Identification of genes associated with technological properties of cow milk using GWA analysis and gene ontology ; Выявление генов, ассоциированных с технологическими свойствами молока коров, с помощью GWA-анализа и генной онтологии

Συγγραφείς: M. V. Levchenko, G. G. Karlikova, G. K. Petryakova, I. A. Lashneva, A. A. Sermyagin, М. В. Левченко, Г. Г. Карликова, Г. К. Петрякова, И. А. Лашнева, А. А. Сермягин

Συνεισφορές: The research was carried out under the support of the Ministry of Science and Higher Education of the Russian Federation within the state assignment of the Federal Research Center for Animal Husbandry named after Academy Member L. K. Ernst No. FGGN-2024-0013, theme No. 124020200029-4)., Работа выполнена при поддержке Минобрнауки России в рамках Государственного задания ФГБНУ «Федеральный исследовательский центр животноводства – ВИЖ имени академика Л. К. Эрнста» (№ FGGN-2024-0013, рег. № 124020200029-4).

Πηγή: Agricultural Science Euro-North-East; Том 26, № 5 (2025); 1112-1124 ; Аграрная наука Евро-Северо-Востока; Том 26, № 5 (2025); 1112-1124 ; 2500-1396 ; 2072-9081

Θεματικοί όροι: сычужная свертываемость молока, Holstein breed, genome-wide association study, functional gene annotation, SNP markers, thermostability of milk, rennet coagulation of milk, голштинская порода, полногеномный анализ ассоциаций, функциональная аннотация генов, SNP-маркеры, термостабильность молока

