LTTR-зависимый промотор sgp-оперона функционирует в отсутствии транскрипционного активатора и эффектора

Πηγή: Школа-конференция молодых ученых, аспирантов и студентов «Генетические технологии в микробиологии и микробное разнообразие».

Θεματικοί όροι: направленный мутагенез, гомологичная рекомбинация, Pseudomonas, РНК-полимераза, салицилат, регуляция экспрессии генов, промотор

Studying concatenation of the Cas9-cleaved transgenes using barcodes ; Изучение конкатенации баркодированных трансгенов, линеаризованных Cas9

Συγγραφείς: A. V. Smirnov, A. N. Korablev, I. A. Serova, A. M. Yunusova, A. A. Muravyova, E. S. Valeev, N. R. Battulin, A. В. Смирнов, A. Н. Кораблев, И. А. Серова, A. М. Юнусова, A. А. Муравьёва, E. С. Валеев, Н. Р. Баттулин

Συνεισφορές: This work was supported by the Russian Science Foundation grant No. 24-74-10013.

Πηγή: Vavilov Journal of Genetics and Breeding; Том 29, № 1 (2025); 26-34 ; Вавиловский журнал генетики и селекции; Том 29, № 1 (2025); 26-34 ; 2500-3259 ; 10.18699/vjgb-25-01

Θεματικοί όροι: эмбрионы мыши, pronuclear microinjection, DNA barcoding, transgenic animals, DSB repair, concatemer, homologous recombination (HR), non-homologous end-joining, NHEJ, mouse embryos, пронуклеарная микроинъекция, ДНК-баркодирование, трансгенные животные, репарация двуцепочечных разрывов ДНК, конкатемер, гомологичная рекомбинация, негомологичное соединение концов

Περιγραφή αρχείου: application/pdf

Relation: https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/4473/1911; Abe T., Inoue K., Furuta Y., Kiyonari H. Pronuclear microinjection during S-phase increases the efficiency of CRISPR-Cas9-assisted knockin of large DNA donors in mouse zygotes. Cell Rep. 2020; 31(7):107653. doi:10.1016/j.celrep.2020.107653; Clarke R., Heler R., MacDougall M.S., Yeo N.C., Chavez A., Regan M., Hanakahi L., Church G.M., Marraffini L.A., Merrill B.J. Enhanced bacterial immunity and mammalian genome editing via RNA-polymerase-mediated dislodging of Cas9 from double-strand DNA breaks. Mol Cell. 2018;71(1):42-55.e8. doi:10.1016/j.molcel.2018.06.005; Cock P.J.A., Antao T., Chang J.T., Chapman B.A., Cox C.J., Dalke A., Friedberg I., Hamelryck T., Kauff F., Wilczynski B., De Hoon M.J.L. Biopython: freely available Python tools for computational molecular biology and bioinformatics. Bioinformatics. 2009;25(11):1422-1423. doi:10.1093/bioinformatics/btp163; Cock P.J.A., Fields C.J., Goto N., Heuer M.L., Rice P.M. The Sanger FASTQ file format for sequences with quality scores, and the Solexa/Illumina FASTQ variants. Nucleic Acids Res. 2010;38(6): 1767-1771. doi:10.1093/nar/gkp1137; Dai J., Cui X., Zhu Z., Hu W. Non-homologous end joining plays a key role in transgene concatemer formation in transgenic zebrafish embryos. Int J Biol Sci. 2010;6(7):756-768. doi:10.7150/ijbs.6.756; Danner E., Lebedin M., De La Rosa K., Kühn R. A homology independent sequence replacement strategy in human cells using a CRISPR nuclease. Open Biol. 2021;11(1):200283. doi:10.1098/rsob.200283; Gurtan A.M., Lu V., Bhutkar A., Sharp P.A. In vivo structure-function analysis of human Dicer reveals directional processing of precursor miRNAs. RNA. 2012;18(6):1116-1122. doi:10.1261/rna.032680.112; Harms D.W., Quadros R.M., Seruggia D., Ohtsuka M., Takahashi G., Montoliu L., Gurumurthy C.B. Mouse genome editing using the CRISPR/Cas system. Curr Protoc Hum Genet. 2014;83:15.7.1-15.7.27. doi:10.1002/0471142905.hg1507s83; Jinek M., Jiang F., Taylor D.W., Sternberg S.H., Kaya E., Ma E., Anders C., Hauer M., Zhou K., Lin S., Kaplan M., Iavarone A.T., Charpentier E., Nogales E., Doudna J.A. Structures of Cas9 endonucleases reveal RNA-mediated conformational activation. Science. 2014;343(6176):1247997. doi:10.1126/science.1247997; Maggio I., Holkers M., Liu J., Janssen J.M., Chen X., Gonçalves M.A.F.V. Adenoviral vector delivery of RNA-guided CRISPR/Cas9 nuclease complexes induces targeted mutagenesis in a diverse array of human cells. Sci Rep. 2014;4(1):5105. doi:10.1038/srep05105; Mali P., Yang L., Esvelt K.M., Aach J., Guell M., DiCarlo J.E., Norville J.E., Church G.M. RNA-guided human genome engineering via Cas9. Science. 2013;339(6121):823-826. doi:10.1126/science.1232033; Maltseva E.A., Vasil’eva I.A., Moor N.A., Kim D.V., Dyrkheeva N.S., Kutuzov M.M., Vokhtantsev I.P., Kulishova L.M., Zharkov D.O., Lavrik O.I. Cas9 is mostly orthogonal to human systems of DNA break sensing and repair. PLoS One. 2023;18(11):e0294683. doi:10.1371/journal.pone.0294683; Nishimasu H., Ran F.A., Hsu P.D., Konermann S., Shehata S.I., Dohmae N., Ishitani R., Zhang F., Nureki O. Crystal structure of Cas9 in complex with guide RNA and target DNA. Cell. 2014;156(5): 935-949. doi:10.1016/j.cell.2014.02.001; Reginato G., Dello Stritto M.R., Wang Y., Hao J., Pavani R., Schmitz M., Halder S., Morin V., Cannavo E., Ceppi I., Braunshier S., Acharya A., Ropars V., Charbonnier J.-B., Jinek M., Nussenzweig A., Ha T., Cejka P. HLTF disrupts Cas9-DNA post-cleavage complexes to allow DNA break processing. Nat Commun. 2024;15(1):5789. doi:10.1038/s41467-024-50080-y; Richardson C.D., Ray G.J., DeWitt M.A., Curie G.L., Corn J.E. Enhancing homology-directed genome editing by catalytically active and inactive CRISPR-Cas9 using asymmetric donor DNA. Nat Biotechnol. 2016;34(3):339-344. doi:10.1038/nbt.3481; Rohan R.M., King D., Frels W.I. Direct sequencing of PCR-amplified junction fragments from tandemly repeated transgenes. Nucleic Acids Res. 1990;18(20):6089-6095. doi:10.1093/nar/18.20.6089; Sakuma T., Nakade S., Sakane Y., Suzuki K.-I.T., Yamamoto T. MMEJ-assisted gene knock-in using TALENs and CRISPR-Cas9 with the PITCh systems. Nat Protoc. 2016;11(1):118-133. doi:10.1038/nprot.2015.140; Schimmel J., Kool H., Van Schendel R., Tijsterman M. Mutational signatures of non‐homologous and polymerase theta‐mediated end-joining in embryonic stem cells. EMBO J. 2017;36(24):3634-3649. doi:10.15252/embj.201796948; Smirnov A., Fishman V., Yunusova A., Korablev A., Serova I., Skryabin B.V., Rozhdestvensky T.S., Battulin N. DNA barcoding reveals that injected transgenes are predominantly processed by homologous recombination in mouse zygote. Nucleic Acids Res. 2020; 48(2):719-735. doi:10.1093/nar/gkz1085; Stephenson A.A., Raper A.T., Suo Z. Bidirectional degradation of DNA cleavage products catalyzed by CRISPR/Cas9. J Am Chem Soc. 2018;140(10):3743-3750. doi:10.1021/jacs.7b13050; Suzuki K., Tsunekawa Y., Hernandez-Benitez R., Wu J., Zhu J., Kim E.J., Hatanaka F., Yamamoto M., Araoka T., Li Z., Kurita M., Hishida T., Li M., Aizawa E., Guo S., Chen S., Goebl A., Soligalla R.D., Qu J., Jiang T., Fu X., Jafari M., Esteban C.R., Berggren W.T., Lajara J., Nuñez-Delicado E., Guillen P., Campistol J.M., Matsuzaki F., Liu G.-H., Magistretti P., Zhang K., Callaway E.M., Zhang K., Belmonte J.C.I. In vivo genome editing via CRISPR/Cas9 mediated homology-independent targeted integration. Nature. 2016; 540(7631):144-149. doi:10.1038/nature20565; Taheri-Ghahfarokhi A., Taylor B.J.M., Nitsch R., Lundin A., Cavallo A.-L., Madeyski-Bengtson K., Karlsson F., Clausen M., Hicks R., Mayr L.M., Bohlooly-Y.M., Maresca M. Decoding non-random mutational signatures at Cas9 targeted sites. Nucleic Acids Res. 2018; 46(16):8417-8434. doi:10.1093/nar/gky653; Takeo T., Nakagata N. Combination medium of cryoprotective agents containing l-glutamine and methyl-β-cyclodextrin in a preincubation medium yields a high fertilization rate for cryopreserved C57BL/6J mouse sperm. Lab Anim. 2010;44(2):132-137. doi:10.1258/la.2009.009074; Takeo T., Nakagata N. Reduced glutathione enhances fertility of frozen/thawed C57BL/6 mouse sperm after exposure to methyl-beta-cyclodextrin. Biol Reprod. 2011;85(5):1066-1072. doi:10.1095/biolreprod.111.092536; Takeo T., Hoshii T., Kondo Y., Toyodome H., Arima H., Yamamura K., Irie T., Nakagata N. Methyl-beta-cyclodextrin improves fertilizing ability of C57BL/6 mouse sperm after freezing and thawing by facilitating cholesterol efflux from the cells. Biol Reprod. 2008;78(3): 546-551. doi:10.1095/biolreprod.107.065359; https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/4473

