-
1Academic Journal
Authors: D. S. Parshin, M. A. Topchiev, V. A. Astakhin, O. B. Chechukhina, E. O. Smirnyagina, E. N. Ravskiy, Д. С. Паршин, М. А. Топчиев, В. А. Астахин, О. Б. Чечухина, Е. О. Смирнягина, Е. Н. Равский
Source: Russian Sklifosovsky Journal "Emergency Medical Care"; Том 13, № 3 (2024); 410-418 ; Журнал им. Н.В. Склифосовского «Неотложная медицинская помощь»; Том 13, № 3 (2024); 410-418 ; 2541-8017 ; 2223-9022
Subject Terms: множественная антибиотикорезистентность, surgical site infections, risk factors for surgical infection, abdominal surgery, multidrug resistance of microorganisms, multiple antibiotic resistance, инфекции области хирургического вмешательства, факторы риска хирургической инфекции, абдоминальная хирургия, множественная лекарственная устойчивость микроорганизмов
File Description: application/pdf
Relation: https://www.jnmp.ru/jour/article/view/1927/1483; https://www.jnmp.ru/jour/article/view/1927/1618; de Souza FHB, Couto BRGM, da Conceição FLA, da Silva GHS, Dias IG, Rigueira RVM, et al. Prediction of Occurrence for Surgical Site Infection in Infected Surgeries. Open Forum Infect Dis. 2020;7(Suppl 1):S482. Abstr. 895. https://doi.org/10.1093/ofid/ofaa439.1083; Ревишвили А.Ш., Сажин В.П., Оловянный В.Е., Захарова М.А. Современные тенденции в неотложной абдоминальной хирургии в Российской Федерации. Хирургия. Журнал им. Н.И. Пирогова. 2020;(7):6–11. https://doi.org/10.17116/hirurgia20200716; Danwang C, Bigna JJ, Tochie JN, Mbonda A, Mbanga CM, Nzalie RNT, et al. Global incidence of surgical site infection after appendectomy: a systematic review and meta-analysis. BMJ Open. 2020;10(2):e034266. PMID: 32075838 https://doi.org/10.1136/bmjopen-2019-034266; Чукина М.А., Вистовская Н.В., Лукина М.В., Журавлева М.В. Реализация программы Стратегии и контроля антимикробной терапии в Российском научном центре хирургии им. академика Б.В. Петровского. Антибиотики и химиотерапия. 2020;65(9–10):44–50. https://doi.org/10.37489/0235-2990-2020-65-9-10-44-50; Friedrichs J, Seide S, Vey J, Zimmermann S, Hardt J, Kleeff J, et al. Interventions to reduce the incidence of surgical site infection in colorectal resections: systematic review with multicomponent network meta-analysis (INTRISSI): study protocol. BMJ Open. 2021;11(11):e057226. PMID: 34824125 https://doi.org/10.1136/bmjopen-2021-057226; WHO/ECDC report: antimicrobial resistance threatens patient safety in European Region. Available at: https://www.ecdc.europa.eu/en/news-events/whoecdc-report-antimicrobial-resistance-threatens-patient-safety-european-region [Accessed 20.08.2024]; Medline A, Muralidharan VJ, Codner J, Sharma J. Organ-Space Surgical Site Infections: Consequences and Prediction Using ACS-NSQIP. Am Surg. 2022;88(8):1773–1782. PMID: 35438577 https://doi.org/10.1177/00031348221083944; Lawson EH, Hall BL, Ko CY. Risk factors for superficial vs deep/organspace surgical site infections: Implications for quality improvement initiatives. JAMA Surg. 2013;148(9):849–858. PMID: 23864108 https://doi.org/10.1001/jamasurg.2013.2925; van Walraven C, Musselman R. The Surgical Site Infection Risk Score (SSIRS): A Model to Predict the Risk of Surgical Site Infections. PLoS ONE. 2013;8(6):e67167. PMID: 23826224 https://doi.org/10.1371/journal.pone.0067167; Chong YY, Chan PK, Chan VWK, Cheung A, Luk MH, Cheung MH, et al. Application of machine learning in the prevention of periprosthetic joint infection following total knee arthroplasty: a systematic review. Arthroplasty. 