РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ ГЕНОВ Β-ЛАКТАМАЗ РАСШИРЕННОГО СПЕКТРА (БЛРС) И КАРБАПЕНЕМАЗ У KLEBSIELLA PNEUMONIAE В РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ: СОВРЕМЕННОЕ СОСТОЯНИЕ ПРОБЛЕМЫ

Subject Terms: antibiotic resistance, surveillance, carbapenemases, карбапенемазы, NDM, молекулярная эпидемиология, внутрибольничные инфекции, extendedspectrum beta-lactamases (BLRS), molecular epidemiology, эпиднадзор, антибиотикорезистентность, Klebsiella pneumoniae, β-лактамазы расширенного спектра (БЛРС), KPC, nosocomial infections, CTX-M, OXA-48

МОЛЕКУЛЯРНО-ЭПИДЕМИОЛОГИЧЕСКИЙ МОНИТОРИНГ ЦИРКУЛЯЦИИ ШТАММОВ CLOSTRIDIOIDES DIFFICILE В МНОГОПРОФИЛЬНОМ СТАЦИОНАРЕ: СВЯЗЬ ГЕНОТИПОВ С ТЯЖЕСТЬЮ ТЕЧЕНИЯ

Subject Terms: тяжесть заболевания, Clostridioides difficile, антибиотико-ассоциированный колит, diarrhea, риботипирование, инфекция Clostridioides difficile (ИКД), молекулярная эпидемиология, hypervirulent strains, гипервирулентные штаммы, нозокомиальная инфекция, antibiotic-associated colitis, molecular epidemiology, PCR ribotype, RT027, Clostridioides difficile infection (And K), nosocomial infection, диарея, disease severity, ribotyping, ПЦР-риботип

ИССЛЕДОВАНИЕ ПУТЕЙ ПЕРЕДАЧИ И ГЕНЕТИЧЕСКАЯ СТРУКТУРА ШТАММОВ ВИРУСА ЭБОЛА, ВЫЯВЛЕННЫХ В ОЧАГАХ В АФРИКЕ, С ПЕРСПЕКТИВОЙ МОНИТОРИНГА В РОССИИ

Subject Terms: Россия, filoviruses, Ebola fever, epidemiological surveillance, генетическая вариабельность, эпидемиологический надзор, молекулярная эпидемиология, пути передачи, zoonotic infections, molecular epidemiology, Russia, лихорадка Эбола, Ebola virus, вирус Эбола, филовирусы, transmission routes, genetic variability, биологическая безопасность, biological safety, зоонозные инфекции

Results and prospects of rotavirus immunisation in the Russian Federation ; Результаты и перспективы вакцинопрофилактики ротавирусной инфекции в Российской Федерации

Authors: A. S. Korovkin, G. M. Ignatyev, А. С. Коровкин, Г. М. Игнатьев

Source: Biological Products. Prevention, Diagnosis, Treatment; Том 23, № 4 (2023); 499-512 ; БИОпрепараты. Профилактика, диагностика, лечение; Том 23, № 4 (2023); 499-512 ; 2619-1156 ; 2221-996X

Subject Terms: национальный календарь профилактических прививок, rotavirus vaccines, rotavirus disease epidemiology, rotavirus disease molecular epidemiology, rotavirus vaccine effectiveness, rotavirus vaccine safety, vaccination, observational studies of rotavirus vaccine effectiveness, national immunisation schedule, ротавирусные вакцины, эпидемиология ротавирусной инфекции, молекулярная эпидемиология ротавирусной инфекции, эффективность ротавирусных вакцин, безопасность ротавирусных вакцин, вакцинация, наблюдательные исследования эффективности ротавирусных вакцин

File Description: application/pdf

Relation: https://www.biopreparations.ru/jour/article/view/515/801; https://www.biopreparations.ru/jour/article/downloadSuppFile/515/804; Sadiq A, Bostan N, Yinda KC, Naseem S, Sattar S. Rotavirus: Genetics, pathogenesis and vaccine advances. Rev Med Virol. 2018;28(6):e2003. https://doi.org/10.1002/rmv.2003; GBD 2016 Diarrhoeal Disease Collaborators. Estimates of the global, regional, and national morbidity, mortality, and aetiologies of diarrhoea in 195 countries: a systematic analysis for the Global Burden of Disease Study 2016. Lancet Infect Dis. 2018;18(11):1211–28. https://doi.org/10.1016/s1473-3099(18)30362-1; Tate JE, Burton AH, Boschi-Pinto C, Parashar UD. Global, regional, and national estimates of rotavirus mortality in children; Баранов АА, Намазова-Баранова ЛС, Таточенко ВК, Вишнева ЕА, Федосеенко МВ, Селимзянова ЛР и др. Ротавирусная инфекция у детей — нерешенная проблема. Обзор рекомендаций по вакцинопрофилактике. Педиатрическая фармакология. 2017;14(4):248–57. https://doi.org/10.15690/pf.v14i4.1756; Халиуллина СВ, Анохин ВА, Мухамердиева ЗТ, Курбанова ГМ. Этиологическая структура острых кишечных инфекций у пациентов, госпитализированных в инфекционный стационар. Практическая медицина. 2019;17(8):109–13. https://doi.org/10.32000/2072-1757-2019-8-109-113; Лукьянова АМ, Бехтерева МК, Птичникова НН. Клинико-эпидемиологическая характеристика вирусных диарей у детей. Журнал инфектологии. 2014;6(1):60–6. EDN: RYRKFB; Молочкова ОВ, Ковалев ОБ, Россина АЛ, Шамшева ОВ, Корсунский АА, Кащенко ОА. и др. Клинико-этиологическая характеристика ОКИ у госпитализированных детей города Москвы в 2015–2017 гг. Детские инфекции. 2018;17(3):27–33. https://doi.org/10.22627/2072-8107-2018-17-3-27-33; Crawford SE, Ramani S, Tate JE, Parashar UD, Svensson L, Hagbom M, et al. Rotavirus infection. Nat Rev Dis Primers. 2017;3:17083. https://doi.org/10.1038/nrdp.2017.83; Sadiq A, Bostan N, Khan J, Aziz A. Effect of rotavirus genetic diversity on vaccine impact. Rev Med Virol. 2022;32(1):e2259. https://doi.org/10.1002/rmv.2259; Jain S, Vashistt J, Changotra H. Rotaviruses: is their surveillance needed? Vaccine. 2014;32(27):3367–78. https://doi.org/10.1016/j.vaccine.2014.04.037; Bányai K, László B, Duque J, Steele AD, Nelson EAS, Gentsch JR, Parashar UD. Systematic review of regional and temporal trends in global rotavirus strain diversity in the pre rotavirus vaccine era: insights for understanding the impact of rotavirus vaccination programs. Vaccine. 2012;30(Suppl 1):A122–30. https://doi.org/10.1016/j.vaccine.2011.09.111; Seheri M, Nemarude L, Peenze I, Netshifhefhe L, Nyaga MM, Ngobeni HG, et al. Update of rotavirus strains circulating in Africa from 2007 through 2011. Pediatr Infect Dis J. 2014;33(Suppl 1):S76–84. https://doi.org/10.1097/inf.0000000000000053; Seheri LM, Magagula NB, Peenze I, Rakau K, Ndadza A, Mwenda JM, et al. Rotavirus strain diversity in Eastern and Southern African countries before and after vaccine introduction. Vaccine. 2018;36(47):7222–30. https://doi.org/10.1016/j.vaccine.2017.11.068; Varghese T, Kang G, Steele AD. Understanding rotavirus vaccine efficacy and effectiveness in countries with high child mortality. Vaccines (Basel). 2022;10(3):346. https://doi.org/10.3390/vaccines10030346; Podkolzin AT, Fenske EB, Abramycheva NY, Shipulin GA, Sagalova OI, Mazepa VN, et al. Hospital-based surveillance of rotavirus and other viral agents of diarrhea in children and adults in Russia, 2005–2007. J Infect Dis. 2009;200(Suppl 1):S228–33. https://doi.org/10.1086/605054; Skansberg A, Sauer M, Tan M, Santosham M, Jennings MC. Product review of the rotavirus vaccines ROTASIIL, ROTAVAC, and Rotavin-M1. Hum Vaccin Immunother. 2021;17(4):1223–34. https://doi.org/10.1080/21645515.2020.1804245; Burke RM, Tate JE, Kirkwood CD, Steele AD, Parashar UD. Current and new rotavirus vaccines. Curr Opin Infect Dis. 2019;32(5):435–44. https://doi.org/10.1097/qco.0000000000000572; Li J, Zhang Y, Yang Y, Liang Z, Tian Y, Liu B, et al. Effectiveness of Lanzhou lamb rotavirus vaccine in preventing gastroenteritis among children younger than 5 years of age. Vaccine. 2019;37(27):3611–6. https://doi.org/10.1016/j.vaccine.2019.03.069; Rosillon D, Buyse H, Friedland LR, Ng SP, Velázquez FR, Breuer T. Risk of intussusception after rotavirus vaccination: meta-analysis of postlicensure studies. Pediatr Infect Dis J. 2015;34(7):763–8. https://doi.org/10.1097/inf.0000000000000715; Духовлинов ИВ, Богомолова ЕГ, Федорова ЕА, Симбирцев АС. Исследование протективной активности кандидатной вакцины против ротавирусной инфекции на основе рекомбинантного белка FliCVP6VP8. Медицинская иммунология. 2016;18(5):417–24. https://doi.org/10.15789/1563-0625-2016-5-417-424; Яговкин ЭА, Решетов АА, Колпакова ЕП, Коврижко МВ, Ванжа ВС, Троценко АА. Изучение возможности применения конъюгационных технологий при разработке ротавирусной инактивированной вакцины. Актуальные вопросы эпидемиологического надзора за инфекционными и паразитарными заболеваниями на Юге России. Ермольевские чтения. Ростов-на-Дону: ФБУН «Ростовский научно-исследовательский институт микробиологии и паразитологии», ООО «Мини Тайп»; 2021. C. 154–8. EDN: YNTIDR; Колпаков СА, Колпакова ЕП. Способ инактивации культурального ротавируса человека. Патент Российской Федерации № 2743300 С1; 2021. EDN: VLTMHM; Черепушкин СА, Цибезов ВВ, Южаков АГ, Латышев ОЕ, Алексеев КП, Алтаева ЭГ и др. Синтез и характеристика вирусоподобных частиц ротавируса А (Reoviridae: Sedoreovirinae: Rotavirus: Rotavirus A) человека. Вопросы вирусологии. 2021;66(1):55–64. https://doi.org/10.36233/0507-4088-27; Рычкова ОА, Казакевич НВ, Дубинина ОВ, Шарухо ГВ, Курбатская МА, Иванова ГН и др. Профилактика ротавирусной инфекции: путь расширения региональной программы вакцинации Тюменской области. Фарматека. 2016;(11):106–11. EDN: WIUJTL; Смирнова СС, Голубкова АА, Колтунов СВ. Опыт вакцинации против ротавирусного гастроэнтерита в Свердловской области. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2018;17(3):68–73. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2018-17-3-68-73; Южакова АГ, Мартынова ГП. Вакцинопрофилактика ротавирусной инфекции: социальная значимость и эффективность. Журнал инфектологии. 2017;9(2):65–71. https://doi.org/10.22625/2072-6732-2017-9-2-65-71; Феклисова ЛВ, Шаповалова РФ. Результаты массовой иммунизации против ротавирусной инфекции детей первого года жизни на отдельной территории Московской области. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2019;18(4):75–81. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2019-18-4-75-81; Гирина АА, Петровский ФИ, Сосыкина НВ, Заплатников АЛ. Оценка заболеваемости ротавирусной инфекцией и эффективности вакцинопрофилактики в Ханты-Мансийском автономном округе Югра в 2014–2018 годах. Эпидемиология и вакцинопрофилактика. 2020;19(2):95–101. https://doi.org/10.31631/2073-3046-2020-19-2-95-101; Гирина АА, Курганская АЮ. Клинико-эпидемиологическая характеристика и возможности профилактики ротавирусной инфекции у детей в Ханты-Мансийском автономном округе — Югре. Инфекционные болезни. 2018;16(1):87–92. https://doi.org/10.20953/1729-9225-2018-1-87-92; Сутовская ДВ, Бурлуцкая АВ, Дубова ЛВ, Тюникова ЕИ, Куликова ВВ. Иммунопрофилактика ротавирусной инфекции в Краснодаре. Кубанский научный медицинский вестник. 2018;25(5):152–5. https://doi.org/10.25207/1608-6228-2018-25-5-152-155; Копачевская КА, Чернышева НВ, Потапова КЭ. Приверженность и эффективность вакцинации детей раннего возраста против ротавирусной инфекции в Хабаровске. Universum: медицина и фармакология. 2022;(6):12–8. https://doi.org/10.32743/UniMed.2022.89.6.13709; Burnett E, Parashar UD, Tate JE. Real-world effectiveness of rotavirus vaccines, 2006–19: a literature review and meta-analysis. Lancet Glob Health. 2020;8(9):e1195–202. https://doi.org/10.1016/s2214-109x(20)30262-x; https://www.biopreparations.ru/jour/article/view/515

Availability: https://www.biopreparations.ru/jour/article/view/515
https://doi.org/10.30895/2221-996X-2023-23-4-499-512

Prevalence of hepatitis B and D viruses in HIV-infected persons in the Socialist Republic of Vietnam ; Распространенность вирусов гепатита B и D у ВИЧ-инфицированных лиц в Социалистической Республике Вьетнам

Authors: Yu. V. Ostankova, A. V. Semenov, E. B. Zueva, E. N. Serikova, A. N. Shchemelev, D. E. Valutite, H. Khanh Thu Huynh, A. A. Totolian, Ю. В. Останкова, А. В. Семенов, Е. Б. Зуева, Е. Н. Серикова, А. Н. Щемелев, Д. Э. Валутите, Хоанг Кханх Тху Хуйнх, А. А. Тотолян

Source: HIV Infection and Immunosuppressive Disorders; Том 14, № 1 (2022); 46-58 ; ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии; Том 14, № 1 (2022); 46-58 ; 2077-9828 ; 10.22328/2077-9828-2022-14-1

Subject Terms: Вьетнам, HDV, coinfection, molecular epidemiology, subtype, Vietnam, ВГD, коинфекция, молекулярная эпидемиология, генотипы