Διαθεσιμότητα: https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/4473
https://doi.org/10.18699/vjgb-25-04

Multicenter non-interventional study of prevalence of homologous recombination gene mutations and approaches to treatment of metastatic castration-resistant prostate cancer in Russia (ADAM) ; Многоцентровое неинтервенционное исследование распространенности мутаций генов гомологичной рекомбинации и подходов к трапии метастатического кастрационно-резистентного рака предстательной железы в России (ADAM)

Συγγραφείς: B. Ya. Alekseev, Yu. V. Anzhiganova, A. V. Sultanbaev, A. A. Bystrov, A. S. Orlov, G. V. Gopp, A. V. Kopyltsov, A. V. Lykov, V. A. Atduev, G. N. Alekseeva, L. M. Rodygin, S. A. Varlamov, A. V. Shestakov, M. R. Maturov, M. F. Urmantsev, L. V. Lankina, E. L. Parsadanova, V. Yu. Startsev, O. V. Vedrova, S. Yu. Andreev, A. A. Perevoshchikov, O. A. Mailyan, A. S. Kalpinskiy, Б. Я. Алексеев, Ю. В. Анжиганова, A. B. Султанбаев, А. А. Быстров, А. С. Орлов, Г. В. Гопп, Е. И. Копыльцов, А. В. Лыков, В. А. Атдуев, Г. Н. Алексеева, Л. М. Родыгин, С. А. Варламов, А. В. Шестаков, М. Р. Матуров, М. Ф. Урманцев, Л. В. Ланкина, Э. Л. Парсаданова, В. Ю. Старцев, О. В. Ведрова, С. Ю. Андреев, А. А. Перевощиков, О. А. Маилян, А. С. Калпинский

Συνεισφορές: The study was performed with the support of AstraZeneca Pharmaceuticals., Исследование проведено при поддержке ООО «АстраЗенека Фармасьютикалз».

Πηγή: Cancer Urology; Том 20, № 2 (2024); 87-100 ; Онкоурология; Том 20, № 2 (2024); 87-100 ; 1996-1812 ; 1726-9776

Θεματικοί όροι: молекулярно-генетический анализ, metastatic castration-resistant prostate cancer, homologous recombination, mutation of homologous recombination, new generation antiandrogen, next generation sequencing, molecular genetic analysis, метастатический кастрационно-резистентный рак предстательной железы, гомологичная рекомбинация, мутация генов гомологичной рекомбинации, антиандроген нового поколения, секвенирование нового поколения

Περιγραφή αρχείου: application/pdf

Relation: https://oncourology.abvpress.ru/oncur/article/view/1836/1532; Злокачественные новообразования в России в 2022 году (забо­ леваемость и смертность). Под. ред. А.Д. Каприна, В.В. Ста­ ринского, О.В. Шахзадовой, И.В. Лисичниковой. М.: МНИОИ им. П.А. Герцена – филиал ФГБУ «НМИЦ радиологии» Мин­ здрава России, 2023. 275 с.; Achard V., Putora P.M., Omlin A. et al. Metastatic prostate cancer: treatment options. Oncology 2022;100(1):48–59. DOI:10.1159/000519861; Petrylak D.P., Tangen C.M., Hussain M.H. et al. Docetaxel and estramustine compared with mitoxantrone and prednisone for advanced refractory prostate cancer. N Engl J Med 2004;351(15):1513–20. DOI:10.1056/NEJMoa041318; Tannock I.F., Osoba D., Stockler M.R. Chemotherapy with mitoxantrone plus prednisone or prednisone alone for symptomatic hormone­resistant prostate cancer: a Canadian randomized trial with palliative end points. J Clin Oncol 1996;14(6):1756–64. DOI:10.1200/JCO.1996.14.6.1756; Tannock I.F., de Wit R., Berry W.R. et al. Docetaxel plus prednisone or mitoxantrone plus prednisone for advanced prostate cancer. N Engl J Med 2004;351(15):1502–12. DOI:10.1056/NEJMoa040720; De Bono J.S., Oudard S., Ozguroglu M. et al. Prednisone plus cabazitaxel or mitoxantrone for metastatic castration­resistant prostate cancer progressing after docetaxel treatment: a randomized open­label trial. Lancet 2010;376(9747):1147–54. DOI:10.1016/S0140-6736(10)61389­X; FDA approved enzalutamide. Reference ID 4291091. Available at: https://www.accessdata.fda.gov/drugsatfda_docs/label/2018/203415s014lbl.pdf; Ryan C.J., Smith M.R., de Bono J.S. et al. Abiraterone in metastatic prostate cancer without previous chemotherapy. N Engl J Med 2013;368(2):138–48. DOI:10.1056/NEJMoa1209096; FDA approved abiraterone acetate. Reference ID 2939553 Available at: https://www.accessdata.fda.gov/drugsatfda_docs/label/2011/202379lbl.pdf; Parker C., Nilsson S., Heinrich D. et al. Alpha emitter radium­223 and survival in metastatic prostate cancer. N Engl J Med 2013;369(3):213–23. DOI:10.1056/NEJMoa1213755; Sartor O., de Bono J., Chi K.N. et al. Lutetium­177­PSMA­617 for metastatic castration­resistant prostate cancer. N Engl J Med 2021;385(12):1091–103. DOI:10.1056/NEJMoa2107322; Hussain M., Mateo J., Fizazi K. et al. Survival with olaparib in metastatic castration­resistant prostate cancer. N Engl J Med 2020;383(24):2345–57. DOI:10.1056/NEJMoa2022485; De Bono J., Mateo J., Fizazi K. et al. Olaparib for metastatic castration resistant prostate cancer. N Engl J Med 2020;382(22):2091–102. DOI:10.1056/NEJMoa1911440; Abida W., Campbell D., Patnaik A. et al. Rucaparib for the treatment of metastatic castration­resistant prostate cancer associated with a DNA damage repair gene alteration: final results from the phase 2 TRITON2 study. Eur Urol 2023;84(3):321–30. DOI:10.1016/j.eururo.2023.05.021; Chi K.N., Rathkopf D., Smith M.R. et al. Niraparib and abiraterone acetate for metastatic castration­resistant prostate cancer. J Clin Oncol 2023;41(18):3339–51. DOI:10.1200/JCO.22.01649; De Bono J.S., Mehra N., Scagliotti G.V. et al. Talazoparib monotherapy in metastatic castration­resistant prostate cancer with DNA repair alterations (TALAPRO­1): an open­label, phase 2 trial [published correction appears in Lancet Oncol 2022;23(5):e207] [published correction appears in Lancet Oncol 2022;23(6):e249]. Lancet Oncol 2021;22(9):1250–64. DOI:10.1016/S1470­2045(21)00376­4; Agarwal N., Azad A.A., Carles J. et al. Talazoparib plus enzalutamide in men with first­line metastatic castration­resistant prostate cancer (TALAPRO­2): a randomised, placebo­controlled, phase 3 trial [published correction appears in Lancet 2023;402(10398):290]. Lancet 2023;402(10398):291–303. DOI:10.1016/S0140­6736(23)01055­3; Castro E., Mateo J., Olmos D., de Bono J.S. Targeting DNA repair: the role of PARP inhibition in the treatment of castration­resistant prostate cancer. Cancer J 2016;22(5):353–6. DOI:10.1097/PPO.0000000000000219; Chung J.H., Dewal N., Sokol E. et al. Prospective comprehensive genomic profiling of primary and metastatic prostate tumors. JCO Precis Oncol 2019;3: PO.18.00283. DOI:10.1200/PO.18.00283; Cui M., Gao X.S., Gu X. et al. BRCA2 mutations should be screened early and routinely as markers of poor prognosis: evidence from 8,988 patients with prostate cancer. Oncotarget 2017;8(25):40222–32. DOI:10.18632/oncotarget.16712; Maughan B.L., Munlde S., Nematian­Samani M. et al. Survival outcomes of APA as a starting treatment: impact in real­world patients with mCSPC (OASIS). J Clin Oncol 2024;42(4_suppl):65. DOI:10.1200/JCO.2024.42.4_suppl.6; https://oncourology.abvpress.ru/oncur/article/view/1836

