Краснов Я.М., Кузнецов А.А., Фадеева А.В., Никифоров А.К., Девдариани З.Л., Куклев Е.В., Бойко А.В., Кутырев В.В. Молекулярная идентификация штаммов Yersinia pestis, выделенных в Аксайском высокогорном очаге Кыргызской Республики в 2024 г. Проблемы особо опасных инфекций. 2024; (4):78–87. DOI:10.21055/0370-1069-2024-4-78-87.; Курманов Ж.Б., Мәмбетов Ғ.И., Жолдас А.С., Сейтпешов У.А., Бексұлтанов А.Т., Сүлейменов А.Ө., Тагибергенов А.М., Саясатова Г.С., Мұхамбедияров Д.С. Анализ эпизоотической активности Северо-Приаральского автономного очага чумы за период 2014–2023 гг. Особо опасные инфекции и биологическая безопасность. 2024; (8-9):50–8.; Мека-Меченко В.Г., Садовская В.П. Результаты мониторинга распространённости и численности носителей, блох большой песчанки и эпизоотологического обследования на территории природных очагов чумы Казахстана в 2023 году. Особо опасные инфекции и биологическая безопасность. 2024; (8-9):58–74.; Бакаев В.В., Гашенко Т.Ю., Марданлы С.С., Жигалева О.Н. Применение искусственного интеллекта для укрепления и развития системы эпидемиологического контроля (обзор литературы). Эпидемиология и инфекционные болезни. 2024; 29(3):126– 34. DOI:10.51620/3034-1981-2024-29-3-126-134.; Кузин А.А., Глушаков Р.И., Парфенов С.А., Сапожников К.В., Лазарев А.А. Разработка системы прогноза развития инфекционных заболеваний на основе искусственного интеллекта. Фундаментальная и клиническая медицина. 2023; 8(3):143–54. DOI:10.23946/2500-0764-2023-8-3-143-154.; https://journal.microbe.ru/jour/article/view/2118

Availability: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/2118
https://doi.org/10.21055/0370-1069-2025-1-74-83

Современные эпидемиологические особенности гриппа и ОРВИ на территории Астраханской области в 2017-2023 гг

Subject Terms: заболеваемость, вакцинопрофилактика, epidemiological surveillance, acute respiratory viral infections, COVID-19, morbidity, эпидемиологический надзор, грипп, influenza, vaccine prevention, 3. Good health, острые респираторные вирусные инфекции

Санитарно-эпидемиологическое благополучие как способ обеспечения конституционного права на охрану здоровья: Sanitary and Epidemiological Well-being as a Way to Ensure the Constitutional Right to Health Care

Source: СОВРЕМЕННОЕ ПРАВО. :128-131

Subject Terms: международное сообщество, здоровье общества, epidemiological surveillance, public health, social rights, эпидемиологический надзор, international community, 16. Peace & justice, социальные права

Современные эпидемиологические особенности кори на территории Астраханской области в 2013–2023 гг

Subject Terms: заболеваемость, коллективный иммунитет, вакцинопрофилактика, epidemiological surveillance, collective immunity, корь, measles, morbidity, эпидемиологический надзор, vaccine prevention, 3. Good health

Assessment of the Current State of the Hissar High-Mountain Natural Plague Focus in the Republic of Tajikistan ; Оценка современного состояния Гиссарского высокогорного природного очага чумы в Республике Таджикистан

Authors: A. N. Matrosov, Z. G. Gulmakhmadzoda, M. Kh. Tilloeva, K. S. Martsokha, A. A. Sludsky, E. R. Kudratov, A. M. Porshakov, S. P. Murodov, O. D. Nazarova, E. V. Kuklev, I. N. Sharova, M. A. Makashova, A. S. Abdrashitova, E. A. Mikheeva, D. T. Tokaev, A. Sh. Amonov, N. G. Karimov, O. F. Umarov, M. G. Giesiddinzoda, E. N. Kondrat’ev, A. G. Selenina, А. Н. Матросов, З. Г. Гулмахмадзода, М. Х. Тиллоева, К. С. Марцоха, А. А. Слудский, Э. Р. Кудратов, А. М. Поршаков, С. П. Муродов, О. Д. Назарова, Е. В. Куклев, И. Н. Шарова, М. А. Макашова, А. С. Абдрашитова, Е. А. Михеева, Д. Т. Токаев, А. Ш. Амонов, Н. Г. Каримов, О. Ф. Умаров, М. Г. Гиесиддинзода, Е. Н. Кондратьев, А. Г. Селенина

Source: Problems of Particularly Dangerous Infections; № 1 (2024); 37-47 ; Проблемы особо опасных инфекций; № 1 (2024); 37-47 ; 2658-719X ; 0370-1069

Subject Terms: эпидемиологический надзор, zoonoses, epidemiology, natural focus, epizootics, carriers and vectors, Hissar high-mountain plague focus, epidemiological surveillance, зоонозы, эпидемиология, природный очаг, эпизоотии, носители и переносчики, Гиссарский высокогорный очаг чумы

File Description: application/pdf

Relation: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1941/1450; Stenseth N.C., Mysterud A., Ottersen G., Hyrrell J.W., Chan K.-S., Lima M. Ecological effects of climate fluctuations. Science. 2002; 297(5585):1292–6. DOI:10.1126/science.1071281.; Renner S.S., Zohner C.M. Climate change and phenological mismatch in trophic interactions among plants, insects, and vertebrates. Annual Rev. Ecol. Evol. Syst. 2018; 49(1):165–82. DOI:10.1146/annurev-ecolsys-110617-062535.; Stenseth N.C., Atshabar B.B., Begon M., Belmain S.R., Bertherat E., Carniel E., Gage K.L., Leirs H., Rahalison L. Plague: past, present, and future. PLoS Med. 2008; 15(1):e3. DOI:10.1371/journal.pmed.0050003.; Прислегина Д.А., Дубянский В.М., Платонов А.Е., Малецкая О.В. Влияние природно-климатических факторов на эпидемиологическую ситуацию по природно-очаговым инфекциям. Инфекция и иммунитет. 2021; 11(5):820–36. DOI:10.15789/2220-7619-EOT-1631.; Bramanti B., Stenseth N.C., Walle L., Lei X. Plague: A disease which changed the path of human civilization. In: Yang R., Anisimov A., editors. Yersinia pestis: Retrospective and Perspective. Dordrecht: Springer; 2016. P. 1–26. DOI:10.1007/978-94-0240890-4_1.; Jarrett C.O., Deak E., Isherwood K.E., Oyston P.C., Fischer E.R., Whitney A.R., Kobayashi S.D., DeLeo F.R., Hinnebusch B.J. Transmission of Yersinia pestis from an infectious biofilm in the flea vector. J. Infect. Dis. 2004; 190(4):783–92. DOI:10.1086/422695.; Бибиков Д.И. Горные сурки Средней Азии и Казахстана. М.: Наука; 1967. 198 с.; Бибиков Д.И., Берендяев С.А., Пейсахис Л.А., Шварц Е.А. Природные очаги чумы сурков в СССР. М.: Медицина; 1973. 192 с.; Яковлев Е.П. Промысел сурков в Узбекистане и Таджикистане. В кн.: Сурки. Биоценотическое и практическое значение. М.: Наука; 1980. С. 195–7.; Сунцов В.В., Сунцова Н.И. Чума. Происхождение и эволюция эпизоотической системы (экологические, географические и социальные аспекты). М.: Товарищество научных изданий КМК; 2006. 247 с.; Wang Z., Kang Y., Wang Y., Tan Y., Yao B., An K., Su J. Himalayan marmot (Marmota himalayana) redistribution to high latitudes under climate change. Animals (Basel). 2023; 13(17):2736. DOI:10.3390/ani13172736.; Xu L., Wang Q., Yang R., Ganbold D., Tsogbadrakh N., Dong K., Liu M., Altantogtokh D., Liu Q., Undrakhbold S., Boldgiv B., Liang W., Stenseth N.C. Climate-driven marmot-plague dynamics in Mongolia and China. Sci. Rep. 2023; 13(1):11906. DOI:10.1038/s41598-023-38966-1.; Давыдов Г.С. Фауна Таджикской ССР. Т. 20. Ч. I. Млекопитающие (Зайцеобразные. Суслики. Сурки). Душанбе: Дониш; 1974. 259 с.; Саидов А.С. Фауногенетический анализ грызунов Таджикистана. Известия Академии наук Республики Таджикистан. Отделение биологических и медицинских наук. 2011; 2:34–41.; Калина Г.П. Чума в Средней Азии. Архангельск: Севкрайгиз; 1936. 96 с.; Финкельштейн Я.М. Чума в Анзобе. Военномедицинский журнал. 1899; 2:534–57.; Левин А.М. Чума в Анзобе в 1898 г. Врач. 1899; 6: 157–62.; Дербек Ф.А. История чумных эпидемий в России с основания государства до настоящего времени. СПб.; 1905. 385 с.; Слудский А.А., Дерлятко К.И., Головко Э.Н., Агеев В.С. Гиссарский природный очаг чумы. Саратов: Изд-во Сарат. ун-та; 2003. 248 с.; Morelli G., Song Y., Mazzoni C.J., Eppinger M., Roumagnac P., Wagner D.M., Feldkamp M., Kusecek B., Vogler A.J., Li Y., Cui Y., Thomson N.R., Jombart T., Leblois R., Lichtner P., Rahalison L., Petersen J.M., Balloux F., Keim P., Wirth T., Ravel J., Yang R., Carniel E., Achtman M. Yersinia pestis genome sequencing identifies patterns of global phylogenetic diversity. Nat. Genet. 2010; 42(12):1140–3. DOI:10.1038/ng.705.; Анисимов Н.В., Комбарова Т.И., Платонов М.Е., Иванов С.А., Сухова М.А., Дентовская С.В., Анисимов А.П. Способ отбора филогенетически близких штаммов Yersinia pestis, отличающихся по вирулентности для морских свинок. Инфекция и иммунитет. 2015; 5(4):373–6. DOI:10.15789/2220-7619-2015-4373-376.; Попова А.Ю., Кутырев В.В., редакторы. Кадастр эпидемических и эпизоотических проявлений чумы на территории Российской Федерации и стран ближнего зарубежья (с 1876 по 2016 год). Саратов: ООО «Амирит»; 2016. 248 с.; Narankhatan N. Some characters of the pathogen Y. pestis found in patients with plague (2000–2015). In: Current Issues on Zoonotic Diseases. Ulaanbatar; 2021. Vol. 24. P. 65–6.; Слудский А.А., Девдариани З.Л. Рамнозопозитивные штаммы возбудителя чумы: вирулентность и эпидемиологическое значение. Проблемы особо опасных инфекций. 2022; 3:38– 44. DOI:10.21055/0370-1069-2022-3-38-44.; Ерошенко Г.А., Краснов Я.М., Носов Н.Ю., Куклева Л.М., Никифоров К.А., Оглодин Е.Г., Кутырев В.В. Совершенствование подвидовой классификации Yersinia pestis на основе данных полногеномного секвенирования штаммов из России и сопредельных государств. Проблемы особо опасных инфекций. 2015; 4:58–64. DOI:10.21055/0370-1069-2015-4-58-64.; Балахонов С.В., Корзун В.М., редакторы. Трансграничный Сайлюгемский природный очаг чумы. Новосибирск; 2022. 248 с. DOI:10.7868/978-5-02-040977-4.; Кучерук В.В., Бибиков Д.И. Сурки как хранители чумы. В кн.: Сурки. Биоценотическое и практическое значение. М.: Наука; 1980. С. 111–61.; Попова А.Ю., Кутырев В.В., редакторы. Обеспечение эпидемиологического благополучия в природных очагах чумы на территории стран СНГ и Монголии в современных условиях. Ижевск: ООО «Принт»; 2018. 336 с. DOI:10.23648/PRNT.2445.; Головко Э.Н., Пейсахис Л.А., Дерлятко К.И., Червякова В.П., Усачев Г.П., Кафарская Д.Г., Яковлев Е.П., Морозкина Е.А., Юсупов А.К., Щербин Ю.В., Неронов И.М. К вопросу о природной очаговости чумы в западной части Гиссарского хребта. Проблемы особо опасных инфекций. 1973; 2:31–6.; Слудский А.А., Лукьянов Г.Н., Дерлятко К.И., Агеев В.С. Пространственная структура Гиссарского природного очага чумы. В кн.: Эпидемиология, эпизоотология и профилактика особо опасных инфекций. Саратов; 1986. С. 32–8.; Онищенко Г.Г., Кутырев В.В., редакторы. Природные очаги чумы Кавказа, Прикаспия, Средней Азии и Сибири. М.: Медицина; 2004. 192 с.; Дерлятко К.И., Агеев В.С., Слудский А.А., Головко Э.Н., Дегтярева В.И., Морозкина Е.Н. Многолетняя и сезонная динамика эпизоотий среди арчовых полевок Гиссарского очага чумы. В кн.: Природная очаговость и профилактика зоонозов. Саратов; 1987. С. 32–40.; Попова А.Ю., Кутырев В.В., редакторы. Атлас природных очагов чумы России и зарубежных государств. Калининград: РА Полиграфычъ; 2022. 348 с.; Агеев В.С., Поле С.Б., Слудский А.А. К эпизоотологическому значению блох в Гиссарском очаге чумы. Карантинные и зоонозные инфекции в Казахстане. 1999; 1:55–8.; Войтенко А.М., Рачинина Н.А., Пак М.И. О результатах серологического исследования на чуму грызунов Гиссарского хребта. Проблемы особо опасных инфекций. 1972; 4:154–5.; Назарова О.Д., Курбонбекова З.Д., Азимов Г.Д. Распространение серой крысы (Rattus norvegicus Berkenhout) в Гиссарской долине. Карантинные и зоонозные инфекции в Казахстане. 2008; 1-2:107–9.; Морозкина Е.А., Лысенко Л.С., Кафарская Д.Г. Блохи красного сурка и других животных, обитающих на Гиссарском хребте. Проблемы особо опасных инфекций. 1971; 1:38–44.; Ващенок В.С. Блохи (Siphonaptera) переносчики возбудителей болезней человека и животных. Л.: Наука; 1988. 163 с.; Слудский А.А. Экология арчовой полевки. В кн.: Фауна и экология грызунов. М.: Изд-во МГУ; 1985. Т. 16. С. 162–94.; https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1941