File Description: application/pdf

Relation: https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/698/470; World Health Organization. Hepatitis B. Key facts. 2021. Available at: http://www.who.int/news-room/fact-sheets/detail/hepatitis-b Access date: 14.08.2021.; Wedemeyer H. The burden of hepatitis D — defogging the epidemiological horizon // J. Hepatol. 2020. Vol. 73, No. 3. Р. 493–495. https://doi.org/10.1016/j.jhep.2020.06.037.; Papatheodoridi M., Papatheodoridis G.V. Is hepatitis delta underestimated? // Liver Int. 2021. Vol. 41, Suppl. 1. Р. 38–44. doi:10.1111/liv.14833.; Huy B.V., Vernavong K., Kính N.V. HBV and HCV Coinfection among HIV/AIDS Patients in the National Hospital of Tropical Diseases, Vietnam // AIDS Res Treat. 2014. 581021. doi:10.1155/2014/581021.; Raimondo G., Locarnini S., Pollicino T., Levrero M., Zoulim F. Lok А.S. Taormina Workshop on Occult HBV Infection Faculty Members. Update of the statements on biology and clinical impact of occult hepatitis B virus infection // J. Hepatol. 2019. Vol. 71, No. 2. Р. 397–408. doi:10.1016/j.jhep.2019.03.034.; Maldonado-Rodriguez A., Cevallos A.M., Rojas-Montes O., Enriquez-Navarro K., Alvarez-Muñoz M.T., Lira R. Occult hepatitis B virus co-infection in human immunodeficiency virus-positive patients: A review of prevalence, diagnosis and clinical significance // World J. Hepatol. 2015. Vol. 7, No. 2. Р. 253–260. https://dx.doi.org/10.4254/wjh.v7.i2.253.; Attiku K., Bonney J., Agbosu E., Bonney E., Puplampu P., Ganu V., Odoom J., Aboagye J., Mensah J., Agyemang S., Awuku-Larbi Y., Arjarquah A., Mawuli G., Quaye O. Circulation of hepatitis delta virus and occult hepatitis B virus infection amongst HIV/HBV co-infected patients in Korle-Bu, Ghana // PLoS One. 2021. Vol. 16, No. 1. Р. e0244507. doi:10.1371/journal.pone.0244507.; Shen D.T., Han P.C., Ji D.Z., Chen H.Y., Cao W.D., Goyal H., Xu H.G. Epidemiology estimates of hepatitis D in individuals co-infected with human immunodeficiency virus and hepatitis B virus, 2002–2018: A systematic review and meta-analysis // J Viral Hepat. 2021. Vol. 28, No. 7. Р. 1057–1067. doi:10.1111/jvh.13512.; Ferrante N.D., Lo R.V. Epidemiology, natural history, and treatment of hepatitis delta virus infection in HIV/hepatitis B virus coinfection // Curr. HIV/AIDS Rep. 2020. Vol. 17, No. 4. Р. 405–414. https://doi.org/10.1007/s11904-020-00508-z.; Щемелев А.Н., Останкова Ю.В., Зуева Е.Б., Хуйнх Хоанг Кханх Тху, Семенов А.В. Генотипическая и фармакорезистентная характеристика ВИЧ у пациентов в Социалистической Республике Вьетнам // ВИЧ инфекция и иммуносупрессии. 2020. Т. 12, № 2. С. 56–68. http://dx.doi.org/10.22328/2077-9828-2020-12-2-56-68.; Do S.H., Yamada H., Fujimoto M., Ohisa M., Matsuo J. et al. High prevalences of hepatitis B and C virus infections among adults living in Binh Thuan province, Vietnam // Hepatol Res. 2015. Vol. 45, No. 3. P. 259–268. doi:10.1111/hepr.12350.; Gish R.G., Bui T.D., Nguyen C.T., Nguyen D.T., Tran H.V. et al. International Group for Liver Health in Viet N. Liver disease in Viet Nam: screening, surveillance, management and education: a 5-year plan and call to action // J Gastroenterol Hepatol. 2012. Vol. 27, No. 2. P. 238– 247. doi:10.1111/j.1440-1746.2011.06974.x; Nguyen V.T., Law M.G., Dore G.J. An enormous hepatitis B virus-related liver disease burden projected in Vietnam by 2025 // Liver Int. 2008. Vol. 28, No. 4. P. 525–531. doi:10.1111/j.1478-3231.2007.01646.x.; Duong M.C., Le P.V., Pham O.N., Pham H.D., Nguyen T.B., Phan H.T. Patterns of hepatitis B virus exposure and associated predictors in Vietnam: A crosssectional study // Asian Pac. J. Trop. Med. 2020. Vol. 13. Р. 535–541. doi:10.4103/1995-7645.296721; Dunford L., Carr M.J., Dean J., Nguyen L.T., Ta Thi T.H., Nguyen B.T., Connell J., Coughlan S., Nguyen H.T., Hall W.W., Thi L.A. A multicentre molecular analysis of hepatitis B and blood-borne virus coinfections in Viet Nam // PLoS One. 2012. 7, No. 6. Р. e39027. doi:10.1371/journal.pone.0039027.; Серикова Е.Н., Семенов А.В., Останкова Ю.В., Тотолян Арег А. Метод выявления вируса гепатита В в плазме крови при низкой вирусной нагрузке с использованием ПЦР в режиме реального времени // Клиническая лабораторная диагностика. 2021. Т. 66, № 1. С. 59–64. doi: http://dx.doi.org/10.18821/0869-2084-2021-66-1-59-64.; Останкова Ю. В., Семенов А. В., Тотолян Арег А. Выявление вируса гепатита В в плазме крови при низкой вирусной нагрузке // Клиническая лабораторная диагностика. 2019. Т. 64, № 10. С. 635–640. doi:10.18821/0869-2084-2019-64-10-635-640.; Останкова Ю.В., Ногойбаева К.А., Зуева Е.Б., Касымбекова К.Т., Тобокалова С.Т., Семенов А.В. Филогенетический анализ и характеристика полноразмерных последовательностей генома вируса гепатита Дельта, выделенных у больных хроническим вирусным гепатитом B/D в Кыргызской Республике // Проблемы особо опасных инфекций. 2020. № 1. С. 124–132. doi:10.21055/0370-1069-2020-1-124-132.; Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets // Molecular Biology and Evolution. 2016. Vol. 33, No 7. P. 1870–1874. doi:10.1093/molbev/msw054.; Останкова Ю.В., Найденова Е.В., Серикова Е.Н., Щемелев А.Н., Валутите Д.Э., Зуева Е.Б., Хуйнх Хоанг Кханх Тху, Семенов А.В. К вопросу о коинфицировании вирусами Денге и возбудителями гемоконтактных инфекций в Социалистической Республике Вьетнам // Проблемы особо опасных инфекций. 2021. № 3. С. 6–12. https://doi.org/10.21055/0370-1069-2021-3-6-12.; Pollack T.M., Trang le T.T., Ngo L., Cuong do D., Thuy P.T., Colby D.J. Response to hepatitis B vaccination among HIV-infected adults in Vietnam // J. Virus Erad. 2016. Vol. 2, No. 2. Р. 102–106.; Binh M.T., Hoan N.X., Van Tong H., Giang D.P., Sy B.T., Toan N.L., Song L.H., Bang M.H., Wedemeyer H., Meyer C.G., Kremsner P.G., Bock C.T., Velavan T.P. HDV infection rates in northern Vietnam // Sci. Rep. 2018. Vol. 8, No. 1. Р. 8047. doi:10.1038/s41598-018-26446-w.; Pourkarim M.R., Amini-Bavil-Olyaee S., Kurbanov F., Van Ranst M., Tacke F. Molecular identification of hepatitis B virus genotypes/subgenotypes: revised classification hurdles and updated resolutions // World J. Gastroenterol. 2014. Vol. 20, No. 23. P. 7152–6868. doi:10.3748/wjg.v20.i23.7152.; Trang N.H., That B.T.T., Thanh T.T.T., Chau L.N., Thanh T.T. et al. Molecular characteristics of hepatitis B virus (HBV) isolated from chronic hepatitis B patients in South Vietnam // Virus Evol. 2017. Vol. 3 (Suppl. 1). pii: vew036.016. doi:10.1093/ve/vew036.016.; Truong B.X., Seo Y., Yano Y., Ho P.T., Phuong T.M., Long D.V., Son N.T., Long N.C., Kato H., Hayashi Y., Trach N.K., Kasuga M. Genotype and variations in core promoter and pre-core regions are related to progression of disease in HBV-infected patients from Northern Vietnam // Int. J. Mol. Med. 2007. Vol. 19, No. 2. P. 293–299. doi:10.3892/ijmm.19.2.293.

Availability: https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/698
https://doi.org/10.22328/2077-9828-2022-14-1-46-58

Prevalence of hepatitis B and C viral markers among apparently healthy residents of the Socialist Republic of Vietnam (Southern Vietnam) ; Распространенность маркеров вирусов гепатита B и C среди условно здоровых жителей южного региона Социалистической Республики Вьетнам

Authors: Ostankova Y.V., Semenov A.V., Zueva E.B., Serikova E.N., Schemelev A.N., Valutite D.E., Huinh H.K., Egorova S.A., Totolian A.A.

Source: Russian Journal of Infection and Immunity; Vol 11, No 6 (2021); 1131-1140 ; Инфекция и иммунитет; Vol 11, No 6 (2021); 1131-1140 ; 2313-7398 ; 2220-7619

Subject Terms: HBV, HCV, viral hepatitis markers, molecular epidemiology, genotype, apparently healthy residents, Southern Vietnam, ВГВ, ВГС, маркеры вирусных гепатитов, молекулярная эпидемиология, генотипы, условно здоровые жители, Южный Вьетнам

File Description: application/pdf

Relation: https://iimmun.ru/iimm/article/view/1793/1386; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/1793/7056; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/1793/7057; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/1793/7058; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/1793/7059; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/1793/7060; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/1793/7061; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/1793/7062; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/1793/7063; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/1793/7064; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/1793/7065; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/1793/7066; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/1793/7067; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/1793/7068; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/1793/7069; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/1793/7070; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/1793/7071; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/1793/7338; https://iimmun.ru/iimm/article/view/1793

Availability: https://iimmun.ru/iimm/article/view/1793
https://doi.org/10.15789/2220-7619-TPO-1793

Amino acid substitutions in core and HBsAg regions of hepatitis B virus in patients with monoinfection and HBV/HIV-coinfection in the Republic of Guinea ; Аминокислотные замены в регионах CORE и HBsAg вируса гепатита В при моноинфекции и ВГВ/ВИЧ-коинфекции в Гвинейской республике

Authors: S. Boumbaly, E. Serikova, Th. A. L. Balde, Yu. V. Ostankova, A. N. Schemelev, D. Е. Valutite, E. В. Zueva, A. V. Semenov, A. A. Totolian, С. Бумбали, Е. Н. Серикова, Т.А. Л. Балде, Ю. В. Останкова, А. Н. Щемелев, Д. Э. Валутите, Е. Б. Зуева, А. В. Семенов, А. А. Тотолян

Source: HIV Infection and Immunosuppressive Disorders; Том 13, № 3 (2021); 96-107 ; ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии; Том 13, № 3 (2021); 96-107 ; 2077-9828 ; 10.22328/2077-9828-2021-13-3

Subject Terms: Гвинейская Республика, genotypes, amino acid substitutions, vaccine escape mutations, drug resistance mutations, molecular epidemiology, Republic of Guinea, генотипы, аминокислотные замены, мутации вакцинного бегства, мутации лекарственной устойчивости, молекулярная эпидемиология