Διαθεσιμότητα: https://oncourology.abvpress.ru/oncur/article/view/1836
https://doi.org/10.17650/1726-9776-2024-20-2-87-100

ПОЛУЧЕНИЕ И ИЗУЧЕНИЕ IN VITRO РЕКОМБИНАНТНОГО ВИРУСА АФРИКАНСКОЙ ЧУМЫ СВИНЕЙ С ДЕЛЕЦИЕЙ ГЕНА A238L

Θεματικοί όροι: green fluorescent protein (EGFP), иммуномодулирующие белки, COS-1 cell culture, количественная ПЦР в режиме реального времени, плазмидный вектор, cloning, plasmid vector, homologous recombination, immunomodulating proteins, 3. Good health, A238L gene, культура клеток COS-1, гомологичная рекомбинация, real-time quantitative PCR, африканская чума свиней, клонирование, ген A238L, African swine fever, recombinant virus, зеленый флуоресцентный белок (EGFP), рекомбинантный вирус

Determination of BRCAness Phenotype in Breast Tumors for the Appointment of Neoadjuvant Chemotherapy Based on Platinum and Taxanes

Συγγραφείς: Matvey Mihajlovich Tsyganov, Marina K. Ibragimova, Evgeniy Y. Garbukov, Olga D. Bragina, Ariana A. Karchevskaya, Evgeny A. Usynin, Nikolai V. Litvyakov

Πηγή: Int J Mol Sci
International Journal of Molecular Sciences; Volume 24; Issue 1; Pages: 207
International journal of molecular sciences. 2023. Vol. 24, № 1. P. 207 (1-13)

Θεματικοί όροι: BRCA2 Protein, BRCA1 Protein, дефицит гомологичной рекомбинации, микроматричный анализ, Breast Neoplasms, BRCAness, homologous recombination, homologous recombination deficiency, breast cancer, gene expression, microarray analysis, DNA copy number aberration, loss of heterozygosity, neoadjuvant chemotherapy, personalized treatment, потеря гетерозиготности, Article, Neoadjuvant Therapy, 3. Good health, 03 medical and health sciences, Phenotype, 0302 clinical medicine, гомологичная рекомбинация, индивидуальное лечение, Humans, Female, Taxoids, экспрессия генов, Prospective Studies, BRCA-мутации, аберрации числа копий ДНК, рак молочной железы, неоадъювантная химиотерапия, Platinum

Περιγραφή αρχείου: application/pdf

Σύνδεσμος πρόσβασης: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36613648
https://vital.lib.tsu.ru/vital/access/manager/Repository/koha:001009372

EPIGENETICS OF CARCINOGENESIS

Συγγραφείς: Rustam N. Mustafin, Elza K. Khusnutdinova

Πηγή: Креативная хирургия и онкология, Vol 7, Iss 3, Pp 60-67 (2017)

Θεματικοί όροι: геномная нестабильность (гн), длинные некодирующие рнк (lncрнк), метилирование (мт), микрорнк, неаллельная гомологичная рекомбинация (nahr – non-allelic homologous recombination), некодирующие рнк (нкрнк), ретротранспозиция (рт), транспозоны (те – transposable elements), Surgery, RD1-811, Neoplasms. Tumors. Oncology. Including cancer and carcinogens, RC254-282

Relation: https://www.surgonco.ru/jour/article/view/244; https://doaj.org/toc/2307-0501; https://doaj.org/toc/2076-3093; https://doaj.org/article/ba7f7b49ede744d187f30d8a01614730

Διαθεσιμότητα: https://doi.org/10.24060/2076-3093-2017-7-3-60-67
https://doaj.org/article/ba7f7b49ede744d187f30d8a01614730

Analysis of different therapeutic schemes combining cyclophosphamide and doublestranded DNA preparation for eradication of Krebs-2 primary ascites in mice ; Характеристика режимов терапевтического воздействия циклофосфана и препаратов двуцепочечной ДНК на опухоль Кребс-2, растущую в асцитной форме, приводящих к эрадикации первичного асцита

Συγγραφείς: E. A. Potter, E. V. Dolgova, A. M. Minkevich, V. P. Nikolin, N. A. Popova, Ya. R. Efremov, S. I. Baiborodin, V. A. Rogachev, A. S. Proskurina, A. V. Kozel, O. S. Taranov, V. V. Omigov, E. I. Vereschagin, D. B. Petrov, A. A. Ostanin, E. R. Chernykh, N. A. Kolchanov, S. S. Bogachev, Е. А. Поттер, Е. В. Долгова, А. М. Минкевич, В. П. Николин, Н. А. Попова, Я. Р. Ефремов, С. И. Байбородин, В. А. Рогачев, А. С. Проскурина, А. В. Козел, О. С. Таранов, В. В. Омигов, Е. И. Верещагин, Д. Б. Петров, А. А. Останин, Е. Р. Черных, Н. А. Колчанов, С. С. Богачев

Συνεισφορές: бюджетным проектом № VI.60.1.3

Πηγή: Vavilov Journal of Genetics and Breeding; Том 20, № 1 (2016); 108-124 ; Вавиловский журнал генетики и селекции; Том 20, № 1 (2016); 108-124 ; 2500-3259

Θεματικοί όροι: полиорганная недостаточность, cyclophosphamide (CP), Krebs-2 ascites, tumor-initiating stem cells, remission, NER, homologous recombination, systemic inflammatory reaction, multiple organ failure, циклофосфан, асцит Кребс-2, стволовые инициирующие раковые клетки, ремиссия, гомологичная рекомбинация, системная воспалительная реакция