2023;5(1):38. PMID: 37316877 https://doi.org/10.1186/s42836-023-00195-2; Ahmed S, Ahmed MZ, Rafique S, Almasoudi SE, Shah M, Jalil NAC, et al. Recent Approaches for Downplaying Antibiotic Resistance: Molecular Mechanisms. Biomed Res Int. 2023:5250040. https://doi.org/10.1155/2023/5250040 eCollection 2023.; Наумкина Е.В., Матущенко Е.В., Абросимова О.А., Калитина И.И., Соколова Т.Н., Иванова С.Ф. и др. Микробиологический мониторинг как основа эпидемиологического надзора и антимикробной терапии в условиях многопрофильного стационара. Клиническая лабораторная диагностика. 2018;63(2):113–118. https://doi.org/10.18821/0869-2084-2018-63-2-113-118; Bhat MJ, Al-Qahtani M, Badawi AS. Awareness and Knowledge of Antibiotic Resistance and Risks of Self-Medication with Antibiotics Among the Aseer Region Population, Saudi Arabia. Cureus. 2023;15(6):e40762. PMID: 37485193 https://doi.org/10.7759/cureus.40762 eCollection 2023 Jun.; Ye J, Chen X. Current Promising Strategies against Antibiotic-Resistant Bacterial Infections. Antibiotics (Basel). 2022;12(1):67. PMID: 36671268 https://doi.org/10.3390/antibiotics12010067; Дибиров М.Д., Хачатрян Н.Н., Исаев А.И., Карсотьян Г.С., Алимова Э.Э., Костюк Е.А. Новые возможности антибактериальной терапии интраабдоминальных инфекций, вызванных полирезистентной микробной флорой. Хирургия. Журнал им. Н.И. Пирогова. 2019;(12):74–83. https://doi.org/10.17116/hirurgia201912174; Opatowski M, Brun-Buisson C, Touat M. Antibiotic prescriptions and risk factors for antimicrobial resistance in patients hospitalized with urinary tract infection: a matched case-control study using the French health insurance database (SNDS). BMC Infect Dis. 2021;21(1):571. PMID: 34126937 https://doi.org/10.1186/s12879-021-06287-1; Yang X, Guo R, Zhang B, Xie B, Zhou S, Zhang B. Retrospective analysis of drug resistance characteristics and infection related risk factors of multidrug-resistant organisms (MDROs) isolated from the orthopedics department of a tertiary hospital. Sci Rep. 2023;13(1):2199. PMID: 36750600 https://doi.org/10.1038/s41598-023-28270-3; Foschi D, Yakushkina A, Cammarata F, Lamperti G, Colombo F, Rimoldi S, et al. Surgical site infections caused by multi-drug resistant organisms: a case-control study in general surgery. Updates Surg. 2022;74(5):1763–1771. PMID: 35304900 https://doi.org/10.1007/s13304-022-01243-3; Дибиров М.Д., Исаев А.И., Джаджиев А.Б., Ашимова А.И., Атаев Т. Роль коррекции синдромов кишечной недостаточности и внутрибрюшной гипертензии в профилактике инфицирования панкреонекроза. Хирургия. Журнал им. Н.И. Пирогова. 2016;(8):67–72. https://doi.org/10.17116/hirurgia2016867-72; Hyoju SK, Keskey R, Castillo G, Machutta K, Zaborin A, Zaborina O, et al. Novel Nonantibiotic Gut-directed Strategy to Prevent Surgical Site Infections. Ann Surg. 2022;276(3):472–481. PMID: 35749750 https://doi.org/10.1097/SLA.0000000000005547; Чукарев В.С., Жидовинов А.А., Коханов А.В., Луцева О.А. Кишечный изофермент щелочной фосфатазы в диагностике абдоминальной хирургической патологии. Астраханский медицинский журнал. 2022;17(4):126–136. https://doi.org/10.48612/agmu/2022.17.4.126.136; Topchiev MA, Parshin DS, Misrikhanov M, Pyatakov S, Brusnev l, Chotchaev M. Intestinal alkaline phosphatase – a biomarker of the degree of acute enteral in sufficiency in urgent surgery. Archiv EuroMedica. 