Availability: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1941
https://doi.org/10.21055/0370-1069-2024-1-37-47

Epidemiological Situation on Plague around the World. Forecast of Epizootic Activity of Natural Plague Foci in the Russian Federation for 2024 ; Эпидемиологическая ситуация по чуме в мире. Прогноз эпизоотической активности природных очагов чумы Российской Федерации на 2024 г.

Authors: N. V. Popov, I. G. Karnaukhov, A. A. Kuznetsov, A. N. Matrosov, A. V. Ivanova, K. S. Martsokha, E. V. Kuklev, V. M. Korzun, D. B. Verzhutsky, E. V. Chipanin, A. V. Kholin, A. A. Lopatin, V. M. Dubyansky, U. M. Ashibokov, A. Yu. Gazieva, I. V. Kutyrev, S. V. Balakhonov, A. N. Kulichenko, V. V. Kutyrev, Н. В. Попов, И. Г. Карнаухов, А. А. Кузнецов, А. Н. Матросов, А. В. Иванова, К. С. Марцоха, Е. В. Куклев, В. М. Корзун, Д. Б. Вержуцкий, Е. В. Чипанин, А. В. Холин, А. А. Лопатин, В. М. Дубянский, У. М. Ашибоков, А. Ю. Газиева, И. В. Кутырев, С. В. Балахонов, А. Н. Куличенко, В. В. Кутырев

Source: Problems of Particularly Dangerous Infections; № 1 (2024); 67-75 ; Проблемы особо опасных инфекций; № 1 (2024); 67-75 ; 2658-719X ; 0370-1069

Subject Terms: ГИС-портал, epizootic activity, epidemiological surveillance, preventive measures, electronic passport, GIS portal, эпизоотическая активность, эпидемиологический надзор, профилактические мероприятия, электронный паспорт

File Description: application/pdf

Relation: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1946/1453; Bramanti B., Stenseth N.C., Walløe L., Lei X. Plague: A disease which changed the path of human civilization. In: Yang R., Anisimov A., editors. Yersinia pestis: Retrospective and Perspective. Dordrecht: “Springer”; 2016. P. 1–26. DOI:10.1007/978-94-024-0890-4_1.; Sah R., Reda A., Mehta R., Mohapatra R.K., Dhama K. A situation analysis of the current plague outbreak in the Demographic Republic of Congo and counteracting strategies – Correspondence. Int. J. Surg. 2022; 105:106885. DOI:10.1016/j.ijsu.2022.106885.; Gao J., Hu Y., Ju C., Liu J., Wang Y., Ma J., Shen X., Liu F., Guo J., Yu X., Zhang W., Wang S., Li K., Zhang Z., Kan B., Wang W., Cong X., Fan M., Li W., Shao K., Zhang T., Li J., Wang Y. Human plague case diagnosed in Ningxia tracked to animal reservoirs – Inner Mongolia Autonomous Region, China, 2021. China CDC Wkly. 2021; 3(52):1109–12. DOI:10.46234/ccdcw2021.267.; Xu L., Wang Q., Yang R., Ganbold D., Tsogbadrakh N., Dong K., Liu M., Altantogtokh D., Liu Q., Undrakhbold S., Boldgiv B., Liang W., Stenseth N.C. Climate-driven marmot-plague dynamics in Mongolia and China. Sci. Rep. 2023; 13(1):11906. DOI:10.1038/s41598-023-38966-1.; Wang Z., Kang Y., Wang Y., Tan Y., Yao B., An K., Su J. Himalayan marmot (Marmota himalayana) redistribution to high latitudes under climate change. Animals (Basel). 2023; 13(17):2736. DOI:10.3390/ani13172736.; He Z., Wei B., Zhang Y., Liu J., Xi J., Ciren D., Qi T., Liang J., Duan R., Qin S., Lv D., Chen Y., Xiao M., Fan R., Song Z., Jing H., Wang X. Distribution and characteristics of human plague cases and Yersinia pestis isolates from 4 marmota plague foci, China, 1950–2019. Emerg. Infect. Dis. 2021; 27(10):2544–53. DOI:10.3201/eid2710.202239.; Liu B.X., Duan R., Wang H.H., Zhang D.Y., Qin S., Luo H.Y., Liu J., Liang J.R., Tang D.M., Jing H.Q., Wang J., Wang X. [Analysis on prevalence and epidemic risk of animal plague in different ecological plague foci in Inner Mongolia Autonomous Region]. Zhonghua Yu Fang Yi Xue Za Zhi [Chinese Journal of Preventive Medicine]. 2022; 56(1):9–14. DOI:10.3760/cma.j.cn112150-20211101-01007.; Qin J., Wu Y., Shi L., Zuo X., Zhang X., Qian X., Fan H., Guo Y., Cui M., Zhang H., Yang F., Kong J., Song Y., Yang R., Wang P., Cui Y. Genomic diversity of Yersinia pestis from Yunnan Province, China, implies a potential common ancestor as the source of two plague epidemics. Commun. Biol. 2023; 6(1):847. DOI:10.1038/s42003-023-05186-2.; Otgonbayar D., Baigalmaa M., Uyanga B., Adiyasuren Z. Epidemiological and clinical features of plague cases registered in Khovd province, Mongolia (1993–2022). In: Current Issues on Zoonotic Diseases. Ulaanbaatar; 2023. Iss. 25. P. 74–5.; Negi S., Tripathy S., Satapathy P., Neyazi A., Padhi B. Plague outbreak in Madagascar amidst COVID-19: A re-emerging concern of public health. Clinical Infection in Practice. 2023; 17(8):100222. DOI:10.1016/j.clinpr.2023.100222.; Rakotosamimanana S., Taglioni F., Ravaoarimanga M., Rajerison M.E., Rakotomanana F. Socioenvironmental determinants as indicators of plague risk in the central highlands of Madagascar: Experience of Ambositra and Tsiroanomandidy districts. PLoS Negl. Trop. Dis. 2023; 17(9):e0011538. DOI:10.1371/journal.pntd.0011538.; Бердиев С.К., Ерошенко Г.А., Балыкова А.Н., Усенбаев Н.Т., Кебекбаева Н.Т., Джапарова А.К., Муканметэсен уулу Ж., Жумашов Д., Ражапбаева А.Ш., Юлдашева А.М., Оглодин Е.Г., Катышев А.Д., Кузнецов А.А., Фадеева А.В., Кутырев В.В. Современные диагностические технологии в исследовании полевого материала 2023 г. из природных очагов чумы Кыргызской Республики. Проблемы особо опасных инфекций. 2023; 4:50–61. DOI:10.21055/0370-1069-2023-4-50-61.; Попова А.Ю., Кутырев В.В., редакторы. Атлас природных очагов чумы России и зарубежных государств. Калининград: РА Полиграфычъ; 2022. 348 с.; Балахонов С.В., Вержуцкий Д.Б., Корзун В.М., Куликалова Е.С., Холин А.В., Шаракшанов М.Б. Особенности современной эпизоотической ситуации и эпидемиологической обстановки по чуме в Южной Сибири, Монголии и Китае (обзор). Санитарный врач. 2021; 8:34–40. DOI:10.33920/med-08-2108-05.; https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1946

Availability: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1946
https://doi.org/10.21055/0370-1069-2024-1-67-75

The Role of the Coordination Council on the Issues of Sanitary Protection of the Territories of the Member States of the Commonwealth of Independent States from the Importation and Spread of Particularly Dangerous Infectious Diseases in the Formation of a Unified System for Monitoring and Responding to Emergencies of Sanitary-Epidemiological Nature in the CIS ; Роль Координационного совета по проблемам санитарной охраны территорий государств – участников Содружества Независимых Государств от завоза и распространения особо опасных инфекционных болезней в формировании единой системы мониторинга и реагирования на ЧС санитарно-эпидемиологического характера на пространстве СНГ

Authors: I. G. Karnaukhov, Zh. A. Kas’yan, S. A. Shcherbakova, V. V. Kutyrev, И. Г. Карнаухов, Ж. А. Касьян, С. А. Щербакова, В. В. Кутырев

Source: Problems of Particularly Dangerous Infections; № 2 (2024); 101-107 ; Проблемы особо опасных инфекций; № 2 (2024); 101-107 ; 2658-719X ; 0370-1069

Subject Terms: санитарная охрана территории, emergency situation, epidemiological surveillance, sanitary protection of the territory, чрезвычайная ситуация, эпидемиологический надзор

