AutoClassWeb: a simple web interface for Bayesian clustering of omics data

Συγγραφείς: Poulain, Pierre, Camadro, Jean-Michel

Συνεισφορές: Institut Jacques Monod (IJM (UMR_7592)), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris Cité (UPCité)

Πηγή: ISSN: 1756-0500 ; BMC Research Notes ; https://hal.science/hal-03858142 ; BMC Research Notes, 2022, 15 (1), pp.241. ⟨10.1186/s13104-022-06129-6⟩.

Θεματικοί όροι: Autoclass, Bayesian, Clustering, Genomics, Machine learning, Proteomics, MESH: Bayes theorem, MESH: Cluster Analysis, MESH: Genomics, MESH: Programming Languages, MESH: Software, [SDV]Life Sciences [q-bio]

Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/35799281; PUBMED: 35799281; PUBMEDCENTRAL: PMC9264669

Διαθεσιμότητα: https://hal.science/hal-03858142
https://hal.science/hal-03858142v1/document
https://hal.science/hal-03858142v1/file/13104_2022_Article_6129-1.pdf
https://doi.org/10.1186/s13104-022-06129-6

The SONATA data format for efficient description of large-scale network models

Συγγραφείς: Dai, Kael, Hernando, Juan, Billeh, Yazan, Gratiy, Sergey, Planas, Judit, Davison, Andrew P., Dura-Bernal, Salvador, Gleeson, Padraig, Devresse, Adrien, Dichter, Benjamin, Gevaert, Michael, King, James, van Geit, Werner A. H., Povolotsky, Arseny, Muller, Eilif, Courcol, Jean-Denis, Arkhipov, Anton

Συνεισφορές: Allen Institute for Brain Science Seattle, WA, USA, Ecole Polytechnique Fédérale de Lausanne (EPFL), Institut des Neurosciences Paris-Saclay (NeuroPSI), Université Paris-Saclay-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), SUNY Downstate Medical Center, State University of New York (SUNY), Nathan S. Kline Institute for Psychiatric Research (NKI), New York State Office of Mental Health, Department of Neuroscience, Physiology & Pharmacology, University College of London London (UCL), Department of Neurosurgery Stanford, Stanford Medicine, Stanford University-Stanford University, Biological Systems and Engineering

Πηγή: ISSN: 1553-734X.

Θεματικοί όροι: MESH: Algorithms, MESH: Brain, MESH: Software, MESH: Brain Mapping, MESH: Computational Biology, MESH: Computer Simulation, MESH: Databases, Factual, MESH: Humans, MESH: Models, Neurological, MESH: Neurons, MESH: Neurosciences, MESH: Programming Languages, MESH: Reproducibility of Results, [SDV.NEU.NB]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Neurobiology, [SDV.NEU.PC]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Psychology and behavior, [SDV.NEU.SC]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]/Cognitive Sciences

Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/32092054; PUBMED: 32092054; PUBMEDCENTRAL: PMC7058350

Διαθεσιμότητα: https://hal.science/hal-02913116
https://hal.science/hal-02913116v1/document
https://hal.science/hal-02913116v1/file/journal.pcbi.1007696%20%281%29.pdf
https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007696

Continuous Photobleaching in Vesicles and Living Cells: A Measure of Diffusion and Compartmentation

Συγγραφείς: Delon, A., Usson, Yves, Derouard, J., Biben, T., Souchier, C.

Συνεισφορές: Laboratoire de Spectrométrie Physique (LSP), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), RFMQ, Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble - UMR 5525 (TIMC-IMAG), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Stress et Dynamique Organisation du Génome, Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)