File Description: application/pdf

Relation: https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/663/454; Schweitzer A., Horn J., Mikolajczyk R.T., Krause G., Ott J.J. Estimations of worldwide prevalence of chronic hepatitis B virus infection: a systematic review of data published between 1965 and 2013 // Lancet. 2015. Vol. 386, No. 10003. Р. 1546–1555. doi:10.1016/S0140-6736(15)61412-X.; Suesstrunk J., Djongali F. B. Hepatitis B virus prevalence in rural areas in south-west Chad // Tropical Doctor. 2017. Vol. 47, No. 4. Р. 374–377. doi:10.1177/0049475517699718.; Zampino R., Boemio A., Sagnelli C., Alessio L., Adinolfi L. E., Sagnelli E., Coppola N. Hepatitis B virus burden in developing countries // World J. Gastroenterol. 2015. Vol. 21, No. 42. Р. 11941–1953. doi:10.3748/wjg.v21.i42.11941.; Kramvis A., Kew M.C. Epidemiology of hepatitis B virus in Africa, its genotypes and clinical associations of genotypes // Hepatol Res. 2007. Vol. 37. Р. S9–S19. doi:10.1111/j.1872-034X.2007.00098.x.; Wurie I.M., Wurie A.T., Gevao S.M. Sero-prevalence of hepatitis B virus among middle to high socio-economic antenatal population in Sierra Leone // West Afr. J. Med. 2005. Vol. 24, No. 1. Р. 18–20. doi:10.4314/wajm.v24i1.28156; Bigna J.J., Amougou M.A., Asangbeh S.L., Kenne A.M., Noumegni S.R.N., Ngo-Malabo E.T., Noubiap J.J. Seroprevalence of hepatitis B virus infection in Cameroon: a systematic review and meta-analysis // BMJ Open. 2017. Vol. 7. e015298. doi:10.1136/bmjopen-2016-015298.; Sadoh A.E., Sadoh W.E. Serological markers of hepatitis B infection in infants presenting for their first immunization // Niger. J. Paeadiatr. 2013. Vol. 40. Р. 248–253.; Shimakawa Y., Bottomley C., Njie R., Mendy M. The association between maternal hepatitis B e antigen status, as a proxy for perinatal transmission, and the risk of hepatitis B e antigenaemia in Gambian children // BMC Public Health. 2014. Vol. 14. Р. 532. doi:10.1186/1471-2458-14-532.; Ladep N.G., Lesi O.A., Mark P., Lemoine M., Onyekwere C., Afihene M., Crossey M.M., Taylor-Robinson S.D. Problem of hepatocellular carcinoma in West Africa // World J. Hepatol. 2014. Vol. 6, No. 11. Р. 783–792. doi:10.4254/wjh.v6.i11.783.; Raimondo G., Locarnini S., Pollicino T., Levrero M., Zoulim F. Anna S. Lok, Taormina Workshop on Occult HBV Infection Faculty Members. Update of the statements on biology and clinical impact of occult hepatitis B virus infection // J. Hepatol. 2019. Vol. 71, No. 2. Р. 397–408. doi:10.1016/j.jhep.2019.03.034.; Kew M.C., Welschinger R., Viana R. Occult hepatitis B virus infection in Southern African blacks with hepatocellular carcinoma // J. Gastroenterol. Hepatol. 2008. Vol. 23, No. 9. Р. 1426–1430. doi:10.1111/j.1440-1746.2008.05481.x.; Kramvis A. Molecular characteristics and clinical relevance of African genotypes and subgenotypes of hepatitis B virus // S. Afr. Med. J. 2018. Vol. 108, No.8b. Р. 17–21. doi:10.7196/SAMJ.2018.v108i8b.13495.; Stasi C., Silvestri C., Voller F.Emerging Trends in Epidemiology of Hepatitis B Virus Infection // J. Clin. Transl. Hepatol. 2017. Vol. 5, No. 3. Р. 272–276. doi:10.14218/JCTH.2017.00010.; Mokaya J., McNaughton A.L., Hadley M.J., Beloukas A., Geretti A.M., Goedhals D., Matthews P.C. A systematic review of hepatitis B virus (HBV) drug and vaccine escape mutations in Africa: A call for urgent action // PLoS Negl. Trop. Dis. 2018. Vol. 12, No. 8. e0006629. doi:10.1371/journal.pntd.0006629.; Xue Y., Wang M.J., Yang Z.T., Yu D.M., Han Y., Huang D., Zhang D.H., Zhang X.X. Clinical features and viral quasispecies characteristics associated with infection by the hepatitis B virus G145R immune escape mutant // Emerg. Microbes Infect. 2017. Vol. 6, No. 3. e15. doi:10.1038/emi.2017.2.; Yll M., Cortese M.F., Guerrero-Murillo M., Orriols G., Gregori J., Casillas R., González C., Sopena S., Godoy C., Vila M., Tabernero D., Quer J., Rando A., Lopez-Martinez R., Esteban R., Riveiro-Barciela M., Buti M., Rodríguez-Frías F. Conservation and variability of hepatitis B core at different chronic hepatitis stages // World J. Gastroenterol. 2020. Vol. 26, No. 20. Р. 2584–2598. doi:10.3748/wjg.v26.i20.2584.; Ingasia L.A.O., Kostaki E.G., Paraskevis D., Kramvis A. Global and regional dispersal patterns of hepatitis B virus genotype E from and in Africa: A full-genome molecular analysis // PLoS One. 2020. Vol. 15, No. 10. Р. e0240375. doi:10.1371/journal.pone.0240375.; Diallo D., Diallo K., Diallo A., Diallo M., Wann T., Doumbouya A., Sow O., Baldé Y., Dillo A. Epidemiological, Clinical and Biological Characteristics of Patients with Chronic Hepatitis B Infection Followed-Up at the University Hospital of Conakry, Guinea // Open J. Gastroenterology. 2020. Vol. 10. Р. 256–265. doi:10.4236/ojgas.2020.1010025.; Garmiri P., Loua A., Haba N., Candotti D., Allain J.P. Deletions and recombinations in the core region of hepatitis B virus genotype E strains from asymptomatic blood donors in Guinea, west Africa // J. Gen. Virol. 2009. Vol. 90, Pt. 10. Р. 2442–2451. doi:10.1099/vir.0.012013-0.; Останкова Ю.В., Семенов А.В., Тотолян Арег А. Выявление вируса гепатита В в плазме крови при низкой вирусной нагрузке // Клиническая лабораторная диагностика. 2019. Т. 64, № 10. С. 635–640. [Ostankova Yu.V., Semenov A.V., Totolian Areg A. Hepatitis B virus identification in a blood plasma at a low viral load. Klinicheskaya Laboratornaya Diagnostika (Russian Clinical Laboratory Diagnostics). 2019. Vol. 64, No. 10. Р. 635–640 (In Russ.)] doi:10.18821/0869-2084-2019-64-10-635-640.; Щемелев А.Н., Останкова Ю.В., Зуева Е.Б., Boumbaly S., Balde T.A., Семенов А.В. Характеристика вируса гепатита B и вируса иммунодефицита человека среди пациентов с коинфекцией ВИЧ/ВГВ из Гвинейской Республики // Проблемы особо опасных инфекций. 2019. № 3. С. 118–124. [Shchemelev A.N., Ostankova Yu.V., Zueva E.B., Boumbaly S., Balde T.A., Semenov A.V. Characterization of Hepatitis B Virus and Human Immunodeficiency Virus among HIV/HBV Co-Infected Patients from the Republic of Guinea. Problems of Particularly Dangerous Infections. 2019, No. 3, рр. 118–124 (In Russ.)]. doi:10.21055/0370-1069-2019-3-118-124.; Colagrossi L., Hermans L.E., Salpini R., Di Carlo D., Pas S.D., Alvarez M., Ben-Ari Z., Boland G., Bruzzone B., Coppola N., Seguin-Devaux C., Dyda T., Garcia F., Kaiser R., Köse S., Krarup H., Lazarevic I., Lunar M.M., Maylin S., Micheli V., Mor O., Paraschiv S., Paraskevis D., Poljak M., Puchhammer-Stöckl E., Simon F., Stanojevic M., Stene-Johansen K., Tihic N., Trimoulet P., Verheyen J., Vince A., Lepej S.Z., Weis N., Yalcinkaya T., Boucher C.A.B., Wensing A.M.J., Perno C.F., Svicher V.; HEPVIR working group of the European Society for translational antiviral research (ESAR). Immune-escape mutations and stop-codons in HBsAg develop in a large proportion of patients with chronic HBV infection exposed to anti-HBV drugs in Europe // BMC Infect. Dis. 2018. Vol. 18, No. 1. Р. 251. doi:10.1186/s12879-018-3161-2.; Magoro T., Gachara G., Mavhandu L., Lum E., Kimbi H.K., Ndip R.N., Bessong P. Serologic and genotypic characterization of hepatitis B virus in HIV-1 infected patients from South West and Littoral Regions of Cameroon // Virol. J. 2016. Vol. 13, No. 1. Р. 178. doi:10.1186/s12985-016-0636-x.; Cerva C., Maffongelli G., Svicher V., Salpini R., Colagrossi L., Battisti A., Mariotti B., Cerretti R., Cudillo L., Sarmati L. Hepatitis B reactivation characterized by HBsAg negativity and anti-HbsAg antibodies persistence in haematopoietic stem cell transplanted patient after lamivudine withdrawal // BMC Infect. Dis. 2017. Vol. 17. Р. 566. doi:10.1186/s12879-017-2672-6.; Malagnino V., Salpini R., Maffongelli G., Battisti A., Fabeni L., Piermatteo L., Colagrossi L., Fini V, Ricciardi A., Sarrecchia C., Perno C.F., Andreoni M., Svicher V., Sarmati L. High rates of chronic HBV genotype E infection in a group of migrants in Italy from West Africa: Virological characteristics associated with poor immune clearance // PLoS One. 2018. Vol. 13, No. 3. Р. e0195045. doi:10.1371/journal.pone.0195045.

Availability: https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/663
https://doi.org/10.22328/2077-9828-2021-13-3-96-107

Severe Fever with Thrombocytopenic Syndrome: Current Epidemiological Situation ; Тяжелая лихорадка с тромбоцитопеническим синдромом: современная эпидемиологическая ситуация

Authors: E. I. Andaev, R. V. Adelshin, S. V. Balakhonov, Е. И. Андаев, Р. В. Адельшин, С. В. Балахонов

Source: Epidemiology and Vaccinal Prevention; Том 20, № 4 (2021); 114-122 ; Эпидемиология и Вакцинопрофилактика; Том 20, № 4 (2021); 114-122 ; 2619-0494 ; 2073-3046

Subject Terms: молекулярная эпидемиология, epidemiology, clinical features, natural reservoir, diagnosis, molecular epidemiology, эпидемиология, клиника, природный резервуар, диагностика

File Description: application/pdf

Relation: https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/1326/772; Yu X.J., Liang M.F., Zhang S.Y., et al. Fever with thrombocytopenia associated with a novel bunyavirus in China. N. Engl. J. Med. 2011. Vol. 364. N16. P.1523–1532.; Xu B., Liu L., Huang X., et al. Metagenomic Analysis of Fever, Thrombocytopenia and Leukopenia Syndrome (FTLS) in Henan Province, China: Discovery of a New Bunyavirus. PloS Pathog. 2011. Vol.7, N11. P. e1002369.; Miao D., Dai K., Zhao G.-P., et al. Mapping the global potential transmission hotspots for severe fever with thrombocytopenia syndrome by machine learning methods. Emerg. Microbes. Infect. 2020. Vol. 9, N 1. P. 817–826.; Matsuno K., Weisend C., Travassos da Rosa A. P. A., et al. Characterization of the Bhanja Serogroup Viruses (Bunyaviridae): a Novel Species of the Genus Phlebovirus and Its Relationship with Other Emerging Tick-Borne Phleboviruses. J. Virol. 2013. Vol. 87, N7. P. 3719–3728.; Yun S.M., Park S.J., Park S.W., et al. Molecular genomic characterization of tick and human-derived severe fever with thrombocytopenia syndrome virus isolates from South Korea. PloS Negl. Trop. Dis. 2017. Vol. 11, N9. P. e0005893.; Tran X.C., Yun Y., An L.V., et al. Endemic Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome, Vietnam. Emerg. Infect. Dis. 2019. Vol. 25, N5. P. 1029–1031.; Mourya D. T., Yadav P. D., Basu A., et al. Malsoor Virus, a Novel Bat Phlebovirus, Is Closely Related to Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome Virus and Heartland Virus. J. Virol. 2014. Vol. 88. Р. 3605–3609.; Lv Q., Zhang H., Tian L., et al. Novel Sublineages, Recombinants and Reassortants of Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome Virus. Ticks Tick Borne Dis. 2017. Vol. 8, N3. P. 385–390.; Fu Y., Li S., Zhang Z., et al. Phylogeographic analysis of severe fever with thrombocytopenia syndrome virus from Zhoushan Islands, China: implication for transmission across the ocean. Sci. Rep. 2016. 6. P. 19563.; Yun M., Ryou J., Choi W. et al. Genetic diversity and evolutionary history of Korean isolates of severe fever with thrombocytopenia syndrome virus from 2013-2016. Arch. Virol. 2020. Vol. 165. Р. 2599–2603.; Lina T.L., Oua S.C., Maedab K., et al. The first discovery of severe fever with thrombocytopenia syndrome virus in Taiwan. Emerg. Microbes. Infect. 2020. Vol. 9. Р. 148–151.; Takahashi T., Maeda K., Suzuki T., et al. The First Identification and Retrospective Study of Severe Fever With Thrombocytopenia Syndrome in Japan. J. Infect. Dis. 2014. Vol. 209. P. 816–827.; LiuY., Li Q., Hu W., et al. Person-to-Person Transmission of Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome Virus. Vector Borne Zoonotic Dis. 2012. Vol. 12, N2. P. 156–160.; Uehara N., Yano T., Ishihara A., et al. An Autopsy Case Report. Intern. Med. 2016. Vol. 55. P. 831–838.; Kimura T., Fukuma A., Shimojima M., et al. Seroprevalence of severe fever with thrombocytopenia syndrome (SFTS) virus antibodies in humans and animals in Ehime prefecture, Japan, an endemic region of SFTS. J. Infect. Chemother. 2018. Vol. 24. N10. Р. 802–806.; Park S.Y., Kwon J.-S., Kim J.Y., et al. Severe fever with thrombocytopenia syndrome-associated еncephalopathy/encephalitis. Clin. Microbiol. Infect. 2018. Vol. 24. P.432. e1–432.e4.; Gai Z.T., Zhang Y., Liang M.F., et al. Clinical Progress and Risk Factors for Death in Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome Patients. J. Infect. Dis. 2012. Vol. 206. P.1095–1102.; Zhu Y., Wu H., Gao J., et al. Two confirmed cases of severe fever with thrombocytopenia syndrome with pneumonia: implication for a family cluster in East China. BMC Infect. Dis. 2017. Vol. 17. P. 537.; Li P., Tong Z.D., Li K.F, et al. Seroprevalence of severe fever with thrombocytopenia syndrome virus in China: A systematic review and meta-analysis. PloS ONE. 2017. Vol. 12, N4. P. e0175592.; Sun J., Lu L., Wu H., et al. The changing epidemiological characteristics of severe fever with thrombocytopenia syndrome in China, 2011-2016. Sci. Rep. 2017. Vol.7. P. 9236.; Hu J., Li Z., Cai J., et al. A Cluster of Bunyavirus-Associated Severe Fever With Thrombocytopenia Syndrome Cases in a Coastal Plain Area in China, 2015: Identification of a Previously Unidentified Endemic Region for Severe Fever With Thrombocytopenia Bunyavirus. Open Forum Infect. Dis. 2019. Vol. 6, N6. Р. ofz209.; Zhu L., Yin F., Moming A., et al. First case of laboratory-confirmed severe fever with thrombocytopenia syndrome disease revealed the risk of SFTSV infection in Xinjiang, China. Emerg. Microbes. Infect. 2019.Vol. 8, N1. P. 1122–1125.; Choi S.J., Park S.W., Bae I.G., et al. Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome in South Korea, 2013-2015. PLoS Negl. Trop. Dis. 2016. Vol. 10, N12. P. e0005264.; Kato H, Yamagishi T, Shimada T, et al. Epidemiological and Clinical Features of Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome in Japan, 2013-2014. PloS One. 2016. Vol. 11, N10. P. e0165207.; Zhao L., Zhai S., Wen H., et al. Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome Virus, Shandong Province, China. Emerg. Infect. Dis. 2012. Vol. 18, N6. P.963–965.; Wi Y.M., Woo H.I., Park D. et al. Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome in Patients Suspected of Having Scrub Typhus Emerg. Infec. Dis. 2016. Vol. 22, N11. Р.1992–1995.; Zohaib A., Zhang J., Saqib M., et al. Serologic Evidence of Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome Virus and Related Viruses in Pakistan. Emerg. Infect. Dis. 2020. Vol. 26, N7. P. 1513–1516.; Matsuno K., Feldmann H. and Ebihara H. Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome Associated with a Novel Bunyavirus. Emerg. Infect. Dis.: Clinical Case Studies. 2014, eds O. Ergonul, F. Can, M. Akova, and L. Madoff (Amsterdam: Elsevier). Р. 1–12.; Chen H., Hu K., Zou J., Xiao J. A cluster of cases of human-to-human transmission caused by severe fever with thrombocytopenia syndrome bunyavirus. Int. J. Infect. Dis. 2013. Vol. 17. P. e206–e208.; Bao C.J, Guo X., Qi X.L, et al. A Family Cluster of Infections by a Newly Recognized Bunyavirus in Eastern China, 2007: Further Evidence of Person-to-Person Transmission. Clin. Infect. Dis. 2011. Vol. 53, N12. P. 1208–1214.; Gai Z., Liang M., Zhang Y., et al. Person-to-Person Transmission of Severe Fever With Thrombocytopenia Syndrome Bunyavirus Through Blood Contact. Clin. Infect. Dis. 2012. Vol. 54. P. 249–252.; Kim W.Y., Choi W.Y., Park S.W., et al. Nosocomial Transmission of Severe Fever With Thrombocytopenia Syndrome in Korea. Clin. Infect. Dis. 2015. Vol.60, N 11. P. 1681–1683.; Ryu B.H., Kim J.Y., Kim T., et al. Extensive severe fever with thrombocytopenia syndrome virus contamination in surrounding environment in patient rooms. Clin. Microbiol. Infect. 2018. Vol. 24. P. 911.e1–911.e4.; Harada T., Fukushi S., Kurosu T., et al. Inactivation of severe fever with thrombocytopenia syndrome virus for improved laboratory safety. J. Biosafety and Biosecurity 2020. Vol. 2. P. 31–35.; Yun S.M., Lee W.G., Ryou J., et al. Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome Virus in Ticks Collected from Humans, South Korea, 2013. Emerg. Infect. Dis. 2014. Vol. 20, N8. P.1358–1361.; Zhuang L., Sun Y., Cui X.M., et al. Transmission of Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome Virus by Haemaphysalis longicornis Ticks, China Emerg. Infect. Dis. 2018. Vol. 24, N5. P. 868–871.; Luo L.M., Zhao L., Wen H.L., et al. Haemaphysalis longicornis Ticks as Reservoir and Vector of Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome Virus in China. Emerg. Infect. Dis. 2015. Vol. 21, N10. P.1770–1776.; Beard C.B., Occi J., Bonilla D.L., et al. Multistate Infestation with the Exotic Disease–Vector Tick Haemaphysalis longicornis – United States, August 2017–September 2018. MMWR. 2018. Vol. 67, N47. P. 1310–1313.; Hwang J., Kang J.G., Ohc S.S. et al. Molecular detection of severe fever with thrombocytopenia syndrome virus (SFTSV) in feral cats from Seoul, Korea Ticks Tick-borne Dis. 2016. Vol. 8, N1. P. 9–12.; Park E., Shimojima M., Nagata N., et al. Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome Phlebovirus causes lethal viral hemorrhagic fever in cats. Sci. Rep. 2019. 9:11990.; Kang J.G., Cho Y.K., Jo Y.S., et al. Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome Virus in Dogs, South Korea. Emerg. Infect. Dis. 2019. Vol. 25, N2. P. 376–378.; Nam S.J., Oh Y.I., Kim H.J. et al. Unusual case of severe fever with thrombocytopenia syndrome showing clinical manifestations in a companion dog. Vet. Med. Sci. 2020. Vol. 6, N3. P.353–358.; Колонин Г.В. Мировое распространение иксодовых клещей: (род Haemaphysalis). М.: Наука; 1978.; Белов Ю.А., Москвина Т.В., Щелканов Е.М. и др. К вопросу о северной границе ареала и хозяевах клеща Haemaphysalis longicornis (acari: ixodidae) в Приморском крае. Чтения памяти Алексея Ивановича Куренцова. 2019, №30. С. 177–182.; Liu W., Lu Q.B., Cui N., et al. Case Fatality Ratio and Effectiveness of Ribavirin Therapy Among Hospitalized Patients in China Who Had Severe Fever With Thrombocytopenia Syndrome. Clin. Infect. Dis. 2013. Vol. 57, N9. P. 1292–1299.; Tani H., Fukuma A., Fukushi S., et al. Efficacy of T-705 (favipiravir) in the treatment of infections with lethal severe fever with thrombocytopenia syndrome virus. mSphere. 2016. Vol. 1, N1. P. e00061–15.; Li Z., Cui L., Zhou M., et al. Development and Application of a One-Step Real-Time RT-PCR Using a Minor-Groove-Binding Probe for the Detection of a Novel Bunyavirus in Clinical Specimens. J. Med. Virol. 2013. Vol. 85. P. 370–377.; Sun Y., Liang M., Qu J., et al. Early diagnosis of novel SFTS bunyavirus infection by quantitative real-time RT-PCR assay. J. Clin. Virol. 2012. Vol. 53. P. 48–53.; Yoshikawa T., Fukushi S., Tani H., et al. Sensitive and Specific PCR Systems for Detection of Both Chinese and Japanese Severe Fever with Thrombocytopenia Syndrome Virus Strains and Prediction of Patient Survival Based on Viral Load. J. Clin. Microbiol. 2014. Vol. 52, N9. P. 3325–3333.; https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/1326