File Description: application/pdf

Relation: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/2003/1480; Черкасский Б.Л. Актуальные проблемы эпидемиологии в конце ХХ – начале ХХI веков. М.; 2004. 49 с.; Кутырев В.В., Щербакова С.А., Карнаухов И.Г., Касьян Ж.А., Шиянова А.Е., Горбунов В.А., Красько А.Г., Лешкевич А.Л., Федорович Е.В., Семижон П.А., Рустамова Л.М., Петкевич А.С., Ерубаев Т.К., Аязбаев Т.З., Турегелдиева Д.А., Ковалева Г.Г., Бердиев С.К., Усенбаев Н.Т., Казыбаева Ж.С. Система мониторинга и реагирования на чрезвычайные ситуации в области общественного здравоохранения санитарно-эпидемиологического характера в странах СНГ. Проблемы особо опасных инфекций. 2022; 3:95–106. DOI: 10/21055/0370-1069-2022-3-95-106.; Положение о Координационном совете по проблемам санитарной охраны территорий государств – участников Содружества Независимых Государств от завоза и распространения особо опасных инфекционных болезней. [Электронный ресурс]. URL: https://microbe.ru/files/15112023_Poloj_KS.pdf (дата обращения 17.01.2024).; Попова А.Ю., Кутырев В.В., редакторы. Международное сотрудничество по формированию единой системы мониторинга и оперативного реагирования на чрезвычайные ситуации в области общественного здравоохранения санитарно-эпидемиологического характера на пространстве СНГ. Саратов: Амирит; 2022. 164 с.; Положение о порядке осуществления информационного обмена между государствами – участниками СНГ о чрезвычайных ситуациях в области общественного здравоохранения санитарно-эпидемиологического характера. [Электронный ресурс]. URL: https://microbe.ru/files/Inform_regul_2020.pdf (дата обращения 17.01.2024).; Соглашение о сотрудничестве в области санитарной охраны территорий государств – участников Содружества Независимых Государств. [Электронный ресурс]. URL: https://microbe.ru/files/28052021_2_sogl.pdf (дата обращения 17.01.2024).; МР «Организация мероприятий по санитарной охране территорий государств – участников содружества независимых государств». [Электронный ресурс]. URL: https://microbe.ru/files/15112023_MR_SanOhran.pdf (дата обращения 17.01.2024).; МР «Организация и проведение эпидемиологического надзора в природных очагах чумы на территории государств – участников содружества независимых государств. [Электронный ресурс]. URL: https://microbe.ru/files/2019_MR_Plague_foci_CIS.pdf (дата обращения 17.01.2024).; МР «Использование информационных систем для мониторинга угроз санитарно-эпидемиологического характера на пространстве СНГ». [Электронный ресурс]. URL: https://microbe.ru/files/15112023_MR_inform.pdf (дата обращения 17.01.2024).; Положение о базовой организации государств – участников Содружества Независимых Государств по мониторингу, оперативному оповещению и совместному реагированию на чрезвычайные ситуации в области общественного здравоохранения санитарно-эпидемиологического характера. [Электронный ресурс]. URL: https://microbe.ru/files/18062021_2_poloj.pdf (дата обращения 17.01.2024).; Порядок формирования реестра специалистов организаций санитарно-эпидемиологического профиля государств – участников СНГ для совместной работы в зоне чрезвычайной ситуации санитарно-эпидемиологического характера. [Электронный ресурс]. URL: https://microbe.ru/files/13102021_por.pdf (дата обращения 17.01.2024).; МР «Тактика организации и проведения совместных международных учений СПЭБ Роспотребнадзора и СПЭБ государств – участников СНГ по ликвидации чрезвычайных ситуаций в области общественного здравоохранения санитарно-эпидемиологического характера». [Электронный ресурс]. URL: https://microbe.ru/files/MR_SPEB_2022.pdf (дата обращения 23.01.2024).; Попова А.Ю., Кутырев В.В., редакторы. Специализированные противоэпидемические бригады Роспотребнадзора: роль в обеспечении санитарно-эпидемиологического благополучия населения на современном этапе. Саратов: Амирит; 2019. 200 с.; Соглашение о сотрудничестве государств – участников Содружества Независимых Государств по предупреждению и реагированию на чрезвычайные ситуации в области общественного здравоохранения санитарно-эпидемиологического характера. [Электронный ресурс]. URL: https://microbe.ru/files/Sogl_sotr_emerg_2022.pdf (дата обращения 23.01.2024).; https://journal.microbe.ru/jour/article/view/2003

Availability: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/2003
https://doi.org/10.21055/0370-1069-2024-2-101-107

Modern aspects of rabies in Cameroon ; Современные аспекты бешенства в Камеруне

Authors: E. A.C. Youmba, A. A. Kuzin, A. E. Zobov, Э. Э.К. Юмба, А. А. Кузин, А. Е. Зобов

Source: Journal Infectology; Том 16, № 3 (2024); 133-139 ; Журнал инфектологии; Том 16, № 3 (2024); 133-139 ; 2072-6732 ; 10.22625/2072-6732-2024-16-4

Subject Terms: Республика Камерун (Камерун), epidemiological surveillance, monitoring, rabies virus (rabies), geographic information system (GIS), QGIS (quantum GIS), Republic of Cameroon (Cameroon), эпидемиологический надзор, мониторинг, вирус бешенства (бешенство), геоинформационная система (ГИС), QGIS (квантовая ГИС)

File Description: application/pdf

Relation: https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/1672/1157; Sadeuh-Mba S.A., Besong, L., Demanou M., et al. Laboratory data of dog rabies in southern Cameroon from 2010 to 2013 // BMC Res Notes 7. 2014. 905C. doi:10.1186/1756-0500-7-905; William H. Wunner., Karl-Klaus Conzelmann. Chapter 2 – Rabies virus // Rabies (Fourth Edition). 2020. C. 43-81. doi:10.1016/B978-0-12-818705-0.00002-9.; Parize P., Dacheux L., Bourhy H. Rage [Rabies] // Rev Prat. 2019 Apr;69(4):423-428. French. PMID: 31626500.; Wallace RM., Cliquet F., Fehlner-Gardiner C., et al. Role of Oral Rabies Vaccines in the Elimination of Dog-Mediated Human Rabies Deaths // Emerg Infect Dis. 2020; 26(12):1-9. doi:10.3201/eid2612.201266; Bourhy H., de Melo G.D., Tarantola A. Nouveaux aspects de la lutte contre la rage [New aspects of rabies control] // Bull Acad Natl Med. 2020;204(9):1000-1009. doi:10.1016/j.banm.2020.09.036; Заволока, А.А. О бешенстве / А.А. Заволока [и др.] // Vetpharma. – Сентябрь 2013. – T. 4. – C. 24–31.; Гаврилов, А.В. Бешенство: учебное пособие / А.В. Гаврилов, А.В. Зотова. – Благовещенск, 2020. – 38 с.; Groleau G. Rabies // Emerg Med Clin North Am. 1992 May; 10(2):361-8. PMID: 1559475.; Lodha L., Manoor Ananda A., Mani R.S. Rabies control in high-burden countries: role of universal pre-exposure immunization // Lancet Reg Health Southeast Asia. 2023; 19:100258. Published 2023 Aug 1. doi:10.1016/j.lansea.2023.100258; Fooks A.R., Banyard A.C., Horton D.L., Johnson N., McElhinney L.M., et al. Current status of rabies and prospects for elimination // Lancet. 2014. T. 384:1389–1399. doi:10.1016/S0140-6736(13)62707-5 PMID: 24828901; Preparedness and response, One Health in action. « zoonotic disease prioritization for inter-sectoral engagement in Cameroon. Yaoundé, Cameroon ». march 3–4, 2016. C. 15.; Roger HEMPO. Les zoonoses majeures au Cameroun et leur incidence sur la population humaine: proposition d’un plan de lutte. Thèse. Université Cheikh Anta Diop. Sénégal. 1988. 157p.; Ministère de la Santé Publique du Cameroun. Plan strategique integre d’elimination de la rage humaine d’origine canine au Cameroun 2018 – 2030. Yaoundé, Avril 2018; Литусов, Н.В. Вирус бешенства: иллюстрированное учебное пособие / Н.В. Литусов. – Екатеринбург: УГМУ, 2018 – 21 с.; Dah I., Poueme Namegni R.S., Mouiche Mouliom M.M., et al. Prevalence and public health significance of rabies virus in bats in the North Region of Cameroon // PLoS Negl Trop Dis. 2023;17(10):e0010803. Published 2023 Oct 23. doi:10.1371/journal.pntd.0010803; Sowe Wobessi J.N., Dibongue E., Tejiokem M.C., Njouom R., Sadeuh-Mba S.A. Detection and molecular characterization of rabies virus isolates from humans in Cameroon // Diagnostic Microbiology and Infectious Disease. 2023; Volume 105, Issue 1: 115834. doi:10.1016/j.diagmicrobio.2022.115834; Sadeuh-Mba S.A., Momo J.B., Besong L., Loul S., Njouom R. Molecular characterization and phylogenetic relatedness of dog-derived Rabies Viruses circulating in Cameroon between 2010 and 2016 // PLoS Negl Trop Dis. 2017; 11(10):e0006041. Published 2017 Oct 30. doi:10.1371/journal.pntd.0006041; Sofeu C.L., Broban A., Njifou Njimah A., et al. Improving systematic rabies surveillance in Cameroon: A pilot initiative and results for 2014-2016 // PLoS Negl Trop Dis. 2018; 12(9):e0006597. Published 2018 Sep 6. doi:10.1371/journal.pntd.0006597; Ndukum J.A., Tchoumboue J., Tong J.C. Canine and Human Rabies in Cameroon // Tropical Veterinarian. 2002; 20:162-168. doi:10.4314/tv.v20i3.4497; Mathurin Cyrille Tejiokem. Rabies Situation in Cameroon: Role of a pilot initiative of surveillance system reinforcement in improving health authorities awareness. June 9-11, 2015, Gauteng, South Africa. 53p.; Kouamo J., Kana A.G.D., Dongmo C.C.Z. The study of prevalence and associated risk factors of diseases and other clinical conditions diagnosed in dogs and cats in Douala city, Cameroon // Revue Vétérinaire Clinique. 2021; Volume 56, Issue 2: 47-61. doi:10.1016/j.anicom.2021.01.001.; https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/1672

Availability: https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/1672
https://doi.org/10.22625/2072-6732-2024-16-3-133-139

Epidemiological features and psychoneurological consequences of infection of people with the Nipah virus ; Эпидемиологические особенности и психоневрологические последствия инфицирования людей вирусом Нипах

Authors: I. M. Ulyukin, V. V. Rassokhin, A. A. Sechin, E. S. Orlova, A. M. Klementev, И. М. Улюкин, В. В. Рассохин, А. А. Сечин, Е. С. Орлова, А. М. Клементьев

Source: HIV Infection and Immunosuppressive Disorders; Том 16, № 2 (2024); 23-39 ; ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии; Том 16, № 2 (2024); 23-39 ; 2077-9828 ; 10.22328/2077-9828-2024-16-2

Subject Terms: санитарно-эпидемиологический надзор, epidemiological features, disease outbreaks, clinical and laboratory features, neuropsychiatric consequences, medical and psychological support, sanitary and epidemiological supervision, вызванное вирусом Нипах, эпидемиологические особенности, вспышки заболевания, клинико-лабораторные особенности, психоневрологические последствия, медико-психологическое сопровождение