2022;12(2):91–93. https://doi.org/10.35630/2199-885X/2022/12/2.23; Parshin DS, Topchiev MA, Kupriyanov AV, Aliev M, Abdulaev F. Is it possible to Predict postoperative abdominal complications by laser Doppler flowmetry? Archiv EuroMedica. 2021;11(6):81–84. https://doi.org/10.35630/2199-885X/2021/11/6.19; Захаренко А.А., Беляев М.А., Трушин А.А., Зайцев Д.А., Курсенко Р. В., Сидоров В.В., и др. Комбинированная оценка жизнеспособности кишки методами лазерной допплеровской флоуметрии и лазерной флуоресцентной спектроскопии. Регионарное кровообращение и микроциркуляция. 2021;20(2):70–76. https://doi.org/10.24884/1682-6655-2021-20-2-70-76; Паршин Д.С., Топчиев М.А. Перитонеальная лазерная допплеровская флоуметрия в прогнозировании и диагностике третичного перитонита. Журнал им. Н.В. Склифосовского Неотложная медицинская помощь. 2020;9(3):410–416. https://doi.org/10.23934/2223-9022-2020-9-3-410-416; Тимербулатов В.М., Тимербулатов Ш.В., Сагитов Р.Б., Асманов Д.И., Султанбаев А.У. Диагностика ишемических повреждений кишечника при некоторых острых хирургических заболеваниях органов брюшной полости. Креативная хирургия и онкология. 2017;(3):12–19. https://doi.org/10.24060/2076-3093-2017-7-3-12-19; Топчиев М.А., Паршин Д.С., Кчибеков Э.А., Бирюков П.А., Мисриханов М.К. Дифференцированный подход к антигипоксической и эндопортальной терапии в лечении разлитого перитонита, осложненного синдромом энтеральной недостаточности. Медицинский вестник Северного Кавказа. 2018;13(4):619–623. https://doi.org/10.14300/mnnc.2018.13120; Шаврина Н.В., Ярцев П.А., Лебедев А.Г., Левитский В.Д., Драйер М. Н., Цулеискири Б.Т., и др. Значение ультразвукового исследования в диагностике острой странгуляционной тонкокишечной непроходимости. Медицинская визуализация. 2021;25(3):31–42. https://doi.org/10.24835/1607-0763-875; Маскин С.С., Александров В.В., Матюхин В.В., Дербенцева Т.В. Стандартизация лечебно-диагностического подхода при сочетанной закрытой травме кишечника. Политравма. 2020;(3):12–19. https://doi.org/10.24411/1819-1495-2020-10028; Gillespie B, Harbeck E, Rattray M, Liang R, Walker R, Latimer Sh, et al. Worldwide incidence of surgical site infections in general surgical patients: A systematic review and meta-analysis of 488,594 patients. Int J Surg. 2021;95:106136. PMID: 34655800 https://doi.org/10.1016/j.ijsu.2021.106136; McFarland AM, Manoukian S, Mason H, Reilly JS. Impact of surgicalsite infection on health utility values: a meta-analysis. Br J Surg. 2023;110(8):942–949. PMID: 37303251 https://doi.org/10.1093/bjs/znad144; Mengistu DA, Alemu A, Abdukadir AA, Mohammed HA, Ahmed F, Mohammed B, et al. Global Incidence of Surgical Site Infection Among Patients: Systematic Review and Meta-Analysis. Inquiry. 2023;60:469580231162549. PMID: 36964747 https://doi.org/10.1177/00469580231162549; https://www.jnmp.ru/jour/article/view/1927
-
2Academic Journal
Authors: N. L. Belkova, E. S. Klimenko, U. M. Nemchenko, E. V. Grigorova, K. O. Sitnikova, R. E. Zugeeva, N. E. Smurova, N. N. Chemezova, E. D. Savilov, Н. Л. Белькова, Е. С. Клименко, У. М. Немченко, Е. В. Григорова, К. О. Ситникова, Р. Е. Зугеева, Н. Е. Смурова, Н. Н. Чемезова, Е. Д. Савилов
Contributors: Исследование выполнено в рамках госзадания № 121022500179-0.