Περιγραφή αρχείου: application/pdf

Relation: https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/468/757; Беспалов В.Г., Жабин А.А., Стуков А.Н., Беляева О.А., Муразов Я.Г., Семенов А.Л., Коньков С.А., Крылова И.М. Синергизм противоопухолевого действия диоксадэта и цисплатина на модели асцитной опухоли яичника // Сибирский онкологический журнал. 2013. No. 1. C. 42-46. Bespalov V.G., Zhabin A.A., Stukov; A.N., Belyaeva O.A., Murazov Y.G., Semenov A.L., Konkov S.A., Krylova I.M. Synergistic antitumor effect of dioxodate and cisplatin on the model of ovarian ascites tumor // Sibirskii onkologicheskii zhurnal. 2013. No. 1. P. 42-46.; Блохин Н.Н., Переводчикова Н.И. Химиотерапия опухолевых заболеваний. М.: Медицина, 1984. 302 с. Blohin N.N., Perevodchikova N.I. Chemotherapy of neoplastic diseases. M.: Medicina. 302 p. (In Russian).; Волкова О.В., Елецкий Ю.К. Основы гистологии и гистологической техники. М.: Медицина, 1971. 272 с. Volkova O.V., Eleckii Yu.K. The fundamentals of histology and histological technique // M: Medicina, 1971. P. 272. (In Russian).; Гаврилов О.К. Проблемы и гипотезы в учении о свертывании крови // М.: Медицина, 1981. Gavrilov O.K. Problems and hypotheses in the study of blood coagulation. M.: Medicina, 1981. (In Russian).; Долгова Е.В., Рогачев В.А., Николин В.П., Попова Н.А., Лихачева А.С., Алямкина Е.А., Себелева Т.Е., Черных Е.Р., Гельфгат Е.Л., Богачев С.С., Шурдов М.А. Лейкостимулирующее действие фрагментов экзогенной ДНК, защищенных протамином, при вызванной циклофосфаном миелосупрессии мышей // Вопросы онкологии. 2009. Т. 55, No. 6, С. 761-764. Dolgova E.V., Rogachev V.A., Nikolin V.P., Popova N.A., Likhacheva A.S., Sebeleva T.E., Chernykh E.R., Gelfgat E.L., Bogachev S.S., Shurdov M.A. Leukostimulatory effect of exogenous DNA fragments protected by protamine in mica in the case of myelosuppression caused by cyclophosphamide // Voprosy oncologii. 2009. V. 55, No 6, P. 761-764. (In Russian).; Лайт Р.У. Болезни плевры: пер. с англ. М.: Медицина, 1986. С. 106-119. Layt R.U. Pleural disease. M.: Medicina, 1986. P. 106-119. (In Russian).; Поттер Е.А., Долгова Е.В., Минкевич А.М., Ефремов Я.Р., Таранов О.С., Омигов В.В., Николин В.П., Попова Н.А., Проскурина А.С., Верещагин Е.И., Козел А.В., Рогачев В.А., Петров Д.Б., Останин А.А., Черных Е.Р., Колчанов Н.А., Богачев С.С. Терапевтические эффекты воздействия циклофосфана, препаратов двуцепочечной ДНК и их сочетания на раковые клетки асцита Кребс-2 и различные формы трансплантатов // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2015а. В печати. Potter Е.А., Dolgova Е.V., Minkevich А.М., Efremov Ya.R., Taranov О.S., Omigov V.V., Nikolin V.P., Popova N.A., Proskurina А.S., Vereschagin Е.I., Kozel А.V., Rogachev V.А., Petrov D.B., Ostanin А.А., Chernykh Е.R., Kolchanov N.А., Bogachev S.S. Therapeutic effects of cyclophosphamide, dsDNA preparations and combinations thereof against Krebs-2 ascites cancer cells and various cancer transplants // Vavilovskii zhurnal genetiki I selekcii. 2015a. (In Russian) (In press).; Стенина М.Б. Спорные вопросы в лечении рака яичников // Онкология: Трудный пациент. 2006. Т. 4. No. 11. С. 9-14. Stenina M.B. Controversial issues in the treatment of ovarian cancer // Oncologiya. 2006. V. 4. No. 11. P. 9-14.; Туаева Н.О., Софронов В.В., Амикеева В.А., Абрамова З.И., Винтер В.Г., Мустафина Д.М., Туточкина К.В. Взаимосвязь концентрации внеклеточной ДНК в плазме крови и содержания антител к нативной ДНК у новорожденных с пневмопатией // Казанский медицинский журнал. 2006. Т. 87. Вып. 4. С. 254-257.; Tuaeva N.O., Sofronov V.V., Amikeeva V.A., Abramova Z.I., Winter V.G., Mustafina D.M., Tutochkina K.V. Interconnection of extracellular DNA concentration in blood plasma and amount of antibodies to native DNA in newborns with pneumopathy // Kazanskii medicinskii zhurnal. 2006. V. 87. No. 4. P. 254-257. (In Russian).; Alyamkina E.A., Dolgova E.V., Likhacheva A.S., Rogachev V.A., Sebeleva T.E., Nikolin V.P., Popova N.A., Orishchenko K.E., Strunkin D.N., Chernykh E.R., Zagrebelniy S.N., Bogachev S.S., Shurdov M.A. Combined therapy with cyclophosphamide and DNA preparation inhibits the tumor growth in mice // Genet. Vaccines Ther. 2009. V. 7(1). No. 12. DOI:10.1186/1479-0556-7-12.; Alyamkina E.A., Dolgova E.V., Likhacheva A.S., Rogachev V.A., Sebeleva T.E., Nikolin V.P., Popova N.A., Kiseleva E.V., Orishchenko K.E., Sakhno L.V., Gel’fgat E.L., Ostanin A.A., Chernykh E.R., Zagrebelniy S.N., Bogachev S.S., Shurdov M.A. Exogenous allogenic fragmented double-stranded DNA is internalized into human dendritic cells and enhances their allostimulatory activity // Cell Immunol. 2010a. V. 262. P. 120-126. DOI:10.1016/j.cellimm.2010.01.005.; Alyamkina E.A., Leplina O.Y., Sakhno L.V., Chernykh E.R., Ostanin A.A., Efremov Y.R., Shilov A.G., Proskurina A.S., Orishchenko K.E., Dolgova E.V., Rogachev V.A., Nikolin V.P., Popova N.A., Zagrebelniy S.N., Bogachev S.S., Shurdov M.A. Effect of double-stranded DNA on maturation of dendritic cells in vitro // Cell Immunol. 2010b. V. 266. P. 46-51. DOI:10.1016/j.cellimm.2010.08.011.; Alyamkina E.A., Nikolin V.P., Popova N.A., Dolgova E.V., Proskurina A.S., Orishchenko K.E., Efremov Y.R., Chernykh E.R., Ostanin A.A., Sidorov S.V., Ponomarenko D.M., Zagrebelniy S.N., Bogachev S.S., Shurdov M.A. A strategy of tumor treatment in mice with doxorubicin-cyclophosphamide combination based on dendritic cell activation by human double-stranded DNA preparation // Genet. Vaccines Ther. 2010c. V. 8(1). No. 7. DOI:10.1186/1479-0556-8-7.; Alyamkina E.A., Leplina O.Y., Ostanin A.A., Chernykh E.R., Nikolin V.P., Popova N.A., Proskurina A.S., Gvozdeva T.S., Dolgova E.V., Orishchenko K.E., Rogachev V.A., Sidorov S.V., Varaksin N.A., Ryabicheva T.G., Bogachev S.S., Shurdov M.A. Effects of human exogenous DNA on production of perforin-containing CD8+ cytotoxic lymphocytes in laboratory setting and clinical practice // Cell Immunol. 2012. V. 276. P. 59-66. DOI:10.1016/j.cellimm.2012.04.004.; Alyamkina E.A., Nikolin V.P., Popova N.A., Minkevich A.M., Kozel A.V., Dolgova E.V., Efremov Y.R., Bayborodin S.I., Andrushkevich O.M., Taranov O.S., Omigov V.V., Rogachev V.A., Proskurina A.S., Vereschagin E.I., Kiseleva E.V., Zhukova M.V., Ostanin A.A., Chernykh E.R., Bogachev S.S., Shurdov M.A. Combination of cyclophosphamide and double-stranded DNA demonstrates synergistic toxicity against established xenografts // Cancer Cell Int. 2015. V. 15. No. 32. DOI:10.1186/s12935-015-0180-6.; Anker P., Mulcahy H., Chen X.Q., Stroun M. Detection of circulating tumour DNA in the blood (plasma/serum) of cancer patients // Cancer Metastasis Rev. 1999. V. 18. No. 1. P. 65-73.; Bleiblo F., Michael P., Brabant D., Ramana C.V., Tai T., Saleh M., Parrillo J.E., Kumar A., Kumar A. The role of immunostimulatory nucleic acids in septic shock // Int. J. Clin. Exp. Med. 2012. V. 5. ISSN:1940-5901/IJCEM1112008.; Brenner D.E. Intraperitoneal chemotherapy: a review // J. Clin. Oncol. 1986. V. 4. No. 7. P. 1135-1147.; Decker P., Wolburg H., Rammensee H.G. Nucleosomes induce lymphocyte necrosis // Eur. J. Immunol. 2003. V. 33. No. 7. P. 1978–1987. DOI:10.1002/eji.200323703.; Dolgova E.V., Proskurina A.S., Nikolin V.P., Popova N.A., Alyamkina E.A., Orishchenko K.E., Rogachev V.A., Efremov Y.R., Dubatolova T.D., Prokopenko A.V., Chernykh E.R., Ostanin A.A., Taranov O.S., Omigov V.V., Zagrebelniy S.N., Bogachev S.S., Shurdov M.A. “Delayed death” phenomenon: A synergistic action of cyclophosphamide and exogenous DNA // Gene. 2012. V. 495. No. 2. P. 134-145. DOI:10.1016/j.gene.2011.12.032.; Dolgova E.V., Efremov Y.R., Orishchenko K.E., Andrushkevich O.M., Alyamkina E.A., Proskurina A.S., Bayborodin S.I., Nikolin V.P., Popova N.A., Chernykh E.R., Ostanin A.A., Taranov O.S., Omigov V.V., Minkevich A.M., Rogachev V.A., Bogachev S.S., Shurdov M.A. Delivery and processing of exogenous double-stranded DNA in mouse CD34+ hematopoietic progenitor cells and their cell cycle changes upon combined treatment with cyclophosphamide and double-stranded DNA // Gene. 2013. V. 528. No. 2. P. 74-83. DOI:10.1016/j.gene.2013.06.058.; Dolgova E.V., Alyamkina E.A., Efremov Y.R., Nikolin V.P., Popova N.A., Tyrinova T.V., Kozel A.V., Minkevich A.M., Andrushkevich O.M., Zavyalov E.L., Romaschenko A.V., Bayborodin S.I., Taranov O.S., Omigov V.V., Shevela E.Y., Stupak V.V., Mishinov S.V., Rogachev V.A., Proskurina A.S., Mayorov V.I., Shurdov M.A., Ostanin A.A., Chernykh E.R., Bogachev S.S. Identification of cancer stem cells and a strategy for their elimination // Cancer Biol. Ther. 2014. V. 15. No. 10. P. 1378-1394. DOI:10.4161/cbt.29854.; Garlatti V., Chouquet A., Lunardi T., Vives R., Paidassi H., Lortat-Jacob H., Thielens N.M., Arlaud G.J., Gaboriaud C. Cutting edge: C1q binds deoxyribose and heparin sulfate through neighboring sites of its recognition domain // J. Immunol. 2010. V. 185. No. 2. P. 808-812. DOI:10.4049/jimmunol.1000184.; Garcia-Olmo D., Garcia-Olmo D.C., Ontanon J., Martinez E. Horizontal transfer of DNA and the “genometastasis hypothesis” // Blood. 2000. V. 95. № 2. P. 724-725.; Gupta P.B., Fillmore C.M., Jiang G., Shapira S.D., Tao K., Kuperwasser C., Lander E.S. Stochastic state transitions give rise to phenotypic equilibrium in populations of cancer cells // Cell. 2011. V. 146. No. 4. P. 633-644. DOI:10.1016/j.cell.2011.07.026.; Jahr S., Hentze H., Englisch S., Hardt D., Fackelmayer F.O., Hesch R.D., Knippers R. DNA fragments in the blood plasma of cancer patients quantitations and evidence for their origin from apoptotic and necrotic cells // Cancer Res. 2001. V. 61. No. 4. P. 1659-1665.; Jiang H., Cooper B., Robey F.A., Gewurz H. DNA binds and activates complement via residues 14-26 of the human C1q A chain // J. Biol. Chem. 1992. V. 267. No. 35. P. 25597-25601.; Kaczorowski D.J., Scott M.J., Pibris J.P., Afrazi A., Nakao A., Edmonds R.D., Kim S., Kwak J.H., Liu Y., Fan J., Billiar T.R. Mammalian DNA is an endogenous danger signal that stimulates local synthesis and release of complement factor B // Mol. Med. 2012. V. 18. No. 1. P. 851–860. DOI:10.2119/molmed.2012.00011.; Laktionov P.P., Tamkovich S.N., Rykova E.Y., Bryzgunova O.E., Starikov A.V., Kuznetsova N.P., Sumarokov S.V., Kolomiets S.A., Sevostianova N.V., Vlassov V.V. Extracellular circulating nucleic acids in human plasma in health and disease // Nucleosides Nucleotides Nucleic Acids. 2004. V. 23. No. 6-7. P. 879-883.; Parsons D.F., Marko M., Braun S.J., Wansor K.J. Ascites tumor invasion of mouse peritoneum studied by high-voltage electron microscope stereoscopy // Cancer Res. 1982. V. 42. No. 11. P. 4574-4583.; Tissot B., Daniel R., Place C. Interaction of the C1 complex of the complement with sulfated polysaccharide and DNA probed by single molecule fluorescence microscopy // Eur. J. Biochem. 2003. V. 270. No. 23. P. 4714-4720.; https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/468