File Description: application/pdf

Relation: https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/907/586; Harit A.K., Ichhpujani R.L., Gupta S. et al. Nipah/Hendra virus outbreak in Siliguri, West Bengal, India in 2001 // Indian J. Med. Res. 2006. Vol. 123, Nо. 4. P. 553–560.; McEntire C.R.S., Song K.W., McInnis R.P. et al. Neurologic Manifestations of the World Health Organization’s List of Pandemic and Epidemic Diseases // Front. Neurol. 2021. Nо. 12. P. 634827. doi:10.3389/fneur.2021.634827.; Bowden T.A., Aricescu A.R., Gilbert R.J. et al. Structural basis of Nipah and Hendra virus attachment to their cell-surface receptor ephrin-B2 // Nat. Struct. Mol. Biol. 2008. Vol. 15, Nо. 6. P. 567–572. doi:10.1038/nsmb.1435.; Anish T.S. Nipah virus is deadly — but smart policy changes can help quell pandemic risk // Nature. 2023. Vol. 622, Nо. 7982. P, 219. doi:10.1038/d41586-023-03162-8.; Prasad A.N., Agans K.N., Sivasubramani S.K. et al. A Lethal Aerosol Exposure Model of Nipah Virus Strain Bangladesh in African Green Monkeys // J. Infect. Dis. 2020. Vol. 21 (Suppl. 4). P. S431–S435. doi:10.1093/infdis/jiz469.; Broder C.C. Henipavirus outbreaks to antivirals: the current status of potential therapeutics // Curr. Opin. Virol. 2012. Vol. 2, Nо. 2. P. 176– 187. doi:10.1016/j.coviro.2012.02.016.; Broder C.C., Weir D.L., Reid P.A. Hendra virus and Nipah virus animal vaccines // Vaccine. 2016. Vol. 34, Nо. 30, P. 3525–3534. doi:10.1016/j.vaccine.2016.03.075.; Singh R.K., Dhama K., Chakraborty S. et al. Nipah virus: epidemiology, pathology, immunobiology and advances in diagnosis, vaccine designing and control strategies — a comprehensive review // Vet. Q. 2019. Vol. 39, Nо. 1. P. 26–55. doi:10.1080/01652176.2019.1580827.; Chua K.B., Bellini W.J., Rota P.A. et al. Nipah virus: a recently emergent deadly paramyxovirus // Science. 2000. Vol. 288, Nо. 5470. P. 1432– 1435. doi:10.1126/science.288.5470.1432.; Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Update: outbreak of Nipah virus — Malaysia and Singapore, 1999 // Morb. Mortal. Wkly Rep. 1999. Vol. 48, Nо. 16. P. 335–337.; Iehle C., Razafitrimo G., Razainirina J. et al. Henipavirus and Tioman virus antibodies in pteropodid bats, Madagascar // Emerg. Infect. Dis. 2007. Vol. 13, Nо. 1. P. 159–161. doi:10.3201/eid1301.060791.; Sun B., Jia L., Liang B. et al. Phylogeography, Transmission, and Viral Proteins of Nipah Virus // Virol. Sin. 2018. Vol. 33, Nо. 5, P. 385–393. doi:10.1007/s12250-018-0050-1.; Mackenzie J.S., Chua K.B., Daniels P.W. et al. Emerging viral diseases of Southeast Asia and the Western Pacific // Emerg. Infect. Dis. 2001. Vol. 7 (Suppl. 3). P. 497–504. doi:10.3201/eid0707.017703.; Gokhale M., Sudeep A.B., Mathapati B. et al. Serosurvey for Nipah virus in bat population of southern part of India // Comp. Immunol. Microbiol. Infect. Dis. 2022. Nо. 85. P. 101800. doi:10.1016/j.cimid.2022.101800.; Soman Pillai V., Krishna G., Veettil V.M. Nipah Virus: Past Outbreaks and Future Containment // Viruses. 2020. Vol. 12, Nо. 4. P. 465. doi:10.3390/v12040465.; Chua K.B., Goh K.J., Wong K.T. et al. Fatal encephalitis due to Nipah virus among pig-farmers in Malaysia // Lancet. 1999. Vol. 354, Nо. 9186. P. 1257–1259. doi:10.1016/S0140-6736(99)04299-3.; Paton N.I., Leo Y.S., Zaki S.R. et al. Outbreak of Nipah-virus infection among abattoir workers in Singapore // Lancet. 1999. Vol. 354, Nо. 9186. P. 1253–1256. doi:10.1016/S0140-6736(99)04379-2.; Chua K.B. Nipah virus outbreak in Malaysia // J. Clin. Virol. 2003. Vol. 26, Nо. 3. P. 265–275. doi:10.1016/s1386–6532(02)00268–8.; Всемирная организация здравоохранения. Новости о вспышках болезней. Вирусная инфекция Нипах — Бангладеш (27.02.2024 г.). URL: https://www.who.int/ru/emergencies/disease-outbreak-news/item/2024-DON508.; Field H., Young P., Yob J.M. et al. The natural history of Hendra and Nipah viruses // Microbes Infect. 2001. Vol. 3, Nо. 4. P. 307–314. doi:10.1016/s1286-4579(01)01384-3.; Luby S.P., Gurley E.S., Hossain M.J. Transmission of human infection with Nipah virus // Clin. Infect. Dis. 2009. Vol. 49, Nо. 11. P. 1743– 1748. doi:10.1086/647951.; Epstein J.H., Rahman S.А., Zambriski J.A. et al. Feral cats and risk for Nipah virus transmission // Emerg. Infect. Dis. 2006. Vol. 12, Nо. 7. P. 1178–1179. doi:10.3201/eid1207.050799.; Luby S.P., Hossain M.J., Gurley E.S. et al. Recurrent zoonotic transmission of Nipah virus into humans, Bangladesh, 2001–2007 // Emerg. Infect. Dis. 2009. Vol. 15, Nо. 8. P. 1229–1235. doi:10.3201/eid1508.081237.; Luby S.P. The pandemic potential of Nipah virus // Antiviral. Res. 2013. Vol. 100, Nо. 1. P. 38–43. doi:10.1016/j.antiviral.2013.07.011.; Aljofan M. Hendra and Nipah infection: emerging paramyxoviruses // Virus Res. 2013. Vol. 177, Nо. 2. P. 119–126. doi:10.1016/j.virusres.2013.08.002.; Thomas B., Chandran P., Lilabi M.P. et al. Nipah Virus Infection in Kozhikode, Kerala, South India, in 2018: Epidemiology of an Outbreak of an Emerging Disease // Indian J. Community Med. 2019. Vol. 44, Nо. 4. P. 383–387. doi:10.4103/ijcm.IJCM_198_19.; Wilson A., Warrier A., Rathish B. Contact tracing: a lesson from the Nipah virus in the time of COVID-19 // Trop. Doct. 2020. Vol. 50, Nо. 3. P. 174–175. doi:10.1177/0049475520928217.; Tan K., Sarji S.A., Tan C.-T. et al. Patients with asymptomatic Nipah virus infection may have abnormal cerebral MR imaging // Neurol. J. Southeast Asia. 2000. Nо. 5. P. 69–73.; Tan C.T., Tan K.S. Nosocomial transmissibility of Nipah virus // J. Infect. Dis. 2001. Vol. 184, Nо. 10. P. 1367. doi:10.1086/323996.; Lee K.E., Umapathi T., Tan C.B. et al. The neurological manifestations of Nipah virus encephalitis, a novel paramyxovirus // Ann. Neurol. 1999. Vol. 46, Nо. 3. P. 428–432.; Siva S., Chong H., Tan C. Ten year clinical and serological outcomes of Nipah virus infection // Neurology Asia. 2009, Nо. 14. P. 53–58.; Public Health England. Nipah virus: epidemiology, outbreaks and guidance. 2018. URL: https://www.gov.uk/guidance/nipah-virus-epidemiology-outbreaks-and-guidance#full-publication-update-history.; Mandell D. and Bennett’s principles and practice of infectious diseases / ed. J. E. Bennett, R. Dolin, M. J. Blaser. 8th ed. Elsevier Health Sciences: 2015, Ch. 163. P. 1974–1980. doi: https://doi.org/10.1016/C2012-1-00075-6.; Kenmoe S., Demanou M., Bigna J.J. et al. Case fatality rate and risk factors for Nipah virus encephalitis: A systematic review and meta-analysis // J. Clin. Virol. 2019, Nо. 117. P. 19–26. doi:10.1016/j.jcv.2019.05.009.; Mounts A.W., Kaur H., Parashar U.D. et al. A cohort study of health care workers to assess nosocomial transmissibility of Nipah virus, Malaysia, 1999 // J. Infect. Dis. 2001. Nо. 183. P. 810–813. doi:10.1086/318822.; Chan K.P., Rollin P.E., Ksiazek T.G. et al. A survey of Nipah virus infection among various risk groups in Singapore // Epidemiol. Infect. 2002. Vol. 128, Nо. 1. P. 93–98. doi:10.1017/s0950268801006422.; Hossain M.J., Gurley E.S., Montgomery J.M. et al. Clinical presentation of nipah virus infection in Bangladesh // Clin. Infect. Dis. 2008. Vol. 46, Nо. 7. P. 977–984. doi:10.1086/529147.; Luby S.P., Rahman M., Hossain M.J. et al. Foodborne transmission of Nipah virus, Bangladesh // Emerg. Infect. Dis. 2006. Vol. 12, Nо. 12. P. 1888–1894. doi:10.3201/eid1212.060732.; Montgomery J.M., Hossain M.J., Gurley E. et al. Risk factors for Nipah virus encephalitis in Bangladesh // Emerg. Infect. Dis. 2008. Vol. 14, Nо. 10. P. 1526–1532. doi:10.3201/eid1410.060507.; Rahman M.A., Hossain M.J., Sultana S. et al. Date palm sap linked to Nipah virus outbreak in Bangladesh, 2008 // Vector Borne Zoonotic Dis. 2012. Vol. 12, Nо. 1. P. 65–72. doi:10.1089/vbz.2011.0656.; Sazzad H.M., Hossain M.J., Gurley E.S. et al. Nipah virus infection outbreak with nosocomial and corpse-to-human transmission, Bangladesh // Emerg. Infect. Dis. 2013. Vol. 19, Nо. 2. P. 210–217. doi:10.3201/eid1902.120971.; Yob J.M., Field H., Rashdi A.M. et al. Nipah virus infection in bats (order Chiroptera) in peninsular Malaysia // Emerg. Infect. Dis. 2001. Vol. 7, Nо. 3. P. 439–441. doi:10.3201/eid0703.010312.; Epstein J.H., Prakash V., Smith C.S. et al. Henipavirus infec tion in fruit bats (Pteropus giganteus), India // Emerg. Infect. Dis. 2008. Vol. 14, Nо. 8. P. 1309–1311. doi:10.3201/eid1408.071492.; Khan S.U., Gurley E.S., Hossain M.J. et al. A randomized controlled trial of interventions to impede date palm sap contamination by bats to prevent Nipah virus transmission in Bangladesh // PLoS One. 2012. Vol. 7, Nо. 8. e42689. doi:10.1371/journal.pone.0042689.; Kerry R.G., Malik S., Redda Y.T. et al. Nano-based approach to combat emerging viral (NIPAH virus) infection // Nanomedicine. 2019, Nо. 18. P. 196–220. doi:10.1016/j.nano.2019.03.004.; Ochani R.K., Batra S., Shaikh A., Asad A. Nipah virus — the rising epidemic: a review // Infez. Med. 2019. Vol. 27, Nо. 2. P. 117–127.; Parashar U.D., Sunn L.M., Ong F. et al. Case-control study of risk factors for human infection with a new zoonotic paramyxovirus, Nipah virus, during a 1998–1999 outbreak of severe encephalitis in Malaysia // J. Infect. Dis. 2000. Vol. 181, Nо. 5. P. 1755–1759. doi:10.1086/315457.; Wong K.T., Shieh W.J., Kumar S. et al. Nipah virus infection: pathology and pathogenesis of an emerging paramyxoviral zoonosis // Am. J. Pathol. 