Πηγή: Biophysical Journal. 90:2548-2562

Θεματικοί όροι: 0301 basic medicine, MESH: Photons, Light, [SDV.IB.IMA]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering/Imaging, Diffusion, Computer-Assisted, Theoretical, MESH: Models, Image Processing, Computer-Assisted, MESH: Dextrans, 0303 health sciences, Microscopy, Confocal, Photobleaching, MESH: Diffusion, Dextrans, Statistical, MESH: Reproducibility of Results, Confocal, MESH: Permeability, MESH: Programming Languages, MESH: Photobleaching, Fluorescein-5-isothiocyanate, Fluorescence Recovery After Photobleaching, MESH: Microscopy, Green Fluorescent Proteins, Biophysics, Fluorescence, Permeability, MESH: Software, MESH: Fluorescein-5-isothiocyanate, 03 medical and health sciences, MESH: Green Fluorescent Proteins, MESH: Computer Simulation, Humans, Computer Simulation, MESH: Biophysics, Photons, MESH: Humans, Models, Statistical, MESH: Time Factors, Reproducibility of Results, Models, Theoretical, MESH: Light, MESH: Hela Cells, MESH: Image Processing, Microscopy, Fluorescence, Programming Languages, MESH: Fluorescence Recovery After Photobleaching, HeLa Cells

Σύνδεσμος πρόσβασης: http://www.cell.com/article/S0006349506724365/pdf
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16428281
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0006349506724365
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0006349506724365
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0006349506724365#!
https://www.cell.com/biophysj/references/S0006-3495(06)72436-5
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16428281
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16428281/

Structured Representation of the Pharmacodynamics Section of the Summary of Product Characteristics for Antibiotics: Application for Automated Extraction and Visualization of Their Antimicrobial Activity Spectra

Συγγραφείς: Duclos, Catherine, Cartolano, Gian Luigi, Ghez, Michael, Venot, Alain

Συνεισφορές: duclos, catherine, Laboratoire d'Informatique Médicale et de BIOinformatique (LIM&BIO), Université Paris 13 (UP13)

Πηγή: Journal of the American Medical Informatics Association. 11:285-293

Θεματικοί όροι: MESH: Terminology as Topic, MESH: Pharmacopoeias as Topic, 02 engineering and technology, 03 medical and health sciences, 0302 clinical medicine, Theoretical, Artificial Intelligence, MESH: Anti-Bacterial Agents, Terminology as Topic, MESH: Models, Drug Resistance, Bacterial, MESH: United States, 0202 electrical engineering, electronic engineering, information engineering, MESH: Artificial Intelligence, Humans, Pharmacopoeias as Topic, MESH: Humans, Bacteria, Bacterial, Models, Theoretical, United States, Anti-Bacterial Agents, 3. Good health, Europe, MESH: Bacteria, [SDV.SPEE] Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, MESH: Drug Resistance, MESH: Programming Languages, [SDV.SPEE]Life Sciences [q-bio]/Santé publique et épidémiologie, Programming Languages, MESH: Europe

Σύνδεσμος πρόσβασης: https://academic.oup.com/jamia/article-pdf/11/4/285/2969974/11-4-285.pdf
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15064283

PyMedTermino: an open-source generic API for advanced terminology services

Συγγραφείς: Lamy, Jean-Baptiste, Venot, Alain, Duclos, Catherine

Συνεισφορές: Tannier, Xavier, Laboratoire d'Informatique Médicale et Ingénierie des Connaissances en e-Santé (LIMICS), Université Paris 13 (UP13)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)

Θεματικοί όροι: MESH: Terminology as Topic, Translating, [INFO.INFO-CL]Computer Science [cs]/Computation and Language [cs.CL], Systems Integration, MESH: Medical Informatics, MESH: Software, Vocabulary, Controlled, [INFO.INFO-CL] Computer Science [cs]/Computation and Language [cs.CL], Terminology as Topic, MESH: Programming Languages, Programming Languages, MESH: Vocabulary, MESH: Systems Integration, MESH: Translating, Controlled, Medical Informatics, Software

Σύνδεσμος πρόσβασης: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25991291
https://hal.science/hal-03650024v1
https://dblp.uni-trier.de/db/conf/mie/mie2015.html#LamyVD15
http://person.hst.aau.dk/ska/MIE2015/Papers/SHTI210-0924.pdf
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25991291
https://doi.org/10.3233/978-1-61499-512-8-924
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25991291/
https://person.hst.aau.dk/ska/MIE2015/Papers/SHTI210-0924.pdf