Availability: https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/1326
https://doi.org/10.31631/2073-3046-2021-20-4-114-122

Molecular-Genetic Features of Tuberculosis in Mongolia and in Russian Bordering Regions

Authors: M. V. Badleyeva, S. N. Zhdanov, E. . Baasansuren, O. B. Ogarkov, N. . Erdenegerel, E. A. Orlova, T. . Oyuntuyaa, E. D. Savilov, B. . Buyanhishig, B. . Puntsag, D. . Nyamhuu

Source: Эпидемиология и вакцинопрофилактика, Vol 16, Iss 5, Pp 53-57 (2017)

Subject Terms: mongolia, 0301 basic medicine, туберкулез, russia, genotype beijing, генотип beijing, россия, молекулярная эпидемиология, монголия, molecular epidemiology, 3. Good health, 03 medical and health sciences, tuberculosis, BD143-237, Epistemology. Theory of knowledge

Access URL: https://www.epidemvac.ru/jour/article/download/320/321
https://doaj.org/article/a4e0ed4107134903a0d2871d8895c527
https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/320
https://www.epidemvac.ru/jour/article/download/320/321

Genotypic and pharmacoresistant HIV characteristics in patients in the Socialist Republic of Vietnam ; Генотипическая и фармакорезистентная характеристика ВИЧ у пациентов в Социалистической Республике Вьетнам

Authors: A. N. Schemelev, Yu. B. Ostankova, E. B. Zueva, H. Khanh Thu Huinh, A. V. Semenov, А. Н. Щемелев, Ю. В. Останкова, Е. Б. Зуева, Хоанг Khanh Thu Huinh, А. В. Семенов

Source: HIV Infection and Immunosuppressive Disorders; Том 12, № 2 (2020); 56-68 ; ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии; Том 12, № 2 (2020); 56-68 ; 2077-9828 ; 10.22328/2077-9828-2020-12-2

Subject Terms: Вьетнам, drug resistance, molecular epidemiology, subtype, gene pol, Vietnam, лекарственная устойчивость, молекулярная эпидемиология, генотипы, ген pol

File Description: application/pdf

Relation: https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/542/389; UNAIDS. Global HIV and AIDS statistics-2018 fact sheet [Online] 2019; Available from: http://www.unaids.org/en/resources/fact-sheet/. [Accessed 10 08 2019]; European Centre for Disease Prevention and Control. HIV/AIDS surveillance in Europe 2015. (ECDC, Stockholm, 2016).; Keele B.F., Van Heuverswyn F., Li Y., Bailes E., Takehisa J., Santiago M.L. Chimpanzee reservoirs of pandemic and nonpandemic HIV-1 // Science. 2006. Vol. 313. P. 523–526. doi:10.1126/science.1126531.; D’arc M., Ayouba A., Esteban A., Learn G.H., Boué V., Liegeois F. Origin of the HIV-1 group O epidemic in western lowland gorillas // Proc. Natl. Acad. Sci. 2015. Vol. 112. P. E1343–E1352. doi:10.1073/pnas.1502022112.; Peeters M., D’Arc M., Delaporte E. Origin and diversity of human retroviruses // AIDS Rev. 2014. Vol. 16 (1). Р. 23–34.; Foley B.T., Leitner T., Paraskevis D., Peeters M. Primate immunodeficiency virus classification and nomenclature: Review // Infect Genet Evol. 2016. Vol. 46. Р. 150–158. doi:10.1016/j.meegid.2016.10.018.; McCutchan F.E. Global epidemiology of HIV // J. Med. Virol. 2006. Vol. 78. P. S7–S12.; Hemelaar J., Gouws E., Ghys P.D., Osmanov S. WHO-UNAIDS Network for HIV Isolation and Characterisation 2011. Global trends in molecular epidemiology of HIV-1 during 2000–2007 // AIDS. 2011. Vol. 25. Р. 679–689.; Hemelaar J. The origin and diversity of the HIV-1 pandemic // Trends Mol. Med. 2012. Vol. 18 (3). P. 182–192.; Buonaguro L., Tornesello M.L., Buonaguro F.M. Human immunodeficiency virus type 1 subtype distribution in the worldwide epidemic: pathogenetic and therapeutic implications // J. Virol. 2007. Vol. 81 (19). P. 10209–10219.; UNAIDS. Global AIDS Update 2016. 2016. Available from: http://www.unaids.org/en/resources/documents/2016/Global-AIDS-update-2016.; De Mendoza C. Hot News: HIV Epidemics — Current Burden and Future Prospects // AIDS Rev. 2017. Vol. 19 (4). P. 239.; Scherrer A., von Wyl V., Yan W., Emergence of Acquired HIV-1 Drug Resistance Almost Stopped in Switzerland: A 15-Year Prospective Cohort Analysis // Clin. Infect. Dis. 2016. 15. Vol. 62 (10). P. 1310–1317.; Gupta R.K., Jordan M.R., Sultan B.J., Hill A., Davis D.H., Gregson J., Sawyer A.W., Hamers R.L., Ndembi N., Pillay D., Bertagnolio S. Global trends in antiretroviral resistance in treatment-naive individuals with HIV after rollout of antiretroviral treatment in resource-limited settings: a global collaborative study and meta-regression analysis // Lancet. 2012. Vol. 380. P. 1250–1258.; Pasquet A., Messou E., Gabillard D., Minga A., Depoulosky A., Deuffic-Burban S., Losina E., Freedberg K.A., Danel C., Anglaret X., Yazdanpanah Y. Impact of drug stock-outs on death and retention to care among HIV-infected patients on combination antiretroviral therapy in Abidjan // Cote d’Ivoire PLoS One. 2010. Р. 5. e13414.; Николенко Г.Н. Изучение механизмов лекарственной устойчивости ВИЧ-1 к ингибиторам обратной транскриптазы: дис. … д-ра биол. наук: 03.01.03. Кольцово, 2012. 182 с.: ил. РГБ ОД, 71 13–3/13.; Shafer R.W., Rhee S.Y., Bennett D.E. Consensus resistance mutations for epidemiological surveillance: basic principles and potential controversies // Antivir. Ther. 2008. Vol. 13. P. 59–68.; Hirsch M.S., Günthard H.F., Schapiro J.M., Brun-Vézinet F., Clotet B., Hammer S.M., Johnson V.A., Kuritzkes D.R., Mellors J.W., Pillay D., Yeni P.G., Jacobsen D.M., Richman D.D. Antiretroviral drug resistance testing in adult HIV-1 infection: 2008 recommendations of an international AIDS society–USA panel // Clin. Infect. Dis. 2008. Vol. 47 (2). Р. 266–285. doi:10.1086/589297.; Nguyen T.H., Nguyen T.L., Trinh Q.H. HIV/AIDS epidemics in Vietnam: evolution and responses // AIDS Educ Prev. 2004. Vol. 16. P. 137– 154. DOI:10.1521/aeap.16.3.5.137.35527.; Nguyen Ha P., Pharris A., Huong N.T., Chuc N.T., Brugha R., Thorson A. The evolution of HIV policy in Vietnam: from punitive control measures to a more rights-based approach // Glob Health Action. 2010. Vol. 3. doi:10.3402/gha.v3i0.4625.; Plantier J.C., Leoz M., Dickerson J.E., de Oliveira F., Cordonnier F. A new human immunodeficiency virus derived from gorillas // Nat. Med. 2009. Vol. 15. Р. 871–872.; Kuiken C., Foley B., Leitner T., Apetrei C., Hahn B. HIV Sequence Compendium 2011. 2011. Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, NM.; UNAIDS Vietnam. Legal documentation on HIV/AIDS. 2009.; Country Operational Plan (COP/ROP) Vietnam 2017 Strategic Direction Summary January 18, 2017. Available from: https://mz.usembassy.gov/wp-content/uploads/sites/182/2017/04/FINAL_COP17_guidance-1.pdf [Accessed 18 09 2019]; Country Operational Plan (COP/ROP) Vietnam 2019 Strategic Direction Summary April 12, 2019. Available from: https://www.state.gov/wpcontent/uploads/2019/09/Vietnam_COP19-Strategic-Directional-Summary_public.pdf [Accessed 18 09 2019]; WHO. Number of people (all ages) living with HIV. https://www.who.int/gho/hiv/epidemic_status/cases_all/en/; GFATM Viet Nam Overview https://www.theglobalfund.org/en/portfolio/country/?loc=VNM&k=90fb7820-b2f0-4401-bc77-067270585a9b; UNAIDS Country factsheets Viet Nam 2015 [UNAIDS website]. UNAIDS, 2015. http://aidsinfo.unaids.org/; Pineda-Pena A.C., Faria N.R., Imbrechts S., Libin P., Abecasis A.B., Deforche K., Gómez-López A., Camacho R.J., de Oliveira T., Vandamme A.M. Automated subtyping of HIV-1 genetic sequences for clinical and surveillance purposes: performance evaluation of the new REGA version 3 and seven other tools // Infect Genet Evol. 2013. Vol. 19. Р. 337–348. doi:10.1016/j.meegid.2013.04.032.; Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets // Mol. Biol. Evol. 2016. Vol. 33 (7). P. 1870–1874.; Schultz A.K., Bulla I., Abdou-Chekaraou M., Gordien E., Morgenstern B., Zoaulim F., Dény P., Stanke M. jpHMM: recombination analysis in viruses with circular genomes such as the hepatitis B virus // Nucleic Acids Res. 2012. Vol. 40 (Web Server issue). W193–198. doi:10.1093/nar/gks414.; Bontell I., Cuong do D., Agneskog E., Diwan V., Larsson M., Sönnerborg A. Transmitted drug resistance and phylogenetic analysis of HIV CRF01_AE in Northern Vietnam // Infect Genet Evol. 2012. Vol. 12 (2). P. 448–452. doi:10.1016/j.meegid.2011.04.034.; Do H.T., Nguyen D.T., Nguyen L.A.T., Do D.H., Le H.X., Trinh X.M.T., Ton H.V.N., Sawada I., Kitamura N., Le M.N., Yoshihara K., Phan T.H.T., Bui C.T., Ariyoshi K., Yoshida L.M. An Alarmingly High Proportion of HIV-1 Isolates Carrying Mutations Corresponding to Resistance to Antiretroviral Drugs among HIV-Positive High-Risk Groups in Central Vietnam: a Substudy of the National Sentinel Survey // Jpn. J. Infect Dis. 2017. Vol. 70 (6). P. 621–627. doi:10.7883/yoken.JJID.2016.512.; Ishizaki A., Cuong N.H., Thuc P.V., Trung N.V., Saijoh K., Kageyama S., Ishigaki K., Tanuma J., Oka S., Ichimura H. Profile of HIV type 1 infection and genotypic resistance mutations to antiretroviral drugs in treatment-naive HIV type 1-infected individuals in Hai Phong, Viet Nam // AIDS Res Hum Retroviruses. 2009. Vol. 25 (2). P. 175–182. doi:10.1089/aid.2008.0193.; Meriki H.D., Tufon K.A., Anong D.N., Atanga P.N., Anyangwe I.A., Cho-Ngwa F., Nkuo-Akenji T. Genetic diversity and antiretroviral resistanceassociated mutation profile of treated and naive HIV-1 infected patients from the Northwest and Southwest regions of Cameroon // PLoS One. 2019. Vol. 14 (11). e0225575. doi:10.1371/journal.pone.0225575.; Thi T. C. P., Azumi I., Dac C. P., Xiuqiong B., Shinichi O., Hiroshi I. Characterization of HIV Type 1 Genotypes and Drug Resistance Mutations Among Drug-Naive HIV Type 1-Infected Patients in Northern Vietnam // AIDS Res Hum Retroviruses. 2010. Vol. 26 (2). Р. 233–235.; Pham Q.D., Huynh T.K., Luong T.T., Tran T., Vu T.X., Truong L. X. HIV-1 drug resistance and associated factors among adults failing first-line highly active antiretroviral therapy in Ho Chi Minh City, Vietnam // HIV Clin. Trials. 2013. Vol. 14 (1). Р. 34–44.; Останкова Ю.В., Щемелев А.Н., Зуева Е.Б., Чурина М.А., Валутите Д.Э., Семенов А.В. Молекулярная эпидемиология и фармакорезистентность ВИЧ у пациентов с вирусологической неэффективностью антиретровирусной терапии в Архангельской области // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2019. Т. 11, № 4. С. 65–72. http://dx.doi.org/10.22328/2077-9828-2019-11-4-65-72.; Nguyen T.H.L., Recordon-Pinson P., Pham V.H. HIV type 1 isolates from 200 untreated individuals in Ho Chi MinhCity (Vietnam): ANRS 1257 study. Large predominance ofCRF01_AE and presence of major resistance mutations toantiretroviral drugs // AIDS Res Hum Retroviruses. 2003. Vol. 19 (10). P. 925–928.; Depincé A.E., Dussert E., Vergnon-Miszczycha D., Keita A., Pillet S., Botelho-Nevers E., Frésard A., Gagneux-Brunon A., Lucht F.R., Roblin X., Pozzetto B., Paul S., Bourlet T. The Genotyping Resistance Profile of the Pol Gene Detected in Blood of Newly Diagnosed HIV-Positive Men Is Durably Archived in the Gut Whatever the Time of Initiation of cART // Intervirology. 2016. Vol. 59 (5–6). Р. 256–261. doi:10.1159/000472716.