2002. Vol. 161, Nо. 6. P. 2153–2167. doi:10.1016/S0002-9440(10)64493-8.; Goh K.J., Tan C.T., Chew N.K. et al. Clinical features of Nipah virus encephalitis among pig farmers in Malaysia // N. Engl. J. Med. 2000. Vol. 342, Nо. 17. P. 1229–1235. doi:10.1056/NEJM200004273421701.; Tan C.T., Chua K.B. Nipah virus encephalitis // Curr. Infect. Dis. Rep. 2008. Vol. 10, Nо. 4. P. 315–320. doi:10.1007/s11908-008-0051-6.; Ang B.S.P., Lim T.C.C., Wang L. Nipah Virus Infection // J. Clin. Microbiol. 2018. Vol. 56, Nо. 6. e01875–17. doi:10.1128/JCM.01875–17.; Chandni R., Renjith T.P., Fazal A. et al. Clinical Manifestations of Nipah Virus-Infected Patients Who Presented to the Emergency Department During an Outbreak in Kerala State in India, May 2018 // Clin. Infect. Dis. 2020. Vol. 71, Nо. 1. P. 152–157. doi:10.1093/cid/ciz789.; Ong K.C., Wong K.T. Henipavirus Encephalitis: Recent Developments and Advances // Brain Pathol. 2015. Vol. 25, Nо. 5. P. 605–613. doi:10.1111/bpa.12278.; Tan C.T., Goh K.J., Wong K.T. et al. Relapsed and late-onset Nipah encephalitis // Ann. Neurol. 2002. Vol. 51, Nо. 6. P. 703–708. doi:10.1002/ana.10212.; Yadav P.D., Sahay R.R., Balakrishnan A. et al. Nipah Virus Outbreak in Kerala State, India Amidst of COVID-19 Pandemic // Front. Public Health. 2022. Nо. 10. P. 818545. doi:10.3389/fpubh.2022.818545.; Lim C.C., Sitoh Y.Y., Hui F. et al. Nipah viral encephalitis or Japanese encephalitis? MR findings in a new zoonotic disease // Am. J. Neuroradiol. 2000. Vol. 21, Nо. 3. P. 455–461.; Arunkumar G., Chandni R., Mourya D.T. et al. Outbreak Investigation of Nipah Virus Disease in Kerala, India, 2018 // J. Infect. Dis. 2019. Vol. 219, Nо. 12. P. 1867–1878. doi:10.1093/infdis/jiy612.; Anam A.M., Ahmad J., Huq S.M.R., Rabbani R. Nipah virus encephalitis: MRI findings // J. R. Coll. Physicians Edinb. 2019. Vol. 49, Nо. 3. P. 227–228. doi:10.4997/JRCPE.2019.312.; Ng B.Y., Lim C.C., Yeoh A., Lee W.L. Neuropsychiatric sequelae of Nipah virus encephalitis // J. Neuropsychiatry Clin. Neurosci. 2004. Vol. 16, Nо. 4. P. 500–504. doi:10.1176/jnp.16.4.500.; Lim C.C., Lee K.E., Lee W.L. et al. Nipah virus encephalitis: serial MR study of an emerging disease // Radiology. 2002. Vol. 222, Nо. 1. P. 219– 226. doi:10.1148/radiol.2221010499.; Bradel-Tretheway B.G., Zamora J.L.R., Stone J.A. et al. Nipah and Hendra Virus Glycoproteins Induce Comparable Homologous but Distinct Heterologous Fusion Phenotypes // J. Virol. 2019. Vol. 93, Nо. 13. e00577–19. doi:10.1128/JVI.00577-19.; Sarji S.A., Abdullah B.J., Goh K.J. et al. MR imaging features of Nipah encephalitis // Am. J. Roentgenol. 2000. Vol. 175, Nо. 2. P. 437–442. doi:10.2214/ajr.175.2.1750437.; Sejvar J.J., Hossain J., Saha S.K. et al. Long-term neurological and functional outcome in Nipah virus infection // Ann. Neurol. 2007. Vol. 62, Nо. 3. P. 235–242. doi:10.1002/ana.21178.; Hsu V.P., Hossain M.J., Parashar U.D. et al. Nipah virus encephalitis reemergence, Bangladesh // Emerg. Infect. Dis. 2004. Vol. 1 0, Nо. 12. P. 2082–2087. doi:10.3201/eid1012.040701.; Steffen D.L., Xu K., Nikolov D.B., Broder C.C. Henipavirus mediated membrane fusion, virus entry and targeted therapeutics // Viruses. 2012. Vol. 4, Nо. 2. P. 280–308. doi:10.3390/v4020280.; Halpin K., Hyatt A.D., Fogarty R. et al. Pteropid bats are confirmed as the reservoir hosts of henipaviruses: a comprehensive experimental study of virus transmission // Am. J. Trop. Med. Hyg. 2011. Vol. 85, Nо. 5. P. 946–951. doi:10.4269/ajtmh.2011.10-0567.; Xia H., Huang Y., Ma H. et al. Biosafety Level 4 Laboratory User Training Program, China // Emerg. Infect. Dis. 2019. Vol. 25, Nо. 5. e180220. doi:10.3201/eid2505.180220.; Федеральный закон РФ от 30.12.2020 г. № 492-ФЗ «О биологической безопасности в Российской Федерации» [Federal Law of the Russian Federation dated December 30, 2020 No. 492-FZ «On biological safety in the Russian Federation» (In Russ.)]. URL: https://rg.ru/documents/2021/01/11/bio-dok.html.; Практическое руководство по биологической безопасности в лабораторных условиях. 4-е изд. Женева: Всемирная организация здравоохранения; 2023. 133 с. URL: https://iris.who.int/bitstream/handle/10665/365602/9789240059283-rus.pdf?sequence=1&isAllowed=y.; Gibney B. Rare and Imported Pathogens Laboratory (RIPL). Specimen referral guidelines and service user manual. UKHSA Porton Version 28, April 2024, Q-Pulse SPATH039. UK Health Security Agency, Salisbury: Rare and Imported Pathogens Laboratory, 2024. 37 p. URL: https://assets.publishing.service.gov.uk/media/65fd905ff1d3a0001132ae15/SPATH039-RIPL-user-manual-April-2024-version-28.pdf; Sazzad H.M., Luby S.P., Stroher U. et al. Exposure-based screening for Nipah virus encephalitis, Bangladesh // Emerg. Infect. Dis. 2015. Vol. 21, Nо. 2. P. 349–351. doi:10.3201/eid2102.141129.; Chiang C.F., Lo M.K., Rota P.A. et al. Use of monoclonal antibodies against Hendra and Nipah viruses in an antigen capture ELISA // Virol. J. 2010. Nо. 7. P, 115. doi:10.1186/1743-422X-7-115.; Tiong V., Lam C.W., Phoon W.H. et al. Serum from Nipah Virus Patients Recognises Recombinant Viral Proteins Produced in Escherichia coli // Jpn. J. Infect. Dis. 2017. Vol. 70, Nо. 1. P. 26–31. doi:10.7883/yoken.JJID.2015.501.; Fischer K., Diederich S., Smith G. et al. Indirect ELISA based on Hendra and Nipah virus proteins for the detection of henipavirus specific antibodies in pigs // PLoS One. 2018. Vol. 13, Nо. 4. e0194385. doi:10.1371/journal.pone.0194385.; Wang L.F., Daniels P. Diagnosis of henipavirus infection: current capabilities and future directions // Curr. Top Microbiol. Immunol. 2012. Nо. 359. P. 179–196. doi:10.1007/82_2012_215.; Kulkarni D.D., Tosh C., Venkatesh G., Senthil Kumar D. Nipah virus infection: current scenario // Indian J. Virol. 2013. Vol. 24, Nо. 3. P. 398– 408. doi:10.1007/s13337-013-0171-y.; Daniels P., Ksiazek T., Eaton B.T. Laboratory diagnosis of Nipah and Hendra virus infections // Microbes Infect. 2001. Vol. 3, Nо. 4. P. 289– 295. doi:10.1016/s1286-4579(01)01382-x.; Chadha M.S., Comer J.A., Lowe L. et al. Nipah virus associated encephalitis outbreak, Siliguri, India // Emerg. Infect. Dis. 2006. Vol. 12, Nо. 2. P. 235–240. doi:10.3201/eid1202.051247.; Chua K.B., Lam S.K., Tan C.T. et al. High mortality in Nipah encephalitis is associated with presence of virus in cerebro spinal fluid // Ann. Neurol. 2000. Vol. 48, Nо. 5. P. 802–880.; Alam A.M. Nipah virus, an emerging zoonotic disease causing fatal encephalitis // Clin. Med. (Lond). 2022. Vol. 22, Nо. 4. P. 348–352. doi:10.7861/clinmed.2022-0166.; Pallister J., Middleton D., Crameri G. et al. Chloroquine administration does not prevent Nipah virus infection and disease in ferrets // J. Virol. 2009. Vol. 83, Nо. 22. P. 11979–11982. doi:10.1128/JVI.01847-09.; Freiberg A.N., Worthy M.N., Lee B., Holbrook M.R. Combined chloroquine and ribavirin treatment does not prevent death in a hamster model of Nipah and Hendra virus infection // J. Gen. Virol. 2010. Nо. 91 (Pt. 3). P. 765–772. doi:10.1099/vir.0.017269-0.; Chong H.T., Kamarulzaman A., Tan C.T. et al. Treatment of acute Nipah encephalitis with ribavirin // Ann. Neurol. 2001. Vol. 49, Nо. 6. P. 810– 813. doi:10.1002/ana.1062.; Georges-Courbot M.C., Contamin H., Faure C. et al. Poly(I)- poly(C12U) but not ribavirin prevents death in a hamster model of Nipah virus infection // Antimicrob. Agents Chemother. 2006. Vol. 50, Nо. 5. P. 1768–1772. doi:10.1128/AAC.50.5.1768-1772.2006.; Zhu Z., Dimitrov A.S., Bossart K.N. et al. Potent neutraliza tion of Hendra and Nipah viruses by human monoclonal antibodies // J. Virol. 2006. Vol. 80, Nо. 2. P. 891–899. doi:10.1128/JVI.80.2.891-899.2006.; Bossart K.N., Zhu Z., Middleton D. et al. A neutralizing human monoclonal antibody protects against lethal disease in a new ferret model of acute Nipah virus infection // PLoS Pathog. 2009. Vol. 5, Nо. 10. e1000642. doi:10.1371/journal.ppat.1000642.; Gurley E.S., Montgomery J.M., Hossain M.J. et al. Person-to person transmission of Nipah virus in a Bangladeshi community // Emerg. Infect. Dis. 2007. Vol. 13, Nо. 7. P. 1031–1037. doi:10.3201/eid1307.061128.; Bird B.H., Mazet J.A.K. Detection of Emerging Zoonotic Pathogens: An Integrated One Health Approach // Annu. Rev. Anim. Biosci. 2018. Nо. 6. P. 121–139. doi:10.1146/annurev-animal-030117-014628.; The Lancet. Nipah virus control needs more than R&D // Lancet. 2018. Vol. 391, Nо. 10137. P. 2295. doi:10.1016/S0140-6736(18)31264-9.; Johnson K., Vu M., Freiberg A.N. Recent advances in combating Nipah virus // Fac. Rev. 2021. Nо. 10. P. 74. doi:10.12703/r/10-74.; Gomez Roman R., Wang L.F., Lee B. et al. Nipah@20: Lessons Learned from Another Virus with Pandemic Potential // mSphere. 2020. Vol. 5, Nо. 4. e00602–20. doi:10.1128/mSphere.00602-20.; World Health Organization. Prioritizing Diseases for Research and Development in Emergency Contexts. Geneva: World Health Organization. 2020. URL: https://www.who.int/activities/prioritizing-diseases-for-research-and-development-in-emergency-contexts.; Banerjee S., Gupta N., Kodan P. et al. Nipah virus disease: A rare and intractable disease // Intractable Rare Dis. Res. 2019. Vol. 8, Nо. 1. P. 1– 8. doi:10.5582/irdr.2018.01130.; Yadav P.D., Raut C.G., Shete A.M. et al. Detection of Nipah virus RNA in fruit bat (Pteropus giganteus) from India // Am. J. Trop. Med. Hyg. 2012. Vol. 87, Nо. 3. P. 576–578. doi:10.4269/ajtmh.2012.11-0416.; Hassan M.Z., Shirin T., Satter S.M. et al. Nipah virus disease: what can we do to improve patient care? // Lancet Infect. Dis. 2024. S1473- 3099(23)00707-7. doi:10.1016/S1473-3099(23)00707-7.