Διαθεσιμότητα: https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/468
https://doi.org/10.18699/VJ15.117

Therapeutic effects of cyclophosphamide, dsDNA preparations and combinations thereof against Krebs-2 ascites cancer cells and various cancer transplants ; Терапевтические эффекты воздействия циклофосфана, препаратов двуцепочечной ДНК и их сочетания на раковые клетки асцита Кребс-2 и различные формы трансплантатов

Συγγραφείς: E. A. Potter, E. V. Dolgova, A. M. Minkevich, Ya. R. Efremov, O. S. Taranov, V. V. Omigov, V. P. Nikolin, N. A. Popova, A. S. Proskurina, E. I. Vereschagin, A. V. Kozel, V. A. Rogachev, D. B. Petrov, A. A. Ostanin, E. R. Chernykh, N. A. Kolchanov, S. S. Bogachev, Е. А. Поттер, Е. В. Долгова, А. М. Минкевич, Я. Р. Ефремов, О. С. Таранов, В. В. Омигов, В. П. Николин, Н. А. Попова, А. С. Проскурина, Е. И. Верещагин, А. В. Козел, В. А. Рогачев, Д. Б. Петров, А. А. Останин, Е. Р. Черных, Н. А. Колчанов, С. С. Богачев

Συνεισφορές: бюджетный проект № VI.60.1.3

Πηγή: Vavilov Journal of Genetics and Breeding; Том 20, № 1 (2016); 96-107 ; Вавиловский журнал генетики и селекции; Том 20, № 1 (2016); 96-107 ; 2500-3259

Θεματικοί όροι: перевивочный потенциал, cyclophosphamide, Krebs-2 ascites, tumor-initiating cancer stem cells, NER, homologous recombination, engraftment potential, циклофосфан, асцит Кребс-2, стволовые инициирующие раковые клетки, гомологичная рекомбинация