CDModelTree (V1): Manipulation of a cyclodextrin-ferrociphenol supramolecular models database using a PHP web application ; CDModelTree (V1): Manipulation d'une base de données contenant des modèles supramoléculaires d'inclusion d'un ferrociphénol dans des cyclodextrines par une application web en PHP

Συγγραφείς: Pigeon, Pascal

Συνεισφορές: Institut Parisien de Chimie Moléculaire (IPCM), Chimie Moléculaire de Paris Centre (FR 2769), École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Ecole Superieure de Physique et de Chimie Industrielles de la Ville de Paris (ESPCI Paris), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-École normale supérieure - Paris (ENS-PSL), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Chemical Biology (CHEMBIO), Université Paris Sciences et Lettres (PSL)-Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Sorbonne Université (SU)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Chimie Moléculaire de Paris Centre (FR 2769), Ecole Nationale Supérieure de Chimie de Paris - Chimie ParisTech-PSL (ENSCP), Université Paris Sciences et Lettres (PSL), IPCM UMR8232, Sorbonne Université, ENSCP, PSL

Πηγή: https://hal.science/hal-03991394 ; 2022, ⟨swh:1:dir:5c05be4fc1a1a2d4ca16bc48323231bb28379dec;origin=https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-03991394.

Θεματικοί όροι: modelling, PHP, web application, XAMPP, cyclodextrin, ferrociphenol, supramolecular, MESH: Drug Compounding, MESH: Programming Languages, MESH: Software, JEL: C - Mathematical and Quantitative Methods/C.C6 - Mathematical Methods • Programming Models • Mathematical and Simulation Modeling/C.C6.C63 - Computational Techniques • Simulation Modeling, JEL: C - Mathematical and Quantitative Methods/C.C8 - Data Collection and Data Estimation Methodology • Computer Programs/C.C8.C88 - Other Computer Software, [CHIM]Chemical Sciences, [CHIM.CHEM]Chemical Sciences/Cheminformatics, [CHIM.THEO]Chemical Sciences/Theoretical and/or physical chemistry, [CHIM.THER]Chemical Sciences/Medicinal Chemistry

Relation: https://hal.science/hal-04176438v1; https://doi.org/10.3390/ijms241512288

Διαθεσιμότητα: https://hal.science/hal-03991394
https://hal.science/hal-03991394v1/document
https://hal.science/hal-03991394v1/file/CDModelTree-V1.zip

Estimating the similarity of alternative Affymetrix probe sets using transcriptional networks

Συγγραφείς: Bellis, Michel

Συνεισφορές: Centre de recherche en Biologie Cellulaire (CRBM), Université de Montpellier (UM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Πηγή: ISSN: 1756-0500 ; BMC Research Notes ; https://hal.science/hal-03599451 ; BMC Research Notes, 2013, 6 (1), pp.107. ⟨10.1186/1756-0500-6-107⟩.

Θεματικοί όροι: MESH: Algorithms, MESH: Animals, MESH: Rats, MESH: Reproducibility of Results, MESH: Cluster Analysis, MESH: Computational Biology, MESH: Exons, MESH: Gene Expression Profiling, MESH: Gene Regulatory Networks, MESH: Humans, MESH: Mice, MESH: Oligonucleotide Array Sequence Analysis, MESH: Oligonucleotide Probes, MESH: Probability, MESH: Programming Languages, [SDV]Life Sciences [q-bio]

Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/23517579; hal-03599451; https://hal.science/hal-03599451; https://hal.science/hal-03599451/document; https://hal.science/hal-03599451/file/1756-0500-6-107.pdf; PUBMED: 23517579; PUBMEDCENTRAL: PMC3630002

Διαθεσιμότητα: https://hal.science/hal-03599451
https://hal.science/hal-03599451/document
https://hal.science/hal-03599451/file/1756-0500-6-107.pdf
https://doi.org/10.1186/1756-0500-6-107