Availability: https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/907
https://doi.org/10.22328/2077-9828-2024-16-2-23-39

Epidemiological Surveillance of Tuberculosis: from Molecular Methods to Genomic Studies ; Эпидемиологический надзор за туберкулезом: от молекулярных методов к геномным исследованиям

Authors: O. B. Ogarkov, E. D. Savilov, S. N. Zhdanova, О. Б. Огарков, Е. Д. Савилов, С. Н. Жданова

Source: Epidemiology and Vaccinal Prevention; Том 22, № 6 (2023); 155-161 ; Эпидемиология и Вакцинопрофилактика; Том 22, № 6 (2023); 155-161 ; 2619-0494 ; 2073-3046

Subject Terms: геномные исследования, epidemiological surveillance, molecular methods, genomic studies, эпидемиологический надзор, молекулярные методы

File Description: application/pdf

Relation: https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/1916/1000; Брико Н.И., Покровский В.И. Глобализация и эпидемический процесс // Эпидемиология и инфекционные болезни. - 2010. -№ 4 - С. 4–10.; Брико Н. И., Онищенко В. И., Покровский В. И. Руководство по эпидемиологии инфекционных болезней. Москва: Издательство «Медицинское информационное агентство» 2019.Т.1.С.46.; Савилов Е. Д. Общая эпидемиология: курс лекций. Москва: Издательство «Медицинское информационное агентство». 2020. 432 с.; European Centre for Disease Prevention and Control. ECDC roadmap for integration of molecular and genomic typing into European-level surveillance and epidemic preparedness – Version 2.1, 2016-19. Stockholm: ECDC; 2016. ISBN 978-92-9193-884-1 Available at: https://ecdc.europa.eu/sites/portal/files/media/en/publications/Publications/molecular-typing-EU-surveillance-epidemic-preparedness-2016-19-roadmap.pdf. 3 April. 2023; European Centre for Disease Prevention and Control. ECDC strategic framework for the integration of molecular and genomic typing into European surveillance and multicountry outbreak investigations. 2019–2021. Stockholm: ECDC; 2019. ISBN 978-92-9498-310-7. doi 10.2900/805317; Andrés M, van der Werf M.J., Ködmön C., et al. Survey study group. Molecular and genomic typing for tuberculosis surveillance: A survey study in 26 European countries. PLoS One. 2019;14(3):e0210080. doi:10.1371/journal.pone.0210080.; Rado T.A., Bates J.H., Engel H.W., et al. World Health Organization studies on bacteriophage typing of mycobacteria. Subdivision of the species Mycobacterium tuberculosis. Am Rev Respir Dis. 1975;111(4):459–68. doi:10.1164/arrd.1975.111.4.459.; Cave M.D., Eisenach K.D., McDermott P.F., et al. IS6110: conservation of sequence in the Mycobacterium tuberculosis complex and its utilization in DNA fingerprinting. Mol. Cell Probes. 1991;5(1):73–80. doi:10.1016/0890-8508(91)90040-q.; Groenen P.M., Bunschoten A.E., van Soolingen D., van Embden J.D. Nature of DNA polymorphism in the direct repeat cluster of Mycobacterium tuberculosis; application for strain differentiation by a novel typing method. Mol. Microbiol. 1993.10(5):1057–65. doi:10.1111/j.1365-2958.1993.tb00976.x.; Kamerbeek J., Schouls L., Kolk A., et al. Simultaneous detection and strain differentiation of Mycobacterium tuberculosis for diagnosis and epidemiology. J. Clin. Microbiol. 1997. 35(4):907–14. doi:10.1128/jcm.35.4.907-914.1997.; Edlin B.R., Tokars J.I., Grieco M.H., et al. An outbreak of multidrug-resistant tuberculosis among hospitalized patients with the acquired immunodeficiency syndrome. N. Engl.J. Med. 1992. 4;326(23):1514–21. doi:10.1056/NEJM199206043262302.; Kurepina N.E., Sreevatsan S., Plikaytis B.B., et al. Characterization of the phylogenetic distribution and chromosomal insertion sites of five IS6110 elements in Mycobacterium tuberculosis: non-random integration in the dnaA-dnaN region. Tuber. Lung. Dis. 1998. 79(1):31–42. doi:10.1054/tuld.1998.0003; Bifani P.J., Mathema B., Kurepina N.E., Kreiswirth B.N. Global dissemination of the Mycobacterium tuberculosis W-Beijing family strains. Trends Microbiol. 2002 . 10(1):45–52. doi:10.1016/s0966-842x(01)02277-6.; Нарвская О. В., Мокроусов И. В., Оттен Т. Ф., Вишневский Б. И. Генетическое маркирование полирезистентных штаммов Мycobacterium tuberculosis, выделенных на Северо-Западе России. // Туберкулез и болезни легких. 1999. - № 1. - С. 39–41; Hirsh A.E., Tsolaki A.G., DeRiemer K., et al. Stable association between strains of Mycobacterium tuberculosis and their human host populations. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 2004 . 6;101(14):4871–6. doi:10.1073/pnas.0305627101.; Tsolaki A.G., Hirsh A.E., DeRiemer K., et al. Functional and evolutionary genomics of Mycobacterium tuberculosis: insights from genomic deletions in 100 strains Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 2004 6;101(14):4865–70. doi:10.1073/pnas.0305634101.; Gagneux S., DeRiemer K., Van T., et al. Variable host-pathogen compatibility in Mycobacterium tuberculosis. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 2006. 21;103(8):2869–73. doi:10.1073/pnas.0511240103.; European Centre for Disease Prevention and Control/WHO Regional Office for Europe. Tuberculosis surveillance in Europe 2009. Stockholm: European Centre for Disease Prevention and Control. ISBN 978-92-9193-237-5 ISSN 1635-270X DOI 10.2900/37573; Supply P., Allix C., Lesjean S., et al. Proposal for standardization of optimized mycobacterial interspersed repetitive unit-variable-number tandem repeat typing of Mycobacterium tuberculosis. J. Clin. Microbiol. 2006. 44(12):4498–510. doi:10.1128/JCM.01392-06; Struelens M. J., Brisse S. From molecular to genomic epidemiology: transforming surveillance and control of infectious diseases. Euro Surveill. 2013. 18(4):pii=20386. doi. org/10.2807/ese.18.04.20386-en; Mokrousov I. Current topics of molecular mycobacteriology. Infect. Genet. Evol. 2019.73:132–138. doi:10.1016/j.meegid.2019.04.027.; Mokrousov I., Otten T., Vyazovaya A., et al. PCR-based methodology for detecting multidrug-resistant strains of Mycobacterium tuberculosis Beijing family circulating in Russia. Eur. J. Clin. Microbiol. Infect. Dis. 2003. 22(6):342–8. doi:10.1007/s10096-003-0944-0.; García De Viedma, D., Pérez-Lago, L. The evolution of genotyping strategies to detect, analyze, and control transmission of tuberculosis. Microbiology spectrum. 2018. 6(5), 6–5. doi:10.1128/microbiolspec.MTBP-0002-2016; Дымова М. А., Ляшенко А. А., Потейко П. И. и др. Генетическое разнообразие штаммов Mycobacterium tuberculosis, циркулирующих на территории Харьковской области Украины // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. – 2011. – Т. 26, №. 1. – С. 19–23.; Умпелева Т. В., Кравченко М. А., Еремеева Н. И. И др. Молекулярно-генетическая характеристика штаммов Мycobacterium tuberculosis, циркулирующих на территории уральского региона России // Инфекция и иммунитет. - 2013. - Т. 3, № 1. - С. 21–28.; Casali N., Nikolayevskyy V., Balabanova Y., et al. Microevolution of extensively drug-resistant tuberculosis in Russia. Genome Res. 2012. №22(4). Р. 735–45. doi:10.1101/gr.128678.111.; Casali N., Nikolayevskyy V., Balabanova Y., et al. Evolution and transmission of drug-resistant tuberculosis in a Russian population. Nat. Genet. 2014. № 46. Р. 279–286. doi:10.1038/ng.2878; Mokrousov I., Vyazovaya A., Otten T., et al. Mycobacterium tuberculosis population in northwestern Russia: an update from Russian-EU/Latvian border region. PLoS One. 2012. № 7(7). e41318. doi:10.1371/journal.pone.0041318.; Mokrousov I., Narvskaya O., Vyazovaya A., et al Russian «successful» clone B0/W148 of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: a multiplex PCR assay for rapid detection and global screening. Journal of Clinical Microbiology. 2012. Vol.50, №11. Р. 3757–3759. doi:10.1128/JCM.02001-12.; Mokrousov I., Vyazovaya A., Otten T., et al. Mycobacterium tuberculosis population in northwestern Russia: an update from Russian-EU/Latvian border region . PLoS One. 2012. №7. e41318. doi:10.1371/journal.pone.0041318.; Mokrousov I. Insights into the origin, emergence, and current spread of a successful Russian clone of Mycobacterium tuberculosis. Clin. Microbiol. Rev. 2013. № 26. Р. 342–360.; Mokrousov I. Mycobacterium tuberculosis phylogeography in the context of human migration and pathogen’s pathobiology: Insights from Beijing and Ural families. Tuberculosis (Edinb). 2015. № 95, Suppl 1:S167–176.; Zhdanova S, Heysell SK, Ogarkov O, et al. Primary multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis in 2 regions, Eastern Siberia, Russian Federation. Emerg. Infect. Dis. 2013. 19(10):1649–52. doi:10.3201/eid1910.121108.; Coll F, McNerney R, Guerra-Assunção JA, et al. A robust SNP barcode for typing Mycobacterium tuberculosis complex strains. Nat Commun. 2014.5:4812. doi:10.1038/ncomms5812.; Napier G, Campino S, Merid Y, et al. Robust barcoding and identification of Mycobacterium tuberculosis lineages for epidemiological and clinical studies. Genome Med. 2020. 12(1):114. doi:10.1186/s13073-020-00817-3.; Sinkov V, Ogarkov O, Mokrousov I, et al. New epidemic cluster of pre-extensively drug resistant isolates of Mycobacterium tuberculosis Ural family emerging in Eastern Europe. BMC Genomics. 2018. 19(1):762. doi:10.1186/s12864-018-5162-3; Жданова С. Н., Огарков О. Б., Степаненко Л. А. и др. Применение делеционного анализа по RD105 для выявления генотипа Пекин Mycobacterium tuberculosis. // Бюллетень Восточно-Сибирского научного центра Сибирского отделения Российской академии медицинских наук. - 2011. -№ 2 (78). - С. 194–197.; Синьков В. В., Савилов Е. Д., Огарков О. Б. Реконструкция эпидемической истории «Пекинского» генотипа Mycobacterium tuberculosis в России и странах бывшего СССР по результатам сполиготипирования. // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. - 2011. -№ 3. - С. 25–29.; Синьков В. В., Савилов Е. Д., Огарков О. Б. Эпидемиология туберкулёза в России: молекулярные и исторические доказательства в пользу сценария распространения пекинского генотипа M. tuberculosis в XX в // Туберкулез и болезни легких. – 2012. – № 3. – С. 57–62.; Огарков О. Б., Медведева Т. В., Zozio T. и др. Молекулярное типирование штаммов микобактерий туберкулеза в Иркутской области (Восточная Сибирь) в 2000-2005 гг. // Молекулярная медицина. – 2007. – № 2. – С. 33–38.; Shitikov E., Vyazovaya A., Malakhova M., et al. Simple Assay for Detection of the Central Asia Outbreak Clade of the Mycobacterium tuberculosis Beijing Genotype. J. Clin. Microbiol. 2019. 25;57(7):e00215–19. doi:10.1128/JCM.00215-19.; Vinogradova T, Dogonadze M, Zabolotnykh N, et al. Extremely lethal and hypervirulent Mycobacterium tuberculosis strain cluster emerging in Far East, Russia. Emerg Microbes Infect. 2021.10(1):1691–1701. doi:10.1080/22221751.2021.1967704.; Жданова С. Н., Огарков О. Б., Винокурова М. К. и др. Моделирование эпидемического распространения генотипа Beijing Mycobacterium tuberculosis в Республике Саха (Якутия) // Туберкулёз и болезни лёгких. –2017. – Т. 95, № 7. – С. 40–47. DOI:10.21292/2075-1230-2017-95-7-40-47; Zhdanova S, Mokrousov I, Orlova E, et al. Transborder molecular analysis of drug-resistant tuberculosis in Mongolia and Eastern Siberia, Russia. Transbound. Emerg .Dis. 2022. 69(5):e1800–e1814. doi:10.1111/tbed.14515; Mokrousov I. The quiet and controversial: Ural family of Mycobacterium tuberculosis. Infect. Genet. Evol. 2012. 12(4):619–29. doi:10.1016/j.meegid.2011.09.026.; Жданова С. Н., Огарков О. Б., Алексеева Г. И. и др. Генетическое разнообразие изолятов микобактерий туберкулеза из республики Саха (Якутия), Россия. // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. -2016. -Т. 34. № 2. - С. 43–48.; Савилов Е. Д., Брико Н. И., Круликовский А. И. Становление междисциплинарного взаимодействия эпидемиологии и патологической физиологии в период постнеклассического развития науки // Вестник Российской академии медицинских наук. - 2022. - Т. 77. - №3. - C. 230–237. doi:10.15690/vramn2011; https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/1916

Availability: https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/1916
https://doi.org/10.31631/2073-3046-2023-22-6-155-161

The State of Immunity of the Population of the Russian Federation to Rubella during the Elimination of Infection ; Состояние иммунитета населения Российской Федерации к краснухе в период элиминации инфекции