Περιγραφή αρχείου: application/pdf

Relation: https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/467/756; Алямкина Е.А., Лихачева А.С., Николин В.П., Попова Н.А., Долгова Е.В., Рогачев В.А., Себелева Т.Е., Стрункин Д.Н., Богачев С.С., Шурдов М.А. // Действие экзогенной ДНК, ассоциированной с протамином, на рост экспериментальных опухолей мыши // Вопросы онкологии. 2009. Т. 55. No. 6. C. 765-768. Alyamkina E.A., Likhacheva A.S., Nikolin V.P., Popova N.A., Dolgova E.V., Rogachev V.A., Sebeleva T.E., Strunkin D.N., Bogachev S.S., Shurdov M.A. Protamine association with exogenous DNA's versus its ability to inhibit ехреrimental tumors // Voprosy oncologii. 2009. V. 55. No. 6. P. 765-768. (In Russian).; Беспалов В.Г., Жабин А.А., Стуков А.Н., Беляева О.А., Муразов Я.Г., Семенов А.Л., Коньков С.А., Крылова И.М. Синергизм противоопухолевого действия диоксадэта и цисплатина на модели асцитной опухоли яичника // Сибирский онкологический журнал. 2013. No. 1. C. 42-46. Bespalov V.G., Zhabin A.A., Stukov A.N., Belyaeva O.A., Murazov Y.G., Semenov A.L., Konkov S.A., Krylova I.M. Synergistic antitumor effect of dioxodate and cisplatin on the model of ovarian ascites tumor // Sibirskii onkologicheskii zhurnal. 2013. No. 1. P. 42-46.; Блохин Н.Н., Переводчикова Н.И. Химиотерапия опухолевых заболеваний. М.: Медицина, 1984. 302 с. Blohin N.N., Perevodchikova N.I. Chemotherapy of neoplastic diseases. M.: Medicina. 302 p. (In Russian).; Долгова Е.В., Лихачева А.С., Орищенко К.Е., Алямкина Е.А., Богачев С.С., Шурдов М.А. // Репарация межцепочечных сшивок молекулы ДНК // Информационный вестник ВОГиС. 2010. Т. 14.No. 2. С. 332-356. Dolgova E.V., Likhacheva A.S., Orishchenko K.E., Alyamkina E.A., Bogachev S.S., Shurdov M.A. Repair of interstrand crosslinks in a DNA molecule // Informacionnii vestnik VOGiS. 2010. V. 14. No. 2. P. 332-356. (In Russian).; Лайт Р.У. Болезни плевры: пер. с англ. М.: Медицина, 1986. С. 106-119. Layt R.U. Pleural disease. M.: Medicina, 1986. P. 106-119. (In Russian).; Лихачева А.С., Рогачев В.А., Николин В.П., Попова Н.А., Шилов А.Г., Себелева Т.Е., Стрункин Д.Н., Черных Е.Р., Гельфгат Е.Л., Богачев С.С., Шурдов М.А. Участие экзогенной ДНК в молекулярных процессах, протекающих в соматической клетке // Информационный вестник ВОГиС. 2008. Т. 12. No. 3. C. 426-473. Likhacheva A.S., Rogachev V.A., Nikolin V.P., Popova N.A., Shilov A.G., Sebeleva T.E., Strunkin D.N., Chernykh E.R., Gelfgat E.L., Bogachev S.S., Shurdov M.A. Involvement of exogenous DNA in the molecular processes in somatic cell // Informacionnii vestnik VOGiS. 2008. V. 12. No. 3. P. 426-473. (In Russian).; Поттер Е.А., Долгова Е.В., Минкевич А.М., Николин В.П., Попова Н.А., Ефремов Я.Р., Байбородин С.И., Рогачев В.А., Проскурина А.С., Козел А.В., Таранов О.С., Омигов В.В., Верещагин Е.И., Петров Д.Б., Останин А.А., Черных Е.Р., Колчанов Н.А., Богачев С.С. Характеристика режимов терапевтического воздействия циклофосфана и препаратов двуцепочечной ДНК на опухоль Кребс-2, растущей в асцитной форме, приводящих к эрадикации первичного асцита // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2015б. В печати. Potter Е.А., Dolgova Е.V., Minkevich А.М., Nikolin V.P., Popova N.A., Efremov Y.R., Bayborodin S.I., Rogachev V.А., Proskurina А.S., Kozel А.V., Taranov О.S., Omigov V.V., Vereschagin Е.I., Petrov D.B., Ostanin А.А., Chernykh Е.R., Kolchanov N.А., Bogachev S.S. Analysis of different therapeutic schemes combining cyclophosphamide and double-stranded DNA preparation for eradication of Krebs-2 primary ascites in mice // Vavilovskii zhurnal genetiki i selekcii. 2015b. In press. (In Russian).; Стенина М.Б. Спорные вопросы в лечении рака яичников // Онкология: Трудный пациент. 2006. Т. 4. No. 11. С. 9-14. Stenina M.B. Controversial issues in the treatment of ovarian cancer // Oncologiya. 2006. V. 4. No. 11. P. 9-14.; Alyamkina E.A., Dolgova E.V., Likhacheva A.S., Rogachev V.A., Sebeleva T.E., Nikolin V.P., Popova N.A., Orishchenko K.E., Strunkin D.N., Chernykh E.R., Zagrebelniy S.N., Bogachev S.S., Shurdov M.A. Combined therapy with cyclophosphamide and DNA preparation inhibits the tumor growth in mice // Genet. Vaccines Ther. 2009. V. 7(1). No. 12. DOI:10.1186/1479-0556-7-12.; Alyamkina E.A., Nikolin V.P., Popova N.A., Dolgova E.V., Proskurina A.S., Orishchenko K.E., Efremov Y.R., Chernykh E.R., Ostanin A.A., Sidorov S.V., Ponomarenko D.M., Zagrebelniy S.N., Bogachev S.S., Shurdov M.A. A strategy of tumor treatment in mice with doxorubicin-cyclophosphamide combination based on dendritic cell activation by human double-stranded DNA preparation // Genet. Vaccines Ther. 2010. V. 8(1). No. 7. DOI:10.1186/1479-0556-8-7.; Alyamkina E.A., Nikolin V.P., Popova N.A., Minkevich A.M., Kozel A.V., Dolgova E.V., Efremov Y.R., Bayborodin S.I., Andrushkevich O.M., Taranov O.S., Omigov V.V., Rogachev V.A., Proskurina A.S., Vereschagin E.I., Kiseleva E.V., Zhukova M.V., Ostanin A.A., Chernykh E.R., Bogachev S.S., Shurdov M.A. Combination of cyclophosphamide and double-stranded DNA demonstrates synergistic toxicity against established xenografts // Cancer Cell Int. 2015. V. 15. No. 32. DOI:10.1186/s12935-015-0180-6.; Brenner D.E. Intraperitoneal chemotherapy: a review // J. Clin. Oncol. 1986. V. 4. No. 7. P. 1135-1147.; Deans A.J., West S.C. DNA interstrand crosslink repair and cancer // Nat. Rev. Cancer. 2011. V. 11. No. 7. P. 467-480. DOI:10.1038/nrc3088.; Dolgova E.V., Proskurina A.S., Nikolin V.P., Popova N.A., Alyamkina E.A., Orishchenko K.E., Rogachev V.A., Efremov Y.R., Dubatolova T.D., Prokopenko A.V., Chernykh E.R., Ostanin A.A., Taranov O.S., Omigov V.V., Zagrebelniy S.N., Bogachev S.S., Shurdov M.A. "Delayed death" phenomenon: A synergistic action of cyclophosphamide and exogenous DNA // Gene. 2012. V. 495. No. 2. P. 134-145. DOI:10.1016/j.gene.2011.12.032.; Dolgova E.V., Efremov Y.R., Orishchenko K.E., Andrushkevich O.M., Alyamkina E.A., Proskurina A.S., Bayborodin S.I., Nikolin V.P., Popova N.A., Chernykh E.R., Ostanin A.A., Taranov O.S., Omigov V.V., Minkevich A.M., Rogachev V.A., Bogachev S.S., Shurdov M.A. Delivery and processing of exogenous double-stranded DNA in mouse CD34+ hematopoietic progenitor cells and their cell cycle changes upon combined treatment with cyclophosphamide and double-stranded DNA // Gene. 2013. V. 528. No. 2. P. 74-83. DOI:10.1016/j.gene.2013.06.058.; Dolgova E.V., Alyamkina E.A., Efremov Y.R., Nikolin V.P., Popova N.A., Tyrinova T.V., Kozel A.V., Minkevich A.M., Andrushkevich O.M., Zavyalov E.L., Romaschenko A.V., Bayborodin S.I., Taranov O.S., Omigov V.V., Shevela E.Y., Stupak V.V., Mishinov S.V., Rogachev V.A., Proskurina A.S., Mayorov V.I., Shurdov M.A., Ostanin A.A., Chernykh E.R., Bogachev S.S. Identification of cancer stem cells and a strategy for their elimination // Cancer Biol. Ther. 2014. V. 15. No. 10. P. 1378-1394. DOI:10.4161/cbt.29854.; Dolgova E.V., Potter E.A., Proskurina A.S., Minkevich A.M., Kozel A.V., Rogachev V.A., Efremov Y.R., Ostanin A.A., Chernykh E.R., Petrov D.B., Bogachev S.S. Properties of internalization factors contributing to the uptake of extracellular DNA into tumor-inducing stem cells of mouse Krebs-2 cell line. 2015, in prep. Likhacheva A.S., Nikolin V.P., Popova N.A., Rogachev V.A., Prokhorovich M.A., Sebeleva T.E., Bogachev S.S., Shurdov M.A. Exogenous DNA can be captured by stem cells and be involved in their rescue from death after lethal-dose γ-radiation // Gene Ther. Mol. Biol. 2007. V. 11. P. 305-314.; Muniandy P.A., Liu J., Majumdar A., Liu S.T., Seidman M.M. DNA interstrand crosslink repair in mammalian cells: step by step // Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol. 2010. V. 45. No. 1. P. 23-49. DOI:10.3109/10409230903501819.; Räschle M., Knipscheer P., Enoiu M., Angelov T., Sun J., Griffith J.D., Ellenberger T.E., Schärer O.D., Walter J.C. Mechanism of replication-coupled DNA interstrand crosslink repair // Cell. 2008. V. 134. No. 6. P. 969-980. DOI:10.1016/j.cell.2008.08.030.; https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/467

Διαθεσιμότητα: https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/467
https://doi.org/10.18699/VJ15.116

Eradication of Krebs-2 primary ascites via a single-injection regimen of cyclophosphamide and double-stranded DNA ; Режим однократной инъекции препарата двуцепочечной ДНК после каждой инъекции циклофосфана, приводящий к эрадикации первичного асцита Кребс-2

Συγγραφείς: E. A. Potter, E. V. Dolgova, A. M. Minkevich, V. P. Nikolin, N. A. Popova, Ya. R. Efremov, S. I. Baiborodin, V. A. Rogachev, A. S. Proskurina, O. S. Taranov, E. I. Vereschagin, A. A. Ostanin, E. R. Chernykh, N. A. Kolchanov, S. S. Bogachev, Е. А. Поттер, Е. В. Долгова, А. М. Минкевич, В. П. Николин, Н. А. Попова, Я. Р. Ефремов, С. И. Байбородин, В. А. Рогачев, А. С. Проскурина, О. С. Таранов, Е. И. Верещагин, А. А. Останин, Е. Р. Черных, Н. А. Колчанов, С. С. Богачев

Πηγή: Vavilov Journal of Genetics and Breeding; Том 20, № 5 (2016); 716-722 ; Вавиловский журнал генетики и селекции; Том 20, № 5 (2016); 716-722 ; 2500-3259

Θεματικοί όροι: полиорганная недостаточность, cyclophosphamide, Krebs-2 ascites, tumor-initiating cancer stem cells, repair, remission, NER, homologous recombination, systemic inflammatory reaction, multiple organ failure, циклофосфан, асцит Кребс-2, стволовые инициирующие раковые клетки, репарация, ремиссия, гомологичная рекомбинация, системная воспалительная реакция

