Генетическая структура и дифференциация популяций Quercus frainetto (Quercus, Fagaceae) на Балканах, изученная различными типами генетических маркеров

Subject Terms: популяционно-генетическая структура, хлоропластная ДНК, ядерные микросателлитные локусы, филогеография

Генетическая структура и дифференциация популяций Quercus frainetto (Quercus, Fagaceae) на Балканах, изученная различными типами генетических маркеров

Subject Terms: популяционно-генетическая структура, хлоропластная ДНК, ядерные микросателлитные локусы, филогеография

Аллельный полиморфизм SSR-маркеров у клонов сосны обыкновенной, используемых для создания ЛСП II порядка

Subject Terms: аллельный полиморфизм, SSR-локусы сосны обыкновенной, генетические маркеры, лесная селекция, лесосеменные плантации, постоянная лесосеменная база, ядерные микросателлитные локусы

File Description: application/pdf

Access URL: https://elib.belstu.by/handle/123456789/47646

Assessment of genetic diversity of some Siberian and Far Eastern species of the genus Spiraea (Rosaceae) by newly developed multiplex panels of nuclear SSR loci ; Оценка генетического разнообразия некоторых сибирских и дальне восточных видов рода Spiraea (Rosaceae) на основе разработанных мультиплексных панелей из ядерных микросателлитных локусов

Authors: T. A. Poliakova, A. V. Shatokhina, G. N. Bondarenko, D. V. Politov, Т. А. Полякова, А. В. Шатохина, Г. Н. Бондаренко, Д. В. Политов

Source: Vavilov Journal of Genetics and Breeding; Том 22, № 6 (2018); 654-659 ; Вавиловский журнал генетики и селекции; Том 22, № 6 (2018); 654-659 ; 2500-3259

Subject Terms: популяционная структура, Spiraea f lexuosa, Spiraea chamaedryfolia, nuclear microsatellite loci, SSR, multiplex panels, genetic variability, population structure, ядерные микросателлитные локусы, мультиплексные панели, генетическая изменчивость

File Description: application/pdf

Relation: https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/1649/1114; Ashizawa K., Kimura M.K., Takahashi A., Lian Ch., Kuramoto N. Development of microsatellite markers in a riparian shrub, Spiraea thunbergii (Rosaceae). Am. J. Bot. 2012;99(7):e283­e285. DOI 10.3732/ajb.1100587.; Brzyski J.R. Isolation and characterization of microsatellite markers in the rare clonal plant, Spiraea virginiana (Rosaceae). Am. J. Bot. 2010;97:e20­e22. DOI 10.3732/ajb.1000008.; Doyle J.J., Doyle J.L. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus. 1990;12:12­15. Earl D.A., von Holdt B.M. STRUCTURE HARVESTER: a website and program for visualizing STRUCTURE output and implementing the Evanno method. Conserv. Genet. Resour. 2012;4:359­361. DOI 10.1007/s12686­011­9548­7.; Evanno G., Regnaut S., Goudet J. Detecting the number of clusters of individuals using the software STRUCTURE: a simulation study. Mol. Ecol. 2005;14:2611­2620. DOI 10.1111/j.1365­294X.2005.02553.x.; Huh M.K. Genetic diversity and population structure of Spiraea prunifolia for. simpliciflora by inter­simple sequence repeats. J. Life Sci. 2009;19,9:1183­1189.; Jakobsson M., Rosenberg N.A. CLUMPP: a cluster matching and permutation program for dealing with label switching and multimodality in analysis of population structure. Bioinformatics. 2007;23(14): 1801­1806. DOI 10.1093/bioinformatics/btm233.; Khan G., Zhang F., Gao Q., Jiao X., Fu P., Xing R., Zhang J., Chen S. Isolation of 16 microsatellite markers for Spiraea alpina and S. mongolica (Rosaceae) of the Qinghai­Tibet Plateau. Appl. Plant Sci. 2014;2(1):e1­e4. DOI 10.3732/apps.1300059.; Peakall R., Smouse P.E. GenAlEx 6.5: genetic analysis in Excel. Population genetic software for teaching and research­an update. Bioinformatics. 2012;28:2537­2539. http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/28/19/2537.; Pojarkova A.I. Spiraeoideae Agardh. Flora of SSSR. Ed. V.L. Komarov. Moscow; Saint­Petersburg: Academy of Sciences of USSR Publ. 1939;9:279­318.; Polyakova T.A. Vnutrividovaya izmenchivost’ dal’nevostochnyh i sibirskih vidov roda Spiraea L. Novosibirsk, 2004. (in Russian); Pritchard J.K., Stephens M., Donnelly P. Inference of population structure using multilocus genotype data. Genetics. 2000;155:945­959.; Rosenberg N.A. DISTRUCT: a program for the graphical display of population structure. Publishers of Center for Computational Medicine and Biology. Department of Human Genetics. University of Michigan, 2007. http://rosenberglab.bioinformatics.med.umich.edu/distruct.html.; Van Oosterhout C., Hutchinson W.F., Wills D.P.M., Shipley P. Microchecker: software for identifying and correcting genotyping errors in microsatellite data. Mol. Ecol. Notes. 2004;4:535­538. DOI 10.1111/j.1471­8286.2004.00684.x.; Yeh F.C., Yang R.C., Boyle T. POPGENE Version 1.31. Microsoft Window­based freeware for population genetic analysis. 1999; available at http://www.ualberta.ca/~fyeh/index.htm.; Zhang F.­Q., Gao Q.­B., Zhang D.­J., Duan Y.­Z., Li Y.­H., Fu P.­ C., Xing R., Gulzar K., Chen S.­L. Phylogeography of Spiraea alpina in the Qinghai­Tibetan Plateau inferred from chloroplast DNA sequence variations. J. Syst. Evol. 2012;50(4):276­283. DOI 10.1111/j.1759­6831.2012.00194.x.; https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/1649

Availability: https://vavilov.elpub.ru/jour/article/view/1649
https://doi.org/10.18699/VJ18.407

Аллельный полиморфизм SSR-маркеров у клонов сосны обыкновенной, используемых для создания ЛСП II порядка

Authors: Падутов, А. В., Балюцкас, В. М.

Subject Terms: лесная селекция, лесосеменные плантации, постоянная лесосеменная база, генетические маркеры, ядерные микросателлитные локусы, аллельный полиморфизм, SSR-локусы сосны обыкновенной

File Description: application/pdf

Relation: https://elib.belstu.by/handle/123456789/47646; 630*165:582.475.4

Availability: https://elib.belstu.by/handle/123456789/47646