Authors: L. A. Barkinkhoeva, N. V. Turaeva, O. V. Tsvirkun, A. G. Gerasimova, Л. А. Баркинхоева, Н. В. Тураева, О. В. Цвиркун, А. Г. Герасимова

Source: Epidemiology and Vaccinal Prevention; Том 23, № 3 (2024); 38-46 ; Эпидемиология и Вакцинопрофилактика; Том 23, № 3 (2024); 38-46 ; 2619-0494 ; 2073-3046

Subject Terms: иммунитет, elimination, serological monitoring, epidemiological surveillance, vaccination, immunity, элиминация, серологический мониторинг, эпидемиологический надзор, вакцинация

File Description: application/pdf

Relation: https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/2012/1034; Ежемесячный обновленный отчет о кори и краснухе – Европейский регион ВОЗ – 2024 г. Доступно на: www.who.int.; Eliminating measles and rubella in the WHO European Region; Integrated guidance for surveillance, outbreak response and verification of elimination. Copenhagen: WHO Regional Office for Europe; 2024. Доступно на: www.who.int.; Цвиркун О. В., Самойлович Е. О., Тихонова Н. Т. и др. Сопоставление результатов исследования состояния популяционного иммунитета к вирусу краснухи у населения Республики Беларусь и Российской Федерации. Инфекция и иммунитет. 2022. Т. 12., №5. C. 909–918.; Тураева Н. В., Герасимова А. Г., Цвиркун О. В. и др. Элиминация краснушной инфекции в России. Научное обеспечение противоэпидемической защиты населения: актуальные проблемы и решения. 2019. С. 115–117.; Фельдблюм И. B., Романенко В. В., Субботина К. А. и др. Безопасность и иммунологическая эффективность отечественной комбинированной тривакцины для профилактики кори, краснухи и эпидемического паротита Вактривир® при иммунизации детей 12 месяцев и 6 лет (результаты простого слепого мультицентрового сравнительного рандомизированного клинического исследования). Эпидемиология и Вакцинопрофилактика. 2021. Т. 20., №1. С.32–43.; Таточенко В. К., Озерецковский Н. А. Иммунопрофилактика 2020. (Справочник). ПедиатрЪ. Москва. 2020.; Measles and rubella strategic framework 2021–2030. Доступно на: www.who.int.; Чехляева Т. С., Цвиркун О. В., Тураева Н. В. и др. Оценка статуса элиминации краснухи в Российской Федерации в 2019 г. Инфекция и иммунитет. 2022. Т. 12., №1. C. 85–94.; Баркинхоева Л. А., Тураева Н. В., Цвиркун О. В., Герасимова А. Г. Актуальные вопросы эпидемиологии краснухи в период ее элиминации. В книге: Современная иммунопрофилактика: вызовы, возможности, перспективы. Сборник тезисов Всероссийской научно-практической конференции с международным участием. 2021. С. 14.; https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/2012

Availability: https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/2012
https://doi.org/10.31631/2073-3046-2024-23-3-38-46

Biosafety and Genomic Epidemiological Surveillance ; Биобезопасность и геномный эпидемиологический надзор

Authors: V. G. Akimkin, T. A. Semenenko, K. F. Khafizov, S. V. Ugleva, D. V. Dubodelov, E. D. Sverdlov, A. S. Cherkashina, G. A. Gasanov, M. I. Nadtoka, N. P. Rumyantseva, Yu. V. Mikhailova, A. A. Shelenkov, A. S. Esman, I. V. Alekseenko, L. G. Kondratyeva, R. M. Beregovykh, В. Г. Акимкин, Т. А. Семененко, К. Ф. Хафизов, С. В. Углева, Д. В. Дубоделов, Е. Д. Свердлов, А. С. Черкашина, Г. А. Гасанов, М. И. Надтока, Н. П. Румянцева, Ю. В. Михайлова, А. А. Шеленков, А. С. Есьман, И. В. Алексеенко, Л. Г. Кондратьева, Р. М. Береговых

Source: Epidemiology and Vaccinal Prevention; Том 23, № 5 (2024); 4-12 ; Эпидемиология и Вакцинопрофилактика; Том 23, № 5 (2024); 4-12 ; 2619-0494 ; 2073-3046

Subject Terms: глобальные угрозы, epidemiology, genomic epidemiological surveillance, COVID-19, SARS-CoV-2, molecular genetic monitoring, global threats, эпидемиология, геномный эпидемиологический надзор, молекулярно-генетический мониторинг

File Description: application/pdf

Relation: https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/2078/1064; Акимкин В. Г., Зверев В. В., Кирпичников М. П. и др. Эпидемиологические, клеточные, генетические и эпигенетические аспекты биобезопасности. Вестник Российской академии наук. 2024; 94 (3): 287–298. doi:10.31857/S0869587324030127.; Ляпин М. Н., Кутырев В. В. Актуальные проблемы биобезопасности. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2013; 90 (1): 97–102.; Акимкин В. Г., Семененко Т. А., Дубоделов Д. В. и др. Теория саморегуляции паразитарных систем и COVID-19. Вестник РАМН. 2024;79(1):33–41. doi:10.15690/vramn11607; Белащенко Д. А., Шоджонов И. Ф. К вопросу об обеспечении биологического суверенитета Российской Федерации. Via in tempore. История. Политология. 2023; 50(4): 1084–1094. doi:10.52575/2687-0967-2023-50-4-1084-1094; Семененко Т.А. Роль банка сывороток крови в системе биологической безопасности страны. Вестник Росздравнадзора. 2010;(3):55–8.; Орехов С. Н., Мохов А. А., Яворский А. Н. Устойчивость к антимикробным средствам - фактор риска системы биобезопасности. Безопасность и риск фармакотерапии. 2023;11(3):336–347. doi:10.30895/2312-7821-2023-11-3-336-347; COVID-19: U.S. Impact on Antimicrobial Resistance, Special Report 2022. Centers for Disease Control and Prevention, National Center for Emerging and Zoonotic Infectious Diseases, Division of Healthcare Quality Promotion; 2022. doi:10.15620/cdc:117915; Bracing for Superbugs. Strengthening environmental action in the One Health response to antimicrobial resistance. 2023 United Nations Environment Programme. https://www.unep.org/resources/superbugs/environmental-action. Ссылка активна на 4 августа 2024.; WHO. 2021 AWaRe classification. Доступно на: https://www.who.int/publications/i/item/2021-aware-classification. Ссылка активна на 4 августа 2024.; WHO Updates Blueprint List of Priority Diseases. Доступно на: https://globalbiodefense.com/2018/02/12/who-updates-blueprint-list-of-priority-diseases/. Ссылка активна на 4 августа 2024.; What Is Disease X? The Pandemic Threat Discussed At Davos 2024. Доступно на: https://www.forbes.com/sites/brucelee/2024/01/27/what-is-disease-x-the-pandemic-threat-discussed-at-davos-2024/. Ссылка активна на 4 августа 2024.; Роспотребнадзор прокомментировал заявления о «болезни Х». Доступно на: https://ria.ru/20240114/bolezn-1921282909.html. Ссылка активна на 4 августа 2024.; Suzuki, R., Yamasoba, D., Kimura, I. et al. Attenuated fusogenicity and pathogenicity of SARS-CoV-2 Omicron variant. Nature 603, 700–705 (2022). https://doi.org/10.1038/s41586-022-04462-1; Willett, B.J., Grove, J., MacLean, O.A. et al. SARS-CoV-2 Omicron is an immune escape variant with an altered cell entry pathway. Nat Microbiol 7, 1161–1179 (2022). https://doi.org/10.1038/s41564-022-01143-7; Willett, B.J., Grove, J., MacLean, O.A., et al. SARS-CoV-2 Omicron is an immune escape variant with an altered cell entry pathway. Nat Microbiol 7, 1161–1179 (2022). https://doi.org/10.1038/s41564-022-01143-7; Dejnirattisai W, Huo J, Zhou D, et al. SARS-CoV-2 Omicron-B.1.1.529 leads to widespread escape from neutralizing antibody responses. Cell. 2022;185(3):467–484.e15. https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.12.046; Tegally, H., Moir, M., Everatt, J., et al. Emergence of SARS-CoV-2 Omicron lineages BA.4 and BA.5 in South Africa. Nat Med 28, 1785–1790 (2022). https://doi.org/10.1038/s41591-022-01911-2; Будущее биобезопасности на Форуме будущих технологий 13.02.2024 г. Доступно на: https://rospotrebnadzor.ru/about/info/news/news_details.php?ELEMENT_ID=26987. Ссылка активна на 4 августа 2024.; Global genomic surveillance strategy for pathogens with pandemic and epidemic potential 2022–2032. Доступно на: https://www.who.int/initiatives/genomic-surveillance-strategy. Ссылка активна на 4 августа 2024.; Carter L.L., Yu M.A., Sacks J.A., et al. Global genomic surveillance strategy for pathogens with pandemic and epidemic potential, 2022–2032. Bull. World Health Organ. 2022;100(4):239–A. doi:10.2471/blt.22.288220; Акимкин В. Г., Семененко Т. А., Углева С. В. и др. COVID-19 в России: эпидемиология и молекулярно-генетический мониторинг. Вестник Российской академии медицинских наук. 2022;77(4):254–60. doi:10.15690/vramn2121; Akimkin, V.; Semenenko, T.A.; Ugleva, S.V.; Dubodelov, D.V.; Khafizov, K. COVID-19 Epidemic Process and Evolution of SARS-CoV-2 Genetic Variants in the Russian Federation. Microbiol. Res. 2024, 15, 213–224. doi:10.3390/microbiolres15010015; Котов И. А., Аглетдинов М. Р., Роев Г. В. и др. Геномный надзор за SARS-CoV-2 в Российской Федерации: возможности платформы VGARus. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2024;101(4):435–447. doi:10.36233/0372-9311-554; Берман А. М. Влияние биологических вызовов на общественно-политические отношения: проблемы и перспективы. Территория новых возможностей. Вестник Владивостокского государственного университета экономики и сервиса. – 2020; 12(4): 79–87. doi:10.24866/VVSU/2073-3984/2020-4/079-087; Акимкин В. Г., Семененко Т. А., Хафизов К. Ф. и др. Стратегия геномного эпидемиологического надзора. Проблемы и перспективы. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2024;101(2):163–172. doi:10.36233/0372-9311-507; WHO Director-General’s High-Level Welcome at the Seventy-seventh World Health Assembly – 27 May 2024. Доступно на: https://www.who.int/director-general/speeches/detail/who-director-general-s-high-level-welcome-at-the-seventy-seventh-world-health-assembly-27-may-2024. Ссылка активна на 4 августа 2024.; Pandemic prevention, preparedness and response accord. Доступно на: https://www.who.int/ru/news-room/questions-and-answers/item/pandemic-prevention--preparedness-and-response-accord. Ссылка активна на 4 августа 2024.; World Health Assembly agreement reached on wide-ranging, decisive package of amendments to improve the International Health Regulations. Доступно на: https://www.who.int/news/item/01-06-2024-world-health-assembly-agreement-reached-on-wide-ranging--decisive-package-of-amendments-to-improve-the-international-health-regulations--and-sets-date-for-finalizing-negotiations-on-a-proposed-pandemic-agreement. Ссылка активна на 4 августа 2024.; https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/2078

Availability: https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/2078
https://doi.org/10.31631/2073-3046-2024-23-5-4-12

Actual Problems of Epidemiological Surveillance of West Nile fever in Russia and Ways of Its Improvement ; Актуальные проблемы эпидемиологического надзора за лихорадкой Западного Нила в России и пути его совершенствования

Authors: S. K. Udovichenko, E. V. Putinseva, Y. A. Gusev, A. V. Toporkov, С. К. Удовиченко, Е. В. Путинцева, Е. А. Гусев, А. В. Топорков

Source: Epidemiology and Vaccinal Prevention; Том 23, № 5 (2024); 13-23 ; Эпидемиология и Вакцинопрофилактика; Том 23, № 5 (2024); 13-23 ; 2619-0494 ; 2073-3046