Using an Iconic Language to Improve Access to Electronic Medical Records in General Medicine

Συγγραφείς: Simon, Christian, Hassler, Sylvain, Beuscart-Zephir, Marie-Catherine, Favre, Madeleine, Venot, Alain, Duclos, Catherine, Lamy, Jean-Baptiste

Συνεισφορές: Tannier, Xavier, Laboratoire d'Informatique Médicale et Ingénierie des Connaissances en e-Santé (LIMICS), Université Paris 13 (UP13)-Université Pierre et Marie Curie - Paris 6 (UPMC)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)

Θεματικοί όροι: Symbolism, MESH: Data Mining, General Practice, [INFO.INFO-CL]Computer Science [cs]/Computation and Language [cs.CL], MESH: France, MESH: Software, User-Computer Interface, [INFO.INFO-CL] Computer Science [cs]/Computation and Language [cs.CL], MESH: General Practice, MESH: Programming Languages, Computer Graphics, Data Mining, Electronic Health Records, Programming Languages, MESH: Symbolism, France, MESH: Computer Graphics, MESH: Electronic Health Records, Software, MESH: User-Computer Interface

Σύνδεσμος πρόσβασης: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25160201
https://hal.science/hal-03650028v1

Creating a magnetic resonance imaging ontology.

Συγγραφείς: Lasbleiz, Jérémy, Saint-Jalmes, Hervé, Duvauferrier, Régis, Burgun, Anita

Συνεισφορές: Modélisation Conceptuelle des Connaissances Biomédicales, Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Structure Fédérative de Recherche en Biologie et Santé de Rennes (Biosit : Biologie - Santé - Innovation Technologique), Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image (LTSI), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)

Πηγή: ISSN: 0926-9630.

Θεματικοί όροι: MRI, MRI Simulator, OWL, ontology, MESH: Algorithms, MESH: Computer Communication Networks, MESH: Software, MESH: Systems Integration, MESH: User-Computer Interface, MESH: Computer Graphics, MESH: Computer Simulation, MESH: Data Display, MESH: Diagnostic Imaging, MESH: Humans, MESH: Magnetic Resonance Imaging, MESH: Programming Languages, MESH: Radiology Information Systems, [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering

Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/21893854; PUBMED: 21893854

Διαθεσιμότητα: https://inserm.hal.science/inserm-00664038
https://inserm.hal.science/inserm-00664038v1/document
https://inserm.hal.science/inserm-00664038v1/file/Creating_a_magnetic_resonance_imaging_ontology2011.pdf
https://inserm.hal.science/inserm-00664038v1/file/inserm-00664038_edited.pdf

Numeric and symbolic knowledge representation of cerebral cortex anatomy: methods and preliminary results.

Συγγραφείς: Dameron, Olivier, Gibaud, Bernard, Morandi, Xavier

Συνεισφορές: Laboratoire d'Informatique Médicale (LIM), Université de Rennes (UR), Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire d'Anatomie et d'Organogenèse

Πηγή: ISSN: 0930-1038.

Θεματικοί όροι: Brain atlas, Neuroanatomy, Ontology, Sulcus, Visualization, Computer-aided surgery, MESH: Cerebral Cortex, MESH: Databases, MESH: Terminology, MESH: Humans, MESH: Hypermedia, MESH: Imaging, Three-Dimensional, MESH: Language, MESH: Magnetic Resonance Imaging, MESH: Medical Illustration, MESH: Neuroanatomy, MESH: Programming Languages, [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering

Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/15118839; PUBMED: 15118839

Διαθεσιμότητα: https://inserm.hal.science/inserm-00152193
https://inserm.hal.science/inserm-00152193/document
https://inserm.hal.science/inserm-00152193/file/sra04.pdf
https://doi.org/10.1007/s00276-003-0204-0

WellReader: a MATLAB program for the analysis of fluorescence and luminescence reporter gene data