Availability: https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/542
https://doi.org/10.22328/2077-9828-2020-12-2-56-68

HIV MOLECULAR EPIDEMIOLOGY AND PHARMACO-RESISTANCE IN PATIENTS WITH ANTIRETROVIRAL THERAPY FAILURE IN ARKHANGELSK DISTRICT ; МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭПИДЕМИОЛОГИЯ И ФАРМАКОРЕЗИСТЕНТНОСТЬ ВИЧ У ПАЦИЕНТОВ С ВИРУСОЛОГИЧЕСКОЙ НЕЭФФЕКТИВНОСТЬЮ АНТИРЕТРОВИРУСНОЙ ТЕРАПИИ В АРХАНГЕЛЬСКОЙ ОБЛАСТИ

Authors: Yu. V. Ostankova, A. N. Schemelev, E. V. Zueva, M. A. Churina, D. E. Valutite, A. V. Semenov, Ю. В. Останкова, А. Н. Щемелев, Е. Б. Зуева, М. А. Чурина, Д. Э. Валутите, А. В. Семенов

Source: HIV Infection and Immunosuppressive Disorders; Том 11, № 4 (2019); 79-90 ; ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии; Том 11, № 4 (2019); 79-90 ; 2077-9828 ; 10.22328/2077-9828-2019-11-4

Subject Terms: Архангельск, drug resistance, molecular epidemiology, subtype, gene pol, Archangelsk, лекарственная устойчивость, молекулярная эпидемиология, генотипы, ген pol

File Description: application/pdf

Relation: https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/491/369; UNAIDS. Global HIV and AIDS statistics-2018 fact sheet [Online] 2018; Available from: http://www.unaids.org/en/resources/fact-sheet/. [Accessed 29 September 2018].; Hemelaar J., Gouws E., Ghys P.D., Osmanov S. Global and regional distribution of HIV-1 genetic subtypes and recombinants in 2004 // AIDS. 2006. Vol. 20. Р. W13–W23.; Hemelaar J. The origin and diversity of the HIV-1 pandemic // Trends Mol Med. 2012. Vol. 18 (3). P. 182–192.; Beloukas A., Psarris A., Giannelou P., Kostaki E., Hatzakis A., Paraskevis D. Molecular epidemiology of HIV-1 infection in Europe: An overview // Infect. Genet. Evol. 2016. Vol. 46. Р. 180–189. DOI:10.1016/j.meegid.2016.06.033.; UNAIDS. Global AIDS Update 2016. 2016. Available from: http://www.unaids.org/en/resources/documents/2016/Global-AIDS-update-2016.; Bobkova M. Current status of HIV-1 diversity and drug resistance monitoring in the former USSR // AIDS Rev. 2013. Vol. 15. P. 204–212.; Справка Федерального научно-методического центра по профилактике и борьбе со СПИДом ФБУН Центрального НИ эпидемиологии Роспотребнадзора «ВИЧ-инфекция в Российской Федерации в первом полугодии 2019 г.».; Foley B.T., Leitner T., Paraskevis D., Peeters M. Primate immunodeficiency virus classification and nomenclature: Review // Infect Genet Evol. 2016. Vol. 46. P. 150–158.; Niccolai L.M., Toussova O.V., Verevochkin S.V., Barbour R., Heimer R., Kozlov A.P. High HIV prevalence, suboptimal HIV testing, and low knowledge of HIV-positive serostatus among injection drug users in St. Petersburg, Russia // AIDS Behav. 2010. No. 14. P. 932–941.; Лаповок И.А., Лопатухин А.Э., Киреев Д.Е., Казеннова Е.В., Лебедев А.В., Бобкова М.Р., Коломеец А.Н., Турбина Г.И., Шипулин Г.А., Ладная Н.Н., Покровский В.В. Молекулярно-эпидемиологический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в России в 1987–2015 гг. // Терапевтический архив. 2017. № 89 (11). С. 44–49.; Dukhovlinova E., Masharsky A., Toussova O., Verevochkin S., Solovyeva T., Meringof M., Paintsil E., White E., Barbour R., Heimer R., Kozlov A. Two Independent HIV Epidemics in St. Petersburg, Russia Revealed by Molecular Epidemiology // AIDS Research and Human Retroviruses. 2015. Vol. 31 (6). P. 608–614.; Казеннова Е.В., Нешумаев Д.А., Руковицин Д.В., Лаповок И.А., Лага В.Ю., Ракчеева О.В., Васильев А.В., Туманов А.С., Воронцова Г.А., Кузнецова А.В., Лойфман Е.А., Старухина И.Н., Кустова О.И., Половица Н.В., Липская Н.А., Бобкова М.Р. Молекулярно-эпидемиологический анализ эпидемии ВИЧ-инфекции в Благовещенске и Хабаровске (Дальний Восток России) // Вопросы вирусологии. 2014. № 4. С. 31–36.; Дементьева Н.Е., Сизова Н.В., Лисицина З.Н., Маклакова В.А., Крутицкая Л.И., Беляков Н.А. Анализ субтипов и фармакорезистентных вариантов ВИЧ, циркулирующих среди ВИЧ-инфицированных пациентов Санкт-Петербурга // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. 2011. Т. 3. № 4. C. 34–44.; De Mendoza C. Hot News: HIV Epidemics — Current Burden and Future Prospects // AIDS Rev. 2017. Vol. 19 (4). P. 239.; Scherrer A., von Wyl V., Yan W., Emergence of Acquired HIV-1 Drug Resistance Almost Stopped in Switzerland: A 15-Year Prospective Cohort Analysis // Clin. Infect. Dis. 2016. Vol. 15. No. 62 (10). P. 1310–1317.; Gupta R.K., Jordan M.R., Sultan B.J., Hill A., Davis D.H., Gregson J., Sawyer A.W., Hamers R.L., Ndembi N., Pillay D., Bertagnolio S. Global trends in antiretroviral resistance in treatment-naive individuals with HIV after rollout of antiretroviral treatment in resource-limited settings: a global collaborative study and meta-regression analysis // Lancet. 2012. Vol. 380. P. 1250–1258.; Pasquet A., Messou E., Gabillard D., Minga A., Depoulosky A., Deuffic-Burban S., Losina E., Freedberg K.A., Danel C., Anglaret X., Yazdanpanah Y. Impact of drug stock-outs on death and retention to care among HIV-infected patients on combination antiretroviral therapy in Abidjan. Cote d’Ivoire // PLoS One. 2010. Vol. 5. e13414.; Hirsch M.S., Günthard H.F., Schapiro J.M., Brun-Vézinet F., Clotet B., Hammer S.M., Johnson V.A., Kuritzkes D.R., Mellors J.W., Pillay D., Yeni P.G., Jacobsen D.M., Richman D.D. Antiretroviral drug resistance testing in adult HIV-1 infection: 2008 recommendations of an international AIDS society — USA panel // Clin. Infect. Dis. 2008. Vol. 47 (2). Р. 266–285. doi:10.1086/589297.; Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis Version 7.0 for Bigger Datasets // Mol. Biol. Evol. 2016. No. 33 (7). P. 1870–1874.; Попова Е.С., Сорокина Т.А. Информационный бюллетень центра по профилактике и борьбе со СПИД и инфекционными заболеваниями Государственного автономного учреждения здравоохранения Архангельской области «Архангельский клинический кожно-венерологический диспансер». Архангельск, 2018. № 1 (38). Режим доступа: 16.08.2019 http://www.kotlasgb.ru/news/1331/?sphrase_id=951; http://www.kotlasgb.ru/for_patients/profilact/2017%20%D0%B3%D0%BE%D0%B4%20%D0%98%D0%BD%D1%84%D0%BE%D1%80%D0%BC%20%D0%B1%D1%8E%D0%BB%D0%BB%D0%B5%D1%82%D0%B5%D0%BD%D1%8C.doc; Kazennova E., Laga V., Lapovok I., Glushchenko N., Neshumaev D., Vasilyev A., Bobkova M. HIV-1 Genetic Variants in the Russian Far East // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2014. No. 8. P. 742–752.; Choudinovskikh O., Denissenko M. Migration Between CIS Countries: Trends and Policy. Search Working Paper (January). WP3/06. Available from: http://www.ub.edu/searchproject/wp-content/uploads/2013/02/WP_3_6.pdf; Aibekova L., Foley B., Hortelano G., Raees M., Abdraimov S., Toichuev R., Ali S. Molecular epidemiology of HIV-1 subtype A in former Soviet Union countries // PLoS One. 2018. No. 13 (2). e0191891.; Бородкина О.И. Проблемы профилактики ВИЧ/СПИДа среди международных мигрантов // Социальное обслуживание семей и детей: научно-методический сборник. 2016. № 8. С. 102–109.; Софронов А.Г., Добровольская А.Е., Пашковский В.Э., Чащин В.П., Чащин М.В., Зуева Л.П., Асланов Б.И., Гончаров А.Е. Распространенность социально-значимых инфекционных заболеваний у трудовых мигрантов в Санкт-Петербурге // Медицинский академический журнал. 2014. № 14 (4). С. 79–83.; Казеннова Е.В., Лага В.Ю., Громов К.Б., Санков М.Н., Попова Е.С., Игумнова Е.Г., Опарина Е.Н., Сорокина Т.А., Бобкова М.Р. Молекулярно-эпидемиологический анализ ВИЧ-инфекции в северных портовых городах России // Вопросы вирусологии. 2017. Т. 62. № 4. С. 154–161.; Кравченко А.В. Современные схемы антиретровирусной терапии // Медицинский совет. 2016. № 17. С. 84–89.

Availability: https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/491
https://doi.org/10.22328/2077-9828-2019-11-4-79-90

MOLECULAR GENETIC ANALYSIS OF HIV-1 VARIANTS CIRCULATING IN THE REPUBLIC OF CRIMEA ; МОЛЕКУЛЯРНО-ГЕНЕТИЧЕСКИЙ АНАЛИЗ ВАРИАНТОВ ВИЧ-1, ЦИРКУЛИРУЮЩИХ В РЕСПУБЛИКЕ КРЫМ

Authors: V. Yu. Laga, A. V. Nemykin, E. N. Begma, A. M. Strakhova, N. A. Vasilyeva, E. N. Ozhmegova, A. A. Antonova, M. R. Bobkova, В. Ю. Лага, А. В. Немыкин, Е. Н. Бегма, А. М. Страхова, Н. А. Васильева, Е. Н. Ожмегова, А. А. Антонова, М. Р. Бобкова

Contributors: Работа выполнена при финансовой поддержке проекта РНФ № 15-15-00050П (2018– 2019). Биоинформационные исследования были выполнены в рамках выполнения международного проекта CARE (соглашение с Миннауки 075-015-2019-006).