Subject Terms: районирование территории, epidemiological surveillance, epizootological monitoring, study of the immune layer to West Nile virus, zoning of the territory, эпидемиологический надзор, эпизоотологический мониторинг, иммунная прослойка

File Description: application/pdf

Relation: https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/2079/1065; СанПиН 3.3686-21. Санитарно-эпидемиологические требования по профилактике инфекционных болезней (с изменениями на 25 мая 2022 года).; Городин В. Н., Нежурин А. В., Жукова Л. И. Современные аспекты лихорадки Западного Нила. Инфекционные болезни. 2023. Т. 21, № 1. С. 140–147.; Львов Д. К., Писарев В. Б., Петров В. А. и др. Лихорадка Западного Нила: по материалам вспышек в Волгоградской области в 1999–2002 гг. Волгоград: Издатель, 2004.; Львов Д. К., Альховский С. В., Жирнов О. П. 130 лет вирусологии. Вопросы вирусологии. 2022; Т. 67, № 5. С. 357–384.; МУ 3.1.3.2600–10. Мероприятия по борьбе с лихорадкой Западного Нила на территории Российской Федерации. М.: Федеральный центр гигиены и эпидемиологии Роспотребнадзора, 2010.; Якименко В. В., Рудакова С. А., Василенко А. Г. Лихорадка Западного Нила в Западной Сибири: информационное письмо. Омск: ООО Издательский центр «Омский научный вестник», 2020.; Климова Е. А., Кареткина Г. Н., Шакарян А. К. и др. Инфекционные болезни: новости, мнения, обучение. 2021; Т. 10, № 4. С. 13–21.; Львов Д. К., Клименко С. М., Гайдамович С. Я. Арбовирусы и арбовирусные инфекции. М.: Медицина, 1989.; Львов Д. К., Дерябин П. Г., Аристова В. А. и др. Атлас распространения природно-очаговых вирусных инфекций на территории Российской Федерации. М. 2001.; Глушкова Л. И., Корабельников И. В., Егорова Ю. И. и др. Возбудители инфекционных заболеваний в организме таежного клеща на территории Республики Коми. Дезинфекционное дело. 2012. № 1. С. 52–56.; Koch R.T., Erazo D., Folly A.J., et al. Genomic epidemiology of West Nile virus in Europe // One Health. 2023. Vol. 18:100664.; Bakonyi T., Haussig J.M. West Nile virus keeps on moving up in Europe. Euro Surveill. 2020. Vol. 25, N46:2001938.; Habarugira G., Suen W.W., Hobson-Peters J., et al. West Nile virus: An update on pathobiology, epidemiology, diagnostics, control and «one health» implications. Pathogens. 2020. Vol. 9, N7:589.; Топорков А. В., Путинцева Е. В., Удовиченко С. К. и др. Изучение особенностей циркуляции и свойств вируса Западного Нила в России в 2022 году. Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии. 2024; Т. 101, № 1. С. 114–126.; About the seasonal surveillance of West Nile virus infections [Internet]. Доступно на: https://www.ecdc.europa.eu/en/west-nile-fever/surveillance-and-disease-data/about. Ссылка активна на 20 мая 2023.; https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/2079

Availability: https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/2079
https://doi.org/10.31631/2073-3046-2024-23-5-13-23

Epidemiologic Monitoring of Enterovirus (Nepolio) Infection: Rationale for Improvement ; Эпидемиологический мониторинг энтеровирусной (неполио) инфекции: обоснование мер его совершенствования

Authors: M. V. Novoselova, E. V. Albaut, E. B. Brusina, М. В. Новоселова, Е. В. Албаут, Е. Б. Брусина

Source: Epidemiology and Vaccinal Prevention; Том 23, № 4 (2024); 55-62 ; Эпидемиология и Вакцинопрофилактика; Том 23, № 4 (2024); 55-62 ; 2619-0494 ; 2073-3046

Subject Terms: эпидемиологический надзор, acute nasopharyngitis, exanthems, indicators, dew point temperature, monitoring, epidemiological surveillance, острый назофарингит, экзантемы, индикаторы, точка росы, мониторинг

File Description: application/pdf

Relation: https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/2051/1052; Moreni G, van Eijk H, Koen G, et al. Non-Polio Enterovirus C Replicate in Both Airway and Intestine Organotypic Cultures. Viruses. 2023. Vol. 15, N 9. P. 1823. doi:10.3390/v15091823; Brouwer L., Moreni G., Wolthers K.C., et al. World-Wide Prevalence and Genotype Distribution of Enteroviruses. Viruses. 2021. Vol. 13, N 3. Р. 434. doi:10.3390/v13030434; Голицына Л. Н., Кашникова А. Д., Полянина А. В., и др. Заболеваемость, этиологическая структура и вопросы профилактики энтеровирусной (неполио) инфекции. Информационный бюллетень Референс - центра по мониторингу за энтеровирусными инфекциями ФБУН ННИИЭМ им. академика И.Н. Блохиной Роспотребнадзора, май 2024 года, г. Нижний Новгород, 29 с.; Jouppila N.V.V., Lehtonen J., Seppälä E., et al. Assessment of the level of antibodies to enterovirus in early childhood using multiplex immunoassay // Microbiol. Spectr. 2023. Vol. 11, N 3. e0535222. doi:10.1128/spectrum.05352-22; Baertl S, Pietsch C, Maier M, Hönemann M, Bergs S, Liebert UG. Enteroviruses in Respiratory Samples from Paediatric Patients of a Tertiary Care Hospital in Germany. Viruses. 2021. Vol. 13, N 5. Р. 882. doi:10.3390/v13050882.; Chuang YY, Huang YC. Enteroviral infection in neonates. J Microbiol Immunol Infect. 2019 Vol. 52, N 6. Р. 851–857. doi:10.1016/j.jmii.2019.08.018.; Harvala H, Benschop KSM, Berginc N, et al. On Behalf Of The Enpen Hospital-Based Surveillance Network. European Non-Polio Enterovirus Network: Introduction of Hospital- Based Surveillance Network to Understand the True Disease Burden of Non-Polio Enterovirus and Parechovirus Infections in Europe. Microorganisms. 2021. Vol. 9, N 9. Р. 1827. doi:10.3390/microorganisms9091827; Новоселова М. В., Поцелуев Н. Ю., Брусина Е. Б. Современные подходы к созданию прогностических моделей энтеровирусной (неполио) инфекции. Фундаментальная и клиническая медицина. 2023;8(1):43–53. https://doi.org/10.23946/2500-0764-2023-8-1-43-53; Bou-Fakhreddine B., Mougharbel I., Faye A., et al. Estimating daily evaporation from poorly-monitored lakes using limited meteorological data: A case study within Qaraoun dam – Lebanon. J. Environ. Manage. 2019. Vol. 241. P. 502–513. doi:10.1016/j.jenvman.2018.07.032; Новиков Д. В., Мелентьев Д. А. Энтеровирусные (Picornaviridae: Enterovirus) (неполио) вакцины. Вопросы вирусологии. 2022. Т. 67, № 3. С. 185–192. doi:10.36233/0507-4088-111; Курская О. Г., Сароян Т. А., Нохова А. Р. и др. Вклад энтеровирусов в этиологию острых респираторных вирусных инфекций у детей г. Новосибирска. Юг России: экология, развитие. 2023. Т. 18, № 4(69). С. 173–181. doi:10.18470/1992-1098-2023-4-173-181; Nguyen-Tran H., Thompson S., Butler M., et al. Duration of RNA release of enterovirus D68 in the upper respiratory tract and transmission among household contacts, Colorado, USA. Emerg. Infect. Dis. 2023. Vol. 29, N 1. P. 2315–2324. doi:10.3201/eid2911.230947; Солодовникова О. Н., Харитонова Л. А. Энтеровирусная инфекция у детей: современное состояние проблемы. Практика педиатра. 2020. № 4. С. 21–27.; Tochilovsky K., Vechorek M., Boykevich E., et al. Pediatric enterovirus infections of the central nervous system in Bialystok, Poland: epidemiology, types of viruses and seasonal fluctuations factors. Viruses. 2020. Vol. 12, N 8. P. 893. doi:10.3390/v12080893; Pons-Salon M., Oberste M.S., Pallansch M.A., et al. The seasonality of nonpolio enteroviruses in the United States: Patterns and drivers. Proc. Natl. Acad. Sci. U S A. 2018. Vol. 115, N 12. P. 3078–3083. doi:10.1073/pnas.1721159115; https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/2051

Availability: https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/2051
https://doi.org/10.31631/2073-3046-2024-23-4-55-62

Healthcare-Associated Infections: State of the Problem and Prospects ; Инфекции, связанные с оказанием медицинской помощи: состояние проблемы и перспективы

Authors: Akimkin V.G., Brusina E.B., Briko N.I., Tutelyan A.V.

Contributors: 1

Source: Annals of the Russian academy of medical sciences; Vol 79, No 5 (2024); 406–415 ; Вестник Российской академии медицинских наук; Vol 79, No 5 (2024); 406–415 ; 2414-3545 ; 0869-6047 ; 10.15690/vramn.795

Subject Terms: infections, surgical procedures, risk-oriented approach, ESKAPE patogens, инфекции, связанные с оказанием медицинской помощи, хирургические технологии, риск-ориентированный эпидемиологический надзор, ESKAPE-патогены

File Description: application/pdf

Relation: https://vestnikramn.spr-journal.ru/jour/article/view/17998/2041; https://vestnikramn.spr-journal.ru/jour/article/view/17998/2050; https://vestnikramn.spr-journal.ru/jour/article/view/17998/2063; https://vestnikramn.spr-journal.ru/jour/article/downloadSuppFile/17998/145708; https://vestnikramn.spr-journal.ru/jour/article/downloadSuppFile/17998/145722

Availability: https://vestnikramn.spr-journal.ru/jour/article/view/17998
https://doi.org/10.15690/vramn17998

МИКРОБИОЛОГИЧЕСКИЙ МОНИТОРИНГ ИНФЕКЦИИ, СВЯЗАННОЙ С ОКАЗАНИЕМ МЕДИЦИНСКОЙ ПОМОЩИ

Subject Terms: антибиотикорезистентность, antibiotic resistance, healthcare-associated infections, microbiological monitoring, epidemiological supervision, связанные с оказанием медицинской помощи, эпидемиологический надзор, микробиологический мониторинг, инфекции, 3. Good health

Politici globale de vaccinare în infecția rotavirală

Authors: Bîrcă, I.V.

Source: Sănătate Publică, Economie şi Management în Medicină 95 (2) 28-37

Subject Terms: rotavirus infection, вакцинация, povara maladiei, infecţia rotavirală, эпидемиологический надзор, burden of disease, vaccination, Vaccinare, rotavirus, supraveghere, ротавирус, surveillance, бремя болезней, ротавирусная инфекция

File Description: application/pdf

Access URL: https://ibn.idsi.md/vizualizare_articol/189942

Використання математичного моделювання в епідеміологічному нагляді за гострими кишковими інфекціями

Authors: Malysh, N.G., Kuzmenko, O.V., Chemych, M.D., Doan, S.I.

Source: Aktualʹnaâ Infektologiâ, Vol 7, Iss 1, Pp 6-12 (2019)
ACTUAL INFECTOLOGY; Том 7, № 1 (2019); 6-12
Актуальная инфектология-Aktualʹnaâ Infektologiâ; Том 7, № 1 (2019); 6-12
Актуальна інфектологія-Aktualʹnaâ Infektologiâ; Том 7, № 1 (2019); 6-12

Subject Terms: diarrheal escherichiosis, salmonellosis, эпидемиологический надзор, факторы риска, прогноз, шигеллез, сальмонеллез, диареегенные эшерихиозы, epidemiological surveillance, risk factors, prognosis, shigellosis, епідеміологічний нагляд, фактори ризику, шигельоз, сальмонельоз, діареєгенні ешерихіози, Infectious and parasitic diseases, RC109-216, 6. Clean water, 3. Good health

File Description: application/pdf

Access URL: https://doaj.org/article/a02ea8075ad446e39cd51fcd2c33e0f5
http://ai.zaslavsky.com.ua/article/view/159222