Συγγραφείς: Boyer, Frédéric, Besson, Bruno, Baptist, Guillaume, Izard, Jérôme, Pinel, Corinne, Ropers, Delphine, Geiselmann, Johannes, de Jong, Hidde

Συνεισφορές: Gagnon, Jean, Modeling, simulation, measurement, and control of bacterial regulatory networks (IBIS), Laboratoire Adaptation et pathogénie des micro-organismes Grenoble (LAPM), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre Inria de l'Université Grenoble Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut Jean Roget, Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Inria Grenoble - Rhône-Alpes

Πηγή: Bioinformatics. 26:1262-1263

Θεματικοί όροι: 0301 basic medicine, Luminescence, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, 0206 medical engineering, MESH: Algorithms, 02 engineering and technology, MESH: Software, MESH: Gene Expression Profiling, 03 medical and health sciences, Genes, Reporter, [SDV.BBM] Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology, Computer Graphics, Reporter, Molecular Biology, Fluorescent Dyes, Oligonucleotide Array Sequence Analysis, MESH: Luminescence, Gene Expression Profiling, Computational Biology, MESH: Fluorescent Dyes, MESH: Gene Expression Regulation, MESH: Genes, Gene Expression Regulation, MESH: Oligonucleotide Array Sequence Analysis, MESH: Programming Languages, Programming Languages, MESH: Computer Graphics, Algorithms, Software, MESH: Computational Biology

Σύνδεσμος πρόσβασης: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/20097915
https://academic.oup.com/bioinformatics/article/26/9/1262/199010
https://dblp.uni-trier.de/db/journals/bioinformatics/bioinformatics26.html#BoyerBBIPRGJ10
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20097915
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00562237
https://paperity.org/p/41700411/wellreader-a-matlab-program-for-the-analysis-of-fluorescence-and-luminescence-reporter

apTreeshape: statistical analysis of phylogenetic tree shape

Συγγραφείς: Bortolussi, Nicolas, Durand, Eric, Blum, Michael, François, Olivier

Συνεισφορές: Francois, Olivier, TIMB, Institut de Chimie de la Matière Condensée de Bordeaux (ICMCB), Université de Bordeaux (UB)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Bordeaux (UB)-Institut Polytechnique de Bordeaux-Institut de Chimie - CNRS Chimie (INC-CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble - UMR 5525 (TIMC-IMAG), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Unite de recherche en résonance magnétique médicale (U2R2M), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Bicêtre AP-HP, Le Kremlin-Bicêtre, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Hôpital Bicêtre AP-HP, Le Kremlin-Bicêtre, Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Assistance publique - Hôpitaux de Paris (AP-HP) (AP-HP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Techniques de l'Ingénierie Médicale et de la Complexité - Informatique, Mathématiques et Applications, Grenoble - UMR 5525 (TIMC-IMAG), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecologie Systématique et Evolution (ESE), Ecole Nationale du Génie Rural, des Eaux et des Forêts (ENGREF)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ecole Nationale du Génie Rural, des Eaux et des Forêts (ENGREF)-Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Modelling and Inference of Complex and Structured Stochastic Systems ?-2006 (MISTIS ?-2006 ), Centre Inria de l'Université Grenoble Alpes, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria), Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Joseph Fourier - Grenoble 1 (UJF)-Institut polytechnique de Grenoble - Grenoble Institute of Technology (Grenoble INP)-VetAgro Sup - Institut national d'enseignement supérieur et de recherche en alimentation, santé animale, sciences agronomiques et de l'environnement (VAS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Πηγή: Bioinformatics. 22:363-364

Θεματικοί όροι: 0301 basic medicine, MESH: Pedigree, Population, MESH: Algorithms, MESH: Databases, MESH: Genetics, MESH: Software, 03 medical and health sciences, MESH: Computer Simulation, Genetic, MESH: Evolution, MESH: Models, Databases, Genetic, Computer Simulation, MESH: Phylogeny, Phylogeny, 0303 health sciences, MESH: Data Interpretation, [SDV.GEN.GPO]Life Sciences [q-bio]/Genetics/Populations and Evolution [q-bio.PE], Models, Statistical, Models, Genetic, Statistical, Biological Evolution, Pedigree, Genetics, Population, Data Interpretation, Statistical, MESH: Programming Languages, [SDV.GEN.GPO] Life Sciences [q-bio]/Genetics/Populations and Evolution [q-bio.PE], Programming Languages, Algorithms, Software