Source: HIV Infection and Immunosuppressive Disorders; Том 11, № 4 (2019); 91-97 ; ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии; Том 11, № 4 (2019); 91-97 ; 2077-9828 ; 10.22328/2077-9828-2019-11-4

Subject Terms: антиретровирусная терапия, molecular epidemiology, drug resistance, Republic Crimea, antiretroviral therapy, молекулярная эпидемиология, лекарственная устойчивость, Республика Крым

File Description: application/pdf

Relation: https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/493/370; Bobkov A.F., Kazennova E.V., Selimova L.M. et al. Temporal trends in the HIV-1 epidemic in Russia: predominance of subtype A // J. Med. Virol. 2004. Vol. 74. Nо. 2. Р. 191–196.; Thomson M.M., de Parga E.V., Vinogradova A. et al. New insights into the origin of the HIV type 1 subtype A epidemic in former Soviet Union’s countries derived from sequence analyses of preepidemically transmitted viruses // AIDS Res Hum Retroviruses. 2007. Vol. 23. Nо. 12. Р. 1599–1604.; Bobkov A., Kazennova E., Selimova L. et al. A sudden epidemic of HIV type 1 among injecting drug users in the former Soviet Union: identification of subtype A, subtype B, and novel gagA/envB recombinants // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 1998. Vol. 14. Nо. 8. Р. 669–676.; Kazennova E., Laga V., Lapovok I. et al. HIV-1 genetic variants in the Russian Far East // AIDS Res. Hum. Retroviruses. 2014. Vol. 30. Nо. 8. Р. 742–752.; Bobkova M. Current status of HIV-1 diversity and drug resistance monitoring in the former USSR // AIDS Rev. 2013. Vol. 15. Nо. 4. Р. 204–212.; Baryshev P.B., Bogachev V.V., Gashnikova N.M. HIV-1 genetic diversity in Russia: CRF63_02A1, a new HIV type 1 genetic variant spreading in Siberia // AIDS Res Hum Retroviruses. 2014. Vol. 30. Nо. 6. Р. 592–597.; Лаповок И.А., Лопатухин А.Э., Киреев Д.Е. и др. Молекулярно-эпидемиологический анализ вариантов ВИЧ-1, циркулировавших в России в 1987–2015 гг. // Терапевтический архив. 2017. Т. 89. № 11. С. 43–48; Saad M.D., Shcherbinskaya A.M., Nadai Y. et al. Molecular epidemiology of HIV Type 1 in Ukraine: birthplace of an epidemic // AIDS Res Hum Retroviruses. 2006. Vol. 22. Nо 8. Р. 709–714.; Nabatov A.А., Kravchenko O.N., Lyulchuk M.G. et al. Simultaneous introduction of HIV type 1 subtype A and B viruses into injecting drug users in southern Ukraine at the beginning of the epidemic in the former Soviet Union // AIDS Res Hum Retroviruses. 2002. Vol. 18. Nо. 12. Р. 891–895.; Foley B.T., Leitner T., Paraskevis D. et al. Primate immunodeficiency virus classification and nomenclature: Review // Infect. Genet. Evol. 2016. Vol. 46. Р. 150–158.; Carr J.K., Nadai Y., Eyzaguirre L. et al. Outbreak of a West African recombinant of HIV-1 in Tashkent, Uzbekistan // J. Acquir Immune Defic. Syndr. 2005. Vol. 39. Nо. 5. Р. 570–575.; Baryshev P.B., Bogachev V.V., Gashnikova N.M. Genetic characterization of an isolate of HIV type 1 AG recombinant form circulating in Siberia, Russia // Arch. Virol. 2012. Vol. 157, Nо. 12. Р. 2335–2341.; Vasylyeva T.I., Liulchuk M., du Plessis L. et al. The Changing Epidemiological Profile of HIV-1 Subtype B Epidemic in Ukraine // AIDS Res Hum Retroviruses. 2019. Vol. 35, Nо 2. Р. 155–163.; Роспотребнадзор, Справка «ВИЧ-инфекция в Российской Федерации в 2018 г.»; Dumchev K., Sazonova Y., Salyuk T. et al. Trends in HIV prevalence among people injecting drugs, men having sex with men, and female sex workers in Ukraine // Int. J. STD AIDS. 2018. Vol. 29, Nо. 13. Р. 1337–1344.; Роспотребнадзор. Справка «ВИЧ-инфекция в Российской Федерации в 2017 г.»; В Крыму заболеваемость ВИЧ растет стремительными темпами. 2018; Available from: https://ruinformer.com/page/v-krymu-zabolevaemost-vich-rastet-stremitelnymi-tempami; Kazatchkine M. Russia’s ban on methadone for drug users in Crimea will worsen the HIV/AIDS epidemic and risk public health // BMJ. 2014. Vol. 348. Р. 3118.; Лага В.Ю., Казеннова Е.В., Васильев А.В. и др. Молекулярно-генетическая характеристика вариантов ВИЧ-1, распространенных на территории Киргизии // Вопросы вирусологии. 2012. № 5. С. 26–31.; Gianotti N., Galli L., Boeri E. et al. In vivo dynamics of the K103N mutation following the withdrawal of non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors in Human Immunodeficiency Virus-infected patients // New Microbiol. 2005. Vol. 28. Nо. 4. Р. 319–326.

Availability: https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/493
https://doi.org/10.22328/2077-9828-2019-11-4-91-97

Prevalence and molecular-genetic characteristics of hepatitis B virus in HIV-positive individuals at the Far Eastern Federal District ; Распространенность и молекулярно-генетическая характеристика вируса гепатита В у ВИЧ-позитивных лиц в Дальневосточном регионе

Authors: Bazykina E.A., Turkutyukov V.B., Trotsenko O.E., Kotova V.O., Balakhontseva L.A., Butakova L.V., Varnavskaya L.V., Fomenko V.V., Chechulina M.A., Krapivkin A.I., Zinkovskaya S.V., Budai G.I., Yanovich O.A., Lomakina E.A., Lukina Z.I.

Contributors: Varnavskaya L.V., Fomenko V.V., Chechulina M.A., Варнавская Л.В., Фоменко В.В., Чечулина М.А.

Source: Russian Journal of Infection and Immunity; Vol 9, No 1 (2019); 183-192 ; Инфекция и иммунитет; Vol 9, No 1 (2019); 183-192 ; 2313-7398 ; 2220-7619 ; 10.15789/2220-7619-2019-1

Subject Terms: HIV-infection, viral hepatitis B, molecular epidemiology, coinfection, Far Eastern Federal District, prevalence, ВИЧ-инфекция, вирусный гепатит В, молекулярная эпидемиология, сочетанное инфицирование, Дальневосточный федеральный округ, распространенность

File Description: application/pdf

Relation: https://iimmun.ru/iimm/article/view/748/796; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/748/2566; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/748/2567; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/748/2568; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/748/2569; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/748/2570; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/748/2571; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/748/2572; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/748/2573; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/748/2574; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/748/2575; https://iimmun.ru/iimm/article/downloadSuppFile/748/3294; https://iimmun.ru/iimm/article/view/748

Availability: https://iimmun.ru/iimm/article/view/748
https://doi.org/10.15789/2220-7619-2019-1-183-192

THE PREVALENCE OF OCCULT HEPATITIS B AMONG HBSAG-NEGATIVE PERSONS WITH HIV IN VELIKY NOVGOROD ; РАСПРОСТРАНЕННОСТЬ ОККУЛЬТНОГО ГЕПАТИТА B СРЕДИ HBSAGНЕГАТИВНЫХ ЛИЦ С ВИЧ В ВЕЛИКОМ НОВГОРОДЕ

Authors: Yu. O. Ostankova, A. V. Semenov, E. B. Zueva, A. A. Totolian, Ю. В. Останкова, А. В. Семенов, Е. Б. Зуева, А. А. Тотолян

Source: HIV Infection and Immunosuppressive Disorders; Том 11, № 1 (2019); 64-70 ; ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии; Том 11, № 1 (2019); 64-70 ; 2077-9828 ; 10.22328/2077-9828-2019-11-1

Subject Terms: молекулярная эпидемиология, occult hepatitis B, comorbidity, HBV genotype, molecular epidemiology, оккультный гепатит В, коморбидность, генотип ВГВ

File Description: application/pdf

Relation: https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/409/330; Yim H.J., Lok A.S. Natural history of chronic hepatitis B virus infection: what we knew in 1981 and what we know in 2005. Hepatology, 2006, Vol. 43, No. Suppl. 1, pp. S173–S181. URL: DOI:10.1002/hep.20956.; Raimondo G., Allain J. P., Brunetto M.R., Buendia M.A., Chen D.S., Colombo M., Craxi A., Donato F., Ferrari C., Gaeta G.B., Gerlich W.H., Levrero M., Locarnini S., Michalak T., Mondelli M.U., Pawlotsky J.M., Pollicino T., Prati D., Puoti M., Samuel D., Shouval D., Smedile A., Squadrito G., Trepo C., Villa E., Will H., Zanetti A.R., Zoulim F. Statements from the Taormina expert meeting on occult hepatitis B virus infection. J. Hepatol., 2008, Vol. 49, pp. 652–657. URL: DOI:10.1016/j.jhep.2008.07.014.; Семенов А.В., Останкова Ю.В., Файзуллаев Х.Н., Казакова Е.И., Козлов А.В., Мусабаев Э.И., Тотолян Арег А. Кольцевая ковалентно замкнутая ДНК ВГВ как маркер распространенности оккультного гепатита В у пациентов c ВГВ, ВГД и ВГС инфекцией в Узбекистане // ЖМЭИ. 2016. № 5. C. 43–49.; Samal J., Kandpal M., Vivekanandan P. Molecular mechanisms underlying occult hepatitis B virus infection. Clin. Microbiol. Rev., 2012, Vol. 25, pp. 142–163. URL: DOI:10.1128/CMR.00018-11.; Joint United Nations Programme on HIV/AIDS, United Nations. Global Report: UNAIDS Report on the Global AIDS epidemic. Geneva: UNAIDS, 2012, 212 p. URL: http://www.unaids.org/en/resources/documents/2012/20121120_UNAIDS_Global_Report_2012.; Prevention and control of viral hepatitis infection: frame work for global action. Geneva: WHO, 2012. URL: http://www.who.int/hiv/pub/hepatitis/Framework/en/.; Дадашева А.Э., Мамедов М.К., Михайлов М.И. О двух типах гpупп с высоким pиском инфициpования виpусами гепатитов В и С: эпидемиологическое и клиническое значение // В миpе виpусных гепатитов. 2011. № 1. С. 12–14.; Argani H., Akhtarishojaie E. Levamizole enhances immune responsiveness to intra-dermal and intra-muscular hepatitis B vaccination in chronic hemodialysis patients. J. Immune Based Ther. Vaccines, 2006, Vol. 4, pp. 3. URL: DOI:10.1186/1476-8518-4-3.; Vallet-Pichard A., Pol S. Natural history and predictors of severity of chronic hepatitis C virus (HCV) and human immunodeficiency virus (HIV) co-infection. J. Hepatol., 2006, Vol. 44, No. 1, pp. S28–S34. URL: DOI:10.1016/j.jhep.2005.11.008.; Osborn M.K., Guest J.L., Rimland D. Hepatitis B virus and HIV coinfection: relationship of different serological patterns to survival and liver disease. HIV Med., 2007, Vol. 8, No. 5, pp. 271–279. URL: DOI:10.1111/j.1468-1293.2007.00469.x.; Ramezani A., Banifazl M., Mohraz M., Rasoolinejad M., Aghakhani A. Occult hepatitis B virus infection: A major concern in HIV-infected patients: Occult HBV in HIV. Hepat. Mon., 2011, Vol. 11, No. 1, pp. 7–10.; Brichler S., Lagathu G., Chekaraou M.A., Le Gal F., Edouard A., Dény P., Césaire R., Gordien E. African, Amerindian and European hepatitis B virus strains circulate on the Caribbean Island of Martinique. J. Gen. Virol., 2013, Vol. 94 (Pt. 10), pp. 2318–2329. URL: DOI:10.1099/vir.0.055459-0.; Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets. Mol. Biol. Evol., 2016, Vol. 33, No. 7, pp. 1870–1874. URL: DOI:10.1093/molbev/msw054.; Coffin C.S., Mulrooney-Cousins P.M., Osiowy C., van der Meer F., Nishikawa S., Michalak T.I., van Marle G., Gill M.J. Virological characteristics of occult hepatitis B virus in a North American cohort of human immunodeficiency virus type 1-positive patients on dual active anti-HBV/HIV therapy. J. Clin. Virol., 2014, Vol. 60, No. 4, pp. 347–353. URL: DOI:10.1016/j.jcv.2014.04.021.; Gupta S., Singh S. Occult Hepatitis B Virus infection in ART-Naïve HIV-Infected patients seen at a tertiary care center in North India. BMC Infect. Dis., 2010, Vol. 10, pp. 53. URL: DOI:10.1186/1471-2334-10-53.; Honarmand A., Pourahmad M., Solhjoo K., Kohan M., Davami M.H., Mostafavi Zadeh S.K. Occult hepatitis B demonstrated by anti-HBc and HBV DNA in HIV-positive patients. Rep. Biochem. Mol. Biol., 2014, Vol. 3, No. 1, pp. 38–42.; Alvarez-Munoz M.T., Maldonado-Rodriguez A., Rojas-Montes O., Torres-Ibarra R., Gutierrez-Escolano F., Vazquez-Rosales G., Gomez A., Munoz O., Torres J., Lira R. Occult hepatitis B virus infection among Mexican human immunodeficiency virus-1-infected patients. World J. Gastroenterol., 2014, Vol. 20, No. 37, pp. 13 530–13 537. URL: DOI:10.3748/wjg.v20.i37.13530.; Bautista-Amorocho H., Castellanos-Domínguez Y.Z., Rodríguez-Villamizar L.A., Velandia-Cruz S.A., Becerra-Peña J.A., Farfán-García A.E. Epidemiology, risk factors and genotypes of HBV in HIV-infected patients in the northeast region of Colombia: high prevalence of occult hepatitis B and F3 subgenotype dominance. PLoS One, 2014, Vol. 9, No. 12, pp. e114 272. URL: DOI:10.1371/journal.pone.0114272.; Cohen Stuart J.W., Velema M., Schuurman R., Boucher C.A., Hoepelman A.I. Occult hepatitis B in persons infected with HIV is associated with low CD4 counts and resolves during antiretroviral therapy. J. Med. Virol., 2009, Vol. 81, No. 3, pp. 441–445. URL: DOI:10.1002/jmv.21422.; Fabris P., Biasin M.R., Giordani M.T., Berardo L., Menini V., Carlotto A., Miotti M.G., Manfrin V., Baldo V., Nebbia G., Infantolino D. Impact of occult HBV infection in HIV/HCV co-infected patients: HBV-DNA detection in liver specimens and in serum samples. Curr. HIV Res., 2008, Vol. 6, No. 2, pp. 173–179. URL: DOI : 10.2174/157016208783885029.; Esmail M.A., Mahdi W.K., Khairy R.M., Abdalla N.H. Genotyping of occult hepatitis B virus infection in Egyptian hemodialysis patients without hepatitis C virus infection. J. Infect. Public Health, 2016, Vol. 9, No. 4, pp. 452–457. URL: DOI:10.1016/j.jiph.2015.11.018.; Kim K.H., Chang H.Y., Park J.Y. Spontaneous HBsAg loss in Korean patients: relevance of viral genotypes, S gene mutations, and covalently closed circular DNA copy numbers. Clin. Mol. Hepatol., 2014, Vol. 20, No. 3, pp. 251–260. URL: DOI:10.3350/cmh.2014.20.3.251.; Останкова Ю.В., Семенов А.В., Буркитбаев Ж.К., Савчук Т.Н., Тотолян А.А. Генетические варианты вируса гепатита B у первичных доноров в г. Астана, Казахстан // Инфекция и иммунитет. 2016. Т. 6, № 4. C. 359–366.; Wiersma S.T., McMahon B., Pawlotsky J.-M., Thio C.L., Thursz Ma., Gee Lim S., Ocama P., Esmat G., Maimuna M., Bell D., Vitoria M., Eramova I., Lavanchy D., Dusheiko G. Treatment of chronic hepatitis B virus infection in resource-constrained settings: expert panel consensus. Liver Int., 2011, Vol. 31, Issue 6, pp. 755–761. URL: DOI:10.1111/j.1478-3231.2010.02373.x.; Sagnelli E., Pisaturo M., Martini S., Filippini P., Sagnelli C., Coppola N. Clinical impact of occult hepatitis B virus infection in immunosuppressed patients. World J. Hepatol., 2014, Vol. 6, No. 6, pp. 384–393. URL: DOI:10.4254/wjh.v6.i6.384.

Availability: https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/409
https://doi.org/10.22328/2077-9828-2019-11-1-64-70

Распространенность оккультного гепатита B среди HBsAg-негативных лиц с ВИЧ инфекцией в Великом Новгороде.