Source: Acta Biomedica Scientifica; Том 9, № 1 (2024); 53-63 ; 2587-9596 ; 2541-9420
Subject Terms: вирулентность, genotyping, multilocus analysis, multiple antibiotic resistance, antimicrobial drugs, virulence, генотипирование, мультилокусный анализ, множественная антибиотикорезистентность, антимикробные препараты
File Description: application/pdf
Relation: https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/4598/2732; Wyres KL, Lam MMC, Holt KE. Population genomics of Klebsiella pneumoniae. Nat Rev Microbiol. 2020; 18(6): 344-359. doi:10.1038/s41579-019-0315-1; Bialek-Davenet S, Criscuolo A, Ailloud F, Passet V, Jones L, Delannoy-Vieillard AS, et al. Genomic definition of hypervirulent and multidrug-resistant Klebsiella pneumoniae clonal groups. Emerg Infect Dis. 2014; 20(11): 1812-1820. doi:10.3201/eid2011.140206; Hennart M, Guglielmini J, Bridel S, Maiden MCJ, Jolley KA, Criscuolo A, et al. A dual barcoding approach to bacterial strain nomenclature: Genomic taxonomy of Klebsiella pneumoniae strains. Mol Biol Evol. 2022; 39(7): msac135. doi:10.1093/molbev/msac135; Gonzalez JM, Puerta-Fernández E, Santana MM, Rekadwad B. On a non-discrete concept of prokaryotic species. Microorganisms. 2020; 8(11): 1723. doi:10.3390/microorganisms8111723; Maiden MC, Bygraves JA, Feil E, Morelli G, Russell JE, Urwin R, et al. Multilocus sequence typing: A portable approach to the identification of clones within populations of pathogenic microorganisms. Proc Natl Acad Sci U S A. 1998; 95(6): 3140-3145. doi:10.1073/pnas.95.6.3140; Achtman M, Wain J, Weill F-X, Nair S, Zhou Z, Sangal V, et al. Multilocus sequence typing as a replacement for serotyping in Salmonella enterica. PloS Pathog. 2012; 8(6): e1002776. doi:10.1371/journal.ppat.1002776; Jolley KA, Bray JE, Maiden MCJ. Open-access bacterial population genomics: BIGSdb software, the PubMLST.Org website and their applications. Wellcome Open Res. 2018; 3: 124. doi:10.12688/wellcomeopenres.14826.1; Diancourt L, Passet V, Verhoef J, Grimont PA, Brisse S. Multilocus sequence typing of Klebsiella pneumoniae nosocomial isolates. J Clin Microbiol. 2005; 43: 4178-4182. doi:10.1128/JCM.43.8.4178-4182.2005; Brisse S, Passet V, Haugaard AB, Babosan A, Kassis-Chikhani N, Struve C, et al. wzi gene sequencing, a rapid method for determination of capsular type for Klebsiella strains. J Clin Microbiol. 2013; 51(12): 4073-4078. doi:10.1128/JCM.01924-13; Lam MMC, Wyres KL, Judd LM, Wick RR, Jenney A, Brisse S, et al. Tracking key virulence loci encoding aerobactin and salmochelin siderophore synthesis in Klebsiella pneumoniae. Genome Med. 2018; 10(1): 77. doi:10.1186/s13073-018-0587-5; Lam MMC, Wick RR, Wyres KL, Gorrie CL, Judd LM, Jenney AWJ, et al. Genetic diversity, mobilisation and spread of the yersiniabactin-encoding mobile element ICEKp in Klebsiella pneumoniae populations. Microb Genom. 2018; 4(9): e000196. doi:10.1099/mgen.0.000196; Носкова О.А., Агапова Е.Д., Батурина Е.А., Гвак Г.В. Микробиологический мониторинг в системе эпидемиологического надзора за гнойно-септическими инфекциями в детском многопрофильном стационаре. Acta biomedica scientifica. 2019; 4(5): 122-126. doi:10.29413/ABS.2019-4.5.19; Немченко У.М., Кунгурцева Е.А., Григорова Е.В., Белькова Н.Л., Маркова Ю.А., Носкова О.А., и др. Моделирование бактериальных биопленок и оценка чувствительности возбудителей инфекций, связанных с оказанием медицинской помощи, к дезинфицирующему средству Секусепт актив. Клиническая лабораторная диагностика. 2020; 65(10): 652-658. doi:10.18821/0869-2084-2020-65-10-652-658; Савилов Е.Д., Анганова Е.В., Носкова О.А., Духанина А.В. Бактериальные биоплёнки при гнойно-септических инфекциях. Acta biomedica scientifica. 2019; 4(5): 38-42. doi:10.29413/ABS.2019-4.5.6; Савилов Е.Д., Маркова Ю.А., Немченко У.М., Носкова О.А., Чемезова Н.Н., Кунгурцева Е.А., и др. Способность к биопленкообразованию у возбудителей инфекций, выделенных от пациентов крупного многопрофильного детского стационара. Тихоокеанский медицинский журнал. 2020; 1: 32-35. doi:10.34215/1609-1175-2020-1-32-35; Воропаева Н.М., Белькова Н.Л., Немченко У.М., Григорова Е.В., Кунгурцева Е.А., Носкова О.А., и др. Идентификация возбудителей инфекционных заболеваний при совместном использовании бактериологической диагностики и MALDI Biotyper. Acta biomedica scientifica. 