Σύνδεσμος πρόσβασης: https://academic.oup.com/bioinformatics/article-pdf/22/3/363/588030/bti798.pdf
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16322049
https://hal.science/hal-00370265v1
https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bti798
https://europepmc.org/article/MED/16322049
http://membres-timc.imag.fr/Michael.Blum/publications/bioinfo.pdf
https://hal.inria.fr/hal-00370265/
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/16322049/
https://dblp.uni-trier.de/db/journals/bioinformatics/bioinformatics22.html#BortolussiDBF06
https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00370265

DVV: a taxonomy for mixed reality visualization in image guided surgery.

Συγγραφείς: Kersten-Oertel, Marta, Jannin, Pierre, Collins, D Louis

Συνεισφορές: McConnell Brain Imaging Centre (MNI), Montreal Neurological Institute and Hospital, McGill University = Université McGill Montréal, Canada -McGill University = Université McGill Montréal, Canada, Vision, Action et Gestion d'informations en Santé (VisAGeS), Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-SIGNAUX ET IMAGES NUMÉRIQUES, ROBOTIQUE (IRISA-D5), Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Rennes (UR)-Institut National des Sciences Appliquées - Rennes (INSA Rennes), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique (Inria)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche en Informatique et Systèmes Aléatoires (IRISA), Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Institut National des Sciences Appliquées (INSA)-Université de Bretagne Sud (UBS)-École normale supérieure - Rennes (ENS Rennes)-Télécom Bretagne-CentraleSupélec-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Traitement du Signal et de l'Image (LTSI), Université de Rennes (UR)-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)

Πηγή: ISSN: 1077-2626 ; IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics ; https://hal.science/hal-00904865 ; IEEE Transactions on Visualization and Computer Graphics, 2012, 18 (2), pp.332-52. ⟨10.1109/TVCG.2011.50⟩.

Θεματικοί όροι: MESH: Classification, MESH: Computer Graphics, MESH: Humans, MESH: Image Processing, Computer-Assisted, MESH: Models, Theoretical, MESH: Programming Languages, MESH: Reproducibility of Results, MESH: Surgery, MESH: Terminology as Topic, MESH: User-Computer Interface, [SDV.IB]Life Sciences [q-bio]/Bioengineering

Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/21383411; PUBMED: 21383411

Διαθεσιμότητα: https://hal.science/hal-00904865
https://doi.org/10.1109/TVCG.2011.50

Collaborative modelling: the future of computational neuroscience?

Συγγραφείς: Davison, Andrew P.

Συνεισφορές: Unité de Neurosciences Information et Complexité Gif sur Yvette (UNIC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Neurobiologie Alfred Fessard (INAF)

Πηγή: ISSN: 0954-898X ; EISSN: 1361-6536.

Θεματικοί όροι: MESH: Animals, MESH: Computer Simulation, MESH: Software, MESH: Systems Biology, MESH: Cooperative Behavior, MESH: Humans, MESH: Information Dissemination, MESH: Models, Neurological, MESH: Nerve Net, MESH: Neurosciences, MESH: Programming Languages, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]

Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/22994605; hal-01055579; https://hal.science/hal-01055579; PUBMED: 22994605

Διαθεσιμότητα: https://hal.science/hal-01055579
https://doi.org/10.3109/0954898X.2012.718482

Creating, documenting and sharing network models.