Authors: Юлия Владимировна Останкова, Александр Владимирович Семенов, Елена Борисовна Зуева, Арег Артемович Тотолян

Source: HIV Infection and Immunosuppressive Disorders; Том 11, № 1 (2019) ; ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии; Том 11, № 1 (2019) ; 2077-9828 ; 10.22328/2077-9828-2019-11-1

Subject Terms: Хронический вирусный гепатит В, оккультный гепатит В, коморбидность, генотип ВГВ, молекулярная эпидемиология

Relation: https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/downloadSuppFile/363/146; https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/downloadSuppFile/363/147; https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/downloadSuppFile/363/148; https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/downloadSuppFile/363/149; https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/downloadSuppFile/363/150; https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/downloadSuppFile/363/151; Yim H.J., Lok A.S. Natural history of chronic hepatitis B virus infection: what we knew in 1981 and what we know in 2005. Hepatology, 2006, v.43(2 S.1), P. S173–S181. DOI:10.1002/hep.20956; Raimondo G., Allain J. P., Brunetto M. R., Buendia M. A., Chen D. S., Colombo M., Craxi A., Donato F., Ferrari C., Gaeta G. B., Gerlich W. H., Levrero M., Locarnini S., Michalak T., Mondelli M. U., Pawlotsky J. M., Pollicino T., Prati D., Puoti M., Samuel D., Shouval D., Smedile A., Squadrito G., Trepo C., Villa E., Will H., Zanetti A. R., Zoulim F. Statements from the Taormina expert meeting on occult hepatitis B virus infection. J. Hepatol, 2008, 49, P. 652–657. DOI:10.1016/j.jhep.2008.07.014; Guo J.T., Guo H. Metabolism and function of hepatitis B virus cccDNA: Implications for the development of cccDNA-targeting antiviral therapeutics. Antiviral research, 2015, vol. 122, P. 91–100. DOI:10.1016/j.antiviral.2015.08.005; Dandri M., Locarnini S. New insight in the pathobiology of hepatitis B virus infection. Gut, 2012, V. 61, № 1, P.i6–i17. DOI:10.1136/gutjnl-2012-302056; Семенов А. В., Останкова Ю. В., Файзуллаев Х. Н., Казакова Е. И., Козлов А. В., Мусабаев Э. И., Тотолян Арег А. Кольцевая ковалентно замкнутая ДНК ВГВ как маркер распространенности оккультного гепатита В у пациентов c ВГВ, ВГД и ВГС инфекцией в Узбекистане // ЖМЭИ. 2016. № 5. с. 43-49.; Samal J., Kandpal M., Vivekanandan P. Molecular mechanisms underlying occult hepatitis B virus infection. Clin. Microbiol. Rev., 2012, 25, P. 142–163. DOI:10.1128/CMR.00018-11; Joint United Nations Programme on HIV/AIDS., United Nations. Global Report: UNAIDS Report on the Global AIDS epidemic: 2012. Geneva: UNAIDS; 2012. 103. A5 p. p. http://www.unaids.org/en/resources/documents/2012/20121120_UNAIDS_Global_Report_2012; WHO Prevention and control of viral hepatitis infection: frame work for global action 2012. Geneva: WHO, 2012. http://www.who.int/hiv/pub/hepatitis/Framework/en/; Дадашева А,Э., Мамедов М.К., Михайлов М.И. О двух типах гpупп с высоким pиском инфициpования виpусами гепатитов В и С: эпидемиологическое и клиническое значение // В миpе виpусных гепатитов. 2011. № 1. С. 12–14.; Nelson P., Mathers B., Cowie B., Hagan H., Jarlais D., Horyniak D., Degenhardt L. The epidemiology of viral hepatitis among people who inject drugs: Results of global systematic reviews. The Lancet, 2011, V. 378, №9791, P. 571–583. DOI:10.1016/S0140-6736(11)61097-0; Rossi С., Shrier I., Marshall L., Cnossen S., Schwartzman K., Klein M.B., Schwarzer G., Greenaway C. Seroprevalence of chronic hepatitis B virus infection and prior immunity in immigrants and refugees: A systematic review and meta-analysis. PLoS ONE, 2012, V. 7, №9, P. e44611. DOI:10.1371/journal.pone.0044611; Argani H., Akhtarishojaie E. Levamizole enhances immune responsiveness to intra-dermal and intra-muscular hepatitis B vaccination in chronic hemodialysis patients. J. Immune Based Ther. Vaccines, 2006, 4, P.3. DOI:10.1186/1476-8518-4-3; Alter M.J. Epidemiology of viral hepatitis and HIV co-infection. J. Hepatol., 2006, 44(1 Suppl), P.S6-S9. DOI:10.1016/j.jhep.2005.11.004; Burnett R.J., François G., Kew M.C., Leroux-Roels G., Meheus A., Hoosen A.A., Mphahlele M.J. Hepatitis B virus and human immunodeficiency virus co-infection in sub-Saharan Africa: a call for further investigation. Liver Int., 2005, 25(2), P.201–213. DOI:10.1111/j.1478-3231.2005.01054.x; Kapembwa K.C., Goldman J.D., Lakhi S., Banda Y., Bowa K., Vermund S.H., Mulenga J., Chama D., Chi B.H. HIV, Hepatitis B, and Hepatitis C in Zambia. J. Glob. Infect. Dis., 2011, v.3(3), P.269–274. DOI:10.4103/0974-777X.83534; Vallet-Pichard A., Pol S. Natural history and predictors of severity of chronic hepatitis C virus (HCV) and human immunodeficiency virus (HIV) co-infection. J. Hepatol., 2006, 44(1), P.S28–S34. DOI:10.1016/j.jhep.2005.11.008; Osborn M.K., Guest J.L., Rimland D. Hepatitis B virus and HIV coinfection: relationship of different serological patterns to survival and liver disease. HIV Med., 2007, 8(5), P.271-279. DOI:10.1111/j.1468-1293.2007.00469.x; Демиденко Т.П., Неверов В.А. Вирусные гепатиты / Под ред. Ю.В. Лобзина. СПб, 2011. 229с.; Thio C.L., Seaberg E.C, Skolasky R., Phair J., Visscher B., Muñoz A., Thomas D.L. HIV-1, hepatitis B virus, and risk of liver-related mortality in the multicenter cohort study (MACS). Lancet, 2002, v.360, p. 1921–1926. DOI:https://doi.org/10.1016/S0140-6736(02)11913-1; Agyeman A.A., Ofori-Asenso R. Prevalence of HIV and hepatitis B coinfection in Ghana: a systematic review and meta-analysis. AIDS. Res. Ther., 2016, vol.13:23. DOI:10.1186/s12981-016-0107-x; Ramezani A., Banifazl M., Mohraz M., Rasoolinejad M., Aghakhani A. Occult hepatitis B virus infection: A major concern in HIV-infected patients: Occult HBV in HIV. Hepat. Mon., 2011, v.11(1), P.7-10.; WHO. Guidelines for the prevention, care and treatment of persons with chronic hepatitis B infection Geneve, Switzerland: WHO, 2015. http://www.who.int/hiv/pub/hepatitis/hepatitis-b-guidelines/en/; Mphahlele M.J., Lukhwareni A., Burnett R.J., Moropeng L.M., Ngobeni J.M. High risk of occult hepatitis B virus infection in HIV-positive patients from South Africa. J. Clin. Virol., 2006, v.35(1), P.14–20. DOI:10.1016/j.jcv.2005.04.003; Filippini P., Coppola N., Pisapia R., Scolastico C., Marrocco C., Zaccariello A., Nacca C., Sagnelli C., De Stefano G., Ferraro T., De Stefano C., Sagnelli E. Impact of occult hepatitis B virus infection in HIV patients naive for antiretroviral therapy. AIDS, 2006, v.20(9), P.1253–1260. DOI:10.1097/01.aids.0000232232.41877.2a; Brichler S., Lagathu G., Chekaraou M.A., . Le Gal F, Edouard A., Dény P., Césaire R., Gordien E. African, Amerindian and European hepatitis B virus strains circulate on the Caribbean Island of Martinique. J. Gen. Virol., 2013, vol. 94 (Pt 10), P. 2318-2329. DOI:10.1099/vir.0.055459-0; Kumar S., Stecher G., Tamura K. MEGA7: Molecular Evolutionary Genetics Analysis version 7.0 for bigger datasets. Molecular Biology and Evolution. 2016, vol. 33, №7. P. 1870-1874. DOI:10.1093/molbev/msw054; Coffin C.S., Mulrooney-Cousins P.M., Osiowy C., van der Meer F., Nishikawa S., Michalak T.I., van Marle G., Gill M.J. Virological characteristics of occult hepatitis B virus in a North American cohort of human immunodeficiency virus type 1-positive patients on dual active anti-HBV/HIV therapy. J. Clin. Virol., 2014, vol.60(4), P.347-353. DOI:10.1016/j.jcv.2014.04.021; Gupta S., Singh S. Occult Hepatitis B Virus infection in ART-Naïve HIV-Infected patients seen at a tertiary care center in North India. BMC Infection Diseases, 2010, 10, p.53. DOI:10.1186/1471-2334-10-53; Honarmand A., Pourahmad M., Solhjoo K., Kohan M., Davami M.H., Mostafavi Zadeh S.K. Occult hepatitis B demonstrated by anti-HBc and HBV DNA in HIV-positive patients. Rep. Biochem. Mol. Biol., 2014, v.3(1), P.38-42.; Alvarez-Munoz M.T., Maldonado-Rodriguez A., Rojas-Montes O., Torres-Ibarra R., Gutierrez-Escolano F., Vazquez-Rosales G., Gomez A., Munoz O., Torres J., Lira R. Occult hepatitis B virus infection among Mexican human immunodeficiency virus-1-infected patients. World J. Gastroenterol., 2014, vol.20(37), P.13530-13537. DOI:10.3748/wjg.v20.i37.13530; Bautista-Amorocho H., Castellanos-Domínguez Y.Z., Rodríguez-Villamizar L.A., Velandia-Cruz S.A., Becerra-Peña J.A., Farfán-García A.E. Epidemiology, risk factors and genotypes of HBV in HIV-infected patients in the northeast region of Colombia: high prevalence of occult hepatitis B and F3 subgenotype dominance. PLoS One, 2014, vol.9(12):e114272. DOI:10.1371/journal.pone.0114272; Cohen Stuart J.W., Velema M., Schuurman R., Boucher C.A., Hoepelman A.I. Occult hepatitis B in persons infected with HIV is associated with low CD4 counts and resolves during antiretroviral therapy. J. Med. Virol., 2009, vol.81(3), P.441–445. DOI:10.1002/jmv.21422; Marite B., Montalvo M.C., Rodriguez Lde L., Sariego S., Verdasquera D., Vincent M., Gutiérrez A., Sánchez M. Occult hepatitis B in Cuban HIV patients. MEDICC Rev., 2011, v.13(2), P.32–37.; Fabris P., Biasin M.R., Giordani M.T., Berardo L., Menini V., Carlotto A., Miotti M.G., Manfrin V., Baldo V., Nebbia G., Infantolino D. Impact of occult HBV infection in HIV/HCV co-infected patients: HBV-DNA detection in liver specimens and in serum samples. Curr. HIV Res., 2008, v.6(2), P.173–179. DOI : 10.2174/157016208783885029; Esmail M.A., Mahdi W.K., Khairy R.M., Abdalla N.H. Genotyping of occult hepatitis B virus infection in Egyptian hemodialysis patients without hepatitis C virus infection. J. Infect. Public Health, 2016, v.9(4), P.452-457. DOI:10.1016/j.jiph.2015.11.018; Kim K.H., Chang H.Y., Park J.Y. Spontaneous HBsAg loss in Korean patients: relevance of viral genotypes, S gene mutations, and covalently closed circular DNA copy numbers. Clin. Mol. Hepatol., 2014, vol. 20 (3), P. 251-260. DOI:10.3350/cmh.2014.20.3.251; Останкова Ю.В., Семенов А.В., Буркитбаев Ж.К., Савчук Т.Н., Тотолян Арег А. Генетические варианты вируса гепатита B у первичных доноров в г. Астана, Казахстан // Инфекция и иммунитет. 2016. Т. 6. № 4. с. 359–366.; Wiersma S. T., McMahon B., Pawlotsky J.-M., Thio C. L., Thursz Ma., Gee Lim S., Ocama P., Esmat G., Maimuna M., Bell D., Vitoria M., Eramova I., Lavanchy D., Dusheiko G. WHO. Treatment of chronic hepatitis B virus infection in resource-constrained settings: expert panel consensus. Liver International, 2011, vol.31, Issue 6, p. 755-761. DOI:10.1111/j.1478-3231.2010.02373.x; Sagnelli E., Pisaturo M., Martini S., Filippini P., Sagnelli C., Coppola N. Clinical impact of occult hepatitis B virus infection in immunosuppressed patients. World J. Hepatol., 2014, v.6(6), P.384–393. DOI:10.4254/wjh.v6.i6.384

Availability: https://hiv.bmoc-spb.ru/jour/article/view/363

Epidemiology of Omsk Haemorragic Fever

Authors: N. V. Rudakov, V. K. Yastrebov, V. V. Yakimenko

Source: Эпидемиология и вакцинопрофилактика, Vol 14, Iss 1, Pp 39-48 (2015)

Subject Terms: экология, 0301 basic medicine, оmsk haemorrhagic fever, 0303 health sciences, вирус, молекулярная эпидемиология, virus, molecular epidemiology, 3. Good health, 03 medical and health sciences, BD143-237, Epistemology. Theory of knowledge, ecology, омская геморрагическая лихорадка

Access URL: https://www.epidemvac.ru/jour/article/download/12/13
https://doaj.org/article/7040ec863ab2434dba3abdb431ac92d8
https://cyberleninka.ru/article/n/epidemiologiya-omskoy-gemorragicheskoy-lihoradki
https://www.epidemvac.ru/jour/article/download/12/13
https://cyberleninka.ru/article/n/epidemiologiya-omskoy-gemorragicheskoy-lihoradki/pdf
https://www.epidemvac.ru/jour/article/view/12

THE CASE OF TRAUMATIC TRANSMISSION CHILD OF HUMAN IMMUNODEFICIENCY VIRUS ; СЛУЧАЙ ТРАВМАТИЧЕСКОГО ИНФИЦИРОВАНИЯ РЕБЕНКА ВИРУСОМ ИММУНОДЕФИЦИТА ЧЕЛОВЕКА

Authors: Yu. V. Ostankova, A. V. Semenov, M. A. Churina, A. P. Rosolovsky, E. V. Grebyonkina, T. N. Tkachenko, T. А. Zhandarmova, A. А. Totolian, Ю. В. Останкова, А. В. Семенов, М. А. Чурина, А. П. Росоловский, Е. В. Гребенкина, Т. Н. Ткаченко, Т. А. Жандармова, А. А. Тотолян