Περιγραφή αρχείου: application/pdf

Relation: https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/820/842; Alyamkina E.A., Dolgova E.V., Likhacheva A.S., Rogachev V.A., Sebeleva T.E., Nikolin V.P., Popova N.A., Orishchenko K.E., Strunkin D.N., Chernykh E.R., Zagrebelniy S.N., Bogachev S.S., Shurdov M.A. Combined therapy with cyclophosphamide and DNA preparation inhibits the tumor growth in mice. Genet Vaccines Ther. 2009;7(1):12. DOI 10.1186/1479-0556-7-12.; Alyamkina E.A., Dolgova E.V., Likhacheva A.S., Rogachev V.A., Sebeleva T.E., Nikolin V.P., Popova N.A., Kiseleva E.V., Orishchenko K.E., Sakhno L.V., Gel’fgat E.L., Ostanin A.A., Chernykh E.R., Zagrebelniy S.N., Bogachev S.S., Shurdov M.A. Exogenous allogenic fragmented double-stranded DNA is internalized into human dendritic cells and enhances their allostimulatory activity. Cell. Immunol. 2010a;262(2):120-126.; Alyamkina E.A., Leplina O.Y., Sakhno L.V., Chernykh E.R., Ostanin A.A., Efremov Y.R., Shilov A.G., Proskurina A.S., Orishchenko K.E., Dolgova E.V., Rogachev V.A., Nikolin V.P., Popova N.A., Zagrebelniy S.N., Bogachev S.S., Shurdov M.A. Effect of doublestranded DNA on maturation of dendritic cells in vitro. Cell. Immunol. 2010b;266(1):46-51.; Alyamkina E.A., Nikolin V.P., Popova N.A., Dolgova E.V., Proskurina A.S., Orishchenko K.E., Efremov Y.R., Chernykh E.R., Ostanin A.A., Sidorov S.V., Ponomarenko D.M., Zagrebelniy S.N., Bogachev S.S., Shurdov M.A. A strategy of tumor treatment in mice with doxorubicin- cyclophosphamide combination based on dendritic cell activation by human double- stranded DNA preparation. Genet. Vaccines Ther. 2010c;8:7. DOI 10.1186/1479-0556-8-7.; Alyamkina E.A., Nikolin V.P., Popova N.A., Minkevich A.M., Kozel A.V., Dolgova E.V., Efremov Y.R., Bayborodin S.I., Andrushkevich O.M., Taranov O.S., Omigov V.V., Rogachev V.A., Proskurina A.S., Vereschagin E.I., Kiseleva E.V., Zhukova M.V., Ostanin A.A., Chernykh E.R., Bogachev S.S., Shurdov M.A. Combination of cyclophosphamide and double-stranded DNA demonstrates synergistic toxicity against established xenografts. Cancer Cell Int. 2015;15:32. DOI 10.1186/s12935-015-0180-6.; Dolgova E.V., Alyamkina E.A., Efremov Y.R., Nikolin V.P., Popova N.A., Tyrinova T.V., Kozel A.V., Minkevich A.M., Andrushkevich O.M., Zavyalov E.L., Romaschenko A.V., Bayborodin S.I., Taranov O.S., Omigov V.V., Shevela E.Y., Stupak V.V., Mishinov S.V., Rogachev V.A., Proskurina A.S., Mayorov V.I., Shurdov M.A., Ostanin A.A., Chernykh E.R., Bogachev S.S. Identification of cancer stem cells and a strategy for their elimination. Cancer Biol. Ther. 2014;15(10):1378- 1394. DOI 10.4161/cbt.29854.; Dolgova E.V., Rogachev V.A, Nikolin V.P., Popova N.A., Likhacheva A.S., Alyamkina E.A., Sebeleva T.E., Chernykh Е.R., Gelfgat E.L., Bogachev S.S., Shurdov M.A. The leukocyte- stimulating action of protamine-protected exogenous DNA in -myelosuppression induced in mice by cyclophosphane. Voprosy onkologii = Problems in Oncology. 2009;55(6):761-764. (in Russian); Peshkova I.V., Bogachev S.S., Drobyazgin E.A., Chikinev Y.V., Mitrofanov I.M., Piontkovskaya K.A., Vereschagin E.I. Effect of glutamine on the nucleic acids exchange during the perioperative period in reconstructive esophagus surgery. J. Nutr. Health Food Eng. 2015;2(4):00058. DOI 10.15406/jnhfe.2015.02.00058.; Potter Е.А., Dolgova Е.V., Minkevich А.М., Efremov Y.R., Taranov О.S., Omigov V.V., Nikolin V.P., Popova N.A., Proskurina А.S., Vereschagin Е.I., Kozel А.V., Rogachev V.А., Petrov D.B., Ostanin А.А., Chernykh Е.R., Kolchanov N.А., Bogachev S.S. Therapeutic effects of cyclophosphamide, dsDNA preparations and their combinations against Krebs-2 ascites cancer cells and various cancer transplants. Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii = Vavilov Journal of Genetics and Breeding. 2016a;20(1):96-107. DOI 10.18699/VJ15.116. (in Russian); Potter Е.А., Dolgova Е.V., Minkevich А.М., Nikolin V.P., Popova N.A., Efremov Y.R., Baiborodin S.I., Rogachev V.А., Proskurina А.S., Kozel А.V., Taranov О.S., Omigov V.V., Vereschagin Е.I., Petrov D.B., Ostanin А.А., Chernykh Е.R., Kolchanov N.А., Bogachev S.S. Analysis of different therapeutic schemes combining cyclophosphamide and double-stranded DNA preparations for eradication of Krebs-2 primary ascites in mice. Vavilovskii Zhurnal Genetiki i Selektsii = Vavilov Journal of Genetics and Breeding. 2016b;20(1):108-124. DOI 10.18699/VJ15.117. (in Russian); Scharovsky O.G., Mainetti L.E., Rozados V.R. Metronomic chemotherapy: changing the paradigm that more is better. Curr. Oncol. 2009; 16(2):7-15.; https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/820

Διαθεσιμότητα: https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/820
https://doi.org/10.18699/VJ16.161

GENOME ENGINEERING TOOLS TO GENERATE ISOGENIC CELLULAR MODEL OF AMYOTROPHIC LATERAL SCLEROSIS ; ИНСТРУМЕНТЫ ГЕНОМНОЙ ИНЖЕНЕРИИ, ПРЕДНАЗНАЧЕННЫЕ ДЛЯ СОЗДАНИЯ ИЗОГЕННОЙ КЛЕТОЧНОЙ МОДЕЛИ БОКОВОГО АМИОТРОФИЧЕСКОГО СКЛЕРОЗА

Συγγραφείς: K. R. Valetdinova, E. I. Ustyantseva, E. A. Elisaphenko, D. O. Zharkov, A. E. Tupikin, M. R. Kabilov, S. P. Medvedev, S. M. Zakian, К. Р. Валетдинова, Е. И. Устьянцева, Е. А. Елисафенко, Д. О. Жарков, А. Е. Тупикин, М. Р. Кабилов, С. П. Медведев, С. М. Закиян

Συνεισφορές: Работа поддержана бюджетным проектом ФГБНУ ФИЦ ИЦиГ СО РАН VI.60.1.2. Материалы были доложены на VII Съезде Российского общества медицинских генетиков, 19—23 мая 2015 г.

Πηγή: Medical Genetics; Том 14, № 6 (2015); 3-9 ; Медицинская генетика; Том 14, № 6 (2015); 3-9 ; 2073-7998

Θεματικοί όροι: гомологичная рекомбинация, TALEN, genome editing, homologous recombination, редактирование генома