Συγγραφείς: Crook, Sharon M., Bednar, James A, Berger, Sandra, Cannon, Robert, Davison, Andrew P., Djurfeldt, Mikael, Eppler, Jochen, Kriener, Birgit, Furber, Steve, Graham, Bruce, Plesser, Hans E, Schwabe, Lars, Smith, Leslie, Steuber, Volker, Van Albada, Sacha

Συνεισφορές: School of Mathematical and Statistical Sciences, Arizona State University Tempe (ASU), School of Life Sciences, School of Informatics, University of Edinburgh, Unité de Neurosciences Information et Complexité Gif sur Yvette (UNIC), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Institut de Neurobiologie Alfred Fessard (INAF), PDC Center for High-Performance Computing, International Neuroinformatics Coordinating Facility-Royal Institute of Technology Stockholm (KTH )

Πηγή: ISSN: 0954-898X ; EISSN: 1361-6536.

Θεματικοί όροι: MESH: Animals, MESH: Computer Simulation, MESH: Documentation, MESH: Humans, MESH: Information Dissemination, MESH: Models, Neurological, MESH: Nerve Net, MESH: Programming Languages, MESH: Software, MESH: Terminology as Topic, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]

Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/22994683; hal-01055577; https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01055577; PUBMED: 22994683

Διαθεσιμότητα: https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01055577
https://doi.org/10.3109/0954898X.2012.722743

EuroPhenome: a repository for high-throughput mouse phenotyping data.

Συγγραφείς: Morgan, Hugh, Beck, Tim, Blake, Andrew, Gates, Hilary, Adams, Niels, Debouzy, Guillaume, Leblanc, Sophie, Lengger, Christoph, Maier, Holger, Melvin, David, Meziane, Hamid, Richardson, Dave, Wells, Sara, White, Jacqui, Wood, Joe, F Ruberte J Ferre T Pujol A Otaegui P Franckhauser S Marvel J Queste V Dacquin R Djebali S Jurdic P Kollias G Chandras C Douni E Aidinis V Barbacid M Cañamero M Dubus P Balling R Hauser H Pasche B Müller W Lengeling A Tocchini-Valentini G Mandillo S Golin, Bosch, De Angelis, Martin Hrabé, Brown, Steve D M, Hancock, John M, Mallon, Ann-Marie

Συνεισφορές: GSF research center, Institute of Experimental Genetis

Πηγή: ISSN: 0305-1048.

Θεματικοί όροι: MESH: Animals, MESH: Computational Biology, MESH: Phenotype, MESH: Programming Languages, MESH: Protein Structure, Tertiary, MESH: Software, MESH: Databases, Genetic, Protein, MESH: Information Storage and Retrieval, MESH: Internet, MESH: Mice, Inbred C57BL, Inbred Strains, Knockout, [SDV.IMM]Life Sciences [q-bio]/Immunology

Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/19933761; hal-00591616; https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00591616; PUBMED: 19933761

Διαθεσιμότητα: https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00591616
https://doi.org/10.1093/nar/gkp1007

Biskit--a software platform for structural bioinformatics.

Συγγραφείς: Grünberg, Raik, Nilges, Michael, Leckner, Johan

Συνεισφορές: Center for Genomic Regulation (CRG-UPF), Centro de Investigación Biomédica en Red de Epidemiología y Salud Pública = Consortium for Biomedical Research of Epidemiology and Public Health (CIBERESP), Bioinformatique Structurale, Institut Pasteur Paris (IP)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Göteborgs Universitet = University of Gothenburg (GU), J.L. and R.G. were supported by fellowships from the Knut and Alice Wallenberg Foundation and the Boehringer Ingelheim Fonds, respectively. We thank Wolfgang Rieping, Michael Habeck, Olivier Perrin and David Giganti for discussions and code contributions

Πηγή: ISSN: 1367-4803.

Θεματικοί όροι: MESH: Computational Biology, MESH: Computer Graphics, MESH: Sequence Analysis, Protein, MESH: Software, MESH: Structure-Activity Relationship, MESH: User-Computer Interface, MESH: Computer Simulation, MESH: Database Management Systems, MESH: Databases, MESH: Information Storage and Retrieval, MESH: Models, Chemical, MESH: Programming Languages, MESH: Protein Interaction Mapping, MESH: Proteins, [SDV.BIBS]Life Sciences [q-bio]/Quantitative Methods [q-bio.QM]

Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/17237072; PUBMED: 17237072

Διαθεσιμότητα: https://pasteur.hal.science/pasteur-01570137
https://pasteur.hal.science/pasteur-01570137v1/document
https://pasteur.hal.science/pasteur-01570137v1/file/75%20NILGES.pdf
https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btl655

Clustal W and Clustal X version 2.0.

