Incorporating negative examples into Hidden Markov Model-based classification of peptide sequences

Συγγραφείς: V. A. Polezhaeva, D. A. Kleverov, A. A. Shalyto, M. Artyomov

Πηγή: Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики, Vol 25, Iss 5, Pp 888-901 (2025)

Θεματικοί όροι: связывание пептидов, скрытые марковские модели, отрицательная выборка, предсказание связывающей способности, предсказание эпитопов, главные комплексы гистосовместимости, связывающие мотивы, машинное обучение, Information technology, T58.5-58.64

Περιγραφή αρχείου: electronic resource

Relation: https://ntv.elpub.ru/jour/article/view/518; https://doaj.org/toc/2226-1494; https://doaj.org/toc/2500-0373

Σύνδεσμος πρόσβασης: https://doaj.org/article/cffdd352ee634685a3511facd736e6a0

A method for constructing interpretable hidden Markov models for the task of identifying binding cores in sequences

Συγγραφείς: D. A. Kleverov, A. A. Shalyto, M. N. Artyomov

Πηγή: Научно-технический вестник информационных технологий, механики и оптики, Vol 23, Iss 5, Pp 989-1000 (2024)

Θεματικοί όροι: предсказание связывающей способности, скрытые марковские модели, алгоритм витерби, анализ данных, поиск мотива, выравнивание последовательностей, Information technology, T58.5-58.64

Περιγραφή αρχείου: electronic resource

Relation: https://ntv.elpub.ru/jour/article/view/187; https://doaj.org/toc/2226-1494; https://doaj.org/toc/2500-0373

Σύνδεσμος πρόσβασης: https://doaj.org/article/d7f4674fa6e541f6807ff0e82ac8a0bc