Relation: Abel O., Powell J.F., Andersen P.M. et al. ALSoD: Auser-friendly online bioinformatics tool for amyotrophic lateral sclerosis genetics // Hum. Mutat. - 2012. - Vol. 33, №9. - P. 1345-1351.; Boch J., Scholze H., Schornack S. et al. Breaking the code of DNA binding specificity of TAL-type III effectors // Science. — 2009. - Vol. 326, №5959. - P. 1509-1512.; Boulting G.L., Kiskinis E., Croft G.F. et al. A functionally characterized test set of human induced pluripotent stem cells // Nat. Biotechnol. - 2011. - Vol. 29, №3. - P. 279-286.; Cermak T., Doyle E.L., Christian M. et al. Efficient design and assembly of custom TALEN and other TAL effector-based constructs for DNA targeting // Nucleic Acids Res. - 2011. - Vol. 39, №12. - P. e82.; Chen H., Qian K., Du Z. et al. Modeling ALS with iPSCs reveals that mutant SOD1 misregulates neurofilament balance in motor neurons // Cell Stem Cell. - 2014. - Vol. 14, №6. -P. 796-809.; Cong L., Ran F.A., Cox D. et al. Multiplex genome engineering using CRISPR/Cas systems // Science. - 2013. - Vol. 339, №6121. - P. 819-823.; Dianov G.L. and Hubscher U. Mammalian base excision repair: the forgotten archangel // Nucleic Acids Res. - 2013. -Vol. 41, №6. - P. 3483-3490.; Dimos J.T., Rodolfa K.T., Niakan K.K. et al. Induced pluri-potent stem cells generated from patients with ALS can be differentiated into motor neurons // Science. - 2008. - Vol. 321, №5893. -P. 1218-1221.; Ding Q., Lee Y.K., Schaefer E.A. et al. A TALEN genome-editing system for generating human stem cell-based disease models // Cell Stem Cell. - 2013. - Vol. 12, №2. - P. 238-251.; Kim H., Um E., Cho S.R. et al. Surrogate reporters for enrichment of cells with nuclease-induced mutations // Nat. Methods. - 2011. - Vol. 8, №11. - P. 941-943.; Makarova K.S., Haft D.H., Barrangou R. et al. Evolution and classification of the CRISPR-Cas systems // Nat. Rev. Microbiol. - 2011. - Vol. 9, №6. - P. 467-477.; Mali P., Yang L., Esvelt K.M. et al. RNA-guided human genome engineering via Cas9 // Science. - 2013. - Vol. 339, №6121. - P. 823-826.; Martinez R.A., Stein J.L., Krostag A.R. et al. Genome engineering of isogenic human ES cells to model autism disorders // Nucleic Acids Res. - 2015. pii: gkv164; Miyaoka Y., Chan A.H., Judge L.M. et al. Isolation of single-base genome-edited human iPS cells without antibiotic selection // Nat. Methods. - 2014. - Vol. 11, №3. - P. 291-293.; Morbitzer R., Romer P., Boch J. et al. Regulation of selected genome loci using de novo-engineered transcription activator-like effector (TALE)-type transcription factors // Proc. Natl. Acad. Sci. USA. - 2010. - Vol. 107, №50. - P. 21617-21622.; Moscou M.J. and Bogdanove A.J. A simple cipher governs DNA recognition by TAL effectors // Science. - 2009. - Vol. 326, №5959. - P. 1501.; Perez E.E., Wang J., Miller J.C. et al. Establishment of HIV-1 resistance in CD4+ T cells by genome editing using zinc-fin-ger nucleases // Nat. Biotechnol. - 2008. - Vol. 26, №7. -P. 808-816.; Ran F.A., Hsu P.D., Lin C.Y. et al. Double nicking by RNA-guided CRISPR Cas9 for enhanced genome editing specificity // Cell. - 2013. - Vol. 154, №6. - P. 1380-1389.; Ran F.A., Hsu P.D., Wright J. et al. Genome engineering using the CRISPR-Cas9 system // Nat. Protoc. - 2013. - Vol. 8, №11. - P. 2281-2308.; Romer P., Hahn S., Jordan T. et al. Plant pathogen recognition mediated by promoter activation of the pepper Bs3 resistance gene // Science. - 2007. - Vol. 318, №5850. - P. 645-648.; Rosen D.R. Mutations in Cu/Zn superoxide dismutase gene are associated with familial amyotrophic lateral sclerosis // Nature. - 1993. - Vol. 364, №6435. - P. 362.; Saleh-Gohari N., Helleday T. Conservative homologous recombination preferentially repairs DNA double-strand breaks in the S phase of the cell cycle in human cells // Nucleic Acids Res. -2004. - Vol. 32, №12. - P. 3683-3688.; Sanjana N.E., Cong L., Zhou Y. et al. A transcription activator-like effector toolbox for genome engineering // Nat. Protoc. — 2012. — Vol. 7, №1. — P. 171—192.; Soldner F., Laganiere J., Cheng A.W. et al. Generation of isogenic pluripotent stem cells differing exclusively at two early onset Parkinson point mutations // Cell. — 2011. — Vol. 146, №2. — P. 318—331.; Wainger B.J., Kiskinis E., Mellin C. et al. Intrinsic membrane hyperexcitability of amyotrophic lateral sclerosis patient-derived motor neurons // Cell Rep. — 2014. — Vol. 7, №1. — P. 1—11.

Διαθεσιμότητα: https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/50
https://doi.org/10.1234/XXXX-XXXX-2015-6-3-9

РОЛЬ ГЕНОВ XRCC1, XRCC3 И PALB2 В ГЕНЕЗЕ СПОРАДИЧЕСКИХ ФОРМ РАКА МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ

Συγγραφείς: КИПЕНЬ ВЯЧЕСЛАВ НИКОЛАЕВИЧ, МЕЛЬНОВ СЕРГЕЙ БОРИСОВИЧ, СМОЛЯКОВА РАИСА МИХАЙЛОВНА

Θεματικοί όροι: РАК МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ,ЭКСЦИЗИОННАЯ РЕПАРАЦИЯ,ГОМОЛОГИЧНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ,ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ,ОТНОШЕНИЕ ШАНСОВ,BREAST CANCER,EXCISION REPAIR,HOMOLOGOUS RECOMBINATION,POLYMERASE CHAIN REACTION,ODDS RATIO

Περιγραφή αρχείου: text/html

Διαθεσιμότητα: http://cyberleninka.ru/article/n/rol-genov-xrcc1-xrcc3-i-palb2-v-geneze-sporadicheskih-form-raka-molochnoy-zhelezy
http://cyberleninka.ru/article_covers/16447166.png

PML-ЗАВИСИМЫЕ МЕХАНИЗМЫ РЕПАРАЦИИ ПОВРЕЖДЕНИЙ ДНК ПЕРСПЕКТИВЫ СОЗДАНИЯ НОВОГО МЕТОДА ЛАБОРАТОРНОЙ ДИАГНОСТИКИ ДЛЯ ОЦЕНКИ ХИМИОИ РАДИОЧУВСТВИТЕЛЬНОСТИ ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫХ НОВООБРАЗОВАНИЙ

Συγγραφείς: Бойчук, С., Джоерап, О.

Θεματικοί όροι: РЕПАРАЦИЯ ПОВРЕЖДЕНИЙ ДНК, ГОМОЛОГИЧНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ, БЕЛОК PML, ХИМИОИ РАДИОЧУВСТВИТЕЛНОСТЬ ОПУХОЛИ, ЛАБОРАТОРНАЯ ДИАГНОСТИКА

Περιγραφή αρχείου: text/html

Διαθεσιμότητα: http://cyberleninka.ru/article/n/pml-zavisimye-mehanizmy-reparatsii-povrezhdeniy-dnk-perspektivy-sozdaniya-novogo-metoda-laboratornoy-diagnostiki-dlya-otsenki-himioi
http://cyberleninka.ru/article_covers/15636154.png

BACILLUS INTERMEDIUS C НОКАУТИРОВАННЫМ ГЕНОМ СУБТИЛИЗИНОПОДОБНОЙ ПРОТЕИНАЗЫ

Συγγραφείς: Тойменцева, Анна, Каримова, Мадина, Ризванов, Альберт, Шагимарданова, Елена, Шарипова, Маргарита

Θεματικοί όροι: СУБТИЛИЗИНОПОДОБНАЯ ПРОТЕИНАЗА, ИНАКТИВАЦИЯ ГЕНА, ГОМОЛОГИЧНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ, СТРЕССЫ

Περιγραφή αρχείου: text/html

Διαθεσιμότητα: http://cyberleninka.ru/article/n/bacillus-intermedius-c-nokautirovannym-genom-subtilizinopodobnoy-proteinazy
http://cyberleninka.ru/article_covers/15097066.png

Роль генов XRCC1, XRCC3 и PALB2 в генезе спорадических форм рака молочной железы

Πηγή: Ecological genetics.

Θεματικοί όροι: РАК МОЛОЧНОЙ ЖЕЛЕЗЫ,ЭКСЦИЗИОННАЯ РЕПАРАЦИЯ,ГОМОЛОГИЧНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ,ПОЛИМЕРАЗНАЯ ЦЕПНАЯ РЕАКЦИЯ,ОТНОШЕНИЕ ШАНСОВ,BREAST CANCER,EXCISION REPAIR,HOMOLOGOUS RECOMBINATION,POLYMERASE CHAIN REACTION,ODDS RATIO, 3. Good health

Περιγραφή αρχείου: text/html

Σύνδεσμος πρόσβασης: http://cyberleninka.ru/article_covers/16447166.png
http://cyberleninka.ru/article/n/rol-genov-xrcc1-xrcc3-i-palb2-v-geneze-sporadicheskih-form-raka-molochnoy-zhelezy

PML-зависимые механизмы репарации повреждений дНк перспективы создания нового метода лабораторной диагностики для оценки химиои радиочувствительности злокачественных новообразований

Πηγή: Практическая медицина.

Θεματικοί όροι: РЕПАРАЦИЯ ПОВРЕЖДЕНИЙ ДНК, ГОМОЛОГИЧНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ, БЕЛОК PML, ХИМИОИ РАДИОЧУВСТВИТЕЛНОСТЬ ОПУХОЛИ, ЛАБОРАТОРНАЯ ДИАГНОСТИКА, 3. Good health

Περιγραφή αρχείου: text/html

Σύνδεσμος πρόσβασης: http://cyberleninka.ru/article_covers/15636154.png
http://cyberleninka.ru/article/n/pml-zavisimye-mehanizmy-reparatsii-povrezhdeniy-dnk-perspektivy-sozdaniya-novogo-metoda-laboratornoy-diagnostiki-dlya-otsenki-himioi

Bacillus intermedius c нокаутированным геном субтилизиноподобной протеиназы

Πηγή: Ученые записки Казанского университета. Серия Естественные науки.

Θεματικοί όροι: СУБТИЛИЗИНОПОДОБНАЯ ПРОТЕИНАЗА, ИНАКТИВАЦИЯ ГЕНА, ГОМОЛОГИЧНАЯ РЕКОМБИНАЦИЯ, СТРЕССЫ

Περιγραφή αρχείου: text/html

Σύνδεσμος πρόσβασης: http://cyberleninka.ru/article/n/bacillus-intermedius-c-nokautirovannym-genom-subtilizinopodobnoy-proteinazy
http://cyberleninka.ru/article_covers/15097066.png