2020; 5(6): 88-94. doi:10.29413/ABS.2020-5.6.10; Определение чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам: клинические рекомендации; версия 2018-03. М., 2018. URL: https://www.antibiotic.ru/files/321/clrec-dsma2018.pdf [дата доступа: 28.08.2023].; Определение чувствительности микроорганизмов к антибактериальным препаратам: МУК 4.2.1890-04. URL: https://docs.cntd.ru/document/1200038583 [дата доступа: 28.08.2023].; The European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing – EUCAST. URL: https://www.eucast.org [date of access: 28.11.2023].; Асланов Б.И., Зуева Л.П., Кафтырева Л.А., Бойцов А.Г., Акимкин В.Г., Долгий А.А., и др. Рациональное применение бактериофагов в лечебной и противоэпидемической практике: Федеральные клинические рекомендации. М.; 2014.; Григорова Е.В., Рычкова Л.В., Белькова Н.Л., Немченко У.М., Савелькаева М.В., Кунгурцева Е.А., и др. Оценка литической активности препаратов бактериофагов на штаммы Klebsiella pneumoniaе, выделенных из микробиоты толстой кишки у детей с функциональными гастроинтестинальными расстройствами. Клиническая лабораторная диагностика. 2021; 66(4): 217-222. doi:10.51620/0869-2084-2021-66-4-217-222; Bankevich A, Nurk S, Antipov D, Gurevich AA, Dvorkin M, Kulikov AS, et al. SPAdes: A new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing. J Comput Biol. 2012; 19(5): 455-477. doi:10.1089/cmb.2012.0021; Rissman AI, Mau B, Biehl BS, Darling AE, Glasner JD, Perna NT. Reordering contigs of draft genomes using the Mauve aligner. Bioinformatics. 2009; 25: 2071-2073. doi:10.1093/bioinformatics/btp356; Seemann T. Prokka: Rapid prokaryotic genome annotation. Bioinformatics. 2014; 30(14): 2068-2069. doi:10.1093/bioinformatics/btu153; Robertson J, Nash JHE. MOB-suite: Software tools for clustering, reconstruction and typing of plasmids from draft assemblies. Microb Genom. 2018; 4(8): e000206. doi:10.1099/mgen.0.000206; IS FINDER. URL: https://www-is.biotoul.fr [date of access: 01.12.2023].; Institut Pasteur. Klebsiella pneumoniae species complex. URL: https://bigsdb.pasteur.fr/klebsiella [date of access: 28.08.2023].; Hynninen A, Touzé T, Pitkänen L, Mengin-Lecreulx D, Virta M. An efflux transporter PbrA and a phosphatase PbrB cooperate in a lead-resistance mechanism in bacteria. Mol Microbiol. 2009; 74(2): 384-394. doi:10.1111/j.1365-2958.2009.06868.x; Vornhagen J, Bassis CM, Ramakrishnan S, Hein R, Mason S, Bergman Y, et al. A plasmid locus associated with Klebsiella clinical infections encodes a microbiome-dependent gut fitness factor. PLoS Pathog. 2021; 17(4): e1009537. doi:10.1371/journal.ppat.1009537; Mason S, Vornhagen J, Smith SN, Mike LA, Mobley HLT, Bachman MA. The Klebsiella pneumoniae ter operon enhances stress tolerance. Infect Immun. 2023; 91(2): e0055922. doi:10.1128/iai.00559-22; Lam MMC, Wick RR, Watts SC, Cerdeira LT, Wyres KL, Holt KE. A genomic surveillance framework and genotyping tool for Klebsiella pneumoniae and its related species complex. Nat Commun. 2021; 12(1): 4188. doi:10.1038/s41467-021-24448-3; Vats P, Kaur UJ, Rishi P. Heavy metal-induced selection and proliferation of antibiotic resistance: A review. J Appl Microbiol. 2022; 132(6): 4058-4076. doi:10.1111/jam.15492; Ковальчук С.Н., Федорова Л.С., Ильина Е.Н. Молекулярные механизмы микробной устойчивости к дезинфицирующим средствам. Антибиотики и химиотерапия. 2023; 68(1-2): 45-56. doi:10.37489/0235-2990-2023-68-1-2-45-56; https://www.actabiomedica.ru/jour/article/view/4598
-
3Academic Journal
Authors: Карпова, Е. В., Тапальский, Д. В.
Subject Terms: Klebsiella pneumoniae, Acinetobacter baumannii, множественная антибиотикорезистентность, эффлюкс, карбапенемазы, инфекция COVID-19, multidrug resistance, efflux, carbapenemases, COVID-19 infection
Relation: Карпова, Е. В. Роль эффлюкса и продукции карбапенемаз в формировании множественной устойчивости к антибиотикам у штаммов Klebsiella pneumoniae и Acinetobacter baumannii, выделенных от пациентов с инфекцией COVID-19 / Е. В. Карпова, Д. В. Тапальский // Лабораторная диагностика. Восточная Европа. – 2022. – Т. 11, № 2. – С. 214–223.; http://elib.gsmu.by/handle/GomSMU/11824; https://doi.org/10.34883/PI.2022.11.2.018