Περιγραφή αρχείου: application/pdf

Relation: https://www.agronauka-sv.ru/jour/article/view/2232/950; Суровцев В. Н. Тенденции и перспективы развития молочного животноводства России: риски и возможности. Молочная промышленность. 2023;(2):12–16. DOI: https://doi.org/10.31515/1019-8946-2023-02-12-16 EDN: UQGWLO DOI: https://doi.org/10.31515/1019-8946-2023-02-12-16; Ларкина Т. А., Ширяев Г. В. GWAS как инструмент обнаружения SNPs у крупного рогатого скота для изучения их связи с воспроизводством, продуктивностью, ростом, поведением, болезнями. Аграрная наука. 2024;1(8):124–131. DOI: https://doi.org/10.32634/0869-8155-2024-385-8-124-131 EDN: FIMLEZ DOI: https://doi.org/10.32634/0869-8155-2024-385-8-124-131; Сермягин А. А., Быкова О. А., Лоретц О. Г., Костюнина А. В., Зиновьева Н. А. Оценка геномной вариабельности продуктивных признаков у животных голштинизированной черно-пестрой породы на основе GWAS-анализа и ROH паттернов. Сельскохозяйственная биология. 2020;55(2):257–274. DOI: https://doi.org/10.15389/agrobiology.2020.2.257rus EDN: DTVHLI DOI: https://doi.org/10.15389/agrobiology.2020.2.257rus; Dadousis C., Biffani S., Cipolat-Gotet C., Nicolazzi E. L., Rosa G. J. M., Gianola D. et al. Genome-wide association study for cheese yield and curd nutrient recovery in dairy cows. Journal of Dairy Science. 2017;100(2):1259–1271. DOI: https://doi.org/10.3168/jds.2016-11586; Lu X., Arbab A. A. I., Abdalla I. M., Liu D., Zhang Zh., Xu T. et al. Genetic parameter estimation and genome-wide association study-based loci identification of milk-related traits in Chinese Holstein. Frontiers in Genetics. 2022;12:799664. DOI: https://doi.org/10.3389/fgene.2021.799664; Korkuć P., Neumann G. B., Hesse D., Arends D., Reißmann M., Rahmatalla S. et al. Whole-genome sequencing data reveal new loci affecting milk production in German Black Pied Cattle (DSN). Genes. 2023;14(3):581. DOI: https://doi.org/10.3390/genes14030581; Liu L., Zhou J., Chen Ch. J., Zhang J., Wen W., Tian J. et al. GWAS-based identification of new loci for milk yield, fat, and protein in Holstein cattle. Animals. 2020;10(11):2048. DOI: https://doi.org/10.3390/ani10112048; Shamsollahi M., Zhang Sh. Genome wide association study associated with milk protein composition. Animal Science Research. 2024;34(1):31–44. DOI: https://doi.org/10.22034/as.2023.54694.1690; Левченко М. В., Гладырь Е. А., Зарипов О. Г., Петрякова Г. К., Лашнева И. А., Карликова Г. Г., Сермягин А. А., Зиновьева Н. А. Полногеномный анализ ассоциаций с технологическими свойствами молока коров голштинской породы. Молочное и мясное скотоводство. 2024;(6):3–9. DOI: https://doi.org/10.33943/MMS.2024.42.72.001 EDN: FQONYJ DOI: https://doi.org/10.33943/MMS.2024.42.72.001; Citek J., Brzakova M., Hanusova L., Hanuš O., Večerek L., Samková E. et al. Technological properties of cow’s milk: correlations with milk composition, effect of interactions of genes and other factors. Czech Journal of Animal Science. 2020;65(1):13–22. DOI: https://doi.org/10.17221/150/2019-CJAS; Dadousis C., Pegolo S., Rosa G. J. M., Gianola D., Bittante G., Cecchinato A. Pathway-based genomewide association analysis of milk coagulation properties, curd firmness, cheese yield, and curd nutrient recovery in dairy cattle. Journal of Dairy Science. 2017;100(2):1223–1231. DOI: https://doi.org/10.3168/jds.2016-11587; Marina H., Pelayo R., Suárez-Vega A., Gutiérrez-Gil B., Esteban-Blanco C., Arranz J. J. Genome-wide association studies (GWAS) and post-GWAS analyses for technological traits in Assaf and Churra dairy breeds. Journal of Dairy Science. 2021;104(11):11850–11866. DOI: https://doi.org/10.3168/jds.2021-20510; Pegolo S., Bergamaschi M., Gasperi F., Biasioli F., Cecchinato A., Bittante G. Integrated PTR-ToF-MS, GWAS and biological pathway analyses reveal the contribution of cow’s genome to cheese volatilome. Scientific Reports. 2018;8:17002. DOI: https://doi.org/10.1038/s41598-018-35323-5; Sanchez M. P., Ramayo Caldas Yu., Wolf V., Laithier C., El Jabri M., Michenet A. et al. Sequence based GWAS, network and pathway analyses reveal genes co associated with milk cheese making properties and milk composition in Montbéliarde cows. Genetics Selection Evolution. 2019;51:34. DOI: https://doi.org/10.1186/s12711-019-0473-7; Lagresle-Peyrou Ch., Six E. M., Picard C., Rieux-Laucat F., Michel V., Ditadi A. et al. Human adenylate kinase 2 deficiency causes a profound hematopoietic defect associated with sensorineural deafness. Nature Genetics. 2009;41:106–111. DOI: https://doi.org/10.1038/ng.278; Riley D. G., Miller R. K., Nicholson K. L., Gill C. A., Herring A. D., Riggs P. K. et al. Genome association of carcass and palatability traits from Bos indicus-Bos taurus crossbred steers within electrical stimulation status and correspondence with steer temperament. Livestock Science. 2019;229:150–158. DOI: https://doi.org/10.1016/j.livsci.2019.09.021; Yan X., Kuang B., Ma Sh., Wang R., Lin J., Zeng Y. et al. NOP14-mediated ribosome biogenesis is required for mTORC2 activation and predicts rapamycin sensitivity. Journal of Biological Chemistry. 2024;300(3):105681. DOI: https://doi.org/10.1016/j.jbc.2024.105681; Zhang L., Ning Y., Li P., Guo H., Zan L. Tissue expression analysis and characterization of SMAD3 promoter in bovine myoblasts and preadipocytes. DNA and Cell Biology. 2018;37(6):551–559. DOI: https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5985903/; Abo-Ismail M. K., Voort G. V., Squires J. J., Swanson K. C., Mandell I. B., Liao X. et al. Single nucleotide polymorphisms for feed efficiency and performance in crossbred beef cattle. BMC Genetics. 2014;15:14. DOI: http://www.biomedcentral.com/1471-2156/15/14; Chaiprasert T., Armartmuntree N., Techasen A., Sakonsinsiri Ch., Pinlaor S., Ungarreevittaya P. et al. Roles of Zinc Finger Protein 423 in Proliferation and Invasion of Cholangiocarcinoma through Oxidative Stress. Biomolecules. 2019;9(7):263. DOI: https://doi.org/10.3390/biom9070263; Pagani F., Tratta E., Dell’Era P., Cominelli M., Poliani P. L. EBF1 is expressed in pericytes and contributes to pericyte cell commitment. Histochemistry and Cell Biology. 2021;156:333–347. DOI: https://doi.org/10.1007/s00418-021-02015-7

Διαθεσιμότητα: https://www.agronauka-sv.ru/jour/article/view/2232
https://doi.org/10.30766/2072-9081.2025.26.5.1112-1124