Source: Journal Infectology; Том 8, № 4 (2016); 98-103 ; Журнал инфектологии; Том 8, № 4 (2016); 98-103 ; 2072-6732 ; 10.22625/2072-6732-2016-8-4

Subject Terms: молекулярно-эпидемиологическое расследование, molecular epidemiology, gene pol, protease, reverse transcriptase, subtype, молекулярная эпидемиология, ген pol, протеаза, обратная транскриптаза, субтип

File Description: application/pdf

Relation: https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/534/502; Dukhovlinova, E. Two Independent HIV Epidemics in St. Petersburg, Russia Revealed by Molecular Epidemiology / E. Dukhovlinova, A. Masharsky, O. Toussova // AIDS Research and Human Retroviruses. – 2015. – Vol.31(6). – P. 608–614. doi:10.1089/aid.2014.0150.; ВИЧ-инфекция в Российской Федерации на 31 декабря 2015 г. / Федеральный центр СПИД. – URL: httphttp:// www.hivrussia.ru/news/index.shtml дата обращения 24.02.2016).; Смольская, Т.Т. ВИЧ-инфекция в Северо-Западном федеральном округе РФ в 2009 г. / Т.Т. Смольская, С.В. Огурцова // Инфекция и иммунитет. – 2011. – Т. 1, № 4. – С. 311–318.; Rates of mother-to-child transmission of HIV-1 in Africa, America, and Europe: results from 13 perinatal studies. The Working Group on Mother-To-Child Transmission of HIV. J Acquir Immune Defic Syndr Hum Retrovirol. 1995;8:506–510.; Zeng, H., Prevention of mother-to-child HIV transmission cascade in China: a systematic review and meta-analysis / H. Zeng, E.P. Chow, Y. Zhao, Y. Wang // Sex Transm Infect. – 2016. – vol. 92(2). – P. 116-123. doi:10.1136/sextrans-2014-051877.; World Health Organization . Male involvement in the prevention of mother-to-child transmission of HIV. Geneva: World Health Organization; 2012.; A progress report on the Global plan towards the elimination of new HIV infections among children by 2015 and keeping their mothers alive // Joint United Nations Programme on HIV/AIDS 2013.; Об утверждении инструкции по профилактике передачи ВИЧ инфекции от матери ребенку и образца информированного согласия на проведение химиопрофилактики ВИЧ: Приказ МЗ РФ от 19.12.2003 г. №606. – 126 с.; Tamura, K. MEGA5: molecular evolutionary genetics analysis using maximum likelihood, evolutionary distance, and maximum parsimony methods / K. Tamura, D. Peterson, N. Peterson // Mol Biol Evol. – 2011. – vol. 28(10) – P.2731-2739. doi:10.1093/molbev/msr121.; Machuca R., Jørgensen L.B., Theilade P., Nielsen C. Molecular investigation of transmission of human immunodeficiency virus type 1 in a criminal case // Clin Diagn Lab Immunol. – 2001. – vol.8(5). – p.884-890.; https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/534

Availability: https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/534
https://doi.org/10.22625/2072-6732-2016-8-4-98-103

Cases inefficient antiretroviral therapy for HIV-1 in children ; СЛУЧАИ НЕЭФФЕКТИВНОЙ АНТИРЕТРОВИРУСНОЙ ТЕРАПИИ ВИЧ-1 У ДЕТЕЙ

Authors: Yu. V. Ostankova, A. V. Semenov, M. A. Churina, A. A. Totolian, Ю. В. Останкова, А. В. Семенов, М. А. Чурина, А. А. Тотолян

Source: Journal Infectology; Том 9, № 2 (2017); 72-79 ; Журнал инфектологии; Том 9, № 2 (2017); 72-79 ; 2072-6732 ; 10.22625/2072-6732-2017-9-2

Subject Terms: естественные полиморфные варианты, molecular epidemiology, gene pol, protease, reverse transcriptase, antiretroviral therapy, resistance, natural polymorphisms, молекулярная эпидемиология, ген pol, протеаза, обратная транскриптаза, антиретровирусная терапия, резистентность

File Description: application/pdf

Relation: https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/603/541; Joint United Nations Programme on HIV/AIDS., United Nations. Global Report: UNAIDS Report on the Global AIDS epidemic: 2012. Geneva: UNAIDS; с 2012. 212 p.; Федеральный научно-методический центр по профилактике и борьбе со СПИДом ФБУН ЦНИИ Эпидемиологии Роспотребнадзора, Справка «ВИЧ-инфекция в Российской Федерации на 31 декабря 2015 г. По данным, предоставленным территориальными центрами по профилактике и борьбе со СПИД». 2015 г.; Хоффман, К. Лечение ВИЧ-инфекции 2009 / К. Хоффман, Ю.К. Рокштро. – М.: Р.Валент, 2010. – 648 с.; Joint United Nations Programme on HIV/AIDS., United Nations. Global Report: UNAIDS Report on the Global AIDS epidemic: 2013. Geneva: UNAIDS; с 2013. 198 p.; Goosby E. The President’s Emergency Plan for AIDS Relief: marshalling all tools at our disposal toward an AIDS-free generation. Health Aff (Millwood). 2012 Jul; 31(7):1593-8.; Zeng H, Chow EP, Zhao Y, Wang Y, Tang M, Li L, Tang X, Liu X, Zhong Y, Wang A, Lo YR, Zhang L. Prevention of motherto-child HIV transmission cascade in China: a systematic review and meta-analysis. Sex Transm Infect. 2016 Mar; 92(2):116-23.; UNICEF. Progress for Children: Beyond Averages – Learning from the MDGs (No. 11). 2015 June; 68 p.; UNDP (United Nations Development Programme) World leaders adopt Sustainable Development Goals. Retrieved 2015 Sep.; Об утверждении инструкции по профилактике передачи ВИЧ инфекции от матери ребенку и образца информированного согласия на проведение химиопрофилактики ВИЧ: Приказ МЗ РФ от 19.12.2003 г. №606. – 126 с.; Prendergast AJ, Klenerman P, Goulder PJ. The impact of differential antiviral immunity in children and adults. Nat Rev Immunol. 2012 Sep; 12(9):636-48.; Newell ML, Coovadia H, Cortina-Borja M, Rollins N, Gaillard P, Dabis F; Ghent International AIDS Society (IAS) Working Group on HIV Infection in Women and Children. Mortality of infected and uninfected infants born to HIV-infected mothers in Africa: a pooled analysis. Lancet. 2004 Oct; 364(9441):1236-43.; Tobin NH, Aldrovandi GM. Immunology of pediatric HIV infection. Immunol Rev. 2013 Jul; 254(1):143-69.; Lowenthal ED, Bakeera-Kitaka S, Marukutira T, Chapman J, Goldrath K, Ferrand RA. Perinatally acquired HIV infection in adolescents from sub-Saharan Africa: a review of emerging challenges. Lancet Infect Dis. 2014 Jul;14(7):627-39.; Lederman MM, Calabrese L, Funderburg NT, Clagett B, Medvik K, Bonilla H, Gripshover B, Salata RA, Taege A, Lisgaris M, McComsey GA, Kirchner E, Baum J, Shive C, Asaad R, Kalayjian RC, Sieg SF, Rodriguez B. Immunologic failure despite suppressive antiretroviral therapy is related to activation and turnover of memory CD4 cells. J. Infect. Dis. 2011 Oct; 204(8):1217-26.; Rosenblatt HM, Stanley KE, Song LY, Johnson GM, Wiznia AA, Nachman SA, Krogstad PA; Pediatric AIDS Clinical Trials Group 377 Study Team. Immunological response to highly active antiretroviral therapy in children with clinically stable HIV-1 infection. J. Infect. Dis. 2005 Aug; 192(3):445-55.; World Health Organization, Department of Reproductive Health and Research. Male involvement in the prevention of mother-to-child transmission of HIV. Geneva: World Health Organization; c 2012. 30 p.; Cecchini DM, Zapiola I, Fernandez Giuliano S, Martinez MG, Rodriguez CG, Bouzas MB. Etravirine resistance mutations in HIV-infected pregnant women. HIV Med. 2013 Feb;14(2):125-6.; Thompson JD, Higgins DG, Gibson TJ. CLUSTAL W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice. Nucleic Acids Res. 1994 Nov; 22(22):4673-80.; Update: vaccine side effects, adverse reactions, contraindications, and precautions. Recommendations of the Advisory Committee on Immunization Practices (ACIP). MMWR Recomm Rep. 1996 Sep; 45(RR-12):1-35.; Paraskevis D, Magiorkinis E, Magiorkinis G, Sypsa V, Paparizos V, Lazanas M, Gargalianos P, Antoniadou A, Panos G, Chrysos G, Sambatakou H, Karafoulidou A, Skoutelis A, Kordossis T, Koratzanis G, Theodoridou M, Daikos GL, Nikolopoulos G, Pybus OG, Hatzakis A; Multicentre Study on HIV Heterogeneity. Increasing prevalence of HIV-1 subtype A in Greece: estimating epidemic history and origin. J Infect Dis. 2007 Oct; 196(8):1167-76.; Manosuthi W, Thongyen S, Nilkamhang S, Manosuthi S, Sungkanuparph S. HIV-1 drug resistance-associated mutations among antiretroviral-naive Thai patients with chronic HIV-1 infection. J Med Virol. 2013; 85(2):194-9.; Sungkanuparph S, Sukasem C, Manosuthi W, Wiboonchutikul S, Piyavong B, Chantratita W. Tipranavir resistance associated mutations in protease inhibitor-na ve patients with HIV-1 subtype A/E infection. J Clin Virol. 2008 Nov; 43(3):284-6.; Davanos N, Panos G, Gogos CA, Mouzaki A. HIV-1 subtype characteristics of infected persons living in southwestern Greece. HIV AIDS (Auckl). 2015 Dec; 7:277-83.; Sutherland KA, Mbisa JL, Cane PA, Pillay D, Parry CM. Contribution of Gag and protease to variation in susceptibility to protease inhibitors between different strains of subtype B human immunodeficiency virus type 1. J Gen Virol. 2014 Jan; 95(Pt 1):190-200.; Alteri C, Artese A, Beheydt G, Santoro MM, Costa G, Parrotta L, Bertoli A, Gori C, Orchi N, Girardi E, Antinori A, Alcaro S, d’Arminio Monforte A, Theys K, Vandamme AM, Ceccherini-Silberstein F, Svicher V, Perno CF. Structural modifications induced by specific HIV-1 protease-compensatory mutations have an impact on the virological response to a firstline lopinavir/ritonavir-containing regimen. J Antimicrob Chemother. 2013 Oct; 68(10):2205-9.; Johnson VA, Brun-V zinet F, Clotet B, G nthard HF, Kuritzkes DR, Pillay D, Schapiro JM, Richman DD. Update of the drug resistance mutations in HIV-1: December 2010. Top HIV Med. 2010 Dec; 18(5):156-63.; Казеннова, Е.В. Проблемы субтипирования ВИЧ-1 на основе анализа гена pol и способы их разрешения / Е.В. Казеннова, И.А. Лаповок, А.В. Васильев // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. – 2010. – Т. 2. № 3. – С. 42–48.; Turriziani O, Russo G, Lichtner M, Stano A, Tsague G, Maida P, Vullo V, Antonelli G. Study of the genotypic resistant pattern in HIV-infected women and children from rural west Cameroon. AIDS Res Hum Retroviruses 2008 Jun; 24(6):781-5.; Казеннова, Е.В. Естественные полиморфизмы гена pol варианта ВИЧ-1 IDU-A / Е.В. Казеннова, И.А. Лаповок, В.Ю. Лага // ВИЧ-инфекция и иммуносупрессии. – 2012. – Т. 4. № 4. – С. 44–51.; Суханова, A.Л. Полиморфизм области генома, кодирующей протеазу и обратную транскриптазу, вариантов ВИЧ-1 подтипа А, распространенных на территории СНГ / A.Л. Суханова, Н.И. Рудинский, Е.В. Богословская // Молекул. биол. – 2005. – Т. 39, № 6. – С. 1063–1071.; https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/603

Availability: https://journal.niidi.ru/jofin/article/view/603
https://doi.org/10.22625/2072-6732-2017-9-2-72-79

RESULTS OF GENOTYPING HEPATITIS VIRUS B IN HBsAg-NEGATIVE BLOOD DONORS IN ASTANA, KAZAKHSTAN ; РЕЗУЛЬТАТЫ ГЕНОТИПИРОВАНИЯ ВИРУСА ГЕПАТИТА В У HBsAg-НЕГАТИВНЫХ ДОНОРОВ КРОВИ В г. АСТАНА, КАЗАХСТАН

Authors: Ostankova Y.V., Semenov A.V., Burkitbayev Z.K., Savchuk T.N., Totolian A.A.

Source: Russian Journal of Infection and Immunity; Vol 7, No 4 (2017); 383-392 ; Инфекция и иммунитет; Vol 7, No 4 (2017); 383-392 ; 2313-7398 ; 2220-7619 ; 10.15789/2220-7619-2017-4

Subject Terms: hepatitis B, occult HBV, molecular epidemiology, DNA HBV, гепатит В, оккультный ВГВ, молекулярная эпидемиология, секвенирование

File Description: application/pdf

Relation: https://iimmun.ru/iimm/article/view/596/352; https://iimmun.ru/iimm/article/view/596

Availability: https://iimmun.ru/iimm/article/view/596
https://doi.org/10.15789/2220-7619-2017-4-383-392

MOLECULAR EPIDEMIOLOGY OF TUBERCULOSIS IN THE KALININGRAD REGION OF RUSSIA: 10 YEARS AFTER ; МОЛЕКУЛЯРНАЯ ЭПИДЕМИОЛОГИЯ ТУБЕРКУЛЕЗА В КАЛИНИНГРАДСКОЙ ОБЛАСТИ РОССИИ: 10 ЛЕТ СПУСТЯ

Authors: Vyazovaya A.A., Akhmedova G.M., Solovieva N.S., Gerasimova A.A., Starkova D.A., Turkin E.N., Zhuravlev V.Y., Narvskaya O.V., Mokrousov I.V.

Source: Russian Journal of Infection and Immunity; Vol 7, No 4 (2017); 367-374 ; Инфекция и иммунитет; Vol 7, No 4 (2017); 367-374 ; 2313-7398 ; 2220-7619 ; 10.15789/2220-7619-2017-4

Subject Terms: pulmonary tuberculosis, molecular epidemiology, Kaliningrad region, Mycobacterium tuberculosis, drug resistance, spoligotyping, Beijing genotype, туберкулез легких, молекулярная эпидемиология, Калининградская область, лекарственная устойчивость, сполиготипирование, генотип Beijing

File Description: application/pdf

Relation: https://iimmun.ru/iimm/article/view/594/350; https://iimmun.ru/iimm/article/view/594

Availability: https://iimmun.ru/iimm/article/view/594
https://doi.org/10.15789/2220-7619-2017-4-367-374