Συγγραφείς: Larkin, M. A., Blackshields, G., Brown, N. P., Chenna, R., McGettigan, P. A., McWilliam, H., Valentin, F., Wallace, I. M., Wilm, A., Thompson, J. D., Gibson, T. J., Higgins, D. G.

Συνεισφορές: Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Πηγή: ISSN: 1367-4803.

Θεματικοί όροι: MESH: Algorithms, MESH: Amino Acid Sequence, MESH: Cluster Analysis, MESH: Computer Graphics, MESH: Molecular Sequence Data, MESH: Programming Languages, MESH: Sequence Alignment, MESH: Sequence Analysis, Protein, MESH: Software, MESH: User-Computer Interface, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology

Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/17846036; hal-00206210; https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00206210; PUBMED: 17846036

Διαθεσιμότητα: https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00206210
https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btm404

Klusters, NeuroScope, NDManager: a free software suite for neurophysiological data processing and visualization.

Συγγραφείς: Hazan, Lynn, Zugaro, Michaël, Buzsáki, György

Συνεισφορές: CMBN, Rutgers, The State University of New Jersey New Brunswick (RU), Rutgers University System (Rutgers)-Rutgers University System (Rutgers), Laboratoire de Physiologie de la Perception et de l'Action (LPPA), Collège de France (CdF (institution))-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), National Institutes of Health (NS34994, NS43157, MH54671) International Human Frontiers Science Program Organization (LTF)

Πηγή: ISSN: 0165-0270 ; Journal of Neuroscience Methods ; https://hal.science/hal-00599387 ; Journal of Neuroscience Methods, 2006, 155 (2), pp.207-16. ⟨10.1016/j.jneumeth.2006.01.017⟩.

Θεματικοί όροι: MESH: Animals, MESH: Automatic Data Processing, MESH: Cluster Analysis, MESH: Computer Graphics, MESH: Humans, MESH: Neurophysiology, MESH: Programming Languages, MESH: User-Computer Interface, [SDV.NEU]Life Sciences [q-bio]/Neurons and Cognition [q-bio.NC]

Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/16580733; PUBMED: 16580733

Διαθεσιμότητα: https://hal.science/hal-00599387
https://doi.org/10.1016/j.jneumeth.2006.01.017

MACSIMS: multiple alignment of complete sequences information management system.

Συγγραφείς: Thompson, Julie D, Muller, Arnaud, Waterhouse, Andrew, Procter, Jim, Barton, Geoffrey J, Plewniak, Frédéric, Poch, Olivier

Συνεισφορές: Institut de génétique et biologie moléculaire et cellulaire (IGBMC), Université Louis Pasteur - Strasbourg I-Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (INSERM)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)

Πηγή: ISSN: 1471-2105 ; BMC Bioinformatics ; https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00188166 ; BMC Bioinformatics, BioMed Central, 2006, 7, pp.318. ⟨10.1186/1471-2105-7-318⟩.

Θεματικοί όροι: MESH: Algorithms, MESH: Animals, MESH: Proteomics, MESH: Reproducibility of Results, MESH: Sequence Analysis, Protein, MESH: Software, MESH: Computational Biology, MESH: Databases, MESH: Evolution, Molecular, MESH: Genomics, MESH: Humans, MESH: Management Information Systems, MESH: Mutation, MESH: Programming Languages, [SDV.BBM.BM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology/Molecular biology

Relation: info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/16792820; hal-00188166; https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00188166; PUBMED: 16792820

Διαθεσιμότητα: https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00188166
https://doi.org/10.1186/1471-2105-7-318